BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205L10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 36,029,662 - 36,140,222
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666792
Upstream geneRbpms, LOC100042769, Dctn6, LOC100042777, Mboat4, Leprotl1, LOC666694, Tmem66, LOC619780, LOC666718, EG234159, LOC666746, Dusp4, LOC675578, Tnks
Downstream geneLOC666797, LOC666804, Ppp1r3b, Thex1, Mfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23, LOC671641
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205L10.bB6Ng01-205L10.g
ACCGA025321GA025322
length264492
definitionB6Ng01-205L10.b B6Ng01-205L10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,139,959 - 36,140,222)(36,029,662 - 36,030,159)
sequence
agtcattttctaggatggagacacacatgcaatgtacacacatatgcaca
catgcatacatatacatgcacatacacacatatatacgcacatgtataca
ggtgtgcataccttcacacacatacacacacacacacaaacacatgtata
gacacatgcatgcatgcacacatccatgcacatacatatacacgcactta
tacacacacagactctcttctgaacctgtcagttaactgcttctcctcct
cctcctcctcctcc
cttaagattaacaaacctcaggacatacagaacataacaggggatgtgac
cagcatgacccttctctgagtcaaactatttttctatgtcaaaggctggt
aggcatattacagcaacaatatgaaatagctggcaagcatggaacaaaat
ggccgcaactatgctagtgggtcaggaggacacaccgcttggtttgtctc
ttcagagttaaatctgactaaggatgctctgagaggcatgcaagactcac
tggcattgggagtatgcaaacctaactagacagagaataagaagggacag
gaatgagcaatgggggagcggggtgggggagggggagcaccagacgagaa
tctcggagactgagcagaccacatgacatgagagacgtggccgtactctg
gaatgactgacttctttcttctgctttgctagcgcatagacaacaggtaa
agcaagtctttaaaatgttaatcctgtcctctcagattacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_36139959_36140222
seq2: B6Ng01-205L10.b_52_315 (reverse)

seq1  GGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGCAGTTAACTGACAGGTTCAGAAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGCAGTTAACTGACAGGTTCAGAAGAG  50

seq1  AGTCTGTGTGTGTATAAGTGCGTGTATATGTATGTGCATGGATGTGTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTGTGTGTATAAGTGCGTGTATATGTATGTGCATGGATGTGTGCA  100

seq1  TGCATGCATGTGTCTATACATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCATGTGTCTATACATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTG  150

seq1  AAGGTATGCACACCTGTATACATGTGCGTATATATGTGTGTATGTGCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATGCACACCTGTATACATGTGCGTATATATGTGTGTATGTGCATG  200

seq1  TATATGTATGCATGTGTGCATATGTGTGTACATTGCATGTGTGTCTCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTATGCATGTGTGCATATGTGTGTACATTGCATGTGTGTCTCCAT  250

seq1  CCTAGAAAATGACT  264
      ||||||||||||||
seq2  CCTAGAAAATGACT  264

seq1: chr8_36029662_36030159
seq2: B6Ng01-205L10.g_66_563

seq1  GAATTCCTTAAGATTAACAAACCTCAGGACATACAGAACATAACAGGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAAGATTAACAAACCTCAGGACATACAGAACATAACAGGGGA  50

seq1  TGTGACCAGCATGACCCTTCTCTGAGTCAAACTATTTTTCTATGTCAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACCAGCATGACCCTTCTCTGAGTCAAACTATTTTTCTATGTCAAAG  100

seq1  GCTGGTAGGCATATTACAGCAACAATATGAAATAGCTGGCAAGCATGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTAGGCATATTACAGCAACAATATGAAATAGCTGGCAAGCATGGAA  150

seq1  CAAAATGGCCGCAACTATGCTAGTGGGTCAGGAGGACACACCGCTTGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGGCCGCAACTATGCTAGTGGGTCAGGAGGACACACCGCTTGGTT  200

seq1  TGTCTCTTCAGAGTTAAATCTGACTAAGGATGCTCTGAGAGGCATGCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTTCAGAGTTAAATCTGACTAAGGATGCTCTGAGAGGCATGCAAG  250

seq1  ACTCACTGGCATTGGGAGTATGCAAACCTAACTAGACAGAGAATAAGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTGGCATTGGGAGTATGCAAACCTAACTAGACAGAGAATAAGAAG  300

seq1  GGACAGGAATGAGCAATGGGGGAGCGGGGTGGGGGAGGGGGAGCACCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGGAATGAGCAATGGGGGAGCGGGGTGGGGGAGGGGGAGCACCAGA  350

seq1  CGAGAATCTCGGAGACTGAGCAGACCACATGACATGAGAGACGTGGCCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGAATCTCGGAGACTGAGCAGACCACATGACATGAGAGACGTGGCCGT  400

seq1  ACTCTGGAATGACTGACTTCTTTCTTCTGCTTTGCTAGCGCAGAGACAAC  450
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACTCTGGAATGACTGACTTCTTTCTTCTGCTTTGCTAGCGCATAGACAAC  450

seq1  AGGTAAAGCAAGTCTCTAAAATGTTAATCCTGTCCTCTCAGATTACAG  498
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAAGCAAGTCTTTAAAATGTTAATCCTGTCCTCTCAGATTACAG  498