BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214G20
Chromosome8 (Build37)
Map Location 99,504,422 - 99,652,091
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC333331, LOC546090, LOC636859, EG384885
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214G20.bB6Ng01-214G20.g
ACCGA031679GA031680
length1,1951,169
definitionB6Ng01-214G20.b B6Ng01-214G20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,504,422 - 99,505,632)(99,650,919 - 99,652,091)
sequence
gaattccctactctctcttgaaggaggttgatgtctctcattcccagtgg
cctctttgttgaataaaaatggctcattattttcatggaaaagaatcaag
atggtatttgtaaacattagcattcatatagtggagcagcacacatgaaa
gttttttctaaaatttagtcttaaaacttcaatgaaatagtataaaacca
ataacttatgagttaagtactgtttcttagtttcttatgttcagttcttc
tcagtatgagttcagttaatggtcaacatcatagtaaatgttcaaaagac
aatcctgaccttagacttttatcatcaggagcaagcacacttgctctctt
ctttctattccagaaattgggagtttattggatgacaatcagccaatcca
caaagggatggcagttataaacttgttatgactaagtaaatgattaacta
gtcattacttcttccactgaagatgtggaaccaggaaataactctatgca
ttcattcaccaatgttttcagtataatttgttaactctttgatgaattag
ttattaatttgtcaacaattgtttagtagatgcttcatttactgtttgtt
agatgtaatgtaaaataaagacattactctaaacctctaccctttatttt
ttattaattctagacaaggatgaaggcaatagacttttgatacaatttga
tacacagaaattgtgaagcgttgctatgagcaaagactctggcaaaattt
ctcatactaacatgctaattcttgaagaagaattaaaaggcctagctaac
tctgggggcacccttatagagactctcaaacaaggagatagtgttgtccc
aaaggtgagactagtgcaatgttttatcaagcccgtgggtctcaattaat
gatgctttcaagtttctgcgcagagccctgtacatacgcatgctttgttt
gttcttgacttgtagtactgtactaacaaggcttcttaacaattaataca
cccctgctttacaagtctgagtgtttgatttgtgacttttcgaagacttc
agggaaatttaaattgtctcaacactacccagttcacctgccctgactat
gtaaatttgaatataatgatcaatattgaccaaggtccgttgagtcatag
aaatctgaattcgtacaggtgtatagagatgttcaatattaaata
gaattccagttattagagaacatgagaaaaattgttattctgaattctgt
atgaagtatggatggactagttaattttgaaagtggatgcaaaattgtct
tgtgtgtgatactcaagcaaaagatgactaaacattcaccatgagagttt
ctgtatagtgttaatatttccccaccaggtgccataaatttagaggaaat
agaccccagcctcttttttctccccagagcattgaggatcagagtcctat
tgtatttagaccagaagaagccaaaaatagaaatctagtaagagaacttg
gaaaaactaaagcattaacacaggtcaagcttatgagaagttgatccaaa
gagtgtgactccataaagaatcacaaaaatgtcagctttcttttgtttaa
gtctggttggctgtagctgtttgttaatgtctgctctgaaaagaatgcat
atatattacatacacacatttatgattatatctatcttcatatctgccta
tctagctgtctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatc
tatctatctatctatctatctatctatctatctatcccatccttcagctt
gacccagctgaagtcatttcgtcagagagaatgtcaactgggaaaatgtc
tctatcagattggcctgtagctaaatctgtgggccattttcttcatttat
gagtgaggtatgagtgctcagcccattttggatgatgttacctctagaga
ggtggtcctaggttgtatatgccatggaatctgcttcagttccaggccct
ggattttttccacagtagctgccactgtttatttgtttgtttttacttat
tcactttacatcttgttcgctccccactccacatcacccccctctcacaa
tcttttccccattcccctccccttctcctctgagtggttgggagccttcc
tgtaaatcctcatacctggtttacaaagtctctgtgaggctaagtgcatc
ttctcccacaggcctgacaagaatagccaagttagagataggttatattt
ccaacaatataggccatagcggtttggataagcctccctgcctctagtta
ttcaggaccacatgagctacctgcaagctgatacataagcccagtctgga
taattgcaggtccagttag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_99504422_99505632
seq2: B6Ng01-214G20.b_51_1245

seq1  GAATTCCCTACTCTCTCTTGAAGGAGGTTGATGTCTCTCATTCCCAGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTACTCTCTCTTGAAGGAGGTTGATGTCTCTCATTCCCAGTGG  50

seq1  CCTCTTTGTTGAATAAAAATGGCTCATTATTTTCATGGAAAAGAATCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTTGTTGAATAAAAATGGCTCATTATTTTCATGGAAAAGAATCAAG  100

seq1  ATGGTATTTGTAAACATTAGCATTCATATAGTGGAGCAGCACACATGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTATTTGTAAACATTAGCATTCATATAGTGGAGCAGCACACATGAAA  150

seq1  GTTTTTTCTAAAATTTAGTCTTAAAACTTCAATGAAATAGTATAAAACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTTCTAAAATTTAGTCTTAAAACTTCAATGAAATAGTATAAAACCA  200

seq1  ATAACTTATGAGTTAAGTACTGTTTCTTAGTTTCTTATGTTCAGTTCTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTTATGAGTTAAGTACTGTTTCTTAGTTTCTTATGTTCAGTTCTTC  250

seq1  TCAGTATGAGTTCAGTTAATGGTCAACATCATAGTAAATGTTCAAAAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTATGAGTTCAGTTAATGGTCAACATCATAGTAAATGTTCAAAAGAC  300

seq1  AATCCTGACCTTAGACTTTTATCATCAGGAGCAAGCACACTTGCTCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTGACCTTAGACTTTTATCATCAGGAGCAAGCACACTTGCTCTCTT  350

seq1  CTTTCTATTCCAGAAATTGGGAGTTTATTGGATGACAATCAGCCAATCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTATTCCAGAAATTGGGAGTTTATTGGATGACAATCAGCCAATCCA  400

seq1  CAAAGGGATGGCAGTTATAAACTTGTTATGACTAAGTAAATGATTAACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGGATGGCAGTTATAAACTTGTTATGACTAAGTAAATGATTAACTA  450

seq1  GTCATTACTTCTTCCACTGAAGATGTGGAACCAGGAAATAACTCTATGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTACTTCTTCCACTGAAGATGTGGAACCAGGAAATAACTCTATGCA  500

seq1  TTCATTCACCAATGTTTTCAGTATAATTTGTTAACTCTTTGATGAATTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCACCAATGTTTTCAGTATAATTTGTTAACTCTTTGATGAATTAG  550

seq1  TTATTAATTTGTCAACAATTGTTTAGTAGATGCTTCATTTACTGTTTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAATTTGTCAACAATTGTTTAGTAGATGCTTCATTTACTGTTTGTT  600

seq1  AGATGTAATGTAAAATAAAGACATTACTCTAAACCTCTACCCTTTATTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTAATGTAAAATAAAGACATTACTCTAAACCTCTACCCTTTATTTT  650

seq1  TTATTAATTCTAGACAAGGATGAAGGCAATAGACTTTTGATACAATTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAATTCTAGACAAGGATGAAGGCAATAGACTTTTGATACAATTTGA  700

seq1  TACACAGAAATTGTGAAGCGTTGCTATGAGCAAAGACTCTGGCAAAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGAAATTGTGAAGCGTTGCTATGAGCAAAGACTCTGGCAAAATTT  750

seq1  CTCATACTAACATGCTAATTCTTGAAGAAGAATTAAAAGGCCTAGCTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATACTAACATGCTAATTCTTGAAGAAGAATTAAAAGGCCTAGCTAAC  800

seq1  TCTGGGGGCACCCTTATAGAGACTCTCAAACAAGGAGATAGTGTTGTCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGGCACCCTTATAGAGACTCTCAAACAAGGAGATAGTGTTGTCCC  850

seq1  AAAGGTGAGACTAGTGCAATGTTTTATCAAGCCCGTGGGTCTCAATTAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTGAGACTAGTGCAATGTTTTATCAAGCCCGTGGGTCTCAATTAAT  900

seq1  GATGCTTTCAAGTTTCTGCGCAGAGCCCTGTACATACGCATGCTTTGTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTTCAAGTTTCTGCGCAGAGCCCTGTACATACGCATGCTTTGTTT  950

seq1  GTTCTTTGACTTGTAGTACTGTACTAACAAGGCTTCTTAACAATTAATTA  1000
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GTTC-TTGACTTGTAGTACTGTACTAACAAGGCTTCTTAACAATTAA-TA  998

seq1  CACCCCTGCTTTACAAGTCTGAGTGTTTTGATTTGTGAACTTTTCGAAGA  1050
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| 
seq2  CACCCCTGCTTTACAAGTCTGAGTG-TTTGATTTGTG-ACTTTTCGAAG-  1045

seq1  ACTTCAGGGAAATTTAAATTGTCCTCCAACAACTACCCAGTTCA-CTGCC  1099
      |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||
seq2  ACTTCAGGGAAATTTAAATTGTC--TCAAC-ACTACCCAGTTCACCTGCC  1092

seq1  CTGAACTATGTAAATTTGATATTAAATGATCAAATATGAACCCAGGGCCC  1149
      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  ||| |||   |
seq2  CTG-ACTATGTAAATTTGA-ATATAATGATC-AATATTGACCAAGG--TC  1137

seq1  CGTGAGGTCAT-GAAATCCTTTGATTTGGGACCAGGTGTATAGAGATGTT  1198
      |||   ||||| ||||||   ||| || | | ||||||||||||||||||
seq2  CGTTGAGTCATAGAAATC---TGAATTCGTA-CAGGTGTATAGAGATGTT  1183

seq1  CAATTATTAAATA  1211
      ||| |||||||||
seq2  CAA-TATTAAATA  1195

seq1: chr8_99650919_99652091
seq2: B6Ng01-214G20.g_63_1231 (reverse)

seq1  CTAACCTGGACCCTTGCAATTATCAGAGACTGGGCTTATGTGTATCAGAC  50
      |||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |
seq2  CTAA-CTGGACC--TGCAATTATC-CAGACTGGGCTTA--TGTATCAG-C  43

seq1  TTGCAGGTTAGCCTTCATGTGGGTCCTGAATAACTAGA-GCAGGGAG--C  97
      ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||   
seq2  TTGCAGG-TAGC--TCATGT-GGTCCTGAATAACTAGAGGCAGGGAGGCT  89

seq1  TATCCCAAACGCTATTGCCTATA-TGT--GGAATATAACTATTCTTCTAA  144
      ||||| || |||||| ||||||| |||  | ||||||||   || |||||
seq2  TATCCAAACCGCTATGGCCTATATTGTTGGAAATATAACCTATC-TCTAA  138

seq1  CTTGGCTA-TCTTGTCAGGCCCTTGTGGGAGAAGATGCACTTAGCCTCAC  193
      |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCTATTCTTGTCAGGCC--TGTGGGAGAAGATGCACTTAGCCTCAC  186

seq1  AGAGACTTTGTAAACCAGGGTATGAGGATTTACAGGAAGGCTCCCAACCA  243
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTTTGTAAACCA-GGTATGAGGATTTACAGGAAGGCTCCCAACCA  235

seq1  CTCAGAGGAGAAGGGGAGGGGAATGGGGAAAAGATTGTGAGAGGGGGGTG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGAGAAGGGGAGGGGAATGGGGAAAAGATTGTGAGAGGGGGGTG  285

seq1  ATGTGGAGTGGGGAGCGAACAAGATGTAAAGTGAATAAGTAAAAACAAAC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGAGTGGGGAGCGAACAAGATGTAAAGTGAATAAGTAAAAACAAAC  335

seq1  AAATAAACAGTGGCAGCTACTGTGGAAAAAATCCAGGGCCTGGAACTGAA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAACAGTGGCAGCTACTGTGGAAAAAATCCAGGGCCTGGAACTGAA  385

seq1  GCAGATTCCATGGCATATACAACCTAGGACCACCTCTCTAGAGGTAACAT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTCCATGGCATATACAACCTAGGACCACCTCTCTAGAGGTAACAT  435

seq1  CATCCAAAATGGGCTGAGCACTCATACCTCACTCATAAATGAAGAAAATG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAAAATGGGCTGAGCACTCATACCTCACTCATAAATGAAGAAAATG  485

seq1  GCCCACAGATTTAGCTACAGGCCAATCTGATAGAGACATTTTCCCAGTTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACAGATTTAGCTACAGGCCAATCTGATAGAGACATTTTCCCAGTTG  535

seq1  ACATTCTCTCTGACGAAATGACTTCAGCTGGGTCAAGCTGAAGGATGG--  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  ACATTCTCTCTGACGAAATGACTTCAGCTGGGTCAAGCTGAAGGATGGGA  585

seq1  --GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  639
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  635

seq1  GATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGCTAGATAGGCAGATATGAAGA  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGCTAGATAGGCAGATATGAAGA  685

seq1  TAGATATAATCATAAATGTGTGTATGTAATATATATGCATTCTTTTCAGA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATAATCATAAATGTGTGTATGTAATATATATGCATTCTTTTCAGA  735

seq1  GCAGACATTAACAAACAGCTACAGCCAACCAGACTTAAACAAAAGAAAGC  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACATTAACAAACAGCTACAGCCAACCAGACTTAAACAAAAGAAAGC  785

seq1  TGACATTTTTGTGATTCTTTATGGAGTCACACTCTTTGGATCAACTTCTC  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATTTTTGTGATTCTTTATGGAGTCACACTCTTTGGATCAACTTCTC  835

seq1  ATAAGCTTGACCTGTGTTAATGCTTTAGTTTTTCCAAGTTCTCTTACTAG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTTGACCTGTGTTAATGCTTTAGTTTTTCCAAGTTCTCTTACTAG  885

seq1  ATTTCTATTTTTGGCTTCTTCTGGTCTAAATACAATAGGACTCTGATCCT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTATTTTTGGCTTCTTCTGGTCTAAATACAATAGGACTCTGATCCT  935

seq1  CAATGCTCTGGGGAGAAAAAAGAGGCTGGGGTCTATTTCCTCTAAATTTA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCTCTGGGGAGAAAAAAGAGGCTGGGGTCTATTTCCTCTAAATTTA  985

seq1  TGGCACCTGGTGGGGAAATATTAACACTATACAGAAACTCTCATGGTGAA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCTGGTGGGGAAATATTAACACTATACAGAAACTCTCATGGTGAA  1035

seq1  TGTTTAGTCATCTTTTGCTTGAGTATCACACACAAGACAATTTTGCATCC  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGTCATCTTTTGCTTGAGTATCACACACAAGACAATTTTGCATCC  1085

seq1  ACTTTCAAAATTAACTAGTCCATCCATACTTCATACAGAATTCAGAATAA  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCAAAATTAACTAGTCCATCCATACTTCATACAGAATTCAGAATAA  1135

seq1  CAATTTTTCTCATGTTCTCTAATAACTGGAATTC  1173
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTTTCTCATGTTCTCTAATAACTGGAATTC  1169