BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167O05
Chromosome8 (Build37)
Map Location 33,047,561 - 33,176,251
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC547008, Dusp26, Rnf122, BC019943, Rbm13, Fut10, LOC666330, LOC666568, 7420700N18Rik, LOC100041329, EG330731, LOC100041340, Nrg1
Downstream gene2010007E15Rik, EG666589, EG546052, LOC100042715, LOC628408
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167O05.bB6Ng01-167O05.g
ACCDH959269DH959270
length1,1731,081
definitionDH959269|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167O05, 5' end.DH959270|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167O05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,047,561 - 33,048,738)(33,175,163 - 33,176,251)
sequence
gaattctcaaactgctttccagtccccaggtcctgtgttttattttgatc
acgccttattggtattttacatttagtggtagattgtagaatcttatgat
gataagagggaagcaaatttcaggattctgatttctcggtaagagtcatt
ttgctgagctttgatttcgatacagtataataatctactccatttaagga
tgacgactaccactattcaatatttccttttgaatgacttctcctaaaca
gtctttttctaaacccctgacttaataatatcccccacttcacctagttt
atgtcacgattgggtgttgttacataagaccagcaccattaggtctaact
ggcctttgcaattcactgcagacttcttcagctgtggacagtgcctgtcc
ccacttccccctaatgcctgaaaaagcacacaccacccagcagcatgtgg
tggataacagcagaaacaggactacaaactgtttagcttactataaaaga
gacagatttctagagacttaggagcaggaaaggggacatcacatttctat
cctggagctcagctgtcactcagttccacgatcctgtcacttatctgact
actggaatggcctaattcctttaaaatttttaaacaaagactgattaagc
ttttgactgtttcaaataaaactcctggccgtcagtactgaacaaactca
gcggtgcgagctcctatctgatgagcaaatacaacctaaactaatcttcc
ctatgtataagcgagtgaaggggaagaatggatgtgaagacatcttgagg
ccataacccgcatgggctttgtaattggtttctaagacactgtcgacctc
tgtagaccgatagataaaatgaaaagtgctggtccagcagccgtctccgt
gattagtggaagtgtgaacacacagcacctttgtgaaagcaatgaaggaa
taaccaagtacctccatgctggattcagtgtagagcagaatgtgagtggg
agatgctggatgagcttctcagcatcatttccctcactgctgtcctctga
ccctgataaaatccgccaatcagcattacctcgactgggaaccacaccct
gcttataaaatgcttaccacatgatcctttctcctttcaaatgagaacac
ttttcaatacccaaatactctgg
gaattcaaggtgaaagaaccgctgattccctgtgttcataggcaagaagt
cctttaactgaagcagcaaattccagcgacgatgagatactgtgctagca
gataccaggagtctgaaaagtaagacagaaaggttagttttcattctgta
attatagtcttcaatattccttttccaagacaagaagtagtgctatttga
agactaaaggaaaaccacaaggggttatgagcagactgaagcatctgcaa
tcaaataaaatgtgctaattaatttatgatatttatggtatacatggtca
accagtgttatatctatatacttagcttccaagaaaaaaaatcttaattt
gtttaaatggttttaccttggccaactgaaattatgaaagtgatgtcacc
atcagagagcaagccctggtctcttctgtatcaccaaccctacagcgggt
acccgaaggttatagcccatgagtgtttgggataggttgtatatatacat
atatctagataaatacataatgaatccaaatgaggattttaattgacagt
atgtttaatagagccaaaccaattatggcgtgggtgacttgttccccttc
ctcaataagtaggaccactgtcatggattcccatctatctgtcctttgct
tattactgaagtatgccccaaatataatgagttgggtcttctatgattca
tgcattcctgtgctgagtgtggtgatggaaggcctctttgaatggcgagt
ggccctgagataaacataggctctcctccacagcaagagcaagagtcagg
ctcctgacacgaggaaatgaatgtcgcagagatggcctgagggaagtgag
ctcaagctcccaagcttcattggaataatgtgtacaggaaagcaccctga
agaagagagaagaggtgtagcatcgcctctgtgtctgtagcagagctaca
gagcctccccctcctctcccgcaccaggcatttttcacaaattgtggtag
ggagaacgggctttgaagtcacttcccactttgcttgctttgttctcctg
aaggcatgctttgatctctgggggggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_33047561_33048738
seq2: B6Ng01-167O05.b_46_1218

seq1  GAATTCTCAAACTGCTTTCCAGTCCCCAGGTCCTGTGTTTTATTTTGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAAACTGCTTTCCAGTCCCCAGGTCCTGTGTTTTATTTTGATC  50

seq1  ACGCCTTATTGGTATTTTACATTTAGTGGTAGATTGTAGAATCTTATGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTTATTGGTATTTTACATTTAGTGGTAGATTGTAGAATCTTATGAT  100

seq1  GATAAGAGGGAAGCAAATTTCAGGATTCTGATTTCTCGGTAAGAGTCATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGAGGGAAGCAAATTTCAGGATTCTGATTTCTCGGTAAGAGTCATT  150

seq1  TTGCTGAGCTTTGATTTCGATACAGTATAATAATCTACTCCATTTAAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGAGCTTTGATTTCGATACAGTATAATAATCTACTCCATTTAAGGA  200

seq1  TGACGACTACCACTATTCAATATTTCCTTTTGAATGACTTCTCCTAAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGACTACCACTATTCAATATTTCCTTTTGAATGACTTCTCCTAAACA  250

seq1  GTCTTTTTCTAAACCCCTGACTTAATAATATCCCCCACTTCACCTAGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTTCTAAACCCCTGACTTAATAATATCCCCCACTTCACCTAGTTT  300

seq1  ATGTCACGATTGGGTGTTGTTACATAAGACCAGCACCATTAGGTCTAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACGATTGGGTGTTGTTACATAAGACCAGCACCATTAGGTCTAACT  350

seq1  GGCCTTTGCAATTCACTGCAGACTTCTTCAGCTGTGGACAGTGCCTGTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTGCAATTCACTGCAGACTTCTTCAGCTGTGGACAGTGCCTGTCC  400

seq1  CCACTTCCCCCTAATGCCTGAAAAAGCACACACCACCCAGCAGCATGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTCCCCCTAATGCCTGAAAAAGCACACACCACCCAGCAGCATGTGG  450

seq1  TGGATAACAGCAGAAACAGGACTACAAACTGTTTAGCTTACTATAAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATAACAGCAGAAACAGGACTACAAACTGTTTAGCTTACTATAAAAGA  500

seq1  GACAGATTTCTAGAGACTTAGGAGCAGGAAAGGGGACATCACATTTCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGATTTCTAGAGACTTAGGAGCAGGAAAGGGGACATCACATTTCTAT  550

seq1  CCTGGAGCTCAGCTGTCACTCAGTTCCACGATCCTGTCACTTATCTGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAGCTCAGCTGTCACTCAGTTCCACGATCCTGTCACTTATCTGACT  600

seq1  ACTGGAATGGCCTAATTCCTTTAAAATTTTTAAACAAAGACTGATTAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAATGGCCTAATTCCTTTAAAATTTTTAAACAAAGACTGATTAAGC  650

seq1  TTTTGACTGTTTCAAATAAAACTCCTGGCCGTCAGTACTGAACAAACTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGACTGTTTCAAATAAAACTCCTGGCCGTCAGTACTGAACAAACTCA  700

seq1  GCGGTGCGAGCTCCTATCTGATGAGCAAATACAACCTAAACTAATCTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTGCGAGCTCCTATCTGATGAGCAAATACAACCTAAACTAATCTTCC  750

seq1  CTATGTATAAGCGAGTGAAGGGGAAGAATGGATGTGAAGACATCTTGAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTATAAGCGAGTGAAGGGGAAGAATGGATGTGAAGACATCTTGAGG  800

seq1  CCATAACCCGCATGGGCTTTGTAATTGGTTTCTAAGACACTGTCGACCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAACCCGCATGGGCTTTGTAATTGGTTTCTAAGACACTGTCGACCTC  850

seq1  TGTAGACCGATAGATAAAATGAAAAGTGCTGGTCCAGCAGCCGTCTCCGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGACCGATAGATAAAATGAAAAGTGCTGGTCCAGCAGCCGTCTCCGT  900

seq1  GATTAGTGGAAGTGTGAACACACAGCACCTTTGTGAAAGCAATGAAGGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGTGGAAGTGTGAACACACAGCACCTTTGTGAAAGCAATGAAGGAA  950

seq1  TAACCAAGTACCTCCATGCTGGATTCAGTGTAAGAGCAGGAATGTGAGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  TAACCAAGTACCTCCATGCTGGATTCAGTGT-AGAGCA-GAATGTGAGTG  998

seq1  GGAGATGGCTGGATGAGCTTCTCAGGCATCATTTCCCTCACTGCTGT-CT  1049
      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGAGAT-GCTGGATGAGCTTCTCA-GCATCATTTCCCTCACTGCTGTCCT  1046

seq1  CTGACCCTGATAAAATCCG-CAATCAGCATTACCTCGGACTTGG-ACCAC  1097
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||
seq2  CTGACCCTGATAAAATCCGCCAATCAGCATTACCTC-GACTGGGAACCAC  1095

seq1  A-CCTGC-TATAAAATGCTTACCACCATGATCCTTTTTCTCTTTCAGATG  1145
      | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||
seq2  ACCCTGCTTATAAAATGCTTACCA-CATGATCCTTTCTC-CTTTCAAATG  1143

seq1  AAACAACCTTTTTTCAATACACAATTACTCTGG  1178
      | |  ||   |||||||||| ||| ||||||||
seq2  AGAACAC---TTTTCAATACCCAAATACTCTGG  1173

seq1: chr8_33175163_33176251
seq2: B6Ng01-167O05.g_69_1149 (reverse)

seq1  CCCCCCCCCCCCAGAGATCAAAAGCATGCC-TCA-GAGAACAAAAGCAAG  48
      ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||
seq2  CCCCCCCCCCCCAGAGATC-AAAGCATGCCTTCAGGAGAAC-AAAGCAAG  48

seq1  CAAAGTGTGAAGTGACTTTCAAAGCCCGGTTCTTCCCTACCACAATTTGG  98
      ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| 
seq2  CAAAGTGGGAAGTGAC-TTCAAAGCCC-GTTC-TCCCTACCACAATTTG-  94

seq1  TTGAAAGAATGCCTGGTTGCGGGAGGGGAGGGGGAGGCTCTGTAGCTCTG  148
       ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  -TGAAA-AATGCCTGG-TGCGGGAGAGGAGGGGGAGGCTCTGTAGCTCTG  141

seq1  CTACAGAACACAGAGGCGATGCTACACCTCTTCTCTCTTCTTCAGGGTGC  198
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAG-ACACAGAGGCGATGCTACACCTCTTCTCTCTTCTTCAGGGTGC  190

seq1  TTTCCTGTACACATTATTCCAATGAAGCTTGGGAGCTTGAGCTCACTTCC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGTACACATTATTCCAATGAAGCTTGGGAGCTTGAGCTCACTTCC  240

seq1  CTCAGGCCATCTCTGCGACATTCATTTCCTCGTGTCAGGAGCCTGACTCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGCCATCTCTGCGACATTCATTTCCTCGTGTCAGGAGCCTGACTCT  290

seq1  TGCTCTTGCTGTGGAGGAGAGCCTATGTTTATCTCAGGGCCACTCGCCAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTGCTGTGGAGGAGAGCCTATGTTTATCTCAGGGCCACTCGCCAT  340

seq1  TCAAAGAGGCCTTCCATCACCACACTCAGCACAGGAATGCATGAATCATA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGAGGCCTTCCATCACCACACTCAGCACAGGAATGCATGAATCATA  390

seq1  GAAGACCCAACTCATTATATTTGGGGCATACTTCAGTAATAAGCAAAGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACCCAACTCATTATATTTGGGGCATACTTCAGTAATAAGCAAAGGA  440

seq1  CAGATAGATGGGAATCCATGACAGTGGTCCTACTTATTGAGGAAGGGGAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAGATGGGAATCCATGACAGTGGTCCTACTTATTGAGGAAGGGGAA  490

seq1  CAAGTCACCCACGCCATAATTGGTTTGGCTCTATTAAACATACTGTCAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCACCCACGCCATAATTGGTTTGGCTCTATTAAACATACTGTCAAT  540

seq1  TAAAATCCTCATTTGGATTCATTATGTATTTATCTAGATATATGTATATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCCTCATTTGGATTCATTATGTATTTATCTAGATATATGTATATA  590

seq1  TACAACCTATCCCAAACACTCATGGGCTATAACCTTCGGGTACCCGCTGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACCTATCCCAAACACTCATGGGCTATAACCTTCGGGTACCCGCTGT  640

seq1  AGGGTTGGTGATACAGAAGAGACCAGGGCTTGCTCTCTGATGGTGACATC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTGGTGATACAGAAGAGACCAGGGCTTGCTCTCTGATGGTGACATC  690

seq1  ACTTTCATAATTTCAGTTGGCCAAGGTAAAACCATTTAAACAAATTAAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCATAATTTCAGTTGGCCAAGGTAAAACCATTTAAACAAATTAAGA  740

seq1  TTTTTTTTCTTGGAAGCTAAGTATATAGATATAACACTGGTTGACCATGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCTTGGAAGCTAAGTATATAGATATAACACTGGTTGACCATGT  790

seq1  ATACCATAAATATCATAAATTAATTAGCACATTTTATTTGATTGCAGATG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATAAATATCATAAATTAATTAGCACATTTTATTTGATTGCAGATG  840

seq1  CTTCAGTCTGCTCATAACCCCTTGTGGTTTTCCTTTAGTCTTCAAATAGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTCTGCTCATAACCCCTTGTGGTTTTCCTTTAGTCTTCAAATAGC  890

seq1  ACTACTTCTTGTCTTGGAAAAGGAATATTGAAGACTATAATTACAGAATG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTCTTGTCTTGGAAAAGGAATATTGAAGACTATAATTACAGAATG  940

seq1  AAAACTAACCTTTCTGTCTTACTTTTCAGACTCCTGGTATCTGCTAGCAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTAACCTTTCTGTCTTACTTTTCAGACTCCTGGTATCTGCTAGCAC  990

seq1  AGTATCTCATCGTCGCTGGAATTTGCTGCTTCAGTTAAAGGACTTCTTGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCTCATCGTCGCTGGAATTTGCTGCTTCAGTTAAAGGACTTCTTGC  1040

seq1  CTATGAACACAGGGAATCAGCGGTTCTTTCACCTTGAATTC  1089
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAACACAGGGAATCAGCGGTTCTTTCACCTTGAATTC  1081