BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213F11
Chromosome8 (Build37)
Map Location 67,138,848 - 67,272,967
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCpe, Sc4mol, Klhl2
Upstream geneLOC384831, EG244495, Tll1, LOC100040989
Downstream geneLOC100040903, LOC619647, 3110005G23Rik, Trim75, Trim60, LOC665388, LOC665396, LOC100040949, LOC665405, Vaultrc-ps1, LOC100040967, March1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213F11.bB6Ng01-213F11.g
ACCGA030896GA030897
length1,181115
definitionB6Ng01-213F11.b B6Ng01-213F11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,138,848 - 67,140,018)(67,272,853 - 67,272,967)
sequence
gaattcagtgatttagtagaacaaaaacaaaaacaaaaaaccaagggctg
gaaagatggctcagtggttaagagtgcttgctgctcttgtcaaggactgg
ggttcaggtctcctgaacccatatagtgtggctcatattcacctgtaact
ccagcacggagagatcttaatatccacttctgacctccatgggtagcatg
catgaatgtggtatacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acagaggcaaaactctcatacacataaaataaaatacataaatctaaaaa
aatcatttaaaaatacagaggaggtattaaatttctaataaagaaggaac
tgaagtccttcatgtgtgtgcatgatgatatatgtgagtctatgtgtttg
acctgtgcgcacatacatacatagaggccagaggtcaacatcagttatct
tccaaagttgctccctctcacttatctggagcttgctcatccagatagac
tggctggctggcagctccaggatccagctgtctctatccctggtcctaaa
tgcataccattatgcccaacttctgcatggaagctggagatcagaacctg
tgtggaaaatactttattaatggagccatctccccagtcaaagccagggc
acttttaaactggaaaaatgaggaagtttcccaattatgctgagagaatc
tacttaattaagtaccttgcctacacagatttatttgtgttcccaccaaa
agagaaggcatagtgaaaaacattttactgccaataaatatttgtgaagg
ggatgaaaaaaaatgcctttcagttcaatttgttagttttataaaattaa
ttagtccctctgagcactgtttcttatctataatggaaatgtaattcttc
gggtttttgtttttgttttttaagctgtaatctcttcacccacagaaata
gctcaacaataaggtggccctttctccaagtcaaatgtcactttataata
tcatagaagtcaccctttaactttatcgcaagtaatttcatgtgacacct
tttgatattctaaacaacttcattaggtaggaagagaacaaaggaaaaaa
acagatatgtttcaaattcttgataggcaaacagcagcacactctgctag
aacactgatcctccaccttacaccctaatca
ctatgctttagataatctatctgtttgattctggaatctggattgtgaaa
acctgaatacatcactaacatgtatttatgatgttagtggtctggggtgt
gtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_67138848_67140018
seq2: B6Ng01-213F11.b_46_1226

seq1  GAATTCAGTGATTTAGTAGAACAAAAACAAAAACAAAAAACCAAGGGCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGATTTAGTAGAACAAAAACAAAAACAAAAAACCAAGGGCTG  50

seq1  GAAAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGTGCTTGCTGCTCTTGTCAAGGACTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGTGCTTGCTGCTCTTGTCAAGGACTGG  100

seq1  GGTTCAGGTCTCCTGAACCCATATAGTGTGGCTCATATTCACCTGTAACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAGGTCTCCTGAACCCATATAGTGTGGCTCATATTCACCTGTAACT  150

seq1  CCAGCACGGAGAGATCTTAATATCCACTTCTGACCTCCATGGGTAGCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACGGAGAGATCTTAATATCCACTTCTGACCTCCATGGGTAGCATG  200

seq1  CATGAATGTGGTATACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATGTGGTATACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  250

seq1  ACAGAGGCAAAACTCTCATACACATAAAATAAAATACATAAATCTAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGCAAAACTCTCATACACATAAAATAAAATACATAAATCTAAAAA  300

seq1  AATCATTTAAAAATACAGAGGAGGTATTAAATTTCTAATAAAGAAGGAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATTTAAAAATACAGAGGAGGTATTAAATTTCTAATAAAGAAGGAAC  350

seq1  TGAAGTCCTTCATGTGTGTGCATGATGATATATGTGAGTCTATGTGTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTCCTTCATGTGTGTGCATGATGATATATGTGAGTCTATGTGTTTG  400

seq1  ACCTGTGCGCACATACATACATAGAGGCCAGAGGTCAACATCAGTTATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGCGCACATACATACATAGAGGCCAGAGGTCAACATCAGTTATCT  450

seq1  TCCAAAGTTGCTCCCTCTCACTTATCTGGAGCTTGCTCATCCAGATAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGTTGCTCCCTCTCACTTATCTGGAGCTTGCTCATCCAGATAGAC  500

seq1  TGGCTGGCTGGCAGCTCCAGGATCCAGCTGTCTCTATCCCTGGTCCTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGCTGGCAGCTCCAGGATCCAGCTGTCTCTATCCCTGGTCCTAAA  550

seq1  TGCATACCATTATGCCCAACTTCTGCATGGAAGCTGGAGATCAGAACCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACCATTATGCCCAACTTCTGCATGGAAGCTGGAGATCAGAACCTG  600

seq1  TGTGGAAAATACTTTATTAATGGAGCCATCTCCCCAGTCAAAGCCAGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAAATACTTTATTAATGGAGCCATCTCCCCAGTCAAAGCCAGGGC  650

seq1  ACTTTTAAACTGGAAAAATGAGGAAGTTTCCCAATTATGCTGAGAGAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTAAACTGGAAAAATGAGGAAGTTTCCCAATTATGCTGAGAGAATC  700

seq1  TACTTAATTAAGTACCTTGCCTACACAGATTTATTTGTGTTCCCACCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAATTAAGTACCTTGCCTACACAGATTTATTTGTGTTCCCACCAAA  750

seq1  AGAGAAGGCATAGTGAAAAACATTTTACTGCCAATAAATATTTGTGAAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGGCATAGTGAAAAACATTTTACTGCCAATAAATATTTGTGAAGG  800

seq1  GGATGAAAAAAAATGCCTTTCAGTTCAATTTGTTAGTTTTATAAAATTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGAAAAAAAATGCCTTTCAGTTCAATTTGTTAGTTTTATAAAATTAA  850

seq1  TTAGTCCCTCTGAGCACTGTTTCTTATCTATAATGGAAATGTAATTCTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCCCTCTGAGCACTGTTTCTTATCTATAATGGAAATGTAATTCTTC  900

seq1  GGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTAAGCTGTAATCTCTTCACCCACAGAAATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTAAGCTGTAATCTCTTCACCCACAGAAATA  950

seq1  GCTCAACAAT-AGGTGGCCCTTTCTCCAAGTCAAATGTCACTTTATAATA  999
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAACAATAAGGTGGCCCTTTCTCCAAGTCAAATGTCACTTTATAATA  1000

seq1  TCATAGAAGTCACCC-TTAAC-TTATCGCAAGTAATTTCATGTGACACC-  1046
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCATAGAAGTCACCCTTTAACTTTATCGCAAGTAATTTCATGTGACACCT  1050

seq1  TTTGATA-TCTAAACAAC-TCATTAGGGAAGGAAGAGAACAAAGG-AAAA  1093
      ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||
seq2  TTTGATATTCTAAACAACTTCATTA-GGTAGGAAGAGAACAAAGGAAAAA  1099

seq1  AACAGATA-GTTTCCAAATCTTGATAAGC-AACAGCAGCACACTCTGCTA  1141
      |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||
seq2  AACAGATATGTTTCAAATTCTTGATAGGCAAACAGCAGCACACTCTGCTA  1149

seq1  G-ACACTGATTCTCCACC-TACACCCTAATCA  1171
      | |||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  GAACACTGATCCTCCACCTTACACCCTAATCA  1181

seq1: chr8_67272853_67272967
seq2: B6Ng01-213F11.g_72_186 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACCCCAGACCACTAACATCATAAATACATGTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACCCCAGACCACTAACATCATAAATACATGTTA  50

seq1  GTGATGTATTCAGGTTTTCACAATCCAGATTCCAGAATCAAACAGATAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGTATTCAGGTTTTCACAATCCAGATTCCAGAATCAAACAGATAGA  100

seq1  TTATCTAAAGCATAG  115
      |||||||||||||||
seq2  TTATCTAAAGCATAG  115