BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-245O19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 120,242,110 - 120,374,612
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHsd17b2, Mphosph6
Upstream geneCdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik, Plcg2, 4632417N05Rik
Downstream geneCdh13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-245O19.bB6Ng01-245O19.g
ACCGA054681GA054682
length1,1401,075
definitionB6Ng01-245O19.b B6Ng01-245O19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,373,470 - 120,374,612)(120,242,110 - 120,243,181)
sequence
gaattcatcatcccttcgaaacaaatgaaacttaagcggcgtcgtggggg
tggagattatgcgttatcaaacccagccaccaccagctccatgtgactgc
agcagcgcttgaaacgtgaacagtatacgttgagatgtgctttagaaaac
acttacacccgatttctgagcttggatagccttagattgggctaaataaa
acagtaaaatgagttaatctgttgcctctctcacatgttctgcatgtgct
ctggggtacctgaaactggttctgtggtttgcactgggtccgttggacgg
cgctgttcccatgggtgtctttttctgtctcagcccctgagatagagcag
ctctgagccaggagatgctgtgaggggctcagctctcttaacaggcagaa
cacctactggatcaagtttaatgatagcaagagcagaggaaaacctcccc
gctgcccccacgggcccctcaggatgctcttactgaagagctgaccaccc
cttaccttagtacgcaatattttaatggactttgaattcacacgccaact
ttttgtgaaactccctgaggaatgtcaagccagtggctttaaccaaactc
agtttgattccatagctaggtgacactgactgctggagtcctctgggctt
acttttgagcaacttctccgtaacggttactgctgtcaacttgacagaat
ctagattcacaacagagataagcctctggatacgtctatgaggatttgtc
taccctggggtaatagaggaggcgaggcacatactaactttaagggtcta
ccctggggtaacagacgaggcaaggcaccactgaatttgagcagtggcat
ttccttggcttgcagcccaggattgaataaagagaagaaagcaaacagag
ccccagcttctcaccttcccaccgccattatgccctgccacgatggactg
tacccggaaactgcaagccaaaaaataaatccttccttcccaaaattgat
attgccagtatttttatcagaaaagaatggtgcagtcccagccagagtca
ctgcctgccagctctgtagttcaagaatgcagatgtagccttgagacgga
tccacctctcgttttcctagttacaatttcaggatatgtg
gaattccgcagcaaggtccttgttctcactgggtttgtatcagaggttgg
aattacaatgttacagctctagttacattgggagggggtggcggctggca
gatggaagggcagaacagcttcaaaacatctttcccctctgtgtccatat
cctggcctcgcagaactggttcatactggggctgttacattcctttgata
atcccattatccagaaatatctcagcctttcgatgagaatgtccctcaaa
actgcttagacaacacaggctgagatggtgaaagctcacagcaagcttcg
aatgaataatatacccgacggccctggtgtttgtttcctggtattttgtg
gaactcccccgtgcaacattgtgcaggtgaggggtcaggagagaacacac
gataagttttttaatgggtaacactcccgagttaaagttttgtacctttg
tccccactgaggtccctttctcaactgcgcagtggaaccctgacccatat
tgcttcattcgagcaactgagatcaaaacaaaggggttggaatgacagct
cgctgggtaaagtccttgctgaataaacatgaagatgtgagtttaaaacc
caggcacattcttggacaaggtgctgctcagcgttaggagtaggggcaga
cacaggtggatgctgggagatcacaagccatccagtttcaccaaaatggc
aagctccaggttcactgagagaccctgtctcaaaaaaacaaggtggagaa
aaataaagacctccaatgcctacctcccacacatgcacacacaggcgaac
tcatttgtgtatgtatgtgcacatacaagaacacactacacacataaaaa
ggtggaatcagccatcacaatcccattaatgctatggtctgtctgtgcgg
gtctacatgtatgtagatgcacatgtatgtagatgcacatgcatatgcat
gcgtgtggataccagaagacctttgttgcttcttcagacacccttgtttt
ttttggtttttgtgagaacacagcttctcaaagccttgagatcaccagtt
tagttagacagctggcttaggagcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_120373470_120374612
seq2: B6Ng01-245O19.b_46_1185 (reverse)

seq1  CACATATCCTGAA--TGTACTTAAGAAAAACGAGAAGTTGGATTCGTCTC  48
      |||||||||||||  ||||  | || |||||||| || ||||| ||||||
seq2  CACATATCCTGAAATTGTAACT-AGGAAAACGAG-AGGTGGATCCGTCTC  48

seq1  AGGGCTACATCTGGCCCTTCTTGGACCTCCAGGAGCTGGCA-GCAGTGAC  97
      | |||||||||||  | ||||| || || || ||||||||| ||||||||
seq2  AAGGCTACATCTG--CATTCTT-GAACTACA-GAGCTGGCAGGCAGTGAC  94

seq1  TCTGGCTGGGACTGCACCATTCCTTTTCCTTGATAAAATACCTGGCAATA  147
      ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||
seq2  TCTGGCTGGGACTGCACCATT-CTTTTC--TGATAAAAATACTGGCAATA  141

seq1  TCAATTTTGGGAAGGAAGGATTTA-TTTTTGGCTTGCAGTTTCCGGGTAC  196
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTTTGGGAAGGAAGGATTTATTTTTTGGCTTGCAGTTTCCGGGTAC  191

seq1  AGTCCATCGTGGCAGGGCATAATGGCGGTGGG-AGGTGAGAAGCTGGGGC  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGTCCATCGTGGCAGGGCATAATGGCGGTGGGAAGGTGAGAAGCTGGGGC  241

seq1  TCTGTTTGCTTTCTTCTCTTTATTCAAT-CTGGGCTGCAAGCCAAGGAAA  294
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTGCTTTCTTCTCTTTATTCAATCCTGGGCTGCAAGCCAAGGAAA  291

seq1  TGCCACTGCTCAAATTCAGTGGTGCCTTGCCTCGTCTGTTACCCCAGGGT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTGCTCAAATTCAGTGGTGCCTTGCCTCGTCTGTTACCCCAGGGT  341

seq1  AGACCCTTAAAGTTAGTATGTGCCTCGCCTCCTCTATTACCCCAGGGTAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTTAAAGTTAGTATGTGCCTCGCCTCCTCTATTACCCCAGGGTAG  391

seq1  ACAAATCCTCATAGACGTATCCAGAGGCTTATCTCTGTTGTGAATCTAGA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATCCTCATAGACGTATCCAGAGGCTTATCTCTGTTGTGAATCTAGA  441

seq1  TTCTGTCAAGTTGACAGCAGTAACCGTTACGGAGAAGTTGCTCAAAAGTA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCAAGTTGACAGCAGTAACCGTTACGGAGAAGTTGCTCAAAAGTA  491

seq1  AGCCCAGAGGACTCCAGCAGTCAGTGTCACCTAGCTATGGAATCAAACTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGAGGACTCCAGCAGTCAGTGTCACCTAGCTATGGAATCAAACTG  541

seq1  AGTTTGGTTAAAGCCACTGGCTTGACATTCCTCAGGGAGTTTCACAAAAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGTTAAAGCCACTGGCTTGACATTCCTCAGGGAGTTTCACAAAAA  591

seq1  GTTGGCGTGTGAATTCAAAGTCCATTAAAATATTGCGTACTAAGGTAAGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCGTGTGAATTCAAAGTCCATTAAAATATTGCGTACTAAGGTAAGG  641

seq1  GGTGGTCAGCTCTTCAGTAAGAGCATCCTGAGGGGCCCGTGGGGGCAGCG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTCAGCTCTTCAGTAAGAGCATCCTGAGGGGCCCGTGGGGGCAGCG  691

seq1  GGGAGGTTTTCCTCTGCTCTTGCTATCATTAAACTTGATCCAGTAGGTGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGTTTTCCTCTGCTCTTGCTATCATTAAACTTGATCCAGTAGGTGT  741

seq1  TCTGCCTGTTAAGAGAGCTGAGCCCCTCACAGCATCTCCTGGCTCAGAGC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTGTTAAGAGAGCTGAGCCCCTCACAGCATCTCCTGGCTCAGAGC  791

seq1  TGCTCTATCTCAGGGGCTGAGACAGAAAAAGACACCCATGGGAACAGCGC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTATCTCAGGGGCTGAGACAGAAAAAGACACCCATGGGAACAGCGC  841

seq1  CGTCCAACGGACCCAGTGCAAACCACAGAACCAGTTTCAGGTACCCCAGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCCAACGGACCCAGTGCAAACCACAGAACCAGTTTCAGGTACCCCAGA  891

seq1  GCACATGCAGAACATGTGAGAGAGGCAACAGATTAACTCATTTTACTGTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGCAGAACATGTGAGAGAGGCAACAGATTAACTCATTTTACTGTT  941

seq1  TTATTTAGCCCAATCTAAGGCTATCCAAGCTCAGAAATCGGGTGTAAGTG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAGCCCAATCTAAGGCTATCCAAGCTCAGAAATCGGGTGTAAGTG  991

seq1  TTTTCTAAAGCACATCTCAACGTATACTGTTCACGTTTCAAGCGCTGCTG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTAAAGCACATCTCAACGTATACTGTTCACGTTTCAAGCGCTGCTG  1041

seq1  CAGTCACATGGAGCTGGTGGTGGCTGGGTTTGATAACGCATAATCTCCAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACATGGAGCTGGTGGTGGCTGGGTTTGATAACGCATAATCTCCAC  1091

seq1  CCCCACGACGCCGCTTAAGTTTCATTTGTTTCGAAGGGATGATGAATTC  1143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACGACGCCGCTTAAGTTTCATTTGTTTCGAAGGGATGATGAATTC  1140

seq1: chr8_120242110_120243181
seq2: B6Ng01-245O19.g_69_1143

seq1  GAATTCCGCAGCAAGGTCCTTGTTCTCACTGGGTTTGTATCAGAGGTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCGCAGCAAGGTCCTTGTTCTCACTGGGTTTGTATCAGAGGTTGG  50

seq1  AATTACAATGTTACAGCTCTAGTTACATTGGGAGGGGGTGGCGGCTGGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACAATGTTACAGCTCTAGTTACATTGGGAGGGGGTGGCGGCTGGCA  100

seq1  GATGGAAGGGCAGAACAGCTTCAAAACATCTTTCCCCTCTGTGTCCATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAAGGGCAGAACAGCTTCAAAACATCTTTCCCCTCTGTGTCCATAT  150

seq1  CCTGGCCTCGCAGAACTGGTTCATACTGGGGCTGTTACATTCCTTTGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCCTCGCAGAACTGGTTCATACTGGGGCTGTTACATTCCTTTGATA  200

seq1  ATCCCATTATCCAGAAATATCTCAGCCTTTCGATGAGAATGTCCCTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCATTATCCAGAAATATCTCAGCCTTTCGATGAGAATGTCCCTCAAA  250

seq1  ACTGCTTAGACAACACAGGCTGAGATGGTGAAAGCTCACAGCAAGCTTCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTAGACAACACAGGCTGAGATGGTGAAAGCTCACAGCAAGCTTCG  300

seq1  AATGAATAATATACCCGACGGCCCTGGTGTTTGTTTCCTGGTATTTTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAATAATATACCCGACGGCCCTGGTGTTTGTTTCCTGGTATTTTGTG  350

seq1  GAACTCCCCCGTGCAACATTGTGCAGGTGAGGGGTCAGGAGAGAACACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCCCCCGTGCAACATTGTGCAGGTGAGGGGTCAGGAGAGAACACAC  400

seq1  GATAAGTTTTTTAATGGGTAACACTCCCGAGTTAAAGTTTTGTACCTTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGTTTTTTAATGGGTAACACTCCCGAGTTAAAGTTTTGTACCTTTG  450

seq1  TCCCCACTGAGGTCCCTTTCTCAACTGCGCAGTGGAACCCTGACCCATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCACTGAGGTCCCTTTCTCAACTGCGCAGTGGAACCCTGACCCATAT  500

seq1  TGCTTCATTCGAGCAACTGAGATCAAAACAAAGGGGTTGGAATGACAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCATTCGAGCAACTGAGATCAAAACAAAGGGGTTGGAATGACAGCT  550

seq1  CGCTGGGTAAAGTCCTTGCTGAATAAACATGAAGATGTGAGTTTAAAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGGGTAAAGTCCTTGCTGAATAAACATGAAGATGTGAGTTTAAAACC  600

seq1  CAGGCACATTCTTGGACAAGGTGCTGCTCAGCGTTAGGAGTAGGGGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCACATTCTTGGACAAGGTGCTGCTCAGCGTTAGGAGTAGGGGCAGA  650

seq1  CACAGGTGGATGCTGGGAGATCACAAGCCATCCAGTTTCACCAAAATGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTGGATGCTGGGAGATCACAAGCCATCCAGTTTCACCAAAATGGC  700

seq1  AAGCTCCAGGTTCACTGAGAGACCCTGTCTCAAAAAAACAAGGTGGAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCCAGGTTCACTGAGAGACCCTGTCTCAAAAAAACAAGGTGGAGAA  750

seq1  AAATAAAGACCTCCAATGCCTACCTCCCACACATGCACACACAGGCGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAGACCTCCAATGCCTACCTCCCACACATGCACACACAGGCGAAC  800

seq1  TCATTTGTGTATGTATGTGCACATACAAGAACACACTACACACATAAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTGTGTATGTATGTGCACATACAAGAACACACTACACACATAAAAA  850

seq1  GGTGGAATCAGCCATCACAATCCCATTAATGCTATGGTCTGTCTGTGCGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAATCAGCCATCACAATCCCATTAATGCTATGGTCTGTCTGTGCGG  900

seq1  GTCTACATGTATGTAGATGCACATGTATGTAGATGCACATGCATATGCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACATGTATGTAGATGCACATGTATGTAGATGCACATGCATATGCAT  950

seq1  GCGTGTGGATACCAGAAGACCTTTGTTGC-TCCTCAGACACCC-TGTTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||
seq2  GCGTGTGGATACCAGAAGACCTTTGTTGCTTCTTCAGACACCCTTGTTTT  1000

seq1  TTT--GTTTTTGTGAG-ACACAGCTTCTCAAAAGCCTGGAGATCACCAGT  1045
      |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  TTTTGGTTTTTGTGAGAACACAGCTTCTC-AAAGCCTTGAGATCACCAGT  1049

seq1  TAAGGTAGACAGGCTGGCTAGGGAGCC  1072
      | || |||||| |||||||  ||||||
seq2  TTAGTTAGACA-GCTGGCTTAGGAGCC  1075