BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-240K20
Chromosome8 (Build37)
Map Location 92,696,498 - 92,843,939
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTox3
Upstream geneEG384862
Downstream geneLOC100041133, Chd9, LOC100041156, EG626231, Rbl2, Aktip, LOC667162, LOC100041222, Rpgrip1l, AJ237917
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-240K20.bB6Ng01-240K20.g
ACCGA050783GA050784
length5471,157
definitionB6Ng01-240K20.b B6Ng01-240K20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,696,498 - 92,697,044)(92,842,763 - 92,843,939)
sequence
gataattgagacaaatgcaatataatatttgtaagcaacttcatctagag
attaaaatatgaatctcagcaaaagagctatgttgtctaataataagcag
cagagtccaagagagtgaggcagggagagtctgcaaaactaaaggcattc
aattgatcttgagcaaaagtacatgctaactgagatgcatgttaactggg
gaccatgctaactgaggcgccatgctaattgagtcaccatgctcaggtga
tatggcacctcaggtacaagatagagagccaacatcatggctccagttgt
gactgggctccgaacgatgccatgtaggcactggaaacctcgtgattaag
ccacatcttcattttctttatccctactctccttacctttatcttctctt
cagccacgtccactgacatatctcttaagagcaggaacagtgacagttgt
aaagacatgtcgtatgttctctgtcgtgtgatttgtatgtttggggaccc
attttctgcaccctgacaaaaattattctgggggtgggggtggggag
gaattcatgaatccactttctttcacttgttaactaaggctttcatttgt
gtctgactgaggctgaaggaaagcctacagtttgccttccacatagctgg
ctggttcgatagtgacaaggccttgcctccatgtccagctagttagagct
atagtagtatacaaacctagaatacaggttttaatcacatctgtcggtcg
attaaaaatattaactaagacagttttttaaaaatttaagtgtttaatgt
taatctttgactggctgactttcattcttgtgaaattccaataatctgac
ctttgaggcttgctgaaatagcaatacttcagacaaacttatcctttcag
agctgaaattcctttattttaaatgtgtgaatttgaattaagtgcagtgt
gggtgtgtgtatgtaaatgatcatgcaagtttattgatgcaggttttaaa
cagtaggggaaagggtactcctcaccccaagtgaccctgctattagaagt
taaccatggtcgagaagtttgactgcagctttaagaaataaatggataat
ttataaacagtattgatattgctccataccaagtgaaacagctaacacaa
gtcagtatacattgctatagctgtcctcagcaccagcagagaggatctca
gaagggagatggggagaacctgtcttagattcttctggccttcctgtttc
agactgaggagcagggtcccacaacatcatagatttcattgtgttgtcag
aatctcttccttcatctgcatctcggccactgaatcattcattattaatg
actgttatcttcaactgaaatgtatcatcatggagagaaaggaacaccaa
atgcgtaattcctggagagagagtgaagaatatttgtgccaagcatgact
aaaagaagccattgaaagtccatgggagttcgctacctaccctcggaaaa
caatttccgggatgctctgctcatgtcacaaaaccacaggagaaactcaa
gcacgagtagaggatgggaaactcaatcaaggaaaattcaagatgtgtac
ttcggagtcatagctaaccaattcactctttcaggaccaaagacagcacg
gcagattaccttgaatagatacctgctaagtacttgcagcctggggtgtg
ccggttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_92696498_92697044
seq2: B6Ng01-240K20.b_55_601

seq1  GATAATTGAGACAAATGCAATATAATATTTGTAAGCAACTTCATCTAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATTGAGACAAATGCAATATAATATTTGTAAGCAACTTCATCTAGAG  50

seq1  ATTAAAATATGAATCTCAGCAAAAGAGCTATGTTGTCTAATAATAAGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATATGAATCTCAGCAAAAGAGCTATGTTGTCTAATAATAAGCAG  100

seq1  CAGAGTCCAAGAGAGTGAGGCAGGGAGAGTCTGCAAAACTAAAGGCATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTCCAAGAGAGTGAGGCAGGGAGAGTCTGCAAAACTAAAGGCATTC  150

seq1  AATTGATCTTGAGCAAAAGTACATGCTAACTGAGATGCATGTTAACTGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGATCTTGAGCAAAAGTACATGCTAACTGAGATGCATGTTAACTGGG  200

seq1  GACCATGCTAACTGAGGCGCCATGCTAATTGAGTCACCATGCTCAGGTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATGCTAACTGAGGCGCCATGCTAATTGAGTCACCATGCTCAGGTGA  250

seq1  TATGGCACCTCAGGTACAAGATAGAGAGCCAACATCATGGCTCCAGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCACCTCAGGTACAAGATAGAGAGCCAACATCATGGCTCCAGTTGT  300

seq1  GACTGGGCTCCGAACGATGCCATGTAGGCACTGGAAACCTCGTGATTAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGGCTCCGAACGATGCCATGTAGGCACTGGAAACCTCGTGATTAAG  350

seq1  CCACATCTTCATTTTCTTTATCCCTACTCTCCTTACCTTTATCTTCTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATCTTCATTTTCTTTATCCCTACTCTCCTTACCTTTATCTTCTCTT  400

seq1  CAGCCACGTCCACTGACATATCTCTTAAGAGCAGGAACAGTGACAGTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCACGTCCACTGACATATCTCTTAAGAGCAGGAACAGTGACAGTTGT  450

seq1  AAAGACATGTCGTATGTTCTCTGTCGTGTGATTTGTATGTTTGGGGACCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACATGTCGTATGTTCTCTGTCGTGTGATTTGTATGTTTGGGGACCC  500

seq1  ATTTTCTGCACCCTGACAAAAATTATTCTGGGGGTGGGGGTGGGGAG  547
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTGCACCCTGACAAAAATTATTCTGGGGGTGGGGGTGGGGAG  547

seq1: chr8_92842763_92843939
seq2: B6Ng01-240K20.g_64_1220 (reverse)

seq1  AAACAGGCACACCC--AGCTGCAAAGTACATCTGGGCAGGGTAAATCTAA  48
      |||| |||||||||   ||||| |||||   ||  |||||    ||||| 
seq2  AAACCGGCACACCCCAGGCTGC-AAGTA---CTTAGCAGG---TATCTAT  43

seq1  TCAAGGTAAATCTGCCGTGCCTTGTCCTTGGTCCTG-AAGAGTTGAATTT  97
      ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||| ||
seq2  TCAAGGT-AATCTGCCGTGC--TGTCTTTGGTCCTGAAAGAG-TGAA-TT  88

seq1  GGTTAGCTATGACTCCGAAGGTACACATTCTGTGAATTTTTCCTGATTTG  147
      ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||
seq2  GGTTAGCTATGACTCCGAA-GTACACA-TCT-TGAATTTTCCTTGA-TTG  134

seq1  AGTTTTCCATCCTTCTTACTCGTTGCTTTGAGTTTCTCTTGTGGTTTTGT  197
      ||||| |||||||   |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| 
seq2  AGTTTCCCATCCT--CTACTCG-TGC-TTGAGTTTCTCCTGTGGTTTTG-  179

seq1  TGACATGGAGCAGAGCATCCCGGAAATTGTTTTCCGAGGGTAGGTAGCGA  247
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAT-GAGCAGAGCATCCCGGAAATTGTTTTCCGAGGGTAGGTAGCGA  228

seq1  ACT-CCATGGACTTTTCAATGGCTTCTTTTAGTCATGCTTGGCACAAATA  296
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCATGGAC-TTTCAATGGCTTCTTTTAGTCATGCTTGGCACAAATA  277

seq1  TTCTTCACTCTCTCTCCAGGAATTACGCATTTGGTGTTCCTTTCTCTCCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCACTCTCTCTCCAGGAATTACGCATTTGGTGTTCCTTTCTCTCCA  327

seq1  TGATGATACATTTCAGTTTGAAGATAACAGTCATTAATAATGAATGATTC  396
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATACATTTCAG-TTGAAGATAACAGTCATTAATAATGAATGATTC  376

seq1  AGTGGCCGAGATGCAGATGAAGGAAGAGATTCTGACAACACAATGAAATC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCGAGATGCAGATGAAGGAAGAGATTCTGACAACACAATGAAATC  426

seq1  TATGATGTTGTGGGACCCTGCTCCTCAGTCTGAAACAGGAAGGCCAGAAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATGTTGTGGGACCCTGCTCCTCAGTCTGAAACAGGAAGGCCAGAAG  476

seq1  AATCTAAGACAGGTTCTCCCCATCTCCCTTCTGAGATCCTCTCTGCTGGT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTAAGACAGGTTCTCCCCATCTCCCTTCTGAGATCCTCTCTGCTGGT  526

seq1  GCTGAGGACAGCTATAGCAATGTATACTGACTTGTGTTAGCTGTTTCACT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGGACAGCTATAGCAATGTATACTGACTTGTGTTAGCTGTTTCACT  576

seq1  TGGTATGGAGCAATATCAATACTGTTTATAAATTATCCATTTATTTCTTA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATGGAGCAATATCAATACTGTTTATAAATTATCCATTTATTTCTTA  626

seq1  AAGCTGCAGTCAAACTTCTCGACCATGGTTAACTTCTAATAGCAGGGTCA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGCAGTCAAACTTCTCGACCATGGTTAACTTCTAATAGCAGGGTCA  676

seq1  CTTGGGGTGAGGAGTACCCTTTCCCCTACTGTTTAAAACCTGCATCAATA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGGTGAGGAGTACCCTTTCCCCTACTGTTTAAAACCTGCATCAATA  726

seq1  AACTTGCATGATCATTTACATACACACACCCACACTGCACTTAATTCAAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGCATGATCATTTACATACACACACCCACACTGCACTTAATTCAAA  776

seq1  TTCACACATTTAAAATAAAGGAATTTCAGCTCTGAAAGGATAAGTTTGTC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACATTTAAAATAAAGGAATTTCAGCTCTGAAAGGATAAGTTTGTC  826

seq1  TGAAGTATTGCTATTTCAGCAAGCCTCAAAGGTCAGATTATTGGAATTTC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTATTGCTATTTCAGCAAGCCTCAAAGGTCAGATTATTGGAATTTC  876

seq1  ACAAGAATGAAAGTCAGCCAGTCAAAGATTAACATTAAACACTTAAATTT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAATGAAAGTCAGCCAGTCAAAGATTAACATTAAACACTTAAATTT  926

seq1  TTAAAAAACTGTCTTAGTTAATATTTTTAATCGACCGACAGATGTGATTA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAACTGTCTTAGTTAATATTTTTAATCGACCGACAGATGTGATTA  976

seq1  AAACCTGTATTCTAGGTTTGTATACTACTATAGCTCTAACTAGCTGGACA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGTATTCTAGGTTTGTATACTACTATAGCTCTAACTAGCTGGACA  1026

seq1  TGGAGGCAAGGCCTTGTCACTATCGAACCAGCCAGCTATGTGGAAGGCAA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGCAAGGCCTTGTCACTATCGAACCAGCCAGCTATGTGGAAGGCAA  1076

seq1  ACTGTAGGCTTTCCTTCAGCCTCAGTCAGACACAAATGAAAGCCTTAGTT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGGCTTTCCTTCAGCCTCAGTCAGACACAAATGAAAGCCTTAGTT  1126

seq1  AACAAGTGAAAGAAAGTGGATTCATGAATTC  1177
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTGAAAGAAAGTGGATTCATGAATTC  1157