BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168A10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 130,931,236 - 131,065,425
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNrp1
Upstream genePard3, EG628847
Downstream geneLOC668494, Itgb1, LOC100042659, LOC100042667, Ccdc7, 1700008F21Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168A10.bB6Ng01-168A10.g
ACCDH959371DH959372
length1,0011,198
definitionDH959371|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168A10, 5' end.DH959372|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168A10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,931,236 - 130,932,185)(131,064,208 - 131,065,425)
sequence
gaattctttggggattttgataaatgaccttgctatgtagtcttagtctc
taactcactatgtagagcaaagtgacattgaactcttcagttattctcat
gaatctaccttcaaagtggcaaggttacaggcatccactcctgcagccac
ttttgtgcaatgctccaagctttgatgaaacccagggcattatgcatgct
ccatattctcccaattgaactgcatcctcagcccatgaattattgttttt
cacttaagttattattatattcccatcttagatgtgtcataacaatctta
ggttgctgtttttattcccctgaagacagtggctcagtccagtcctgtct
ccctattctctggaagcggcacctcaaggctcctggatccacaccaagta
tagcacattgacatcacttctgtatatgagtactgtgctgtgtctaccca
aaaatgtaaagaggaatggtttatgaggtcaaatttaagtaaccatgccc
caaacacagatttaggttaccccaaatccatattccaacattgacacagt
tttgtgaagtttcagagtaacagaaaaaataaagtcggaaatcaagggat
ttttaaaatacatcagtggcacttacatcacagcagagaaatccctctca
gatgggatctgatgactttagctacttggttggtggggaattagggtttt
attgagtttgttaatcaaaagattttttaacctataatcagtgtagtagt
taagtaacagagaggaaggagcaaacagatggctatttaataagctaagg
aaagacaagacagactggaattaggagagtcctgcaagcttccaaacttt
ccatagtcactgaggttttaatcagtcaattggcctctacaaacacagcc
tcttttccagaaatcttcattcatacctgcatgtgcaccatgtgagtgct
tgatgccatcagaggccagaagagaccatcagattcctggagctagagtt
t
gaattcttttcatgtttctcagactctgaaggcaaacacaaggtgatttt
ccaagccatttcctctgcttgacctacttccaaaactgatgtctttcctt
ctgcttcctgcctattgcatggatgggagaatgtggccacatttctcttt
gagatcagagcattattagggaggcaactcaaaatgtatattcagggcaa
gaggtaggctgtccaggcactttaccaagtgaactgtctccccagttcca
tcctcctcaagcctcctcctcacaacccaaccctaatccaggcaggtgga
tctggttctctgcgtctctttgttttgatctttgaaaaagtcctttgcta
cctcgtcttacttgataattaacaaacaataagtttgactacaatttacg
aagcggcaatcagatatgatctagtttaatatcctaggcctaggaccctc
tatagcagtcctggcaacccacaaagagttgttcccagggtctgcaggga
cctgtatcaccaaactctggtaatgtaagtcacctataacaaaatatatt
ttgttatttattctaatccccatccattatcaggggttgtgttacagacc
cccataggacatattagacttattagaccctgtgtaagctgattttctat
ttatagttatgttacggtaatgaaggtttacttttgtattatattatatc
tttgtgaactttctttttcacccaaggaagcactcttgggcctgtattta
gcccaaatatgaacatctccgctcttatactaagcatcactattaagtta
taggacacaagtattgcagtaacctggaagttgacttcataaccaagaat
agccatacagtgtggagacactgggaagagagatgatcatcaccacagac
aggaagacagggatgtataaataagctcttatcatgcctcttcgaatgct
attcctcttaaaacaatgactatgggccagcaagatggctaagtgggtaa
agctactttgtgctagtctgatggcccaagaagcactaatagtagaaggg
agaaaatcagctcttacccaggtgccatggcagcctctccgtgccccttt
ctagtataagttaacaacaaccaacaactattgctaggacaccctggttt
tatctttaaaccggtgccgaacgtatggaactcagaaaacaaattgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_130931236_130932185
seq2: B6Ng01-168A10.b_47_997

seq1  GAATTCTTTGGGGATTTTGATAAATGACCTTGCTATGTAGTCTTAGTCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGGGATTTTGATAAATGACCTTGCTATGTAGTCTTAGTCTC  50

seq1  TAACTCACTATGTAGAGCAAAGTGACATTGAACTCTTCAGTTATTCTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCACTATGTAGAGCAAAGTGACATTGAACTCTTCAGTTATTCTCAT  100

seq1  GAATCTACCTTCAAAGTGGCAAGGTTACAGGCATCCACTCCTGCAGCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTACCTTCAAAGTGGCAAGGTTACAGGCATCCACTCCTGCAGCCAC  150

seq1  TTTTGTGCAATGCTCCAAGCTTTGATGAAACCCAGGGCATTATGCATGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTGCAATGCTCCAAGCTTTGATGAAACCCAGGGCATTATGCATGCT  200

seq1  CCATATTCTCCCAATTGAACTGCATCCTCAGCCCATGAATTATTGTTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATTCTCCCAATTGAACTGCATCCTCAGCCCATGAATTATTGTTTTT  250

seq1  CACTTAAGTTATTATTATATTCCCATCTTAGATGTGTCATAACAATCTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAAGTTATTATTATATTCCCATCTTAGATGTGTCATAACAATCTTA  300

seq1  GGTTGCTGTTTTTATTCCCCTGAAGACAGTGGCTCAGTCCAGTCCTGTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGCTGTTTTTATTCCCCTGAAGACAGTGGCTCAGTCCAGTCCTGTCT  350

seq1  CCCTATTCTCTGGAAGCGGCACCTCAAGGCTCCTGGATCCACACCAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATTCTCTGGAAGCGGCACCTCAAGGCTCCTGGATCCACACCAAGTA  400

seq1  TAGCACATTGACATCACTTCTGTATATGAGTACTGTGCTGTGTCTACCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACATTGACATCACTTCTGTATATGAGTACTGTGCTGTGTCTACCCA  450

seq1  AAAATGTAAAGAGGAATGGTTTATGAGGTCAAATTTAAGTAACCATGCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTAAAGAGGAATGGTTTATGAGGTCAAATTTAAGTAACCATGCCC  500

seq1  CAAACACAGATTTAGGTTACCCCAAATCCATATTCCAACATTGACACAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACAGATTTAGGTTACCCCAAATCCATATTCCAACATTGACACAGT  550

seq1  TTTGTGAAGTTTCAGAGTAACAGAAAAAATAAAGTCGGAAATCAAGGGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGAAGTTTCAGAGTAACAGAAAAAATAAAGTCGGAAATCAAGGGAT  600

seq1  TTTTAAAATACATCAGTGGCACTTACATCACAGCAGAGAAATCCCTCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAATACATCAGTGGCACTTACATCACAGCAGAGAAATCCCTCTCA  650

seq1  GATGGGATCTGATGACTTTAGCTACTTGGTTGGTGGGGAATTAGGGTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGATCTGATGACTTTAGCTACTTGGTTGGTGGGGAATTAGGGTTTT  700

seq1  ATTGAGTTTGTTAATCAAAAGATTTTTTAACCTATAATCAGTGTAGTAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTTTGTTAATCAAAAGATTTTTTAACCTATAATCAGTGTAGTAGT  750

seq1  TAAGTAACAGAGAGGAAGGAGCAAACAGATGGCTATTTAATAAGCTAAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTAACAGAGAGGAAGGAGCAAACAGATGGCTATTTAATAAGCTAAGG  800

seq1  AAAGACAAGACAGACTGGAATTAGGAGAGTCCTGCAAGCTTCCAAACTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACAAGACAGACTGGAATTAGGAGAGTCCTGCAAGCTTCCAAACTTT  850

seq1  CCATAGTCACTGAGGTTTTAATCAGTCAATTGGCCTCTACAAACACAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGTCACTGAGGTTTTAATCAGTCAATTGGCCTCTACAAACACAGCC  900

seq1  TC-TTTCCAGAAATCTTCATTCATACCTGCATGTGCACCATGTGAGTGCT  949
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTCCAGAAATCTTCATTCATACCTGCATGTGCACCATGTGAGTGCT  950

seq1  T  950
      |
seq2  T  951

seq1: chr8_131064208_131065425
seq2: B6Ng01-168A10.g_67_1264 (reverse)

seq1  CACAATTTTGTTTTCTGAAGTTTCAGTGACCTGTTCAGCAGCAGTATAAA  50
      ||||| ||||||||||| |||| ||   ||  |||| ||| | || ||||
seq2  CACAA-TTTGTTTTCTG-AGTTCCA--TAC--GTTCGGCACCGGTTTAAA  44

seq1  AGTATAAACAGGGTTGTTCTATGCAATATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTT  100
        || || ||||| ||| ||| ||||||     |||   ||| ||||| |
seq2  GATAAAACCAGGG-TGTCCTA-GCAATA-----GTT--GTTGGTTGTTGT  85

seq1  ACATTTATTTACTTATGTAGGGGCACGGAGAGCTTGCCATGGCACCTGGG  150
        | |||  ||| ||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||
seq2  TAACTTA--TAC-TAGAAAGGGGCACGGAGAGGCTGCCATGGCACCTGGG  132

seq1  T-AGAGCTGATTTTCTCCCTTCTACTATAAGTGCTCCTTGGGCCATCAGA  199
      | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  TAAGAGCTGATTTTCTCCCTTCTACTATTAGTGCTTCTTGGGCCATCAGA  182

seq1  CTTAGCACCAAGTAGCTTTACCCACTTAGCCATCTTGCTGGCCCATAGTC  249
      | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TAGCACAAAGTAGCTTTACCCACTTAGCCATCTTGCTGGCCCATAGTC  231

seq1  ATTTGTTTTAAGAGGAATAGCATTCGAAGAGGCATGATAAGAGCTTATTT  299
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TTGTTTTAAGAGGAATAGCATTCGAAGAGGCATGATAAGAGCTTATTT  280

seq1  ATACATCCCTGTTCTTCCTGTCTGTGGTGATGATCATCTCTCTTCCCAGT  349
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATCCCTG-TCTTCCTGTCTGTGGTGATGATCATCTCTCTTCCCAGT  329

seq1  GTCTCCACACTGTATGGCTATTCTTGGTTATGAAGTCAACTTCCAGGTTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCACACTGTATGGCTATTCTTGGTTATGAAGTCAACTTCCAGGTTA  379

seq1  CTGCAATACTTGTGTCCTATAACTTAATAGTGATGCTTAGTATAAGAGCG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAATACTTGTGTCCTATAACTTAATAGTGATGCTTAGTATAAGAGCG  429

seq1  GAGATGTTCATATTTGGGCTAAATACAGGCCCAAGAGTGCTTCCTTGGGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGTTCATATTTGGGCTAAATACAGGCCCAAGAGTGCTTCCTTGGGT  479

seq1  GAAAAAGAAAGTTCACAAAGATATAATATAATACAAAAGTAAACCTTCAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGAAAGTTCACAAAGATATAATATAATACAAAAGTAAACCTTCAT  529

seq1  TACCGTAACATAACTATAAATAGAAAATCAGCTTACACAGGGTCTAATAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGTAACATAACTATAAATAGAAAATCAGCTTACACAGGGTCTAATAA  579

seq1  GTCTAATATGTCCTATGGGGGTCTGTAACACAACCCCTGATAATGGATGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAATATGTCCTATGGGGGTCTGTAACACAACCCCTGATAATGGATGG  629

seq1  GGATTAGAATAAATAACAAAATATATTTTGTTATAGGTGACTTACATTAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAGAATAAATAACAAAATATATTTTGTTATAGGTGACTTACATTAC  679

seq1  CAGAGTTTGGTGATACAGGTCCCTGCAGACCCTGGGAACAACTCTTTGTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTTGGTGATACAGGTCCCTGCAGACCCTGGGAACAACTCTTTGTG  729

seq1  GGTTGCCAGGACTGCTATAGAGGGTCCTAGGCCTAGGATATTAAACTAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGCCAGGACTGCTATAGAGGGTCCTAGGCCTAGGATATTAAACTAGA  779

seq1  TCATATCTGATTGCCGCTTCGTAAATTGTAGTCAAACTTATTGTTTGTTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCTGATTGCCGCTTCGTAAATTGTAGTCAAACTTATTGTTTGTTA  829

seq1  ATTATCAAGTAAGACGAGGTAGCAAAGGACTTTTTCAAAGATCAAAACAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCAAGTAAGACGAGGTAGCAAAGGACTTTTTCAAAGATCAAAACAA  879

seq1  AGAGACGCAGAGAACCAGATCCACCTGCCTGGATTAGGGTTGGGTTGTGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACGCAGAGAACCAGATCCACCTGCCTGGATTAGGGTTGGGTTGTGA  929

seq1  GGAGGAGGCTTGAGGAGGATGGAACTGGGGAGACAGTTCACTTGGTAAAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGGCTTGAGGAGGATGGAACTGGGGAGACAGTTCACTTGGTAAAG  979

seq1  TGCCTGGACAGCCTACCTCTTGCCCTGAATATACATTTTGAGTTGCCTCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGACAGCCTACCTCTTGCCCTGAATATACATTTTGAGTTGCCTCC  1029

seq1  CTAATAATGCTCTGATCTCAAAGAGAAATGTGGCCACATTCTCCCATCCA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAATGCTCTGATCTCAAAGAGAAATGTGGCCACATTCTCCCATCCA  1079

seq1  TGCAATAGGCAGGAAGCAGAAGGAAAGACATCAGTTTTGGAAGTAGGTCA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATAGGCAGGAAGCAGAAGGAAAGACATCAGTTTTGGAAGTAGGTCA  1129

seq1  AGCAGAGGAAATGGCTTGGAAAATCACCTTGTGTTTGCCTTCAGAGTCTG  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAGGAAATGGCTTGGAAAATCACCTTGTGTTTGCCTTCAGAGTCTG  1179

seq1  AGAAACATGAAAAGAATTC  1218
      |||||||||||||||||||
seq2  AGAAACATGAAAAGAATTC  1198