BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-215C12
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,869,461 - 119,006,373
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC384868
Upstream geneWwox, Maf
Downstream geneLOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-215C12.bB6Ng01-215C12.g
ACCGA032207GA032208
length1,0881,223
definitionB6Ng01-215C12.b B6Ng01-215C12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,005,284 - 119,006,373)(118,869,461 - 118,870,683)
sequence
gaattccaacttctgctggtagtgtttaaatattgctttctgcccattaa
gcacccctcctttattacaaagaatctagagacttccttaaaaacacaca
ttatactcattaagcacccctcctttattacaaagaatctagagacttcc
ttaaaaacacacattatactatcagacagataatgggatgggtcattccc
attgttaacaacgagttctgcttgtctcccaatacctgcttgatcagttt
cctttaacacatgcatttccactatcagtgcagtgactggaaaatgtgtc
cctccctctcctgaggccctctgtgactccagaccctctctctctgcccc
tccaaggtaaccacgctggtcagtttgtatgtttgtctagatatactctc
tctgtctgcctgagcctggcttcccttacattttatgcatcctagatttc
atttacccacaatcatatttttttgtatacaggttcatactaatattaat
tatgtgtatgcatatataaactttcaaattgcatactgtgtagaagtacc
ctgttggaaactacaaatctaagttgattatctagagtatttttttctac
aaataatgccactgtatccttgcgtaatgagctttgggtccatagtgacc
actaagaaataaagggacatagtgctggatgcattcagatgggcagagtt
ccagttgttatggggagtgcagacacattcctttccctttcctcctatga
gattacttcttgggtttggtggctcccagcatgctttgcatttcgaggtt
gtttgtgtttgttgaattctctctaatccttcctcactgtcagtgcaccc
agaattagttctgcagctctctttaaggaatgaaaggctccaagagaact
gggcagggactcggtgtgtctctgccacccaatcagcatctggagcaggg
aggttcgatattattcataaaggccaacaatatagatattaaatttgttc
tgtgattattaacttctgactgggaatcataccctccaaatccaatattt
taagataacttttagaatatttattattatatttaata
gaattcttgcaggcgagatactagctcaggcaagaccccagaggttagag
caagccttcaataggtttgatataaaaccaaccatctgcttataatccca
gcactgtggatacagactgatcccaagttcatagccagcctgagcatata
aagagttccagatcagcctcagcaacagaaagagaccttgactcatagca
acagcaaagcagttatctttgtgcaggcttataaactaagtacctgggag
gtagggatgggaagatgaaatgttcgtgtgatccttggttacatagcaag
tttggggccaacctggactccatgagaccctgtctcaaaatatccaatgc
cagaggctggaaagagggccctgcaaatgagagggcctgcattcagatct
ctggcattcatataaaaagaacaggtatagcactggtctcagcctcagga
agccaaccaggcagagccctggagctcactagtctttcagtggagccaat
ggagccaggttcagtgagaaaccctgtctcaggaaataaggtagagtgag
ctcaatggagacaaaaaaaattatatatctggcctccaaatgtgtgtgca
cagatacagatgcattcatacaattaatacacacacacacacacacacat
acacacatgaacacacacacacagagaaggggaaataaacagataaacag
aggccctgtttggaaatcatgtgtatcttagccataagctcctggatgga
gcaggttaaggacacacaagtaagtccttaacaacaagagatttgatctt
tctttactaactgccccttttcaacttccaagaaaggatctagctctgct
gctaggattgggcatatctgcgaatggcatcaagcccaggccattggagc
tttctccaccttggagctggcagaggcatggtggctctcggcaagtaaag
agaagcaggcgtcccctgtgcactccccatcctcatcctcttaaggttgt
taaaagccaaggctaagggaagagacacaatcaatccggtgaaccaaggg
aaccaggctggcccaggtctatgtaagcttcagcacggcacctagatctg
aataagaaggggcctcttgcaaaaccgtcagatctgtccactgccagaag
acagctgggaatgggaaatgcagtgtttgaatcccagctcgtagtccttg
gctcagcagcgcccatagggcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119005284_119006373
seq2: B6Ng01-215C12.b_44_1131 (reverse)

seq1  TAT------TAATAAT-AATATCTTAAAAGTTTATCTTAAAAATTATTTG  43
      |||      ||||||| |||||  |||||| |||||||||||  || |||
seq2  TATTAAATATAATAATAAATATTCTAAAAG-TTATCTTAAAA--TA-TTG  46

seq1  GATTTGGGAGGGTTATGATTCCAGTTCAGAAGTTAATAATCAACAGAACA  93
      ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||| 
seq2  GATTT-GGAGGG-TATGATTCCCAGTCAGAAGTTAATAATC-ACAGAAC-  92

seq1  AAATTTAATATCTATATTGTTGGCCTTTATGAATATTATCGAACCTCCCC  143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
seq2  AAATTTAATATCTATATTGTTGGCCTTTATGAATAATATCGAACCT-CCC  141

seq1  TGCTCCAGATGCTGATTGGGTGGCAGAGACACACCGAGTCCCTGCCCAGT  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCAGATGCTGATTGGGTGGCAGAGACACACCGAGTCCCTGCCCAGT  191

seq1  TCTCTTGGAGCCTTTCATTCCTTAAAGAGAGCTGCAGAACTAATTCTGGG  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTGGAGCCTTTCATTCCTTAAAGAGAGCTGCAGAACTAATTCTGGG  241

seq1  TGCACTGACAGTGAGGAAGGATTAGAGAGAATTCAACAAACACAAACAAC  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGACAGTGAGGAAGGATTAGAGAGAATTCAACAAACACAAACAAC  291

seq1  CTCGAAATGCAAAGCATGCTGGGAGCCACCAAACCCAAGAAGTAATCTCA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGAAATGCAAAGCATGCTGGGAGCCACCAAACCCAAGAAGTAATCTCA  341

seq1  TAGGAGGAAAGGGAAAGGAATGTGTCTGCACTCCCCATAACAACTGGAAC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGGAAAGGGAAAGGAATGTGTCTGCACTCCCCATAACAACTGGAAC  391

seq1  TCTGCCCATCTGAATGCATCCAGCACTATGTCCCTTTATTTCTTAGTGGT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCATCTGAATGCATCCAGCACTATGTCCCTTTATTTCTTAGTGGT  441

seq1  CACTATGGACCCAAAGCTCATTACGCAAGGATACAGTGGCATTATTTGTA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGGACCCAAAGCTCATTACGCAAGGATACAGTGGCATTATTTGTA  491

seq1  GAAAAAAATACTCTAGATAATCAACTTAGATTTGTAGTTTCCAACAGGGT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAAATACTCTAGATAATCAACTTAGATTTGTAGTTTCCAACAGGGT  541

seq1  ACTTCTACACAGTATGCAATTTGAAAGTTTATATATGCATACACATAATT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTACACAGTATGCAATTTGAAAGTTTATATATGCATACACATAATT  591

seq1  AATATTAGTATGAACCTGTATACAAAAAAATATGATTGTGGGTAAATGAA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTAGTATGAACCTGTATACAAAAAAATATGATTGTGGGTAAATGAA  641

seq1  ATCTAGGATGCATAAAATGTAAGGGAAGCCAGGCTCAGGCAGACAGAGAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGGATGCATAAAATGTAAGGGAAGCCAGGCTCAGGCAGACAGAGAG  691

seq1  AGTATATCTAGACAAACATACAAACTGACCAGCGTGGTTACCTTGGAGGG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATATCTAGACAAACATACAAACTGACCAGCGTGGTTACCTTGGAGGG  741

seq1  GCAGAGAGAGAGGGTCTGGAGTCACAGAGGGCCTCAGGAGAGGGAGGGAC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGAGAGAGGGTCTGGAGTCACAGAGGGCCTCAGGAGAGGGAGGGAC  791

seq1  ACATTTTCCAGTCACTGCACTGATAGTGGAAATGCATGTGTTAAAGGAAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTTCCAGTCACTGCACTGATAGTGGAAATGCATGTGTTAAAGGAAA  841

seq1  CTGATCAAGCAGGTATTGGGAGACAAGCAGAACTCGTTGTTAACAATGGG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCAAGCAGGTATTGGGAGACAAGCAGAACTCGTTGTTAACAATGGG  891

seq1  AATGACCCATCCCATTATCTGTCTGATAGTATAATGTGTGTTTTTAAGGA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACCCATCCCATTATCTGTCTGATAGTATAATGTGTGTTTTTAAGGA  941

seq1  AGTCTCTAGATTCTTTGTAATAAAGGAGGGGTGCTTAATGAGTATAATGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTAGATTCTTTGTAATAAAGGAGGGGTGCTTAATGAGTATAATGT  991

seq1  GTGTTTTTAAGGAAGTCTCTAGATTCTTTGTAATAAAGGAGGGGTGCTTA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTTAAGGAAGTCTCTAGATTCTTTGTAATAAAGGAGGGGTGCTTA  1041

seq1  ATGGGCAGAAAGCAATATTTAAACACTACCAGCAGAAGTTGGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCAGAAAGCAATATTTAAACACTACCAGCAGAAGTTGGAATTC  1088

seq1: chr8_118869461_118870683
seq2: B6Ng01-215C12.g_67_1289

seq1  GAATTCTTGCAGGCGAGATACTAGCTCAGGCAAGACCCCAGAGGTTAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGCAGGCGAGATACTAGCTCAGGCAAGACCCCAGAGGTTAGAG  50

seq1  CAAGCCTTCAATAGGTTTGATATAAAACCAACCATCTGCTTATAATCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCTTCAATAGGTTTGATATAAAACCAACCATCTGCTTATAATCCCA  100

seq1  GCACTGTGGATACAGACTGATCCCAAGTTCATAGCCAGCCTGAGCATATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGTGGATACAGACTGATCCCAAGTTCATAGCCAGCCTGAGCATATA  150

seq1  AAGAGTTCCAGATCAGCCTCAGCAACAGAAAGAGACCTTGACTCATAGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTTCCAGATCAGCCTCAGCAACAGAAAGAGACCTTGACTCATAGCA  200

seq1  ACAGCAAAGCAGTTATCTTTGTGCAGGCTTATAAACTAAGTACCTGGGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAAAGCAGTTATCTTTGTGCAGGCTTATAAACTAAGTACCTGGGAG  250

seq1  GTAGGGATGGGAAGATGAAATGTTCGTGTGATCCTTGGTTACATAGCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGATGGGAAGATGAAATGTTCGTGTGATCCTTGGTTACATAGCAAG  300

seq1  TTTGGGGCCAACCTGGACTCCATGAGACCCTGTCTCAAAATATCCAATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGCCAACCTGGACTCCATGAGACCCTGTCTCAAAATATCCAATGC  350

seq1  CAGAGGCTGGAAAGAGGGCCCTGCAAATGAGAGGGCCTGCATTCAGATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCTGGAAAGAGGGCCCTGCAAATGAGAGGGCCTGCATTCAGATCT  400

seq1  CTGGCATTCATATAAAAAGAACAGGTATAGCACTGGTCTCAGCCTCAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCATTCATATAAAAAGAACAGGTATAGCACTGGTCTCAGCCTCAGGA  450

seq1  AGCCAACCAGGCAGAGCCCTGGAGCTCACTAGTCTTTCAGTGGAGCCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAACCAGGCAGAGCCCTGGAGCTCACTAGTCTTTCAGTGGAGCCAAT  500

seq1  GGAGCCAGGTTCAGTGAGAAACCCTGTCTCAGGAAATAAGGTAGAGTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCAGGTTCAGTGAGAAACCCTGTCTCAGGAAATAAGGTAGAGTGAG  550

seq1  CTCAATGGAGACAAAAAAAATTATATATCTGGCCTCCAAATGTGTGTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATGGAGACAAAAAAAATTATATATCTGGCCTCCAAATGTGTGTGCA  600

seq1  CAGATACAGATGCATTCATACAATTAATACACACACACACACACACACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACAGATGCATTCATACAATTAATACACACACACACACACACACAT  650

seq1  ACACACATGAACACACACACACAGAGAAGGGGAAATAAACAGATAAACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATGAACACACACACACAGAGAAGGGGAAATAAACAGATAAACAG  700

seq1  AGGCCCTGTTTGGAAATCATGTGTATCTTAGCCATAAGCTCCTGGATGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCTGTTTGGAAATCATGTGTATCTTAGCCATAAGCTCCTGGATGGA  750

seq1  GCAGGTTAAGGACACACAAGTAAGTCCTTAACAACAAGAGATTTGATCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGTTAAGGACACACAAGTAAGTCCTTAACAACAAGAGATTTGATCTT  800

seq1  TCTTTACTAACTGCCCCTTTTCAACTTCCAAGAAAGGATCTAGCTCTGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACTAACTGCCCCTTTTCAACTTCCAAGAAAGGATCTAGCTCTGCT  850

seq1  GCTAGGATTGGGCATATCTGCGAATGGCATCAAGCCCAGGCCATTGGAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGATTGGGCATATCTGCGAATGGCATCAAGCCCAGGCCATTGGAGC  900

seq1  TTTCTCCACCTTGGAGCTGGCAGAGGCATGGTGGCTCTCGGCAAGTAAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCACCTTGGAGCTGGCAGAGGCATGGTGGCTCTCGGCAAGTAAAG  950

seq1  AGAAGCAGGCGTCCCCTGTGCACTCCCCATCCTCATCCTCTTAAGGTTG-  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGAAGCAGGCGTCCCCTGTGCACTCCCCATCCTCATCCTCTTAAGGTTGT  1000

seq1  TAAAAGCCAAGGCTAAGGGAAGAGACACAAATCAATCCCGGTGGACCAAG  1049
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||
seq2  TAAAAGCCAAGGCTAAGGGAAGAGACAC-AATCAAT-CCGGTGAACCAAG  1048

seq1  GG-ACCAGGCTGGCCCAGGTCTATGTAAAGCTTCAGCACCGGCA-CTAGA  1097
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||
seq2  GGAACCAGGCTGGCCCAGGTCTATGT-AAGCTTCAGCA-CGGCACCTAGA  1096

seq1  TCTGAATAAG-AGGGGGCTC-TGCAGAACGGCCAGAACTGCCCACTGCCA  1145
      |||||||||| ||||| ||| |||| ||| | |||| ||| |||||||| 
seq2  TCTGAATAAGAAGGGGCCTCTTGCAAAACCGTCAGATCTGTCCACTGCC-  1145

seq1  AGAAGACAGCTTTGGGA--TGGAGATGCATGTGTTTGAATCCCAGCTCTG  1193
      ||||||||||  |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||| |
seq2  AGAAGACAGC--TGGGAATGGGAAATGCA-GTGTTTGAATCCCAGCTC-G  1191

seq1  TAGTTCCCTGGCTCAGACG---CCATAGGGCAG  1223
      ||| ||| ||||||||  |   |||||||||||
seq2  TAG-TCCTTGGCTCAGCAGCGCCCATAGGGCAG  1223