BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264D21
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,684,991 - 14,815,152
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2, C030037F17Rik
Upstream gene4932443I19Rik, LOC665516, Cdc16, Upf3a, AF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140
Downstream geneCln8, Arhgef10, 2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599, EG234097, EG665619
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264D21.bB6Ng01-264D21.g
ACCGA068196GA068197
length1,2101,162
definitionB6Ng01-264D21.b B6Ng01-264D21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,813,962 - 14,815,152)(14,684,991 - 14,686,138)
sequence
gaattctgttatgcacaacatctacaaaaggccaggtgacctagaaggac
ttcctcagcatcccattggaaaccttgtaatactaccattgcaagacaaa
agttaaaataaacagaccatctgataccaacttggcccagttctttaaga
atgggagtttgggctcaggcatgtggcgcatgctgcagtctcagcataca
ggcagcagaggaccatgagttagagactagactgggttacacagtgagac
actctcaaaggatgtggtacagtggtaagccatcaaagaaggtcttcagg
gctcataaaggccataaacttatatgggaacacttgaaaagaatccagtt
gaaaatcacagattaataacaaacatattgaatgtcaactggggtgggga
gggcatggatggatatgctggtgacatgtttgatctgtgcagtggacagc
cctgtcatttgtctcacagtgtgtatctgtgtgcacacctagccacaaac
attagtttcattccgactcttaaaatgaatgttatgtttattctagtgat
tctggaattgcatttgtctcactggggcttgaggaaaggctaattctgca
tggtacactgcggacttaagtttacgggcgcgactgacctcccgaggtaa
atatatctagatatcaatgtctcttaattaagggagaagccgggcagtgg
tggcgcaagcctttaatcccagcacttgggaggcagaggcaggtggattt
ctgagttcgaggccagcctggtctacaaagtgagttccaggacagccagg
gctatacagagaaaccctgtcttgaaaaaaaaaattgaggaagagatgac
tttccataaagtatccatgaacgataaagcaaatgcttcttgcatgtgca
gacagtgcacacctaacttattgatgtttcagggtataattagcacatgc
ttagaggccccaggcaatacaccggtggactgcactgtcataaattcaag
ggtataatagaaatggaaaaggagcacacaggtatcgatccctcttacaa
cacaaggcgagtggtgattttctttctggcttcactggagaactgttcag
ccagaacagccatgtcagcctgtgtacaacaggatgacgttccttgcgtg
tcagtctctgagaatcttcaggtctaggggaaatcaattaacgcgctcaa
ttcactagga
gaattctgtatgtaatcgagtgagtttcttcaattgtgtgtggcttccaa
acatggattttaactagcgttgttgaagaggagagattctgtttaaacct
gcggtcaccctgtgaggtcacccctatgccctgtgatgtgaaggtctgga
aaggcaaagtcacctatgcgcatgctgttgtgcaggatccgaatcctcaa
aacagcatccttctcacattccactaagtgcctgcacatacacacagcac
agtccagttcaaatatgtgtagtggatacccgagagttaaatgctgtgaa
ccaactgtctgtggagaaggctggacacgtgttacagcctcatcagaaga
gaaccccgcccctcccctccatttctaggatgcactagattccatgaaat
aagaaacatgggactattagtgtctccattacatgatatctttacattgg
aattccagggacacaaagagatggcttagcagttaaaagcactcctctgc
ttcttcagaagcctgggctcagttcccagcaccaacaacgtcaggcagcc
caccactgccagtaattccagctccaagggatccaacgcttctgtggtct
cacacgcatgaacacacatacacacgcagatgtgcatacacaaaaataaa
aactatatacatacatatgtacatatgtatgttatttttaaatggaatgt
cagtacttatgtgagctcaggggactcagctccaacagtagctttatgcc
gtgcccctgatagtctcaggatttctctcaacaaagccactcataagaaa
tgccagaggaaacaccagatgagggagggacatgaggaatctactccata
agtggtctgcacaccactgctttcccaccaccccacagcacacgcagcct
cacctcactgaacacggacacagggttggccctcctgttgccacagaagt
cagctccgagttcagctctgagcttaccacgtaggagggccggactttga
tcaacttaccccacgagttgtcaaatggagtttggcatcttaggagccca
ggaatatccattcaggggagagaatggatttcaggaatggggaggaatct
gacttcagcactgaagcatccttggtgtgacaaaggtgacagccaacccg
atcatcttggtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14813962_14815152
seq2: B6Ng01-264D21.b_44_1253 (reverse)

seq1  TCCTAGTGA--TG---GCGTTTATTGA-TTCACCTAGACTTGAAGATTCT  44
      |||||||||  ||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||
seq2  TCCTAGTGAATTGAGCGCGTTAATTGATTTCCCCTAGACCTGAAGATTCT  50

seq1  CAGAGGACTG-CACGCCAAGGACGCTCAT-CTGTTGT-CACA-GCTGACA  90
      |||| ||||| |||| ||||||   |||| ||||||| |||| |||||||
seq2  CAGA-GACTGACACG-CAAGGAACGTCATCCTGTTGTACACAGGCTGACA  98

seq1  TTGGCTG-TCTGCCTGGACAG-TCT-CAGTG-AGGCAGAAGGAAAATCAA  136
       |||||| |||| ||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| 
seq2  -TGGCTGTTCTGGCTGAACAGTTCTCCAGTGAAGCCAGAAAGAAAATCAC  147

seq1  CACTCG-CTTGTGTTGT-AGGGGGATCGATACCTGTGTGCTCCTTTTC--  182
      |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  
seq2  CACTCGCCTTGTGTTGTAAGAGGGATCGATACCTGTGTGCTCCTTTTCCA  197

seq1  ATTCTATTATA-CCTTGAAATTATGACAGTGCAGTCCA-CGGTGTA-TGC  229
       |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  TTTCTATTATACCCTTGAATTTATGACAGTGCAGTCCACCGGTGTATTGC  247

seq1  CTGGGGCCTCTAAGCATGTGCTAATTATACCCTGAAACATCAATAAGTTA  279
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCCTCTAAGCATGTGCTAATTATACCCTGAAACATCAATAAGTTA  297

seq1  GGTGTGCACTGTCTGCACATGCAAGAAGCATTTGCTTTATCGTTCATGGA  329
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGCACTGTCTGCACATGCAAGAAGCATTTGCTTTATCGTTCATGGA  347

seq1  TACTTTATGGAAAGTCATCTCTTCCTCAA-TTTTTTTTTCAAGACAGGGT  378
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTATGGAAAGTCATCTCTTCCTCAATTTTTTTTTTCAAGACAGGGT  397

seq1  TTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTG  428
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTG  447

seq1  GCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTA  478
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTA  497

seq1  AAGGCTTGCGCCACCACTGCCCGGCTTCTCCCTTAATTAAGAGACATTGA  528
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTTGCGCCACCACTGCCCGGCTTCTCCCTTAATTAAGAGACATTGA  547

seq1  TATCTAGATATATTTACCTCGGGAGGTCAGTCGCGCCCGTAAACTTAAGT  578
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAGATATATTTACCTCGGGAGGTCAGTCGCGCCCGTAAACTTAAGT  597

seq1  CCGCAGTGTACCATGCAGAATTAGCCTTTCCTCAAGCCCCAGTGAGACAA  628
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCAGTGTACCATGCAGAATTAGCCTTTCCTCAAGCCCCAGTGAGACAA  647

seq1  ATGCAATTCCAGAATCACTAGAATAAACATAACATTCATTTTAAGAGTCG  678
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATTCCAGAATCACTAGAATAAACATAACATTCATTTTAAGAGTCG  697

seq1  GAATGAAACTAATGTTTGTGGCTAGGTGTGCACACAGATACACACTGTGA  728
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAACTAATGTTTGTGGCTAGGTGTGCACACAGATACACACTGTGA  747

seq1  GACAAATGACAGGGCTGTCCACTGCACAGATCAAACATGTCACCAGCATA  778
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAATGACAGGGCTGTCCACTGCACAGATCAAACATGTCACCAGCATA  797

seq1  TCCATCCATGCCCTCCCCACCCCAGTTGACATTCAATATGTTTGTTATTA  828
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCCATGCCCTCCCCACCCCAGTTGACATTCAATATGTTTGTTATTA  847

seq1  ATCTGTGATTTTCAACTGGATTCTTTTCAAGTGTTCCCATATAAGTTTAT  878
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGATTTTCAACTGGATTCTTTTCAAGTGTTCCCATATAAGTTTAT  897

seq1  GGCCTTTATGAGCCCTGAAGACCTTCTTTGATGGCTTACCACTGTACCAC  928
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTATGAGCCCTGAAGACCTTCTTTGATGGCTTACCACTGTACCAC  947

seq1  ATCCTTTGAGAGTGTCTCACTGTGTAACCCAGTCTAGTCTCTAACTCATG  978
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTGAGAGTGTCTCACTGTGTAACCCAGTCTAGTCTCTAACTCATG  997

seq1  GTCCTCTGCTGCCTGTATGCTGAGACTGCAGCATGCGCCACATGCCTGAG  1028
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTGCTGCCTGTATGCTGAGACTGCAGCATGCGCCACATGCCTGAG  1047

seq1  CCCAAACTCCCATTCTTAAAGAACTGGGCCAAGTTGGTATCAGATGGTCT  1078
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAACTCCCATTCTTAAAGAACTGGGCCAAGTTGGTATCAGATGGTCT  1097

seq1  GTTTATTTTAACTTTTGTCTTGCAATGGTAGTATTACAAGGTTTCCAATG  1128
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTTTAACTTTTGTCTTGCAATGGTAGTATTACAAGGTTTCCAATG  1147

seq1  GGATGCTGAGGAAGTCCTTCTAGGTCACCTGGCCTTTTGTAGATGTTGTG  1178
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGAGGAAGTCCTTCTAGGTCACCTGGCCTTTTGTAGATGTTGTG  1197

seq1  CATAACAGAATTC  1191
      |||||||||||||
seq2  CATAACAGAATTC  1210

seq1: chr8_14684991_14686138
seq2: B6Ng01-264D21.g_68_1229

seq1  GAATTCTGTATGTAATCGAGTGAGTTTCTTCAATTGTGTGTGGCTTCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTATGTAATCGAGTGAGTTTCTTCAATTGTGTGTGGCTTCCAA  50

seq1  ACATGGATTTTAACTAGCGTTGTTGAAGAGGAGAGATTCTGTTTAAACCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGATTTTAACTAGCGTTGTTGAAGAGGAGAGATTCTGTTTAAACCT  100

seq1  GCGGTCACCCTGTGAGGTCACCCCTATGCCCTGTGATGTGAAGGTCTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTCACCCTGTGAGGTCACCCCTATGCCCTGTGATGTGAAGGTCTGGA  150

seq1  AAGGCAAAGTCACCTATGCGCATGCTGTTGTGCAGGATCCGAATCCTCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAAGTCACCTATGCGCATGCTGTTGTGCAGGATCCGAATCCTCAA  200

seq1  AACAGCATCCTTCTCACATTCCACTAAGTGCCTGCACATACACACAGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCATCCTTCTCACATTCCACTAAGTGCCTGCACATACACACAGCAC  250

seq1  AGTCCAGTTCAAATATGTGTAGTGGATACCCGAGAGTTAAATGCTGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAGTTCAAATATGTGTAGTGGATACCCGAGAGTTAAATGCTGTGAA  300

seq1  CCAACTGTCTGTGGAGAAGGCTGGACACGTGTTACAGCCTCATCAGAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTGTCTGTGGAGAAGGCTGGACACGTGTTACAGCCTCATCAGAAGA  350

seq1  GAACCCCGCCCCTCCCCTCCATTTCTAGGATGCACTAGATTCCATGAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCCGCCCCTCCCCTCCATTTCTAGGATGCACTAGATTCCATGAAAT  400

seq1  AAGAAACATGGGACTATTAGTGTCTCCATTACATGATATCTTTACATTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACATGGGACTATTAGTGTCTCCATTACATGATATCTTTACATTGG  450

seq1  AATTCCAGGGACACAAAGAGATGGCTTAGCAGTTAAAAGCACTCCTCTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAGGGACACAAAGAGATGGCTTAGCAGTTAAAAGCACTCCTCTGC  500

seq1  TTCTTCAGAAGCCTGGGCTCAGTTCCCAGCACCAACAACGTCAGGCAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCAGAAGCCTGGGCTCAGTTCCCAGCACCAACAACGTCAGGCAGCC  550

seq1  CACCACTGCCAGTAATTCCAGCTCCAAGGGATCCAACGCTTCTGTGGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACTGCCAGTAATTCCAGCTCCAAGGGATCCAACGCTTCTGTGGTCT  600

seq1  CACACGCATGAACACACATACACACGCAGATGTGCATACACAAAAATAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACGCATGAACACACATACACACGCAGATGTGCATACACAAAAATAAA  650

seq1  AACTATATACATACATATGTACATATGTATGTTATTTTTAAATGGAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATATACATACATATGTACATATGTATGTTATTTTTAAATGGAATGT  700

seq1  CAGTACTTATGTGAGCTCAGGGGACTCAGCTCCAACAGTAGCTTTATGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACTTATGTGAGCTCAGGGGACTCAGCTCCAACAGTAGCTTTATGCC  750

seq1  GTGCCCCTGATAGTCTCAGGATTTCTCTCAACAAAGCCACTCATAAGAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCTGATAGTCTCAGGATTTCTCTCAACAAAGCCACTCATAAGAAA  800

seq1  TGCCAGAGGAAACACCAGATGAGGGAGGGACATGAGGAATCTACTCCATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAGGAAACACCAGATGAGGGAGGGACATGAGGAATCTACTCCATA  850

seq1  AGTGGTCTGCACACCACTGC-TTCCCACCACCCCACAGCACACGCAGCCT  899
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCTGCACACCACTGCTTTCCCACCACCCCACAGCACACGCAGCCT  900

seq1  CACCTCACTGAACACGGACACAGGGTTGG-CCTCCTGTTG-CACAG-AGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||
seq2  CACCTCACTGAACACGGACACAGGGTTGGCCCTCCTGTTGCCACAGAAGT  950

seq1  CAGCTCCGAG-TCAGCTCTGAGCTTA-CACGTAGGAGGGCC-GACTTTGA  993
      |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGCTCCGAGTTCAGCTCTGAGCTTACCACGTAGGAGGGCCGGACTTTGA  1000

seq1  TCAACTTA-CCCACGAG-TGTCAA--TGAGTTTGGCATCTTA-GAG-CCA  1037
      |||||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||
seq2  TCAACTTACCCCACGAGTTGTCAAATGGAGTTTGGCATCTTAGGAGCCCA  1050

seq1  GG-ATATCCATTCAGGGGAGAAGAAT-GATTTCAAGAAT-GGGAGG-ATC  1083
      || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||
seq2  GGAATATCCATTCAGGGGAG-AGAATGGATTTCAGGAATGGGGAGGAATC  1099

seq1  TGACTTCAGGCACCTGAGCA-CCCTGGTGTGACAAAGAGGTGACAGCCAC  1132
      |||||||| ||||   |||| || |||||||||||  |||||||||||| 
seq2  TGACTTCA-GCACTGAAGCATCCTTGGTGTGACAA--AGGTGACAGCCA-  1145

seq1  ACCCGGTCATC-TGGTC  1148
      ||||| ||||| |||||
seq2  ACCCGATCATCTTGGTC  1162