BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-237A08
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,688,565 - 119,834,169
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGan, 4933407C03Rik
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1
Downstream genePlcg2, 4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6, Cdh13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-237A08.bB6Ng01-237A08.g
ACCGA048091GA048092
length1,1471,104
definitionB6Ng01-237A08.b B6Ng01-237A08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,833,011 - 119,834,169)(119,688,565 - 119,689,671)
sequence
gaattctttgctggcatcggagactgccgccaggcacaaagaggtaccca
cacgccactctttaagtgaggtagctttgtctcaacccgctcacctcagc
ttatcctagctcagggtgccaggtttgactaagcacattctagaaaaggc
cctgggatgggagatccccaccctggcacctgctcaggtccctgtagcaa
aatctgatcactctgcagcattccaaggaccaggccagagcagtcaactg
gtaccagaggtcacaggggcttggaaacacgcctctatgaccaggctgtc
ccatttctgagacagggatggccgtgcatttgtctcagagatggacagag
gacagccacttgaaagagccaaggactggaaacacatccatctgcaggaa
gatgtttagataaattcctaagaaggaagagtccctagccacagagaagc
cggcaacaacccgttgttattgtttagactgaaaacggcctgcgacgtgt
gtatacaattctgtcatctgtttaaacaagcatggaaaagaaatagaatt
tgtatgtgttcgcttctgtctactaagactagactatcttgggacaggag
ggccaagaatgtgtgcttctgtcctctatgaggaggggacaggtggctca
gccacaggataagaaaaaggcctgtcctgtgtatttcagttactaaaggg
catactgtgtagacatgaggacctgggtccagatgcccagcgcccacata
acaagccataacatacgtcagcacatgcttgtgttccaaaagcagaagga
gtgggctccagattcaggagagaccctgcctcaaaaaagtaaggtggaga
gaaagatgaagatatccaatcttgacctccagcctatacacaatcatata
taaacatgcatgctcacacacatggacacacacatgcacacaatcaatca
gtcatcaatggaagagactagccccaccgtctggaccaatatctcccagc
agtccccactaccgagcatcccaacccccccccccaaaaaaaaaccctca
acacagagcaaagtactacacagccacccaaccaagattcatcagcttca
tgttaatctccaataagctgtaatttcacatccacttccgtctgtgc
gaattcttgggtttcctcgggttaacgatgctagaaaaagaatacatagg
tgaagtaagatttttttttgcccagtcaatataagacagtttaataagcc
aggcgtggtggcgcacgcctttaatcccagcacttgggaggcagaggcag
gaggatttctgagtttgaggccagcctggtctacaaagtgagttccagga
cagccaggactacacagagaaaccctgtctcgaaaaaaaaaccaaaccaa
aacagaacaaaaagacagtttaataaagccttcttgaaaagatggaagga
aagacagacagacagacagaccgtgagctagcaagctccgagggctgggg
aggtggtgcagtgagtatgagtgtttgctgtgcaagcctgagaacccagc
ttcagattccccagcacccacataaaatctgggtgtggcaacacatgttt
gtaaccctagtgctcgagttagtggaggcaggtggatgcccagagctggc
tggcaagccactctagctgaaatggtgaactacagggtcagtgtaagatg
ctctctttctctcaaaaacaaaaagtccaaggtgaagactaatagaagcc
ctgtaaaggcagagggaggctcgtgcagtgggactctccttcacagaccc
ctacgcaccacacaggtgtgcacagtgtgaacacacactcagttctacag
agccttgttgggcagtgtgcagcctaagtggaagatagacaggctggtgt
ttaaatctctgctgaactaggaagcaccgaggggagccatgttttgtttc
tgtttggagctgcgtgctgatggaggccagctctctactgtgccgtttat
tctggttcttctctacccagaagcattgccctgtcttttaggaacaactt
gaaagaggattcagtgctgacagctgatacaccttggaatatgtatttct
agtcttaatagcattcatcataaacacctgccagtgcctctgaaaaactg
acactgtctgtgctgtgggggcttcaaggtatccgcaactctgttgctca
ttgtttgtcagccacctcctctgtactggacccaacccttgagacatgag
ttag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119833011_119834169
seq2: B6Ng01-237A08.b_49_1195 (reverse)

seq1  GCACAGATTTGGAGTGGAATGTGAAATTTACAAGGCTTAT--GAGATTAA  48
      |||||||   | ||||| |||||||| |||||  ||||||  |||||| |
seq2  GCACAGA-CGGAAGTGG-ATGTGAAA-TTACA--GCTTATTGGAGATT-A  44

seq1  ACATGAAGCCTGAATGGAATTCTTGGTTGGGTGGCTGTGTAGTACTTTGC  98
      |||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAG-CTG-ATG--AATCTTGGTTGGGTGGCTGTGTAGTACTTTGC  90

seq1  TCTGTGTTGAGGGTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGTTGGGGATGCTCGGTA  148
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||
seq2  TCTGTGTTGAGGGTTTTTTTTTGGGGGGGGGGG--TTGGGATGCTCGGTA  138

seq1  GTGGGGGACTGCTGGGAGATATTGGTCCAGACGGTGGGGCTAGTCTCTTC  198
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GT-GGGGACTGCTGGGAGATATTGGTCCAGACGGTGGGGCTAGTCTCTTC  187

seq1  CATTGATGACTGATTGATTGTGTGCATGTGTGTGTCCATGTGTGTGAGCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATGACTGATTGATTGTGTGCATGTGTGTGTCCATGTGTGTGAGCA  237

seq1  TGCATGTTTATATATGATTGTGTATAGGCTGGAGGTCAAGATTGGATATC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTTTATATATGATTGTGTATAGGCTGGAGGTCAAGATTGGATATC  287

seq1  TTCATCTTTCTCTCCACCTTACTTTTTTGAGGCAGGGTCTCTCCCTGAAT  348
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTCATCTTTCTCTCCACCTTACTTTTTTGAGGCAGGGTCTCT-CCTGAAT  336

seq1  CTGGAGCCCACTCCTTCTGCTTTTGGAACACAAGCATGTGCTGACGTATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGCCCACTCCTTCTGCTTTTGGAACACAAGCATGTGCTGACGTATG  386

seq1  TTATGGCTTGTTATGTGGGCGCTGGGCATCTGGACCCAGGTCCTCATGTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGCTTGTTATGTGGGCGCTGGGCATCTGGACCCAGGTCCTCATGTC  436

seq1  TACACAGTATGCCCTTTAGTAACTGAAATACACAGGACAGGCCTTTTTCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGTATGCCCTTTAGTAACTGAAATACACAGGACAGGCCTTTTTCT  486

seq1  TATCCTGTGGCTGAGCCACCTGTCCCCTCCTCATAGAGGACAGAAGCACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTGTGGCTGAGCCACCTGTCCCCTCCTCATAGAGGACAGAAGCACA  536

seq1  CATTCTTGGCCCTCCTGTCCCAAGATAGTCTAGTCTTAGTAGACAGAAGC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTGGCCCTCCTGTCCCAAGATAGTCTAGTCTTAGTAGACAGAAGC  586

seq1  GAACACATACAAATTCTATTTCTTTTCCATGCTTGTTTAAACAGATGACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACATACAAATTCTATTTCTTTTCCATGCTTGTTTAAACAGATGACA  636

seq1  GAATTGTATACACACGTCGCAGGCCGTTTTCAGTCTAAACAATAACAACG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTATACACACGTCGCAGGCCGTTTTCAGTCTAAACAATAACAACG  686

seq1  GGTTGTTGCCGGCTTCTCTGTGGCTAGGGACTCTTCCTTCTTAGGAATTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTTGCCGGCTTCTCTGTGGCTAGGGACTCTTCCTTCTTAGGAATTT  736

seq1  ATCTAAACATCTTCCTGCAGATGGATGTGTTTCCAGTCCTTGGCTCTTTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAACATCTTCCTGCAGATGGATGTGTTTCCAGTCCTTGGCTCTTTC  786

seq1  AAGTGGCTGTCCTCTGTCCATCTCTGAGACAAATGCACGGCCATCCCTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGCTGTCCTCTGTCCATCTCTGAGACAAATGCACGGCCATCCCTGT  836

seq1  CTCAGAAATGGGACAGCCTGGTCATAGAGGCGTGTTTCCAAGCCCCTGTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAAATGGGACAGCCTGGTCATAGAGGCGTGTTTCCAAGCCCCTGTG  886

seq1  ACCTCTGGTACCAGTTGACTGCTCTGGCCTGGTCCTTGGAATGCTGCAGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGGTACCAGTTGACTGCTCTGGCCTGGTCCTTGGAATGCTGCAGA  936

seq1  GTGATCAGATTTTGCTACAGGGACCTGAGCAGGTGCCAGGGTGGGGATCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCAGATTTTGCTACAGGGACCTGAGCAGGTGCCAGGGTGGGGATCT  986

seq1  CCCATCCCAGGGCCTTTTCTAGAATGTGCTTAGTCAAACCTGGCACCCTG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCCCAGGGCCTTTTCTAGAATGTGCTTAGTCAAACCTGGCACCCTG  1036

seq1  AGCTAGGATAAGCTGAGGTGAGCGGGTTGAGACAAAGCTACCTCACTTAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGGATAAGCTGAGGTGAGCGGGTTGAGACAAAGCTACCTCACTTAA  1086

seq1  AGAGTGGCGTGTGGGTACCTCTTTGTGCCTGGCGGCAGTCTCCGATGCCA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGGCGTGTGGGTACCTCTTTGTGCCTGGCGGCAGTCTCCGATGCCA  1136

seq1  GCAAAGAATTC  1159
      |||||||||||
seq2  GCAAAGAATTC  1147

seq1: chr8_119688565_119689671
seq2: B6Ng01-237A08.g_68_1171

seq1  GAATTCTTGGGTTTCCTCGGGTTAACGATGCTAGAAAAAGAATACATAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGGTTTCCTCGGGTTAACGATGCTAGAAAAAGAATACATAGG  50

seq1  TGAAGTAAGATTTTTTTTTGCCCAGTCAATATAAGACAGTTTAATAAGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAAGATTTTTTTTTGCCCAGTCAATATAAGACAGTTTAATAAGCC  100

seq1  AGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAG  150

seq1  GAGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGA  200

seq1  CAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAAACCAAACCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAAACCAAACCAA  250

seq1  AACAGAACAAAAAGACAGTTTAATAAAGCCTTCTTGAAAAGATGGAAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAACAAAAAGACAGTTTAATAAAGCCTTCTTGAAAAGATGGAAGGA  300

seq1  AAGACAGACAGACAGACAGACCGTGAGCTAGCAAGCTCCGAGGGCTGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGACAGACAGACAGACCGTGAGCTAGCAAGCTCCGAGGGCTGGGG  350

seq1  AGGTGGTGCAGTGAGTATGAGTGTTTGCTGTGCAAGCCTGAGAACCCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGTGCAGTGAGTATGAGTGTTTGCTGTGCAAGCCTGAGAACCCAGC  400

seq1  TTCAGATTCCCCAGCACCCACATAAAATCTGGGTGTGGCAACACATGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGATTCCCCAGCACCCACATAAAATCTGGGTGTGGCAACACATGTTT  450

seq1  GTAACCCTAGTGCTCGAGTTAGTGGAGGCAGGTGGATGCCCAGAGCTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCCTAGTGCTCGAGTTAGTGGAGGCAGGTGGATGCCCAGAGCTGGC  500

seq1  TGGCAAGCCACTCTAGCTGAAATGGTGAACTACAGGGTCAGTGTAAGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAGCCACTCTAGCTGAAATGGTGAACTACAGGGTCAGTGTAAGATG  550

seq1  CTCTCTTTCTCTCAAAAACAAAAAGTCCAAGGTGAAGACTAATAGAAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTTCTCTCAAAAACAAAAAGTCCAAGGTGAAGACTAATAGAAGCC  600

seq1  CTGTAAAGGCAGAGGGAGGCTCGTGCAGTGGGACTCTCCTTCACAGACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAAAGGCAGAGGGAGGCTCGTGCAGTGGGACTCTCCTTCACAGACCC  650

seq1  CTACGCACCACACAGGTGTGCACAGTGTGAACACACACTCAGTTCTACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGCACCACACAGGTGTGCACAGTGTGAACACACACTCAGTTCTACAG  700

seq1  AGCCTTGTTGGGCAGTGTGCAGCCTAAGTGGAAGATAGACAGGCTGGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTGTTGGGCAGTGTGCAGCCTAAGTGGAAGATAGACAGGCTGGTGT  750

seq1  TTAAATCTCTGCTGAACTAGGAAGCACCGAGGGGAGCCATGTTTTGTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATCTCTGCTGAACTAGGAAGCACCGAGGGGAGCCATGTTTTGTTTC  800

seq1  TGTTTGGAGCTGCGTGCTGATGGAGGCCAGCTCTCTACTGTGCCGTTTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGAGCTGCGTGCTGATGGAGGCCAGCTCTCTACTGTGCCGTTTAT  850

seq1  TCTGGTTCTTCTCTACCCAGAAGCATTGCCCTGTCTTTTAGGAACAACTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTCTTCTCTACCCAGAAGCATTGCCCTGTCTTTTAGGAACAACTT  900

seq1  GAAAGAGGATTCAGTGCTGACAAGCTGATACACCTTGGAATATGTATTTC  950
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGGATTCAGTGCTGAC-AGCTGATACACCTTGGAATATGTATTTC  949

seq1  TAGTCTTAATAGCATTCATCATAAACACCTGCCAGTGCCTCTGAAAAACT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTTAATAGCATTCATCATAAACACCTGCCAGTGCCTCTGAAAAACT  999

seq1  GAACACTGTCTGTGCTGTGGGG--CTCAAGGTATCCGCAAACTTCTGTTG  1048
      | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   |||||||
seq2  G-ACACTGTCTGTGCTGTGGGGGCTTCAAGGTATCCGCAA--CTCTGTTG  1046

seq1  CTCAATTGTTTGTCAGCCAC--TCTCTGTACTGGACCCCAACCTTGAGGA  1096
      ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||| ||
seq2  CTC-ATTGTTTGTCAGCCACCTCCTCTGTACTGGACCCAACCCTTGA-GA  1094

seq1  CATGAGGTTAG  1107
      ||||| |||||
seq2  CATGA-GTTAG  1104