BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-153A23
Chromosome8 (Build37)
Map Location 29,907,617 - 30,084,380
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUnc5d
Upstream geneEG666422, LOC666430, EG666446, LOC100042598
Downstream geneLOC100041237
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-153A23.bB6Ng01-153A23.g
ACCDH948475DH948476
length6611,043
definitionDH948475|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153A23, 5' end.DH948476|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153A23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,907,617 - 29,908,276)(30,083,342 - 30,084,380)
sequence
gaattctcaaaattaactacagtaaaaaatagaaatattttttcaaggaa
tggaaaactacagagaaacaaagaagcactcttctagacatttagctgga
agttccttcactggagaaaaacagtgtcctgacttttatttattaagctg
tttagttagtttattatcttgaagctgaacacagaaattatgctgagcaa
aagaggtgcagaaacccacagtcaaacactagttggagctatggagtctt
ggggaggagttgggggaatgattgaggaacacactagggacagggactcc
acaaaaaggccagcagagtcaactaacatggacctttggggggggggggg
ctcccagagactgagccaccaactgaagaacatacaaaggatggacttag
accccttgcacgtatgtagcagatgtgcagtatggtcttcatgtgaaccc
ctcaacaactagagtaggggatgtccctgactctgttgcctgcctgtgga
tcctttccccaaatggggtacctgtgtggtctcactagaagagcatgata
tgcctagtccttcagtaacttgatggtctagggtgggttggtacctaggg
gtggtgggtgctccctgttcttagaggagaaggttagaaaaaatgggggg
ggggggactgg
gaattccactgatgtagagaattaaggaatcaggcacagagcagccccat
gcttgcaagaggaaaacacataacgttcaggaaacattgaataacacgtt
tattactaaaatgagtgtaatgccttataaatcagcatggaggaaagtgg
tgaaaaaaataaacattacaagttttaactggcccagtgtaccttgaagt
agttcatgtcaaaagaaaagtaatatgaatttacaactttggtgttatca
ttttctgttgttttacataatttccctattattagtctttctcttactag
tctcttcctttgttcttttcaaccttagttaagacaattaatattctaag
atctggcagtgttattgggatgcagcagcccatgaccacttcctaatgtt
tttcttaatgaattaaactaagtcatatgggtagagacatcttttgcctg
atggctattgtagaatgcgatacttatctaagtatttaaagacccactga
gttattaaaggaggaagctgccattgccataagatgaattgaggcattat
tctattttacagcaagctgtgtaatagctacataaattaacagaaaacca
gggtgcattttgtaattctgttttggacaggtaagacctttggtttgaat
caagatccgtagatttgaaatgaaatgtctagttaaacagatttcagaaa
tcaagcccagtgtagtactacaaaggatgtgagatttgtatgtttagaat
agaaaaacgtatcaatacgtttattgatatttatccccaaagcggggagt
ctctgtagaggagactatgtgcaggtttatggaatctcaccaagatccca
tcgtgaatgggttgtgtatgtggtgggggtcaggcttaggaaagagggaa
taatagaagatactgtgacaactctcacctgtgagaagatgtaagtgggt
gtcaaagtaaggatgtaataagttttcttaatcctgggagaatgacaaga
cagaggatgttaaaaaagaaaacgggttttaaaacctataaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_29907617_29908276
seq2: B6Ng01-153A23.b_43_703

seq1  GAATTCTCAAAATTAACTACAGTAAAAAATAGAAATATTTTTTCAAGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAAAATTAACTACAGTAAAAAATAGAAATATTTTTTCAAGGAA  50

seq1  TGGAAAACTACAGAGAAACAAAGAAGCACTCTTCTAGACATTTAGCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAACTACAGAGAAACAAAGAAGCACTCTTCTAGACATTTAGCTGGA  100

seq1  AGTTCCTTCACTGGAGAAAAACAGTGTCCTGACTTTTATTTATTAAGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCTTCACTGGAGAAAAACAGTGTCCTGACTTTTATTTATTAAGCTG  150

seq1  TTTAGTTAGTTTATTATCTTGAAGCTGAACACAGAAATTATGCTGAGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTAGTTTATTATCTTGAAGCTGAACACAGAAATTATGCTGAGCAA  200

seq1  AAGAGGTGCAGAAACCCACAGTCAAACACTAGTTGGAGCTATGGAGTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGTGCAGAAACCCACAGTCAAACACTAGTTGGAGCTATGGAGTCTT  250

seq1  GGGGAGGAGTTGGGGGAATGATTGAGGAACACACTAGGGACAGGGACTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGGAGTTGGGGGAATGATTGAGGAACACACTAGGGACAGGGACTCC  300

seq1  ACAAAAAGGCCAGCAGAGTCAACTAACATGGACCTTTGGGGGGGGGGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAAGGCCAGCAGAGTCAACTAACATGGACCTTTGGGGGGGGGGGGG  350

seq1  CTCCCAGAGACTGAGCCACCAACTGAAGAACATACAAAGGATGGACTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGAGACTGAGCCACCAACTGAAGAACATACAAAGGATGGACTTAG  400

seq1  ACCCCTTGCACGTATGTAGCAGATGTGCAGTATGGTCTTCATGTGAACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTTGCACGTATGTAGCAGATGTGCAGTATGGTCTTCATGTGAACCC  450

seq1  CTCAACAACTAGAGTAGGGGATGTCCCTGACTCTGTTGCCTGCCTGTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACAACTAGAGTAGGGGATGTCCCTGACTCTGTTGCCTGCCTGTGGA  500

seq1  TCCTTTCCCCAAATGGGGTACCTGTGTGGTCTCACTAGAAGAGCATGATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTCCCCAAATGGGGTACCTGTGTGGTCTCACTAGAAGAGCATGATA  550

seq1  TGCCTAGTCCTTCAGTAACTTGATGGTCTAGGGTGGGTTGGTACCTAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAGTCCTTCAGTAACTTGATGGTCTAGGGTGGGTTGGTACCTAGGG  600

seq1  GTGGTGGGTGCTCCCTGTTCTCAGAGGAGAAGGCTAGAAAAAAT-GGGGG  649
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  GTGGTGGGTGCTCCCTGTTCTTAGAGGAGAAGGTTAGAAAAAATGGGGGG  650

seq1  GGGGGGACTGG  660
      |||||||||||
seq2  GGGGGGACTGG  661

seq1: chr8_30083342_30084380
seq2: B6Ng01-153A23.g_69_1103 (reverse)

seq1  GTTTTAAAAACCAGTCTCTTTTCTAACATCCTCTTGCTTTGTCATTCATC  50
      ||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||
seq2  GTTTTAAAACCCGTTTTCTTTTTTAACATCCTC-TGTCTTGTCATTC-TC  48

seq1  CCA-GATTAAGAAAACTTATTAACATCCTTACTTTGACACCCACTTACAT  99
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATTAAGAAAACTTATT-ACATCCTTACTTTGACACCCACTTACAT  97

seq1  CTCATCACAGGTGAGAGTTGTCACAGTTATCTTCTATTATTCCCTCTTTC  149
      ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCACAGGTGAGAGTTGTCACAG-TATCTTCTATTATTCCCTCTTTC  146

seq1  CTAAGCCTGACCCCCACCACATACACAACCCATTCACGATGGGATCTTGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCCTGACCCCCACCACATACACAACCCATTCACGATGGGATCTTGG  196

seq1  TGAGATTCCATAAACCTGCACATAGTCTCCTCTAACAGAGACTCCCCGCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGAGATTCCATAAACCTGCACATAGTCTCCTCT-ACAGAGACTCCCCGCT  245

seq1  TTGGGGATAAATATCAATAAACGTATTGATACGTTTTTCTATTCTAAACA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGATAAATATCAATAAACGTATTGATACGTTTTTCTATTCTAAACA  295

seq1  TACAAATCTCACATCCTTTGTAGTACTACACTGGGCTTGATTTCTGAAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAATCTCACATCCTTTGTAGTACTACACTGGGCTTGATTTCTGAAAT  345

seq1  CTGTTTAACTAGACATTTCATTTCAAATCTACGGATCTTGATTCAAACCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTAACTAGACATTTCATTTCAAATCTACGGATCTTGATTCAAACCA  395

seq1  AAGGTCTTACCTGTCCAAAACAGAATTACAAAATGCACCCTGGTTTTCTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTTACCTGTCCAAAACAGAATTACAAAATGCACCCTGGTTTTCTG  445

seq1  TTAATTTATGTAGCTATTACACAGCTTGCTGTAAAATAGAATAATGCCTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTATGTAGCTATTACACAGCTTGCTGTAAAATAGAATAATGCCTC  495

seq1  AATTCATCTTATGGCAATGGCAGCTTCCTCCTTTAATAACTCAGTGGGTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCATCTTATGGCAATGGCAGCTTCCTCCTTTAATAACTCAGTGGGTC  545

seq1  TTTAAATACTTAGATAAGTATCGCATTCTACAATAGCCATCAGGCAAAAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATACTTAGATAAGTATCGCATTCTACAATAGCCATCAGGCAAAAG  595

seq1  ATGTCTCTACCCATATGACTTAGTTTAATTCATTAAGAAAAACATTAGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTCTACCCATATGACTTAGTTTAATTCATTAAGAAAAACATTAGGA  645

seq1  AGTGGTCATGGGCTGCTGCATCCCAATAACACTGCCAGATCTTAGAATAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCATGGGCTGCTGCATCCCAATAACACTGCCAGATCTTAGAATAT  695

seq1  TAATTGTCTTAACTAAGGTTGAAAAGAACAAAGGAAGAGACTAGTAAGAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTCTTAACTAAGGTTGAAAAGAACAAAGGAAGAGACTAGTAAGAG  745

seq1  AAAGACTAATAATAGGGAAATTATGTAAAACAACAGAAAATGATAACACC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACTAATAATAGGGAAATTATGTAAAACAACAGAAAATGATAACACC  795

seq1  AAAGTTGTAAATTCATATTACTTTTCTTTTGACATGAACTACTTCAAGGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGTAAATTCATATTACTTTTCTTTTGACATGAACTACTTCAAGGT  845

seq1  ACACTGGGCCAGTTAAAACTTGTAATGTTTATTTTTTTCACCACTTTCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGGGCCAGTTAAAACTTGTAATGTTTATTTTTTTCACCACTTTCCT  895

seq1  CCATGCTGATTTATAAGGCATTACACTCATTTTAGTAATAAACGTGTTAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTGATTTATAAGGCATTACACTCATTTTAGTAATAAACGTGTTAT  945

seq1  TCAATGTTTCCTGAACGTTATGTGTTTTCCTCTTGCAAGCATGGGGCTGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTTTCCTGAACGTTATGTGTTTTCCTCTTGCAAGCATGGGGCTGC  995

seq1  TCTGTGCCTGATTCCTTAATTCTCTACATCAGTGGAATTC  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGCCTGATTCCTTAATTCTCTACATCAGTGGAATTC  1035