BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-231D02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 41,388,691 - 41,579,963
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2900075B16Rik, Zdhhc2, Cnot7
Upstream geneEG621335, LOC434304, Msr1, EG621431, LOC100039072, LOC666959, EG632166, Fgf20
Downstream geneVps37a, Mtmr7, LOC100039179, Adam24, LOC667019, LOC100039170, LOC436137, Adam25, EG667041, LOC667052, LOC384806, Adam39, LOC384808, EG667077, Slc7a2, Pdgfrl, Mtus1, Fgl1, Pcm1, Asah1, Frg1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-231D02.bB6Ng01-231D02.g
ACCGA043857GA043858
length1,0881,174
definitionB6Ng01-231D02.b B6Ng01-231D02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,388,691 - 41,389,780)(41,578,797 - 41,579,963)
sequence
gaattcttttttatttattctatccagttgcttagataaactattttttt
ttacatccacacttccactgaaggatatatgagtcgcttatagtctgttg
acaattacaagggatgctgctttgaatacacacctatgacttctggagac
ttacgtacttgctcatgttatttcaaggagaaggagaattaattggccac
aggacatgcatatgtcttagcaaaatattgctgacagttttcagaagctc
attagttgttttgatacttgggtattgcagttgtgtgatggatgactagc
agtgaactaggaacctattttctgccagaagacatcctttgatggttatg
aacctttaatcactatcacttctgtggtaatcaacattggaagtatcatg
accacacaactcttataaagggaaacgtttcactggggcttgcttatggt
tcagaggtttagtccattatcatcacggcgggaagcatgaccgtgggcag
gcagacacagtgctgtagaaggagctgagagttctacatccgggtgggca
ggcaacgggtagagagaggggtactgggcctggcttgagcatttgaaacc
tcaaagcccacctccagtgacacacttcttccaacaaggccacacctact
gcaacgaggccacaacccctgatagcaccagtctgaatttatggaggcca
tatttcttcaaaccaccacaacacatgaacaaaagaagagtgactaagat
ggttttgcttgctttggatggaggaggggggctttgctggtagtaagtct
gagtggctattccatattattctttaaataatgtaaaagtccctaccagc
aagtggcaagcaaagatgggaatttttaaggactacaaaggaggagttgg
acaataaagcaccaatagaaaagaccttgaagttgtgaagagtgcattta
aaaaactaagtaggtgtgatggtcatggttagagttctacttgccttgat
gttagaatatatatgcatcactagaatttggttactgctacaaagagaat
acattagacgtagaaggacctgtgaccatcagcccagt
gaattctggcaccagtttgttatccttattttcctttttattgtcttctt
caaggacagtgatgtagtgagagtgttaaggtttactgtctataccatgc
ttaggattttgttaattttagtcagttcacccttgcacctagacttaaga
caacctaagatggtataatgtctcctccccttctcgacattacttctcat
attctgtgaagtttgttatgttaaagaaatgaaaatgtctgccatgtttt
ttatgctcataagttcttattaaaatgaggtaaatgttaacgaaaaatat
ttttgctttttagaacgtgtcctttaggcctgtagttaagggcatcagtc
agtcttatttattaaatatgcagcatagcttctcaaaggaacatcacaga
aagagttagtagcaattacagtgttgagatgtaaactacaggttgtatca
tttgcttaagatgatttttttttctttcaaaattttctttttagatgttc
tttgaagatcacattgatgatgccaaatactgtggtcacttatatggcct
tggttctggctcatcctatgtacagaacggcacagggaatgcatatgaag
aggaagccagcaagcagtcatgacaggaaatagtcttcttatttttattt
tatacgagttacacacatgcttgtatataggttttatcatcccttaaata
ataggcaatacccccccccttttgtagaccttctctgctttcagtaataa
gtatggcctttcttagctatgatcttaataaattaaagtacattcaggtt
aaatctggccttaattttaatacacttcttatcaagcttgtgtgacaagc
tacattactgaataatttgataaactttggcctacttgagcttggttttg
ttttcccttttcctaaattaactagcattgagtgtaatttatttccctct
tccatgccttctcctttctatttctgcagtacttataagtattaaaggat
tgtgggacatcaagtttgcactttagagagtgatttcaatccttctaatt
ttattcaaaaaattgtgatttttcttgctctttagctagaaaaaatacca
atcctaccaccttttaacgatattgcttgttttttgactcaagtcagcag
ttgcattgtgccaattgttcaaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_41388691_41389780
seq2: B6Ng01-231D02.b_44_1131

seq1  GAATTCTTTTTTATTTATTCTATCCAGTTGCTTAGATAAACTATTTTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTTATTTATTCTATCCAGTTGCTTAGATAAACTATTTTTTT  50

seq1  TTACATCCACACTTCCACTGAAGGATATATGAGTCGCTTATAGTCTGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATCCACACTTCCACTGAAGGATATATGAGTCGCTTATAGTCTGTTG  100

seq1  ACAATTACAAGGGATGCTGCTTTGAATACACACCTATGACTTCTGGAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTACAAGGGATGCTGCTTTGAATACACACCTATGACTTCTGGAGAC  150

seq1  TTACGTACTTGCTCATGTTATTTCAAGGAGAAGGAGAATTAATTGGCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGTACTTGCTCATGTTATTTCAAGGAGAAGGAGAATTAATTGGCCAC  200

seq1  AGGACATGCATATGTCTTAGCAAAATATTGCTGACAGTTTTCAGAAGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACATGCATATGTCTTAGCAAAATATTGCTGACAGTTTTCAGAAGCTC  250

seq1  ATTAGTTGTTTTGATACTTGGGTATTGCAGTTGTGTGATGGATGACTAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTTGTTTTGATACTTGGGTATTGCAGTTGTGTGATGGATGACTAGC  300

seq1  AGTGAACTAGGAACCTATTTTCTGCCAGAAGACATCCTTTGATGGTTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAACTAGGAACCTATTTTCTGCCAGAAGACATCCTTTGATGGTTATG  350

seq1  AACCTTTAATCACTATCACTTCTGTGGTAATCAACATTGGAAGTATCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTTAATCACTATCACTTCTGTGGTAATCAACATTGGAAGTATCATG  400

seq1  ACCACACAACTCTTATAAAGGGAAACGTTTCACTGGGGCTTGCTTATGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACACAACTCTTATAAAGGGAAACGTTTCACTGGGGCTTGCTTATGGT  450

seq1  TCAGAGGTTTAGTCCATTATCATCACGGCGGGAAGCATGACCGTGGGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGTTTAGTCCATTATCATCACGGCGGGAAGCATGACCGTGGGCAG  500

seq1  GCAGACACAGTGCTGTAGAAGGAGCTGAGAGTTCTACATCCGGGTGGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACACAGTGCTGTAGAAGGAGCTGAGAGTTCTACATCCGGGTGGGCA  550

seq1  GGCAACGGGTAGAGAGAGGGGTACTGGGCCTGGCTTGAGCATTTGAAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACGGGTAGAGAGAGGGGTACTGGGCCTGGCTTGAGCATTTGAAACC  600

seq1  TCAAAGCCCACCTCCAGTGACACACTTCTTCCAACAAGGCCACACCTACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGCCCACCTCCAGTGACACACTTCTTCCAACAAGGCCACACCTACT  650

seq1  GCAACGAGGCCACAACCCCTGATAGCACCAGTCTGAATTTATGGAGGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACGAGGCCACAACCCCTGATAGCACCAGTCTGAATTTATGGAGGCCA  700

seq1  TATTTCTTCAAACCACCACAACACATGAACAAAAGAAGAGTGACTAAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTTCAAACCACCACAACACATGAACAAAAGAAGAGTGACTAAGAT  750

seq1  GGTTTTGCTTGCTTTGGATGGAGGAGGGGGGCTTTGCTGGTAGTAAGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTGCTTGCTTTGGATGGAGGAGGGGGGCTTTGCTGGTAGTAAGTCT  800

seq1  GAGTGGCTATTCCATATTATTCTTTAAATAATGTAAAAGTCCCTACCAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGCTATTCCATATTATTCTTTAAATAATGTAAAAGTCCCTACCAGC  850

seq1  AAGTGGCAAGCAAAGATGGGAA-TTTTAAGGACTACAAAGGAGGAGTTGG  899
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGCAAGCAAAGATGGGAATTTTTAAGGACTACAAAGGAGGAGTTGG  900

seq1  ACAATAAAGCACCAATAGAAAAGACCTTGAAGTTGTGAAGAGTTCCTTTT  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
seq2  ACAATAAAGCACCAATAGAAAAGACCTTGAAGTTGTGAAGAG-TGCATTT  949

seq1  AAAAAACTAAGTAGGTGTGATGGTCATGGTTAGAGTTCTACTTGCCTTGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACTAAGTAGGTGTGATGGTCATGGTTAGAGTTCTACTTGCCTTGA  999

seq1  TGTTAGAATATTATATGCATCACTAAGAATTTGGTTACTGCTAACAAAGA  1049
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGTTAGAATA-TATATGCATCACT-AGAATTTGGTTACTGCT-ACAAAGA  1046

seq1  G-ATACATAAGACGAAAAAGGACATGTGACCATCAGGCCAGT  1090
      | |||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||||
seq2  GAATACATTAGACGTAGAAGGACCTGTGACCATCAGCCCAGT  1088

seq1: chr8_41578797_41579963
seq2: B6Ng01-231D02.g_69_1242 (reverse)

seq1  TGTTGAACAATTTGCACAATGCACGTGCTGTACTCTGAATGTC-AAAAAC  49
      |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||  ||| ||||||
seq2  TGTTGAACAATTGGCACAATGCAACTGCTG-ACT-TGA--GTCAAAAAAC  46

seq1  AAGCAAATACTGTAAAAAGGTGGTAG--ATGGTTATTTTTCTAGCT-AAG  96
      |||| ||||  || ||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||
seq2  AAGC-AATATCGTTAAAAGGTGGTAGGATTGGTATTTTTTCTAGCTAAAG  95

seq1  AGCAAGAAAAATCACAATTTCT--GATAAAA-TAG-AGGATTGAAATCAC  142
      |||||||||||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||||||||
seq2  AGCAAGAAAAATCACAATTTTTTGAATAAAATTAGAAGGATTGAAATCAC  145

seq1  TCTCTAAAGTGCAAACTTGATGGTCCACAAT-CTTAAATACCTATAAGTA  191
      ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||
seq2  TCTCTAAAGTGCAAACTTGATGTCCCACAATCCTTTAATACTTATAAGTA  195

seq1  CTGCAG-AATAG-AAGGAG-AGGCATGGAAGAGGGAAATAAATTACACTC  238
      |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAAATAGAAAGGAGAAGGCATGGAAGAGGGAAATAAATTACACTC  245

seq1  AATGCTAGTTAATTTAGGAAAAGGGAAAAACAAAACCAAGCTCAAGTAGG  288
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTAGTTAATTTAGGAAAAGGG-AAAACAAAACCAAGCTCAAGTAGG  294

seq1  -CAAAGTTTATCAAATTATTCAGTAATGTAGCTTTGTCACACAAGCTTGA  337
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CCAAAGTTTATCAAATTATTCAGTAATGTAGC-TTGTCACACAAGCTTGA  343

seq1  TAAGAAGTGTATT-AAATTAAGGCCAGATTTAACCTGAATGTACTTTAAT  386
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGTGTATTAAAATTAAGGCCAGATTTAACCTGAATGTACTTTAAT  393

seq1  TTATTAAGATCATAGCTAAGAAAGGCCATACTTATTACTGAAAGCAGAGA  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAAGATCATAGCTAAGAAAGGCCATACTTATTACTGAAAGCAGAGA  443

seq1  AGGTCTACAAAAGGGGGGGGGTATTGCCTATTATTTAAGGGATGATAAAA  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTACAAAAGGGGGGGGGTATTGCCTATTATTTAAGGGATGATAAAA  493

seq1  CCTATATACAAGCATGTGTGTAACTCGTATAAAATAAAAATAAGAAGACT  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATACAAGCATGTGTGTAACTCGTATAAAATAAAAATAAGAAGACT  543

seq1  ATTTCCTGTCATGACTGCTTGCTGGCTTCCTCTTCATATGCATTCCCTGT  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTGTCATGACTGCTTGCTGGCTTCCTCTTCATATGCATTCCCTGT  593

seq1  GCCGTTCTGTACATAGGATGAGCCAGAACCAAGGCCATATAAGTGACCAC  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGTTCTGTACATAGGATGAGCCAGAACCAAGGCCATATAAGTGACCAC  643

seq1  AGTATTTGGCATCATCAATGTGATCTTCAAAGAACATCTAAAAAGAAAAT  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTGGCATCATCAATGTGATCTTCAAAGAACATCTAAAAAGAAAAT  693

seq1  TTTGAAAGAAAAAAAAATCATCTTAAGCAAATGATACAACCTGTAGTTTA  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAAGAAAAAAAAATCATCTTAAGCAAATGATACAACCTGTAGTTTA  743

seq1  CATCTCAACACTGTAATTGCTACTAACTCTTTCTGTGATGTTCCTTTGAG  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAACACTGTAATTGCTACTAACTCTTTCTGTGATGTTCCTTTGAG  793

seq1  AAGCTATGCTGCATATTTAATAAATAAGACTGACTGATGCCCTTAACTAC  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATGCTGCATATTTAATAAATAAGACTGACTGATGCCCTTAACTAC  843

seq1  AGGCCTAAAGGACACGTTCTAAAAAGCAAAAATATTTTTCGTTAACATTT  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTAAAGGACACGTTCTAAAAAGCAAAAATATTTTTCGTTAACATTT  893

seq1  ACCTCATTTTAATAAGAACTTATGAGCATAAAAAACATGGCAGACATTTT  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATTTTAATAAGAACTTATGAGCATAAAAAACATGGCAGACATTTT  943

seq1  CATTTCTTTAACATAACAAACTTCACAGAATATGAGAAGTAATGTCGAGA  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTTTAACATAACAAACTTCACAGAATATGAGAAGTAATGTCGAGA  993

seq1  AGGGGAGGAGACATTATACCATCTTAGGTTGTCTTAAGTCTAGGTGCAAG  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGAGACATTATACCATCTTAGGTTGTCTTAAGTCTAGGTGCAAG  1043

seq1  GGTGAACTGACTAAAATTAACAAAATCCTAAGCATGGTATAGACAGTAAA  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAACTGACTAAAATTAACAAAATCCTAAGCATGGTATAGACAGTAAA  1093

seq1  CCTTAACACTCTCACTACATCACTGTCCTTGAAGAAGACAATAAAAAGGA  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAACACTCTCACTACATCACTGTCCTTGAAGAAGACAATAAAAAGGA  1143

seq1  AAATAAGGATAACAAACTGGTGCCAGAATTC  1167
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGGATAACAAACTGGTGCCAGAATTC  1174