BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-187G14
Chromosome8 (Build37)
Map Location 96,994,374 - 97,100,830
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAI451557, Cpne2, 2310065K24Rik
Upstream geneCes7, Gnao1, Amfr, Nudt21, Ogfod1, Bbs2, Mt4, Mt3, Mt2, Mt1, Nup93, LOC100041555, Slc12a3, Herpud1, EG434339
Downstream geneRspry1, Arl2bp, Pllp, Ccl22, Cx3cl1, 1700121C10Rik, Ccl17, Ciapin1, LOC664947, Coq9, Polr2c, Dok4, LOC100040942, Ccdc102a, Gpr114, Gpr56, Gpr97, Gm770, Katnb1, Kifc3, BC016201, Map1lc3-ps6, 1700055M20Rik, Zfp319, AA960436, Mmp15, Gtl3, Csnk2a2, 4933406B17Rik, Ccdc113, 4931432M23Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-187G14.bB6Ng01-187G14.g
ACCGA011999GA012000
length1,1571,097
definitionB6Ng01-187G14.b B6Ng01-187G14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,994,374 - 96,995,542)(97,099,735 - 97,100,830)
sequence
gaattcacctgagagcagcttcccaataaacctgccttttaatatattct
aatctggattgaattagctcatttcaccagtggagaaatagcctctcact
gacctcctttcatctgtcccctgatgccccaagtgattcttttccaggga
atatggctgccagacagcatagcccagtaagtggatacaaccttagggtt
aaaatcacacaaagcctttgtctcatgctacctgaggatctaaggctttg
gagtttactgacctgggagccaagaagtcatagttctgatcctagctctg
cccatgaccttgggatttgaccttgggcacttccatctctcttccttgac
ctgagtcactcactctccagggacagtggtcccagcctaaggatcatgga
cctgagcatattgtgtgacttataatatagacatattctgtgtctatgca
gagacagctgctcgaagtctagtggaggagagggcctggagggagctggg
acatgagcctggtcagcaccccgcccccaccacatgcacaggttacacaa
tcaatgtaacaaggccagctagctcatgggtgagggagcctcccactctc
tagagttagagatgatatttctgcagatgtgaggattggctagcctatag
tacacccagagagtaccatgcctaacacagtgtatattttctaagtattg
ccactgttgatagagaaatatattgaaaaacaccttattccagcgtacat
agaccaccatttaattaacccatcccaactgttggctatttgtgttgctt
ctggtttttaattattataaataattgtgccaggaacactttcaaaactg
ttcatgaacagtacaaaaaaaagttgcacagccacggtagcttcctgctg
cctatggagttactagctcacaaatatcagttattattttaggcttctgc
tttgtaaatgccctgtgccttctgttggaactcttcccagcaggcttttg
gtgagtttcagtctagaggggagactggagagatggttcagcagttagag
ttctgtgcttgtctagaggccccaggtttaagatcaagccccacatcaga
tggctcagactgcttggactccagctccagagatcagtcacctcttctgc
tgtgcag
gaattcttacaacttacttgactcccctcatcagtaagcagggagaacac
ccacatacaagttgttacagtgatcaaatgaggctggaaacattcagagg
gaggaaagaatggagcgccattctcagtttaggtttgtttgacttttaaa
aacatcttggttcttaagtatgtatttatgtatctgtatgtgtctgggtg
tgtgtgcatgaatgctgtgccatgaaggccatcagagggctgccaggccc
tccaagcaggagttaaaggtagttacaggttatgaactagctgacacagt
gctgggaactgaactcatgtcctcttcaacggcacagtatgtgcttttaa
tctctgaatcatctcttcaggcctcttcacttggcctctaattgttgttc
tccatgttgtcgatgaaggcttttgtctttggagtagcagaatcactgtg
catatcctgggaagaaaagagcccagatacttggtggcattgtatatagc
tttaaaatatttccttcagggggtcttgcataaacgaactaaaaagtaaa
agtggtgagatcagtttctgaggtgctcctctcccaggggtaggaaattg
ccttaataaagagcagagctgcatggctcgtgtctgccagttggtcactg
gtctcttcagtgtggcatcacagaatcggtagtatcactcacaggtggtc
tcttgatctagcctcctgttgagggccacaagagtggctaaggaagacat
cagacctgagtcccacttgctgtaatgccatgacttgtgaagacaggaat
ctaactataataggtgactataaggtttgttccccatctcagaactagtg
ggtggcaagagagtgtgggcagtctttcaagtcccaactgtgtactctct
tctgtccgcttctttgactgtaacacaagatgtccagagtctcccaagat
tgcatagagttgttcttgcagcaaggggcttttttttatagaaagcccca
gcattgtgttcaggctgggaaatggcccttccagcattagaggtgatggt
ttaacttgcctgtccttcttttgcagaggccccgtctgcatgttctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_96994374_96995542
seq2: B6Ng01-187G14.b_47_1203

seq1  GAATTCACCTGAGAGCAGCTTCCCAATAAACCTGCCTTTTAATATATTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTGAGAGCAGCTTCCCAATAAACCTGCCTTTTAATATATTCT  50

seq1  AATCTGGATTGAATTAGCTCATTTCACCAGTGGAGAAATAGCCTCTCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGGATTGAATTAGCTCATTTCACCAGTGGAGAAATAGCCTCTCACT  100

seq1  GACCTCCTTTCATCTGTCCCCTGATGCCCCAAGTGATTCTTTTCCAGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCCTTTCATCTGTCCCCTGATGCCCCAAGTGATTCTTTTCCAGGGA  150

seq1  ATATGGCTGCCAGACAGCATAGCCCAGTAAGTGGATACAACCTTAGGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGCTGCCAGACAGCATAGCCCAGTAAGTGGATACAACCTTAGGGTT  200

seq1  AAAATCACACAAAGCCTTTGTCTCATGCTACCTGAGGATCTAAGGCTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCACACAAAGCCTTTGTCTCATGCTACCTGAGGATCTAAGGCTTTG  250

seq1  GAGTTTACTGACCTGGGAGCCAAGAAGTCATAGTTCTGATCCTAGCTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTACTGACCTGGGAGCCAAGAAGTCATAGTTCTGATCCTAGCTCTG  300

seq1  CCCATGACCTTGGGATTTGACCTTGGGCACTTCCATCTCTCTTCCTTGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGACCTTGGGATTTGACCTTGGGCACTTCCATCTCTCTTCCTTGAC  350

seq1  CTGAGTCACTCACTCTCCAGGGACAGTGGTCCCAGCCTAAGGATCATGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCACTCACTCTCCAGGGACAGTGGTCCCAGCCTAAGGATCATGGA  400

seq1  CCTGAGCATATTGTGTGACTTATAATATAGACATATTCTGTGTCTATGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGCATATTGTGTGACTTATAATATAGACATATTCTGTGTCTATGCA  450

seq1  GAGACAGCTGCTCGAAGTCTAGTGGAGGAGAGGGCCTGGAGGGAGCTGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGCTGCTCGAAGTCTAGTGGAGGAGAGGGCCTGGAGGGAGCTGGG  500

seq1  ACATGAGCCTGGTCAGCACCCCGCCCCCACCACATGCACAGGTTACACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGCCTGGTCAGCACCCCGCCCCCACCACATGCACAGGTTACACAA  550

seq1  TCAATGTAACAAGGCCAGCTAGCTCATGGGTGAGGGAGCCTCCCACTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTAACAAGGCCAGCTAGCTCATGGGTGAGGGAGCCTCCCACTCTC  600

seq1  TAGAGTTAGAGATGATATTTCTGCAGATGTGAGGATTGGCTAGCCTATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTTAGAGATGATATTTCTGCAGATGTGAGGATTGGCTAGCCTATAG  650

seq1  TACACCCAGAGAGTACCATGCCTAACACAGTGTATATTTTCTAAGTATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCCAGAGAGTACCATGCCTAACACAGTGTATATTTTCTAAGTATTG  700

seq1  CCACTGTTGATAGAGAAATATATTGAAAAACACCTTATTCCAGCGTACAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTTGATAGAGAAATATATTGAAAAACACCTTATTCCAGCGTACAT  750

seq1  AGACCACCATTTAATTAACCCATCCCAACTGTTGGCTATTTGTGTTGCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACCATTTAATTAACCCATCCCAACTGTTGGCTATTTGTGTTGCTT  800

seq1  CTGGTTTTTAATTATTATAAATAATTGTGCCAGGAACACTTTCAAAACTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTTTAATTATTATAAATAATTGTGCCAGGAACACTTTCAAAACTG  850

seq1  TTCATGAACAGTACAAAAAAAAGTTGCACAGCCACGGTAGCTTCCTGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGAACAGTACAAAAAAAAGTTGCACAGCCACGGTAGCTTCCTGCTG  900

seq1  CCTATGGAGTTACTAGCTCACAAATATCAGTTATTATTTTAGGCTTCTGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGGAGTTACTAGCTCACAAATATCAGTTATTATTTTAGGCTTCTGC  950

seq1  TTTGTAAATGCCCTGTGCCTTCTGTTGGAACTCTTCCCAGCAGGCTTTTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAAATGCCCTGTGCCTTCTGTTGGAACTCTTCCCAGCAGGCTTTTG  1000

seq1  GTGAGTTTCAGTCTAGAGGGGGAGACTGGAGAGATGGTTCAGCAGTTAAG  1050
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GTGAGTTTCAGTCTAGA-GGGGAGACTGGAGAGATGGTTCAGCAGTT-AG  1048

seq1  AGTTCTTGTTGCTTGTCTAGAGGCCCCAGGTTT-AGATCCAAGCCCCCAC  1099
      ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||
seq2  AGTTCT--GTGCTTGTCTAGAGGCCCCAGGTTTAAGAT-CAAG-CCCCAC  1094

seq1  ATCAGATGGCTCAGAACTGCTTTGGAACTTCAGCTCCAGAGAATCCAGTG  1149
      |||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||   |||| 
seq2  ATCAGATGGCTCAG-ACTGCTT--GGACTCCAGCTCCAGAGA--TCAGTC  1139

seq1  ACCTCTTCTGGCCTGTGCAG  1169
      ||||||||||  ||||||||
seq2  ACCTCTTCTG--CTGTGCAG  1157

seq1: chr8_97099735_97100830
seq2: B6Ng01-187G14.g_62_1158 (reverse)

seq1  AAGAGACATGCAGGACGGGGCCTCTGCAAAAGGAGGACA-GCAAGTT-AA  48
      |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||
seq2  AAGA-ACATGCA-GACGGGGCCTCTGCAAAAGAAGGACAGGCAAGTTAAA  48

seq1  CCATCACCTTCCTAATGCT-GAAGGGCCA-TTCCCAGCCTGAACACAATG  96
      |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCATCACCT--CTAATGCTGGAAGGGCCATTTCCCAGCCTGAACACAATG  96

seq1  CTGGGGCTTTCTAT--AAAAAAGCCCCTTTGCTGC-AGAACAACTCTATG  143
      ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
seq2  CTGGGGCTTTCTATAAAAAAAAGCCCC-TTGCTGCAAGAACAACTCTATG  145

seq1  CAATCTTGGGAGACTCTGGACATCTTTGTGTTACAGTCAAAGAAGCGGAC  193
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTTGGGAGACTCTGGACATC-TTGTGTTACAGTCAAAGAAGCGGAC  194

seq1  AGAAGAGAGTACACAGTTGGGACTTGAAAGACTGCCCACACTCTCTTGCC  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGAGTACACAGTTGGGACTTGAAAGACTGCCCACACTCTCTTGCC  244

seq1  ACCCACTAGTTCTGAGATGGGGAACAAACCTTATAGTCACCTATTATAGT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACTAGTTCTGAGATGGGGAACAAACCTTATAGTCACCTATTATAGT  294

seq1  TAGATTCCTGTCTTCACAAGTCATGGCATTACAGCAAGTGGGACTCAGGT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTCCTGTCTTCACAAGTCATGGCATTACAGCAAGTGGGACTCAGGT  344

seq1  CTGATGTCTTCCTTAGCCACTCTTGTGGCCCTCAACAGGAGGCTAGATCA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGTCTTCCTTAGCCACTCTTGTGGCCCTCAACAGGAGGCTAGATCA  394

seq1  AGAGACCACCTGTGAGTGATACTACCGATTCTGTGATGCCACACTGAAGA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCACCTGTGAGTGATACTACCGATTCTGTGATGCCACACTGAAGA  444

seq1  GACCAGTGACCAACTGGCAGACACGAGCCATGCAGCTCTGCTCTTTATTA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGTGACCAACTGGCAGACACGAGCCATGCAGCTCTGCTCTTTATTA  494

seq1  AGGCAATTTCCTACCCCTGGGAGAGGAGCACCTCAGAAACTGATCTCACC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAATTTCCTACCCCTGGGAGAGGAGCACCTCAGAAACTGATCTCACC  544

seq1  ACTTTTACTTTTTAGTTCGTTTATGCAAGACCCCCTGAAGGAAATATTTT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTACTTTTTAGTTCGTTTATGCAAGACCCCCTGAAGGAAATATTTT  594

seq1  AAAGCTATATACAATGCCACCAAGTATCTGGGCTCTTTTCTTCCCAGGAT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTATATACAATGCCACCAAGTATCTGGGCTCTTTTCTTCCCAGGAT  644

seq1  ATGCACAGTGATTCTGCTACTCCAAAGACAAAAGCCTTCATCGACAACAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACAGTGATTCTGCTACTCCAAAGACAAAAGCCTTCATCGACAACAT  694

seq1  GGAGAACAACAATTAGAGGCCAAGTGAAGAGGCCTGAAGAGATGATTCAG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAACAACAATTAGAGGCCAAGTGAAGAGGCCTGAAGAGATGATTCAG  744

seq1  AGATTAAAAGCACATACTGTGCCGTTGAAGAGGACATGAGTTCAGTTCCC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTAAAAGCACATACTGTGCCGTTGAAGAGGACATGAGTTCAGTTCCC  794

seq1  AGCACTGTGTCAGCTAGTTCATAACCTGTAACTACCTTTAACTCCTGCTT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTGTGTCAGCTAGTTCATAACCTGTAACTACCTTTAACTCCTGCTT  844

seq1  GGAGGGCCTGGCAGCCCTCTGATGGCCTTCATGGCACAGCATTCATGCAC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGCCTGGCAGCCCTCTGATGGCCTTCATGGCACAGCATTCATGCAC  894

seq1  ACACACCCAGACACATACAGATACATAAATACATACTTAAGAACCAAGAT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCCAGACACATACAGATACATAAATACATACTTAAGAACCAAGAT  944

seq1  GTTTTTAAAAGTCAAACAAACCTAAACTGAGAATGGCGCTCCATTCTTTC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAAAAGTCAAACAAACCTAAACTGAGAATGGCGCTCCATTCTTTC  994

seq1  CTCCCTCTGAATGTTTCCAGCCTCATTTGATCACTGTAACAACTTGTATG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCTGAATGTTTCCAGCCTCATTTGATCACTGTAACAACTTGTATG  1044

seq1  TGGGTGTTCTCCCTGCTTACTGATGAGGGGAGTCAAGTAAGTTGTAAGAA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGTTCTCCCTGCTTACTGATGAGGGGAGTCAAGTAAGTTGTAAGAA  1094

seq1  TTC  1096
      |||
seq2  TTC  1097