BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-159G12
Chromosome8 (Build37)
Map Location 90,431,776 - 90,603,290
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp423, LOC100040328
Upstream geneLOC666960, EG625298, EG330819, Cbln1, LOC100040294, 4933402J07Rik
Downstream gene5033428A16Rik, Heatr3, Papd5, Adcy7, Brd7, LOC100040369, Nkd1, 9130017C17Rik, Nod2, Cyld, LOC675985, Sall1, LOC100041089
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-159G12.bB6Ng01-159G12.g
ACCDH953079DH953080
length1,0931,069
definitionDH953079|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159G12, 5' end.DH953080|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159G12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,602,193 - 90,603,290)(90,431,776 - 90,432,848)
sequence
gaattcaattgacctgtttataggcaatttcaccaggcttctcccaggga
cctagcaacagcttacatcatcatctgctgctgccaggtgctaccagtgt
gggctgcagataaaaggactgctccactactctagctctctctctctctt
tccaaggttttccagctggtctttcctcctttctgtcctctgtaccacat
cctcttctctgctcatggctctgctcccatcagtctgcctcccagtcttc
atgcccactcatctgcctcgactccatttccaggtcctcactcccttctt
ccaaataacctctcttatgccaggtctgttgcatggagtgatttttttaa
gggggacatcttggcatgggcccaccacacacccccttgtcacattatat
ttcatagcaacctctccttctcaaatgactttagggtgtgtcagattgac
agataatgttagctaggacaaagatcattggacatttctgtaaatatatt
ttatttaatttacaatatgtgtatatgtatctgtgtgcatatgtgtggct
tcaggtgccctcagagtcaatcatggccaggtggtggtggcatgtgtttt
tttaaacacttgggaggcagaggtggtcagatctttgaattccaggacag
ccagggctacacagagaaaacctgtcttaagaaaactataagcaaatgaa
tgaatgaatgaatgaatgaatgaacgaacaaataaataaagttgtgagct
gcctaagtgagtgttgggaactgaactctgatcccctgcaagagcaatac
atgctcttaagcactgagccatgcctctgaccccactgatttgtctttaa
agtctttcccccactttattcttatgtagtgtgtatgggtgttttgcctg
cttctattctgtgtaccatgtgtttgcatgcccatagaggctagaagaga
gcacctgattttctggaactgtagtttaagatgactaggaactgtcttgt
gggtgcagaatatgaacctgccttctggaaagcatccactgttcctaact
gctaaccaccacctccaggtccctcttataaaataatgaattt
gaattcttaataatggaagagaagggactaggaaaggactgggaagcctc
ttaggggcaccggtctggtggcagcaattcaagggtagctctgatcaatg
cctcggggtgggaggtgctaagaagaatcctaaagctctgtaagagctta
aaacagcagaagcccgagttctttctcggctgtggggtcaacggctaact
taaccatgggaatgggtgggtcccaccaaatgctgtctctataattcctc
ctctgggatatgtagagtctgggccatgtatacttgcagctccagatata
ccaggcagacacaggaccttgtgtgctggcctctgaaccacaaacctcag
taaaatatcggtgtgttaaagcaggtgggcaccagtgtaagatgcttgct
cccggctggagagcagtgtcctcctccggagggcaaggccgtcccaacac
ctcagggaacaagaagagaagacactagatgcagaagaagatgcagaaag
tggggcagaggtgaggagaatgaacaatcaccctctagcccagcagcatg
ctaactcaacggggctttccctccctccgagctgtggcaaagtcagaaag
gacctgtgttgtcacaggctaaggcaatggcctcaagaagagaaggagga
aagggaaagctggctgagcccagagcccacttagcaccagaacccattca
tcccaggccagtgcttacagagacgagagaggacaggacagacacattta
gctcctagagcctgcatgttgggcatttttcgtaggaaagatcattttca
ccaaacattatctaggaaaatgttctctccacaaatgtctgccaacaagg
tcaagaactcctgtactcctttggagagttttgtttgtttgtttgtttgt
ttgtttcactctgggtcagtcatgcttccaggtcttagtaaacatccttc
agttcctctgaacccagagaccactcttaccctagcaagggagctggact
caccttggcttccaagaaggctccctgagagccccccattcccacaggaa
gtggtaagccaacaagctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_90602193_90603290
seq2: B6Ng01-159G12.b_48_1140 (reverse)

seq1  AAATTCATTATTTTATAAAGAGGGACCCTGAAGTGATGGTTTAGCAGTTA  50
      |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||||||||
seq2  AAATTCATTATTTTAT-AAGAGGGACCTGGAGGTGGTGG-TTAGCAGTTA  48

seq1  AGAACAGTGGATGCTTTTCCAGAAAGCAGGTTCAAATTCTGCACCCACAT  100
       ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| 
seq2  GGAACAGTGGATGC-TTTCCAGAAGGCAGGTTCATATTCTGCACCCACAA  97

seq1  GACAGTTCCTAGTCATCTGTAACTACAGTTCCAGAAAATCAGGTGCTCTC  150
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTTCCTAGTCATCTTAAACTACAGTTCCAGAAAATCAGGTGCTCTC  147

seq1  TTCTAGCCTCTATGGGCATTGCAAACACATGGTACACAGAATAGAAGCAG  200
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGCCTCTATGGGCA-TGCAAACACATGGTACACAGAATAGAAGCAG  196

seq1  GCAAAACACCCATACACACTACATAAGAATAAAGTGGGGGAAAGACTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAACACCCATACACACTACATAAGAATAAAGTGGGGGAAAGACTTTA  246

seq1  AAGACAAATCAGTGGGGTCAGAGGCATGGCTCAGTGCTTAAGAGCATGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAAATCAGTGGGGTCAGAGGCATGGCTCAGTGCTTAAGAGCATGTA  296

seq1  TTGCTCTTGCAGGGGATCAGAGTTCAGTTCCCAACACTCACCTTAGGCAG  350
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTGCTCTTGCAGGGGATCAGAGTTCAGTTCCCAACACTCA-CTTAGGCAG  345

seq1  CTCACAACTTTATTTATTTGTTCGTTCATTCATTCATTCATTCATTCATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAACTTTATTTATTTGTTCGTTCATTCATTCATTCATTCATTCATT  395

seq1  CATTTGCTTATAGTTTTCTTAAGACAGGTTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGCTTATAGTTTTCTTAAGACAGGTTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCT  445

seq1  GTCCTGGAATTCAAAGATCTGACCACCTCTGCCTCCCAAGTGTTTAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGGAATTCAAAGATCTGACCACCTCTGCCTCCCAAGTGTTTAAAAA  495

seq1  AACACATGCCACCACCACCTGGCCATGATTGACTCTGAGGGCACCTGAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATGCCACCACCACCTGGCCATGATTGACTCTGAGGGCACCTGAAG  545

seq1  CCACACATATGCACACAGATACATATACACATATTGTAAATTAAATAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACATATGCACACAGATACATATACACATATTGTAAATTAAATAAAA  595

seq1  TATATTTACAGAAATGTCCAATGATCTTTGTCCTAGCTAACATTATCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTACAGAAATGTCCAATGATCTTTGTCCTAGCTAACATTATCTGT  645

seq1  CAATCTGACACACCCTAAAGTCATTTGAGAAGGAGAGGTTGCTATGAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTGACACACCCTAAAGTCATTTGAGAAGGAGAGGTTGCTATGAAAT  695

seq1  ATAATGTGACAAGGGGGTGTGTGGTGGGCCCATGCCAAGATGTCCCCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTGACAAGGGGGTGTGTGGTGGGCCCATGCCAAGATGTCCCCCTT  745

seq1  AAAAAAATCACTCCATGCAACAGACCTGGCATAAGAGAGGTTATTTGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATCACTCCATGCAACAGACCTGGCATAAGAGAGGTTATTTGGAA  795

seq1  GAAGGGAGTGAGGACCTGGAAATGGAGTCGAGGCAGATGAGTGGGCATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGAGTGAGGACCTGGAAATGGAGTCGAGGCAGATGAGTGGGCATGA  845

seq1  AGACTGGGAGGCAGACTGATGGGAGCAGAGCCATGAGCAGAGAAGAGGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGGAGGCAGACTGATGGGAGCAGAGCCATGAGCAGAGAAGAGGAT  895

seq1  GTGGTACAGAGGACAGAAAGGAGGAAAGACCAGCTGGAAAACCTTGGAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACAGAGGACAGAAAGGAGGAAAGACCAGCTGGAAAACCTTGGAAA  945

seq1  GAGAGAGAGAGAGCTAGAGTAGTGGAGCAGTCCTTTTATCTGCAGCCCAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGCTAGAGTAGTGGAGCAGTCCTTTTATCTGCAGCCCAC  995

seq1  ACTGGTAGCACCTGGCAGCAGCAGATGATGATGTAAGCTGTTGCTAGGTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTAGCACCTGGCAGCAGCAGATGATGATGTAAGCTGTTGCTAGGTC  1045

seq1  CCTGGGAGAAGCCTGGTGAAATTGCCTATAAACAGGTCAATTGAATTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGAGAAGCCTGGTGAAATTGCCTATAAACAGGTCAATTGAATTC  1093

seq1: chr8_90431776_90432848
seq2: B6Ng01-159G12.g_67_1135

seq1  GAATTCTTAATAATGGAAGAGAAGGGACTAGGAAAGGACTGGGAAGCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAATAATGGAAGAGAAGGGACTAGGAAAGGACTGGGAAGCCTC  50

seq1  TTAGGGGCACCGGTCTGGTGGCAGCAATTCAAGGGTAGCTCTGATCAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGGCACCGGTCTGGTGGCAGCAATTCAAGGGTAGCTCTGATCAATG  100

seq1  CCTCGGGGTGGGAGGTGCTAAGAAGAATCCTAAAGCTCTGTAAGAGCTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGGGGTGGGAGGTGCTAAGAAGAATCCTAAAGCTCTGTAAGAGCTTA  150

seq1  AAACAGCAGAAGCCCGAGTTCTTTCTCGGCTGTGGGGTCAACGGCTAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGCAGAAGCCCGAGTTCTTTCTCGGCTGTGGGGTCAACGGCTAACT  200

seq1  TAACCATGGGAATGGGTGGGTCCCACCAAATGCTGTCTCTATAATTCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCATGGGAATGGGTGGGTCCCACCAAATGCTGTCTCTATAATTCCTC  250

seq1  CTCTGGGATATGTAGAGTCTGGGCCATGTATACTTGCAGCTCCAGATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGATATGTAGAGTCTGGGCCATGTATACTTGCAGCTCCAGATATA  300

seq1  CCAGGCAGACACAGGACCTTGTGTGCTGGCCTCTGAACCACAAACCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCAGACACAGGACCTTGTGTGCTGGCCTCTGAACCACAAACCTCAG  350

seq1  TAAAATATCGGTGTGTTAAAGCAGGTGGGCACCAGTGTAAGATGCTTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATCGGTGTGTTAAAGCAGGTGGGCACCAGTGTAAGATGCTTGCT  400

seq1  CCCGGCTGGAGAGCAGTGTCCTCCTCCGGAGGGCAAGGCCGTCCCAACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGCTGGAGAGCAGTGTCCTCCTCCGGAGGGCAAGGCCGTCCCAACAC  450

seq1  CTCAGGGAACAAGAAGAGAAGACACTAGATGCAGAAGAAGATGCAGAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGAACAAGAAGAGAAGACACTAGATGCAGAAGAAGATGCAGAAAG  500

seq1  TGGGGCAGAGGTGAGGAGAATGAACAATCACCCTCTAGCCCAGCAGCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCAGAGGTGAGGAGAATGAACAATCACCCTCTAGCCCAGCAGCATG  550

seq1  CTAACTCAACGGGGCTTTCCCTCCCTCCGAGCTGTGGCAAAGTCAGAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTCAACGGGGCTTTCCCTCCCTCCGAGCTGTGGCAAAGTCAGAAAG  600

seq1  GACCTGTGTTGTCACAGGCTAAGGCAATGGCCTCAAGAAGAGAAGGAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGTGTTGTCACAGGCTAAGGCAATGGCCTCAAGAAGAGAAGGAGGA  650

seq1  AAGGGAAAGCTGGCTGAGCCCAGAGCCCACTTAGCACCAGAACCCATTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAAAGCTGGCTGAGCCCAGAGCCCACTTAGCACCAGAACCCATTCA  700

seq1  TCCCAGGCCAGTGCTTACAGAGACGAGAGAGGACAGGACAGACACATTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGCCAGTGCTTACAGAGACGAGAGAGGACAGGACAGACACATTTA  750

seq1  GCTCCTAAGAGCCTGCATGTTGGGCATTTTTCGTAGGAAAAGATCATTTT  800
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCTCCT-AGAGCCTGCATGTTGGGCATTTTTCGTAGG-AAAGATCATTTT  798

seq1  CACCAAACATTATCTAGGAAAATGTTCTCTCCACAAATGTCTGCCAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAACATTATCTAGGAAAATGTTCTCTCCACAAATGTCTGCCAACAA  848

seq1  GGTCAAGAACTCCTGTACT-CTTTGGAGAGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT  899
      ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGTCAAGAACTCCTGTACTCCTTTGGAGAG-TTTTGTTTGTTTGTTTGTT  897

seq1  TGTTTTGTTTTCACTCTGGGTCAGTCATGCTTCCAGGGTCTTAGTAAACA  949
      |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGTTT--GTTTCACTCTGGGTCAGTCATGCTTCCA-GGTCTTAGTAAACA  944

seq1  TCCTTCAGTTTCCTCTGAACCCAGAGACCACTC-TACCCTAGCAAGGGAG  998
      |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCCTTCAG-TTCCTCTGAACCCAGAGACCACTCTTACCCTAGCAAGGGAG  993

seq1  CTGGACTCACCTTGGCTACAAAG-AGGCT-CCTGAGAGTCCCCCATTCCC  1046
      ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||
seq2  CTGGACTCACCTTGGCTTCCAAGAAGGCTCCCTGAGAGCCCCCCATTCCC  1043

seq1  ACAGGAAGTGGTAAGCCAGACAAGCTC  1073
      |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ACAGGAAGTGGTAAGCCA-ACAAGCTC  1069