BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-225E10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 113,341,239 - 113,508,071
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSf3b3, Cog4, Fuk, St3gal2, Ddx19a
Upstream geneAp1g1, Phlppl, Marveld3, LOC100041884, Tat, Chst4, Zfp612, Gm1467, Calb2, BC025546, Hydin, LOC672398, Vac14, BC060632, 2010004A03Rik
Downstream geneDdx19b, Aars, Exosc6, Mrcl, 4930402E16Rik, 9430091E24Rik, Glg1, Rfwd3, LOC547023, Mlkl, Fa2h, Wdr59, Znrf1, Ldhd, Zfp1, Ctrb1, Bcar1, Cfdp1, Tmem170, Chst5, 4932417I16Rik, Gabarapl2, Adat1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-225E10.bB6Ng01-225E10.g
ACCGA039513GA039514
length7911,104
definitionB6Ng01-225E10.b B6Ng01-225E10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(113,507,282 - 113,508,071)(113,341,239 - 113,342,340)
sequence
gaattcatacacatagataaaaataaatcttcttaaaaaatagtttgagt
cgggcagtggtggcacatgcctttaatcccaacatttggagggcagaggc
aggcagatttctggtctacagagtgagttccaggacaaccagggctatac
agagaaatcctgtctcaaaaaacaaacaaaccatagttggaggtggtgag
gtggttaattgggtaaaggcacttgccaccaagcccaataagctgagttc
aaaccctagtaccttcatagtgaagggagaacgctgacctgtgcaagttg
ccctctgacctccacctgtacacccatggcacatgctcacatacagacat
acatagagaataaccaaatgtgaattttagaatagtagtttgactgagat
gagcatcatacctaggtagatatatctagggaaggtgataagtctctaaa
aacattttaattgctggaaagccatcttatctctacccttccccctagga
aacctcagcttctccaaggagtctacgccatgggcttcaatcgaccgtcc
aagatccaggagaatgctctgcccatgatgcttgctgaaccgtgagtacc
gacccggctgcacctcttcacaggtggcttagctaagtgtttcacaaatg
actgtcattgttgctgggcacaaaatgggctgtctgggacatcctgcttc
ctcaaaaaagagcttcatatgtgcaaagagaattcatggggtattttgaa
catacttctgtggggagaggaacgttgagacagggttcttg
gaattccagcccttggaaagctgggaatagcaggatcattaagagttcct
ggcaagccagggttatggtctgagaccctatctccaaagcagtgtgtatg
tgacatggagaagagaattagaggtggtttctaaatttaaacttttctaa
acaacttcacaggcaggcgttttgaaattgcccctctggaggtcagagta
attacctcagccatctgctgctttctctgagcttttgtggcctcagtgta
ggcattgtgatccgtctcaatgatgataaggttgttactctcagggtgga
tgacaaacttcctgggtgtgtactgcaatgggaaggctacttgattgaag
acagcaccaagcttctctaaagccaaaatcctatggtaataggcaagaga
gttaaaggtgttggctcactcagctcagctgatgaaatgaagctgcttat
gccctaaggcaacacgataacaactgtgtacgattaaacgaccaccgtac
acgacaaggagatacacgcagatttccccttcagcaacacataccctgca
attgtgttttcaccactgaaacacactgaactagaaccttgcactgacat
tgtcaaacccttactattgcatagttaatgtaataacatgacgttcaggg
gacacggagaaggttcagttggtaaagtatttgtatggaaccatgatgac
ctgaattatgaaccctaaaacccacttaaaaggcagggcacagcagtacc
ccgtaatccctatgctaaggaaaaagagacaggaggttctctggggtttg
atagcagtcagttttgctagtttgcaaactactttcagtgagagatcctg
ccccaaaaaatagtcgactgtttatctctccagttggctttgtgaacctg
ggagaatggggtctaaaaacgaggacaaactctcatgtgacagccaactt
ttattcagaacatcagaacaatttatactctgaaggttaagaagaggtca
cacggagtaaggtattcattccaaggacaacacaaacagcaaaaccatgt
tgtttcaaagaagcacattgagttaacatgactgctcagctcactcctat
ctgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_113507282_113508071
seq2: B6Ng01-225E10.b_46_836 (reverse)

seq1  CAAGAAACCCTGTCTCAACGTTCCTCTCCCCCAAGAAGTATGTTCAAA--  48
      |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  
seq2  CAAG-AACCCTGTCTCAACGTTCCTCTCCCCACAGAAGTATGTTCAAAAT  49

seq1  TCCCCCTG-ATTCTCTTTGCACATTTGAAGCTCTTTTTCTGAGGAAGCAG  97
       |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACCCCATGAATTCTCTTTGCACATATGAAGCTCTTTTT-TGAGGAAGCAG  98

seq1  GATGTCCCAGACAGCCCATTTTGTGCCCAGCAACAATGACAGTCATTTGT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCCCAGACAGCCCATTTTGTGCCCAGCAACAATGACAGTCATTTGT  148

seq1  GAAACACTTAGCTAAGCCACCTGTGAAGAGGTGCAGCCGGGTCGGTACTC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACACTTAGCTAAGCCACCTGTGAAGAGGTGCAGCCGGGTCGGTACTC  198

seq1  ACGGTTCAGCAAGCATCATGGGCAGAGCATTCTCCTGGATCTTGGACGGT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTTCAGCAAGCATCATGGGCAGAGCATTCTCCTGGATCTTGGACGGT  248

seq1  CGATTGAAGCCCATGGCGTAGACTCCTTGGAGAAGCTGAGGTTTCCTAGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATTGAAGCCCATGGCGTAGACTCCTTGGAGAAGCTGAGGTTTCCTAGG  298

seq1  GGGAAGGGTAGAGATAAGATGGCTTTCCAGCAATTAAAATGTTTTTAGAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGGTAGAGATAAGATGGCTTTCCAGCAATTAAAATGTTTTTAGAG  348

seq1  ACTTATCACCTTCCCTAGATATATCTACCTAGGTATGATGCTCATCTCAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATCACCTTCCCTAGATATATCTACCTAGGTATGATGCTCATCTCAG  398

seq1  TCAAACTACTATTCTAAAATTCACATTTGGTTATTCTCTATGTATGTCTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACTACTATTCTAAAATTCACATTTGGTTATTCTCTATGTATGTCTG  448

seq1  TATGTGAGCATGTGCCATGGGTGTACAGGTGGAGGTCAGAGGGCAACTTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAGCATGTGCCATGGGTGTACAGGTGGAGGTCAGAGGGCAACTTG  498

seq1  CACAGGTCAGCGTTCTCCCTTCACTATGAAGGTACTAGGGTTTGAACTCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTCAGCGTTCTCCCTTCACTATGAAGGTACTAGGGTTTGAACTCA  548

seq1  GCTTATTGGGCTTGGTGGCAAGTGCCTTTACCCAATTAACCACCTCACCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATTGGGCTTGGTGGCAAGTGCCTTTACCCAATTAACCACCTCACCA  598

seq1  CCTCCAACTATGGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGGATTTCTCTGTATAGC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAACTATGGTTTGTTTGTTTTTTGAGACAGGATTTCTCTGTATAGC  648

seq1  CCTGGTTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGAAATCTGCCTGCCTCTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGAAATCTGCCTGCCTCTG  698

seq1  CCCTCCAAATGTTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACTGCCCGACTCAAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCAAATGTTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACTGCCCGACTCAAA  748

seq1  CTATTTTTTAAGAAGATTTATTTTTATCTATGTGTATGAATTC  790
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTTTTAAGAAGATTTATTTTTATCTATGTGTATGAATTC  791

seq1: chr8_113341239_113342340
seq2: B6Ng01-225E10.g_64_1167

seq1  GAATTCCAGCCCTTGGAAAGCTGGGAATAGCAGGATCATTAAGAGTTCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCCCTTGGAAAGCTGGGAATAGCAGGATCATTAAGAGTTCCT  50

seq1  GGCAAGCCAGGGTTATGGTCTGAGACCCTATCTCCAAAGCAGTGTGTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGCCAGGGTTATGGTCTGAGACCCTATCTCCAAAGCAGTGTGTATG  100

seq1  TGACATGGAGAAGAGAATTAGAGGTGGTTTCTAAATTTAAACTTTTCTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATGGAGAAGAGAATTAGAGGTGGTTTCTAAATTTAAACTTTTCTAA  150

seq1  ACAACTTCACAGGCAGGCGTTTTGAAATTGCCCCTCTGGAGGTCAGAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTCACAGGCAGGCGTTTTGAAATTGCCCCTCTGGAGGTCAGAGTA  200

seq1  ATTACCTCAGCCATCTGCTGCTTTCTCTGAGCTTTTGTGGCCTCAGTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCTCAGCCATCTGCTGCTTTCTCTGAGCTTTTGTGGCCTCAGTGTA  250

seq1  GGCATTGTGATCCGTCTCAATGATGATAAGGTTGTTACTCTCAGGGTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTGTGATCCGTCTCAATGATGATAAGGTTGTTACTCTCAGGGTGGA  300

seq1  TGACAAACTTCCTGGGTGTGTACTGCAATGGGAAGGCTACTTGATTGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAACTTCCTGGGTGTGTACTGCAATGGGAAGGCTACTTGATTGAAG  350

seq1  ACAGCACCAAGCTTCTCTAAAGCCAAAATCCTATGGTAATAGGCAAGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCACCAAGCTTCTCTAAAGCCAAAATCCTATGGTAATAGGCAAGAGA  400

seq1  GTTAAAGGTGTTGGCTCACTCAGCTCAGCTGATGAAATGAAGCTGCTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAGGTGTTGGCTCACTCAGCTCAGCTGATGAAATGAAGCTGCTTAT  450

seq1  GCCCTAAGGCAACACGATAACAACTGTGTACGATTAAACGACCACCGTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTAAGGCAACACGATAACAACTGTGTACGATTAAACGACCACCGTAC  500

seq1  ACGACAAGGAGATACACGCAGATTTCCCCTTCAGCAACACATACCCTGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACAAGGAGATACACGCAGATTTCCCCTTCAGCAACACATACCCTGCA  550

seq1  ATTGTGTTTTCACCACTGAAACACACTGAACTAGAACCTTGCACTGACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGTTTTCACCACTGAAACACACTGAACTAGAACCTTGCACTGACAT  600

seq1  TGTCAAACCCTTACTATTGCATAGTTAATGTAATAACATGACGTTCAGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAACCCTTACTATTGCATAGTTAATGTAATAACATGACGTTCAGGG  650

seq1  GACACGGAGAAGGTTCAGTTGGTAAAGTATTTGTATGGAACCATGATGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACGGAGAAGGTTCAGTTGGTAAAGTATTTGTATGGAACCATGATGAC  700

seq1  CTGAATTATGAACCCTAAAACCCACTTAAAAGGCAGGGCACAGCAGTACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTATGAACCCTAAAACCCACTTAAAAGGCAGGGCACAGCAGTACC  750

seq1  CCGTAATCCCTATGCTAAGGAAAAAGAGACAGGAGGTTCTCTGGGGTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTAATCCCTATGCTAAGGAAAAAGAGACAGGAGGTTCTCTGGGGTTTG  800

seq1  ATAGCAGTCAGTTTTGCTAGTTTGCAAACTACTTTCAGTGAGAGATCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCAGTCAGTTTTGCTAGTTTGCAAACTACTTTCAGTGAGAGATCCTG  850

seq1  CCCCAAAAAATAGTCGACTGTTTATCTCTCCAGTTGGCTTTGTGAACCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAAAAATAGTCGACTGTTTATCTCTCCAGTTGGCTTTGTGAACCTG  900

seq1  GGAGAATGGGGTCTAAAAACGAGGACAAACTCTCATGTGACAGCCAAC-T  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGAGAATGGGGTCTAAAAACGAGGACAAACTCTCATGTGACAGCCAACTT  950

seq1  TTATTCAGAACATCAG-ACAATTTATACCCTGAAGGTTAAGAAGA-GTCA  997
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  TTATTCAGAACATCAGAACAATTTATACTCTGAAGGTTAAGAAGAGGTCA  1000

seq1  CAC-GAGTAAGGTATTCAATTCCAAGGACAACACAAACAGCAAAAACCAT  1046
      ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CACGGAGTAAGGTATTC-ATTCCAAGGACAACACAAACAGC-AAAACCAT  1048

seq1  GTTGTTTCAAAGAAGCACA-TGAGTTAACAATGACTGCTCAGCTCACTCC  1095
      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTCAAAGAAGCACATTGAGTTAAC-ATGACTGCTCAGCTCACTCC  1097

seq1  TATCTGC  1102
      |||||||
seq2  TATCTGC  1104