BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205E15
Chromosome8 (Build37)
Map Location 127,793,486 - 127,953,017
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSipa1l2
Upstream geneGalnt2, Pgbd5, Cog2, Agt, Capn9, 2310022B05Rik, Ttc13, Arv1, 2310031A18Rik, LOC668444, Trim67, 2810004N23Rik, Gnpat, Exoc8, Gm505, Egln1, Tsnax, Disc1
Downstream gene4933403G14Rik, 2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891, Kcnk1, Slc35f3, LOC668434, 1810063B05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205E15.bB6Ng01-205E15.g
ACCGA025012GA025013
length1,120644
definitionB6Ng01-205E15.b B6Ng01-205E15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,951,892 - 127,953,017)(127,793,486 - 127,794,129)
sequence
gaattctttttcaaatctcttaaaaagagagccccatttagacagcctgg
gtctgtaagattgcagtgagaaagcatagtgaactgctgtagtgggtggg
gattattcattgttacagtcgagagtttaactagtttaataaaagaaaag
ctttaattatagtaagttatagtaggtgaagtaattaagagtgattatcc
taatttcttaaaagtatatctaatggaattgggaccgatttctaatcaga
gataagacttgagagatcctaacacagtcttgtggaggatgtagcctgat
tcccagatagtctacaggatgcagttgggaatatgctgatgagcagggtt
tcctcagaagttaaacaagaagctgccttagtttctttctcattgctgaa
ataagatgccctgacagagcaatgtgagggagaagcatgaactctgactc
acagttcctaagagaatagtcccccgtgcagggaagggtttgcattgctg
tgagcagacaccatgatcaaggcagctcctatgaaggacaaggtttactt
ggggctggctcgcaggttcagaggttcagtccattactataaaggtggga
acatggcagcatccaggcaggcatggtgcaggaggagctgagagttctat
gtcttcatctgaaggctgctaggagaagactggcttccaaagtcttaaag
tccaccccctcggtgacatacctactccaacaaggctacacctactccaa
catgaccacacctcataataatgccactccctgtgccaaacatattcaga
gcatcagcaaaggcatggtgtggttgcccacagcattggaagctggttgg
tcccattatgtccacgcacaggacacaagactaggacctggatgtggtgt
ggctctgcatttcgctctgagagggaagcaccaatacactgctggggcgt
gggaaaattgcagcctaagaggagggaggctaaagctggggttccctgac
tccaggcattcattcaccactggaaaccgcacagaggagttgaaagggag
atcaggtctacaggcctagattgagagctgggccagggtctctttacttc
tggacttccaaacctgctgg
gaattcctccccacaggtgagcagagcccaagcaaagttagattcgggaa
gatcttagcatctcagtgaatcacacagcacccacagcaaagcctgagta
tagagaggggctgccttcagacctaaggcgaaggcttttcagtttgatag
gcatcccttgggctcctatgaagtgttgagtgctggagttacaggaatac
aaatgccgacagagccacggcaattacagctgtgtgcatggtctctgtgc
tctccactctggactttcaactgcttcagataaagagacatggctctgtg
ctacaagaccctgtcctgtactttattgattatccttcatctgaactgga
tttaggtgtgctcaggagaaacacctgtgttgtgtgtcggagagtgtttc
cagagaggtttaactggaatagggagacgagtctggggggcctggcctga
atgaaaagggagaaaagaagaaagtgagctgatcatctctctctctctct
ctctctctctctctctctctctctctgcttcctgactatataaatacaac
aggacagccaccaggcacccctttgcactactaacgagggctgtggatct
aaatttcaagaatagttcctatggcaggggttgggggggtgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_127951892_127953017
seq2: B6Ng01-205E15.b_44_1163 (reverse)

seq1  CCAGCAGCGTCTGGAAGTCCAGGAGTAAAGAGACCCCTGGCCCCAGCTCC  50
      ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| 
seq2  CCAGCAG-GTTTGGAAGTCCAGAAGTAAAGAGA-CCCTGG-CCCAGCTCT  47

seq1  TCATCTAAGGCCTGTGGACCCTGATCCTCCCTTTCAACTCCTCTGTGCGG  100
        |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCT-AGGCCTGTAGA-CCTGAT-CTCCCTTTCAACTCCTCTGTGCGG  94

seq1  TTTCCAGTGGTGACTGAATGCCTTGGAGTCAGGGAACCCCAGCTTTGGCC  150
      ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTCCAGTGGTGAATGAATGCC-TGGAGTCAGGGAACCCCAGCTTTAGCC  143

seq1  TCCCTCCTCTTAGGCTGC-ATTTTCCCACGCCCCAGCAGTGTATTGGTGC  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCTCTTAGGCTGCAATTTTCCCACGCCCCAGCAGTGTATTGGTGC  193

seq1  TTCCCTCTCAGAGCGAAATGCAGAGCCACACCACATCCAGGTCCTAGTCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCTCAGAGCGAAATGCAGAGCCACACCACATCCAGGTCCTAGTCT  243

seq1  TGTGTCCTGTGCGTGGACATAATGGGACCAACCAGCTTCCAATGCTGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTGTGCGTGGACATAATGGGACCAACCAGCTTCCAATGCTGTGG  293

seq1  GCAACCACACCATGCCTTTGCTGATGCTCTGAATATGTTTGGCACAGGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCACACCATGCCTTTGCTGATGCTCTGAATATGTTTGGCACAGGGA  343

seq1  GTGGCATTATTATGAGGTGTGGTCATGTTGGAGTAGGTGTAGCCTTGTTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCATTATTATGAGGTGTGGTCATGTTGGAGTAGGTGTAGCCTTGTTG  393

seq1  GAGTAGGTATGTCACCGAGGGGGTGGACTTTAAGACTTTGGAAGCCAGTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGGTATGTCACCGAGGGGGTGGACTTTAAGACTTTGGAAGCCAGTC  443

seq1  TTCTCCTAGCAGCCTTCAGATGAAGACATAGAACTCTCAGCTCCTCCTGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTAGCAGCCTTCAGATGAAGACATAGAACTCTCAGCTCCTCCTGC  493

seq1  ACCATGCCTGCCTGGATGCTGCCATGTTCCCACCTTTATAGTAATGGACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCCTGCCTGGATGCTGCCATGTTCCCACCTTTATAGTAATGGACT  543

seq1  GAACCTCTGAACCTGCGAGCCAGCCCCAAGTAAACCTTGTCCTTCATAGG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCTGAACCTGCGAGCCAGCCCCAAGTAAACCTTGTCCTTCATAGG  593

seq1  AGCTGCCTTGATCATGGTGTCTGCTCACAGCAATGCAAACCCTTCCCTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCCTTGATCATGGTGTCTGCTCACAGCAATGCAAACCCTTCCCTGC  643

seq1  ACGGGGGACTATTCTCTTAGGAACTGTGAGTCAGAGTTCATGCTTCTCCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGGGACTATTCTCTTAGGAACTGTGAGTCAGAGTTCATGCTTCTCCC  693

seq1  TCACATTGCTCTGTCAGGGCATCTTATTTCAGCAATGAGAAAGAAACTAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTGCTCTGTCAGGGCATCTTATTTCAGCAATGAGAAAGAAACTAA  743

seq1  GGCAGCTTCTTGTTTAACTTCTGAGGAAACCCTGCTCATCAGCATATTCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTTCTTGTTTAACTTCTGAGGAAACCCTGCTCATCAGCATATTCC  793

seq1  CAACTGCATCCTGTAGACTATCTGGGAATCAGGCTACATCCTCCACAAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGCATCCTGTAGACTATCTGGGAATCAGGCTACATCCTCCACAAGA  843

seq1  CTGTGTTAGGATCTCTCAAGTCTTATCTCTGATTAGAAATCGGTCCCAAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTAGGATCTCTCAAGTCTTATCTCTGATTAGAAATCGGTCCCAAT  893

seq1  TCCATTAGATATACTTTTAAGAAATTAGGATAATCACTCTTAATTACTTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTAGATATACTTTTAAGAAATTAGGATAATCACTCTTAATTACTTC  943

seq1  ACCTACTATAACTTACTATAATTAAAGCTTTTCTTTTATTAAACTAGTTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACTATAACTTACTATAATTAAAGCTTTTCTTTTATTAAACTAGTTA  993

seq1  AACTCTCGACTGTAACAATGAATAATCCCCACCCACTACAGCAGTTCACT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCGACTGTAACAATGAATAATCCCCACCCACTACAGCAGTTCACT  1043

seq1  ATGCTTTCTCACTGCAATCTTACAGACCCAGGCTGTCTAAATGGGGCTCT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTCTCACTGCAATCTTACAGACCCAGGCTGTCTAAATGGGGCTCT  1093

seq1  CTTTTTAAGAGATTTGAAAAAGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAAGAGATTTGAAAAAGAATTC  1120

seq1: chr8_127793486_127794129
seq2: B6Ng01-205E15.g_68_711

seq1  GAATTCCTCCCCACAGGTGAGCAGAGCCCAAGCAAAGTTAGATTCGGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCCCACAGGTGAGCAGAGCCCAAGCAAAGTTAGATTCGGGAA  50

seq1  GATCTTAGCATCTCAGTGAATCACACAGCACCCACAGCAAAGCCTGAGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTAGCATCTCAGTGAATCACACAGCACCCACAGCAAAGCCTGAGTA  100

seq1  TAGAGAGGGGCTGCCTTCAGACCTAAGGCGAAGGCTTTTCAGTTTGATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGGGGCTGCCTTCAGACCTAAGGCGAAGGCTTTTCAGTTTGATAG  150

seq1  GCATCCCTTGGGCTCCTATGAAGTGTTGAGTGCTGGAGTTACAGGAATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCCTTGGGCTCCTATGAAGTGTTGAGTGCTGGAGTTACAGGAATAC  200

seq1  AAATGCCGACAGAGCCACGGCAATTACAGCTGTGTGCATGGTCTCTGTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCCGACAGAGCCACGGCAATTACAGCTGTGTGCATGGTCTCTGTGC  250

seq1  TCTCCACTCTGGACTTTCAACTGCTTCAGATAAAGAGACATGGCTCTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCACTCTGGACTTTCAACTGCTTCAGATAAAGAGACATGGCTCTGTG  300

seq1  CTACAAGACCCTGTCCTGTACTTTATTGATTATCCTTCATCTGAACTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAAGACCCTGTCCTGTACTTTATTGATTATCCTTCATCTGAACTGGA  350

seq1  TTTAGGTGTGCTCAGGAGAAACACCTGTGTTGTGTGTCGGAGAGTGTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGTGTGCTCAGGAGAAACACCTGTGTTGTGTGTCGGAGAGTGTTTC  400

seq1  CAGAGAGGTTTAACTGGAATAGGGAGACGAGTCTGGGGGGCCTGGCCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGGTTTAACTGGAATAGGGAGACGAGTCTGGGGGGCCTGGCCTGA  450

seq1  ATGAAAAGGGAGAAAAGAAGAAAGTGAGCTGATCATCTCTCTCTCTCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAAGGGAGAAAAGAAGAAAGTGAGCTGATCATCTCTCTCTCTCTCT  500

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCCTGACTATATAAATACAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCCTGACTATATAAATACAAC  550

seq1  AGGACAGCCACCAGGCACCCCTTTGCACTACTAACGAGGGCTGTGGATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGCCACCAGGCACCCCTTTGCACTACTAACGAGGGCTGTGGATCT  600

seq1  AAATTTCAAGAATAGTTCCTATGGCAGGGGTTGGGGGGGTGGGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCAAGAATAGTTCCTATGGCAGGGGTTGGGGGGGTGGGG  644