BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-241O02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 100,265,395 - 100,444,383
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG384885
Upstream geneLOC333331, LOC546090, LOC636859
Downstream geneLOC100041173, EG636915
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-241O02.bB6Ng01-241O02.g
ACCGA051683GA051684
length1,1401,026
definitionB6Ng01-241O02.b B6Ng01-241O02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,443,241 - 100,444,383)(100,265,395 - 100,266,470)
sequence
gaattcttttaaatttcatagaaaagccgaaaacctagaatttaagaaga
tttaaaataagaactacaaatttgtgagacttgtattcttttaacctaag
acatgctacaatattgctaattaagatcatgaactatttgtgtagaataa
taaagaaaataaagggactagacttttcatacagacctgccagtacctga
tgatttaaaacacaggcaaataaaaaccagcagcacataaatttgtattt
ctggtctcctggccaggatcctttctcatgcaagttcaaagaatgtttat
cagtggaagaaggctttgagtgttagagctttatgctacttctagttcat
tctttgttcatatacttgtttttgaagatctgggctctcagcttcacatt
tctcttgctgtgccttctgtttgccactatcaaagtgggacggtttccct
ttgccaccattagcgcaaatagcccttccttcaataagttgccttgatca
tcggacctaatcaaagcaagagaaaaataattaattcagacatctttctc
tattgttctccacagagagattactgagaggtatgtcactttattcttga
aacagtatccttcactgcacttggaactcacagactgtacaagacacggt
ggttagagaggtctaaggatcaccatgtctctgtgttctagttctaatat
tcctgggttttaatatggttgctgggcacctgaactaaagtcctttcgct
ttcacataaggcatttttctgactgagccacctgcataacattattatct
ttcctatatatacattttctactgacacttttcaatatcaacaatcgttt
atggaggcttaatatgcaatttaagtctaatttcctttatttataagatt
cattaatacaagttttattgaataatcgataaggttattcaataaactat
aatatttctatacctccttgcattatcagaattgttttatgctcactggc
tttattatttgctttctaaaatatatttgttgtgtctggttcagctttat
gataatgtcccagtcataatcggttatgccacttctgcttcttatacctt
ctggaattttattaggattgtgaaatgatggtaatttgga
gaattcactaaccaactcaactccattgctctacattcacggcactgact
cccacctgactgactcaactccactgcattgaattcaactgactgaacag
gactaagtcaatttactgaactgtctcgcagtttgaaatcactttcaaac
atggctactcctcctacaaaagtaagcttacctacatgctctgtactttg
tacatatgtactaaaggtgtgtgtgtgtgtgtgttgcagccagatcacac
agacctaagacgtctttggatgttattcatttctggagcagccaggttga
tggattaatattcctctacagtagaattatttgagaagtatggcattaac
tctttgaaagtttggtagaatgcttttctaatagaagggggaaggatctg
gttacttcccattaggaatgtatagctatttaattttattagataagagg
tgagagataacaatttaattagaataggttagcaatacagaagaagaaag
ggatttatctctaagacagtagtggtaaaatcagaaggttgtcagcacaa
atggaatccttctttctattatttagaagtaacccctgatctttcacttg
tgcaactctcctgaatttacaaatggagctactatctgaattgtgtttgg
atttttcttccacaataaacccatatttcacttctggactcaatgactaa
gtcaggttcaatttgtgataatcaatctgatagagtaacttaagatggag
gtatttaagaattaatgggggaatggatgtaaggaattagttctaggaga
atctataaagtacctgtaaatattttatggttaggtagtgctgtattgct
ttatttacttttccacttaatatcagtaatctaaattcttctttagtata
ttcctggtatatatctctagcacttcatattagataaatatcatcacatt
acttagagtcacttcaaactgattttaacataccacctctttttcataca
tttgatgtcacagtgactatgtccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_100443241_100444383
seq2: B6Ng01-241O02.b_42_1181 (reverse)

seq1  TCCAAATTA-CATCA-TTCACAAT-CTAATAAAAATTCCCAGAA-GTATA  46
      ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  | |||||| |||||
seq2  TCCAAATTACCATCATTTCACAATCCTAATAAAA--TTCCAGAAGGTATA  48

seq1  AGAAGCAGAAGT-GCATAA-CGATTATGACTGGAACATTTAACCAATTAA  94
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  | ||  |||
seq2  AGAAGCAGAAGTGGCATAACCGATTATGACTGGGACATT--ATCA--TAA  94

seq1  AGCTGAACCAGACACAACAAATTATAATTTTAGAAAGCAAATAATAAAGC  144
      ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAACCAGACACAACAAA-TAT-ATTTTAGAAAGCAAATAATAAAGC  142

seq1  CAGTGAGCATAAAACAATTCTGATAATGCAAGGAGGTATAGAAATATTTA  194
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CAGTGAGCATAAAACAATTCTGATAATGCAAGGAGGTATAGAAATA-TTA  191

seq1  TAGTTTATTGAATAACCTTATCGATTATTCAATAAAACTTGTATTAATGA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTATTGAATAACCTTATCGATTATTCAATAAAACTTGTATTAATGA  241

seq1  ATCTTATAAATAAAGGAAATTAGACTTAAATTGCATATTAAGCCTCCATA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTATAAATAAAGGAAATTAGACTTAAATTGCATATTAAGCCTCCATA  291

seq1  AACGATTGTTGATATTGAAAAGTGTCAGTAGAAAATGTATATATAGGAAA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGATTGTTGATATTGAAAAGTGTCAGTAGAAAATGTATATATAGGAAA  341

seq1  GATAATAATGTTATGCAGGTGGCTCAGTCAGAAAAATGCCTTATGTGAAA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATAATGTTATGCAGGTGGCTCAGTCAGAAAAATGCCTTATGTGAAA  391

seq1  GCGAAAGGACTTTAGTTCAGGTGCCCAGCAACCATATTAAAACCCAGGAA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAAAGGACTTTAGTTCAGGTGCCCAGCAACCATATTAAAACCCAGGAA  441

seq1  TATTAGAACTAGAACACAGAGACATGGTGATCCTTAGACCTCTCTAACCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGAACTAGAACACAGAGACATGGTGATCCTTAGACCTCTCTAACCA  491

seq1  CCGTGTCTTGTACAGTCTGTGAGTTCCAAGTGCAGTGAAGGATACTGTTT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGTCTTGTACAGTCTGTGAGTTCCAAGTGCAGTGAAGGATACTGTTT  541

seq1  CAAGAATAAAGTGACATACCTCTCAGTAATCTCTCTGTGGAGAACAATAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATAAAGTGACATACCTCTCAGTAATCTCTCTGTGGAGAACAATAG  591

seq1  AGAAAGATGTCTGAATTAATTATTTTTCTCTTGCTTTGATTAGGTCCGAT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGATGTCTGAATTAATTATTTTTCTCTTGCTTTGATTAGGTCCGAT  641

seq1  GATCAAGGCAACTTATTGAAGGAAGGGCTATTTGCGCTAATGGTGGCAAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAGGCAACTTATTGAAGGAAGGGCTATTTGCGCTAATGGTGGCAAA  691

seq1  GGGAAACCGTCCCACTTTGATAGTGGCAAACAGAAGGCACAGCAAGAGAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAACCGTCCCACTTTGATAGTGGCAAACAGAAGGCACAGCAAGAGAA  741

seq1  ATGTGAAGCTGAGAGCCCAGATCTTCAAAAACAAGTATATGAACAAAGAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAAGCTGAGAGCCCAGATCTTCAAAAACAAGTATATGAACAAAGAA  791

seq1  TGAACTAGAAGTAGCATAAAGCTCTAACACTCAAAGCCTTCTTCCACTGA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTAGAAGTAGCATAAAGCTCTAACACTCAAAGCCTTCTTCCACTGA  841

seq1  TAAACATTCTTTGAACTTGCATGAGAAAGGATCCTGGCCAGGAGACCAGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATTCTTTGAACTTGCATGAGAAAGGATCCTGGCCAGGAGACCAGA  891

seq1  AATACAAATTTATGTGCTGCTGGTTTTTATTTGCCTGTGTTTTAAATCAT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAAATTTATGTGCTGCTGGTTTTTATTTGCCTGTGTTTTAAATCAT  941

seq1  CAGGTACTGGCAGGTCTGTATGAAAAGTCTAGTCCCTTTATTTTCTTTAT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTACTGGCAGGTCTGTATGAAAAGTCTAGTCCCTTTATTTTCTTTAT  991

seq1  TATTCTACACAAATAGTTCATGATCTTAATTAGCAATATTGTAGCATGTC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTACACAAATAGTTCATGATCTTAATTAGCAATATTGTAGCATGTC  1041

seq1  TTAGGTTAAAAGAATACAAGTCTCACAAATTTGTAGTTCTTATTTTAAAT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTTAAAAGAATACAAGTCTCACAAATTTGTAGTTCTTATTTTAAAT  1091

seq1  CTTCTTAAATTCTAGGTTTTCGGCTTTTCTATGAAATTTAAAAGAATTC  1143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTAAATTCTAGGTTTTCGGCTTTTCTATGAAATTTAAAAGAATTC  1140

seq1: chr8_100265395_100266470
seq2: B6Ng01-241O02.g_66_1091

seq1  GAATTCACTAACCAACTCAACTCCATTGCTCTACATTCACGGCACTGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAACCAACTCAACTCCATTGCTCTACATTCACGGCACTGACT  50

seq1  CCCACCTGACTGACTCAACTCCACTGCATTGAATTCAACTGACTGAACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCTGACTGACTCAACTCCACTGCATTGAATTCAACTGACTGAACAG  100

seq1  GACTAAGTCAATTTACTGAACTGTCTCGCAGTTTGAAATCACTTTCAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAGTCAATTTACTGAACTGTCTCGCAGTTTGAAATCACTTTCAAAC  150

seq1  ATGGCTACTCCTCCTACAAAAGTAAGCTTACCTACATGCTCTGTACTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTACTCCTCCTACAAAAGTAAGCTTACCTACATGCTCTGTACTTTG  200

seq1  TACATATGTACTAAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCAGCCAGATCACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATGTACTAAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCAGCCAGATCACAC  250

seq1  AGACCTAAGACGTCTTTGGATGTTATTCATTTCTGGAGCAGCCAGGTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTAAGACGTCTTTGGATGTTATTCATTTCTGGAGCAGCCAGGTTGA  300

seq1  TGGATTAATATTCCTCTACAGTAGAATTATTTGAGAAGTATGGCATTAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTAATATTCCTCTACAGTAGAATTATTTGAGAAGTATGGCATTAAC  350

seq1  TCTTTGAAAGTTTGGTAGAATGCTTTTCTAATAGAAGGGGGAAGGATCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGAAAGTTTGGTAGAATGCTTTTCTAATAGAAGGGGGAAGGATCTG  400

seq1  GTTACTTCCCATTAGGAATGTATAGCTATTTAATTTTATTAGATAAGAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTTCCCATTAGGAATGTATAGCTATTTAATTTTATTAGATAAGAGG  450

seq1  TGAGAGATAACAATTTAATTAGAATAGGTTAGCAATACAGAAGAAGAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGATAACAATTTAATTAGAATAGGTTAGCAATACAGAAGAAGAAAG  500

seq1  GGATTTATCTCTAAGACAGTAGTGGTAAAATCAGAAGGTTGTCAGCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTATCTCTAAGACAGTAGTGGTAAAATCAGAAGGTTGTCAGCACAA  550

seq1  ATGGAATCCTTCTTTCTATTATTTAGAAGTAACCCCTGATCTTTCACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAATCCTTCTTTCTATTATTTAGAAGTAACCCCTGATCTTTCACTTG  600

seq1  TGCAACTCTCCTGAATTTACAAATGGAGCTACTATCTGAATTGTGTTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACTCTCCTGAATTTACAAATGGAGCTACTATCTGAATTGTGTTTGG  650

seq1  ATTTTTCTTCCACAATAAACCCATATTTCACTTCTGGACTCAATGACTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCTTCCACAATAAACCCATATTTCACTTCTGGACTCAATGACTAA  700

seq1  GTCAGGTTCAATTTGTGATAATCAATCTGATAGAGTAACTTAAGATGGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGTTCAATTTGTGATAATCAATCTGATAGAGTAACTTAAGATGGAG  750

seq1  GTATTTAAGAATTAATGGGGGAATGGATGTAAGGAATTAGTTCTAGGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTAAGAATTAATGGGGGAATGGATGTAAGGAATTAGTTCTAGGAGA  800

seq1  ATCTATAAAAGTACCTGTAAATATTTTATGGTTAGGTAGTGCTGTATTGC  850
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAT-AAAGTACCTGTAAATATTTTATGGTTAGGTAGTGCTGTATTGC  849

seq1  TTTAATTTACTTTTCCACTTATTATCAGTAATCTAAATTCTTCTTTAGTA  900
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTT-ATTTACTTTTCCACTTAATATCAGTAATCTAAATTCTTCTTTAGTA  898

seq1  TATTCCTGGTATATAATCTCTTAGAACTTCATATTAGATAAAATATCATC  950
      |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||
seq2  TATTCCTGGTATAT-ATCTC-TAGCACTTCATATTAGAT-AAATATCATC  945

seq1  ACATAACTTAGAGTCACTTTAAAACTGATTTTAAACATAACACCTCTTTT  1000
      |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  ACATTACTTAGAGTCAC-TTCAAACTGATTTT-AACATACCACCTCTTTT  993

seq1  CAATATATTTAATGTCACAGTGACATATGTCTCTTTGTTTTATTCCTCTT  1050
        ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||                
seq2  TCATACATTTGATGTCACAGTGAC-TATGTCCCT----------------  1026

seq1  TTAGACTCAATAGCATTTATGTCCCT  1076
                                
seq2  --------------------------  1026