BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-229M19
Chromosome8 (Build37)8 (Build37)
Map Location 35,949,102 - 35,949,5449,056,454 - 9,057,567
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap geneTnks
Upstream geneRbpms, LOC100042769, Dctn6, LOC100042777, Mboat4, Leprotl1, LOC666694, Tmem66, LOC619780, LOC666718, EG234159, LOC666746, Dusp4, LOC675578
Downstream geneLOC666792, LOC666797, LOC666804, Ppp1r3b, Thex1, Mfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-229M19.bB6Ng01-229M19.g
ACCGA042834GA042835
length7741,099
definitionB6Ng01-229M19.b B6Ng01-229M19.g
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,949,102 - 35,949,544)(9,056,454 - 9,057,567)
sequence
gaattcaattaataaattaataaggcccctttatttttgtcatgggtagg
gtatgtagaccatgttgtggaagcatttgacagtgactaccagaggttga
atttcacaaacaacatgatttcttatttcacagttaactaggacttcagc
aaacaaagaaagctgggaattgtgttatgtgcaaagatgggaaaggtagg
gggtaacagagccaccacacagggcacaggtgtggctttagtttaagccc
taaatcctgggaacagagggaccggtgtaccaagggcgtcaggtgggcag
gggaggtttgaaatggaggtggtgggagtgtgttttcaagacataatatt
aaattccacattgggggctcagtggttaagagcactggctcctcttccag
aggacctgggttcaattcccagcacccacgctgtagctgacaactgtctg
ttccaggggatctggtaccatcacacaaacacacatgcaggtaaacatca
atgtacataaaacaaaaataaaattttaaaattctacattgtttctcatt
gatctacatataaaataattttttaaagatttattttcatttgtatttgt
gtcatgttagctgtatgagcatatgtacataacatctaggtggtatttgt
ggagaccaaaagagggcatcggtttccctagaactcgagttacaggtgct
tgtgagccaccatgtgggtgctaggaaccaaacccagggtcctgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
gaattcatgaccaatggaactttctgaaatagtgacttgagaaattgtct
taattgggatatgtacagagaagagaggctgggataaggccttgagtata
agtagtcttgtgacaaagctcatcccaggagtaagtcaataggaaggaga
cagaccaataaagcaagctttgcatagtctactttggtgaccatctagtc
tttgagtcctttgcctgccacccccccccccccgtttctctggcatgttg
gtaatggtagttcacactctttggatgccctggatgactagttcacaaga
ctttgggggaaaaaaaaacaagttttttgacaaaattcagagtcacacca
gaccactttggatgacaagctgtatgcaattaggctcagcccatcccatc
tgcttttgagggtccagagacgatgaggtaaaatagtatctatccaatct
tcaggagttgatttttagtgagttgatgctttaggaataaaacgagaggt
atgaagaatgtcgagattgaatggattagtcatgtccaacaggcatcaca
tgatgatcacagaatgatggatctcatagatgtggctagaagcaatctga
agagcgtcagagcctccaacaataagaacaactaagcagattcccgatgg
gcatgtacccacacatggaagatcagggtgtcacttgctgcctcaggaga
tgaagaaggcatgcttgtgtgtttttagatgttcacaaacatcaatttcg
tttcacattcatcacccctagacctgaggtacttcatgttaagttgttga
acatgcgagtctgtgtcatacttgtctggtatatttgcaaacttactgat
ccagttgtcttctctcagacacttccacgggacatctgggatgggaaaca
ccatgattggagatgcacactgtggtgatagagagtgtttctaattctgg
tgcttcagctggagtcagcggccacatggaggtggcagcaaagcagcaac
tagtcaagcaaggctctgctgagcaatacagtaaaaacgtcaaacagttg
acatgggaacgtccgctttctccctgtgtaactttcacaaggattttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_35949102_35949544
seq2: B6Ng01-229M19.b_369_813

seq1  GTGTTTTCAAGACATAATATTAAATTCCACATTGGGGGCTCAGTGGTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTCAAGACATAATATTAAATTCCACATTGGGGGCTCAGTGGTTAA  50

seq1  GAGCACTGGCTCCTCTTCCAGAGGACCTGGGTTCAATTCCCAGCACCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTGGCTCCTCTTCCAGAGGACCTGGGTTCAATTCCCAGCACCCAC  100

seq1  GCTGTAGCTGACAACTGTCTGTTCCAGGGGATCTGGTACCATCACACAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAGCTGACAACTGTCTGTTCCAGGGGATCTGGTACCATCACACAAA  150

seq1  CACACATGCAGGTAAACATCAATGTACATAAAACAAAAATAAAATTTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATGCAGGTAAACATCAATGTACATAAAACAAAAATAAAATTTTAA  200

seq1  AATTCTACATTGTTTCTCATTGATCTACATATAAAATAATTTTTTAAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTACATTGTTTCTCATTGATCTACATATAAAATAATTTTTTAAAGA  250

seq1  TTTA-TTTCATTTGTATTTGTGTCATGTTAGCTGTATGAGCATATGTACA  299
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTCATTTGTATTTGTGTCATGTTAGCTGTATGAGCATATGTACA  300

seq1  TAACATCTAGGTGGTATTTGTGGAGACCAAAAGAGGGCATCGGTTTCCCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCTAGGTGGTATTTGTGGAGACCAAAAGAGGGCATCGGTTTCCCT  350

seq1  AGAACTCGAGTTACAGGTGCTTGTGAGCCACCATGTGGGTGCTAGGAACC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTCGAGTTACAGGTGCTTGTGAGCCACCATGTGGGTGCTAGGAACC  400

seq1  AAACCCA-GGTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  443
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCAGGGTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  445

seq1: chr8_9056454_9057567
seq2: B6Ng01-229M19.g_67_1165

seq1  GAATTCATGACCAATGGAACTTTCTGAAATAGTGACTTGAGAAATTGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGACCAATGGAACTTTCTGAAATAGTGACTTGAGAAATTGTCT  50

seq1  TAGTTGGGATATGTACAGAGAAGAGAGGCTGGGATAAGGCCTTGAGTATA  100
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGGGATATGTACAGAGAAGAGAGGCTGGGATAAGGCCTTGAGTATA  100

seq1  AGTAGTCTTGTGACAAAGCTCATCCCAGGAGTAAGTCAATAGGAAGGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTCTTGTGACAAAGCTCATCCCAGGAGTAAGTCAATAGGAAGGAGA  150

seq1  CAGACCAATAAAGCAAGCTTTGCATAGTCTACTTTGGTGACCATCTAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCAATAAAGCAAGCTTTGCATAGTCTACTTTGGTGACCATCTAGTC  200

seq1  TTTGAGTCCTTTGCCTGCCACCCCCCCCCCCCCGTTTCTCTGGCATGTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGTCCTTTGCCTGCCACCCCCCCCCCCCCGTTTCTCTGGCATGTTG  250

seq1  GTAATGGTAGTTCACACTCTTTGGATGCCCTGGATGACTAGTTCACAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGGTAGTTCACACTCTTTGGATGCCCTGGATGACTAGTTCACAAGA  300

seq1  CTTTGGGGGAAAAAAAAACAAGTTTTTTGACAAAATTCAGAGTCACACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGGGGAAAAAAAAACAAGTTTTTTGACAAAATTCAGAGTCACACCA  350

seq1  GACCACTTTGGATGACAAGCTGTATGCAATTAGGCTCAGCCCATCCCATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACTTTGGATGACAAGCTGTATGCAATTAGGCTCAGCCCATCCCATC  400

seq1  TGCTTTTGAGGGTCCAGAGACGATGAGGTAAAATAGTATCTATCCAATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTGAGGGTCCAGAGACGATGAGGTAAAATAGTATCTATCCAATCT  450

seq1  TCAGGAGTTGATTTTTAGTGAGTTGATGCTTTAGGAATAAAACGAGAGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGTTGATTTTTAGTGAGTTGATGCTTTAGGAATAAAACGAGAGGT  500

seq1  ATGAAGAATGTCGAGATTGAATGGATTAGTCATGTCCAACAGGCATCACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGAATGTCGAGATTGAATGGATTAGTCATGTCCAACAGGCATCACA  550

seq1  TGATGATCACAGAATGATGGATCTCATAGATGTGGCTAGAAGCAATCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATCACAGAATGATGGATCTCATAGATGTGGCTAGAAGCAATCTGA  600

seq1  AGAGCGTCAGAGCCTCCAACAATAAGAACAACTAAGCAGATTCCCGATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCGTCAGAGCCTCCAACAATAAGAACAACTAAGCAGATTCCCGATGG  650

seq1  GCATGTACCCACACATGGAAGATCAGGGTGTCACTTGCTGCCTCAGGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTACCCACACATGGAAGATCAGGGTGTCACTTGCTGCCTCAGGAGA  700

seq1  TGAAGAAGGCATGCTTGTGTGTTTTTAGATGTTCACAAACATCAATTTCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAGGCATGCTTGTGTGTTTTTAGATGTTCACAAACATCAATTTCG  750

seq1  TTTCACATTCATCACCCCTAGACCTGAGGTACTTCATGTTAAGTTGTTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACATTCATCACCCCTAGACCTGAGGTACTTCATGTTAAGTTGTTGA  800

seq1  ACATGCGAGTCTGTGTCATACTTGTCTGGTATATTTGCAAACTTACTGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCGAGTCTGTGTCATACTTGTCTGGTATATTTGCAAACTTACTGAT  850

seq1  CCAGTTGTCTTCTCTCAGACACCTCCACGGGACATCTGGGATGGGAAACA  900
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTGTCTTCTCTCAGACACTTCCACGGGACATCTGGGATGGGAAACA  900

seq1  CCAGGATTGGAAGATGCACACTGTGGTGATAAGAGAAGTGTTTCTAATTC  950
      ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  CCATGATTGG-AGATGCACACTGTGGTGAT-AGAG-AGTGTTTCTAATTC  947

seq1  TGGTGCTTTCAGCTGGAGTCAGCGGCCACATGGAGGTGGCAAGCAAAACA  1000
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | 
seq2  TGGTGC-TTCAGCTGGAGTCAGCGGCCACATGGAGGTGGC-AGCAAAGC-  994

seq1  AGCAACAAGTCAAAGCAAAGGCTCTTGCTGAGAAATACAGTAAAAAACGT  1050
      |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||
seq2  AGCAACTAGTC-AAGC-AAGGCTC-TGCTGAGCAATACAGT-AAAAACGT  1040

seq1  CCAAACAGTAGAACCAT-GGAAGGTTCGCTTTCTCCCTGTGGTAGACTTT  1099
       |||||||| ||  ||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||
seq2  -CAAACAGTTGA--CATGGGAACGTCCGCTTTCTCCCTGT-GTA-ACTTT  1085

seq1  CACCAGGTATTTTAT  1114
      ||| ||| |||||||
seq2  CACAAGG-ATTTTAT  1099