BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265N08
Chromosome8 (Build37)
Map Location 73,093,606 - 73,236,456
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEll, Isyna1, Ssbp4, Lrrc25, Gdf15, Pgpep1, Lsm4, Jund1, 2410018E23Rik
Upstream geneLOC100041482, LOC673968, AI449175, EG636741, 1200003I07Rik, D330038O06Rik, Atp13a1, Gmip, Edg4, Pbx4, Cilp2, BC028663, Ndufa13, Tssk6, Gatad2a, LOC665649, 9130404D08Rik, Sf4, Tm6sf2, Hapln4, Ncan, Rfxank, 2310073E15Rik, 2310045N01Rik, Mef2b, Tmem161a, Slc25a42, Armc6, Sfrs14, Homer3, Ddx49, Cope, Lass1, Upf1, Comp, Crtc1, Klhl26, Tmem59l, Crlf1, 2810428I15Rik, Uba52, Fkbp8
Downstream geneLOC100041434, Pde4c, Rab3a, BC051227, Ifi30, Pik3r2, LOC100041971, Mast3, Il12rb1, Arrdc2, Kcnn1, LOC100042011, Ccdc124, Slc5a5, Rpl18a, Snora68, Mtap1s, LOC100042057, LOC665858, LOC384645, LOC100041583, EG621377, 2410004L22Rik, Myo9b, 2010315L10Rik, Ocel1, Nr2f6, Ushbp1, 5430437P03Rik, Ankrd41, Abhd8, Mrpl34, 1500034J01Rik, Tmem16h, Gtpbp3, Plvap, LOC665928, Bst2, 1110012M11Rik, BC033932, Txnl6, Slc27a1, Pgls, Bcnp1, Glt25d1, Unc13a, Jak3, Insl3, B3gnt3, LOC100042289, Fcho1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265N08.bB6Ng01-265N08.g
ACCGA069382GA069383
length1,1571,153
definitionB6Ng01-265N08.b B6Ng01-265N08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,093,606 - 73,094,736)(73,235,282 - 73,236,456)
sequence
gaattctgacctcctaccatctctaagtgctgtgtttacaggtgtgcacc
actatgcctaactccaggttccttctttcgcaagtctactggagcagcca
ttggcaccacatagcttgcctgagctgccactacacaagttgtggtccag
tgcagggccgccaagccctgccattcacggacttgaccttctgcccaact
agcacccaccatgcactggccagattggagtagggctggtgctgaagctg
cctaggccctcagcagcccaagtcccagggtgctgggcaccttctgactg
gaactagccaaagagacaaggcttctacacggtccttgattgtaaccctt
tctagacctggctgagagggttgggctttaagaaagttcttagttgtgcc
aggtggatgtgtgtatgtgatggaccccgattgcagcagcctcagggtcc
tgtggtaggtgtgacaggagtggttggtttagaacacaggacacctttga
agaaacttaactccttcagcctctcaaggcctttgagtctgtgctgtgtg
aggagattgggtgtgaggtacctgctgtcttcatggcctgtctgcactga
gtggtaacagctagagccagccaggctattgggtccctccaccagccacc
ggctagtggctggcaccatcagggtagctcacccaggtcacctggtttcc
cctagactggctcactaaaagggactccagctgtcaggcacatgggccaa
ggcagtggtgaacagctgtggtcctctgttgtggaacactgagcagtgcc
cctcctggtctgtctttgttaatcagttttcactttgcaaggtcactgtg
accttgtgacaatttgtgggtcatgatggcattctgcccagaagctgttg
gctttgaggcaaggtcttgcctctgcaacccaaggcttacctgggcctca
tcattctcctgcctcaagccttcctgactgctggtgcaccacccattcac
aggcttggtctggctttttccaaggcctgtccaataacctgtccaatagc
ccttttggggggagttgcagtctaaatgaccagttagcaagggataaggc
ctggaacagctcatatgcttgcctaaggcggggggccctcttgtccaggt
gaatggc
gaattcctgcatgtcaccctccctgctacattccagaccctctgaaggtg
gcaagctagatggaatggaggcgctagcgaaggggctgttctgcaaggag
ttctgagaggtacagctgtcctggcagcggaccctgggatagctcttggc
taacacaatctgtgggtgctgtgggatcttggccagtaactcatccagaa
gggacctgtgatggtcagtggcctggctcagggaatggggtggggctgag
gacacttgggggtgcttctcctgtttgagggtagacctgctggtgacttt
ctgtgacttaggatttaggaacactggtgatggctgagcactacactgtt
cttcggctaccttcctgacgatggtaaccatgtccttactgcccagtggt
gccgttactcgtctgtgacctgacggcagaacctgcctacaagtctcctt
gggcaatgtgctgcgactccggactagagaagagcagtagccacagggag
actttttgtgcatccctggggttggacactgacacacattgccatgacaa
gtggtagagggccacggggacataggggacttcccgtcacccacgcgacc
cgagcgcttgctggccaccacgttgccctcttggtatgacgaccctgggt
agggtaccctgctggccacagatggctggcaggagcttggggctgtgcta
ttactgatcactggcggctggttactgcttgggcctacaccgttggcaac
aagtggctgccatggactaggaggtggtggctgggacagtcgcttgggga
catggggaccctcaccacatgccatggagtcaagatcaaacgacctcaga
tagagaccagaataaaggaccaaacctacctccccggacagcgtgggtat
tttgagtagaggacagcagtaagttccagtgaccttccctccagtaaaga
gcctatggtggactgtgcgagcaggtgacccttccaatgtgacccttttc
tcccagatcccatcagttgttccagggcaagcccttcccatggtgctgac
cttgctacacgtgctctacaggatccatcgcagtcccacgccacggacga
cttcgctgccagtcacctccctggcaagcctgtgtatccggctcccactg
ttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_73093606_73094736
seq2: B6Ng01-265N08.b_51_1207

seq1  GAATTCTGACCTCCTACCATCTCTAAGTGCTGTGTTTACAGGTGTGCACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGACCTCCTACCATCTCTAAGTGCTGTGTTTACAGGTGTGCACC  50

seq1  ACTATGCCTAACTCCAGGTTCCTTCTTTCGCAAGTCTACTGGAGCAGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCCTAACTCCAGGTTCCTTCTTTCGCAAGTCTACTGGAGCAGCCA  100

seq1  TTGGCACCACATAGCTTGCCTGAGCTGCCACTACACAAGTTGTGGTCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCACCACATAGCTTGCCTGAGCTGCCACTACACAAGTTGTGGTCCAG  150

seq1  TGCAGGGCCGCCAAGCCCTGCCATTCACGGACTTGACCTTCTGCCCAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGGCCGCCAAGCCCTGCCATTCACGGACTTGACCTTCTGCCCAACT  200

seq1  AGCACCCACCATGCACTGGCCAGATTGGAGTAGGGCTGGTGCTGAAGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCCACCATGCACTGGCCAGATTGGAGTAGGGCTGGTGCTGAAGCTG  250

seq1  CCTAGGCCCTCAGCAGCCCAAGTCCCAGGGTGCTGGGCACCTTCTGACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGCCCTCAGCAGCCCAAGTCCCAGGGTGCTGGGCACCTTCTGACTG  300

seq1  GAACTAGCCAAAGAGACAAGGCTTCTACACGGTCCTTGATTGTAACCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAGCCAAAGAGACAAGGCTTCTACACGGTCCTTGATTGTAACCCTT  350

seq1  TCTAGACCTGGCTGAGAGGGTTGGGCTTTAAGAAAGTTCTTAGTTGTGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGACCTGGCTGAGAGGGTTGGGCTTTAAGAAAGTTCTTAGTTGTGCC  400

seq1  AGGTGGATGTGTGTATGTGATGGACCCCGATTGCAGCAGCCTCAGGGTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGATGTGTGTATGTGATGGACCCCGATTGCAGCAGCCTCAGGGTCC  450

seq1  TGTGGTAGGTGTGACAGGAGTGGTTGGTTTAGAACACAGGACACCTTTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTAGGTGTGACAGGAGTGGTTGGTTTAGAACACAGGACACCTTTGA  500

seq1  AGAAACTTAACTCCTTCAGCCTCTCAAGGCCTTTGAGTCTGTGCTGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTTAACTCCTTCAGCCTCTCAAGGCCTTTGAGTCTGTGCTGTGTG  550

seq1  AGGAGATTGGGTGTGAGGTACCTGCTGTCTTCATGGCCTGTCTGCACTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATTGGGTGTGAGGTACCTGCTGTCTTCATGGCCTGTCTGCACTGA  600

seq1  GTGGTAACAGCTAGAGCCAGCCAGGCTATTGGGTCCCTCCACCAGCCACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAACAGCTAGAGCCAGCCAGGCTATTGGGTCCCTCCACCAGCCACC  650

seq1  GGCTAGTGGCTGGCACCATCAGGGTAGCTCACCCAGGTCACCTGGTTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGTGGCTGGCACCATCAGGGTAGCTCACCCAGGTCACCTGGTTTCC  700

seq1  CCTAGACTGGCTCACTAAAAGGGACTCCAGCTGTCAGGCACATGGGCCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGACTGGCTCACTAAAAGGGACTCCAGCTGTCAGGCACATGGGCCAA  750

seq1  GGCAGTGGTGAACAGCTGTGGTCCTCTGTTGTGGAACACTGAGCAGTGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTGGTGAACAGCTGTGGTCCTCTGTTGTGGAACACTGAGCAGTGCC  800

seq1  CCTCCTGGTCTGTCTTTGTTAATCAGTTTTCACTTTGCAAGGTCACTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGGTCTGTCTTTGTTAATCAGTTTTCACTTTGCAAGGTCACTGTG  850

seq1  ACCTTGTGACAATTTGTGGGTCATGATGGCATTCTGCCCAGAAGCTGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGTGACAATTTGTGGGTCATGATGGCATTCTGCCCAGAAGCTGTTG  900

seq1  GCTTTTGAGGCAAGGTCTTG-CTCTGCAACCC-AGGCTTACCTGGGCCTC  948
      || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GC-TTTGAGGCAAGGTCTTGCCTCTGCAACCCAAGGCTTACCTGGGCCTC  949

seq1  ATCATTCTCCTGCCTC-AGCC-TCCTGACTGCTGGTGCACCA-CCATTCA  995
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATCATTCTCCTGCCTCAAGCCTTCCTGACTGCTGGTGCACCACCCATTCA  999

seq1  CA-GCTTGTTCTGTC-TTTTCCAA-GCCTGTCCA--TACCTGTCC-ATAG  1039
      || ||||| |||| | |||||||| |||||||||   |||||||| ||||
seq2  CAGGCTTGGTCTGGCTTTTTCCAAGGCCTGTCCAATAACCTGTCCAATAG  1049

seq1  CCCTTT---GGGGAGTTGCAGTCT-AATGA-CAG-TAGC-AGGGATA--G  1080
      ||||||   ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||  |
seq2  CCCTTTTGGGGGGAGTTGCAGTCTAAATGACCAGTTAGCAAGGGATAAGG  1099

seq1  GCTG--ACAGCTCATGTGGCTGC--TAGGCGGGG---CCTCTTGTCCAGG  1123
       |||  ||||||||| ||  |||   ||||||||   |||||||||||||
seq2  CCTGGAACAGCTCATATGCTTGCCTAAGGCGGGGGGCCCTCTTGTCCAGG  1149

seq1  TGAATGGC  1131
      ||||||||
seq2  TGAATGGC  1157

seq1: chr8_73235282_73236456
seq2: B6Ng01-265N08.g_68_1220 (reverse)

seq1  AAACAGTGGGGAGCCGGATGACCACAGCGCCTGCCCCAGTGGAGGTGACT  50
      ||||||| |||||||||||   ||||| || ||  |||| ||||||||||
seq2  AAACAGT-GGGAGCCGGAT--ACACAG-GCTTG--CCAG-GGAGGTGACT  43

seq1  TGCAGCGGGAGTCTGTCGGTGGCGTGGGGACCTGCGATGGGTCCTGTAGG  100
       ||||| | |||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||| |
seq2  GGCAGC-GAAGTC-GTCCGTGGCGTGGG--ACTGCGATGGATCCTGTA-G  88

seq1  AGCACGGTGTAGCAAGGTCAGGCCACCATGGG-AGGGCTTGCCCTGGGAA  149
      ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  AGCAC-GTGTAGCAAGGTCAG--CACCATGGGAAGGGCTTGCCCT-GGAA  134

seq1  CAACCTGATGGGATCCTGGGGGAGAAAAGGGTCACATTGGAAGGGTCACC  199
      ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CAA-CTGATGGGATC---TGGGAGAAAAGGGTCACATTGGAAGGGTCA-C  179

seq1  CTGCTCGCCACAGTCCACCATAGGCTCTTTTACTGGAGGGAAGGTCACTG  249
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCG-CACAGTCCACCATAGGCTC-TTTACTGGAGGGAAGGTCACTG  227

seq1  GAACTTACTGCTGTCCTCTACTCAAAATACCCACGCTGTCCGGGGAGGTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTACTGCTGTCCTCTACTCAAAATACCCACGCTGTCCGGGGAGGTA  277

seq1  GGTTTGGTCCTTTATTCTGGTCTCTATCTGAGGTCGTTTGATCTTGACTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGTCCTTTATTCTGGTCTCTATCTGAGGTCGTTTGATCTTGACTC  327

seq1  CATGGCATGTGGTGAGGGTCCCCATGTCCCCAAGCGACTGTCCCAGCCAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCATGTGGTGAGGGTCCCCATGTCCCCAAGCGACTGTCCCAGCCAC  377

seq1  CACCTCCTAGTCCATGGCAGCCACTTGTTGCCAACGGTGTAGGCCCAAGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCCTAGTCCATGGCAGCCACTTGTTGCCAACGGTGTAGGCCCAAGC  427

seq1  AGTAACCAGCCGCCAGTGATCAGTAATAGCACAGCCCCAAGCTCCTGCCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACCAGCCGCCAGTGATCAGTAATAGCACAGCCCCAAGCTCCTGCCA  477

seq1  GCCATCTGTGGCCAGCAGGGTACCCTACCCAGGGTCGTCATACCAAGAGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCTGTGGCCAGCAGGGTACCCTACCCAGGGTCGTCATACCAAGAGG  527

seq1  GCAACGTGGTGGCCAGCAAGCGCTCGGGTCGCGTGGGTGACGGGAAGTCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACGTGGTGGCCAGCAAGCGCTCGGGTCGCGTGGGTGACGGGAAGTCC  577

seq1  CCTATGTCCCCGTGGCCCTCTACCACTTGTCATGGCAATGTGTGTCAGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGTCCCCGTGGCCCTCTACCACTTGTCATGGCAATGTGTGTCAGTG  627

seq1  TCCAACCCCAGGGATGCACAAAAAGTCTCCCTGTGGCTACTGCTCTTCTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACCCCAGGGATGCACAAAAAGTCTCCCTGTGGCTACTGCTCTTCTC  677

seq1  TAGTCCGGAGTCGCAGCACATTGCCCAAGGAGACTTGTAGGCAGGTTCTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCGGAGTCGCAGCACATTGCCCAAGGAGACTTGTAGGCAGGTTCTG  727

seq1  CCGTCAGGTCACAGACGAGTAACGGCACCACTGGGCAGTAAGGACATGGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTCAGGTCACAGACGAGTAACGGCACCACTGGGCAGTAAGGACATGGT  777

seq1  TACCATCGTCAGGAAGGTAGCCGAAGAACAGTGTAGTGCTCAGCCATCAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATCGTCAGGAAGGTAGCCGAAGAACAGTGTAGTGCTCAGCCATCAC  827

seq1  CAGTGTTCCTAAATCCTAAGTCACAGAAAGTCACCAGCAGGTCTACCCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTCCTAAATCCTAAGTCACAGAAAGTCACCAGCAGGTCTACCCTC  877

seq1  AAACAGGAGAAGCACCCCCAAGTGTCCTCAGCCCCACCCCATTCCCTGAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGAGAAGCACCCCCAAGTGTCCTCAGCCCCACCCCATTCCCTGAG  927

seq1  CCAGGCCACTGACCATCACAGGTCCCTTCTGGATGAGTTACTGGCCAAGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCCACTGACCATCACAGGTCCCTTCTGGATGAGTTACTGGCCAAGA  977

seq1  TCCCACAGCACCCACAGATTGTGTTAGCCAAGAGCTATCCCAGGGTCCGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACAGCACCCACAGATTGTGTTAGCCAAGAGCTATCCCAGGGTCCGC  1027

seq1  TGCCAGGACAGCTGTACCTCTCAGAACTCCTTGCAGAACAGCCCCTTCGC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGGACAGCTGTACCTCTCAGAACTCCTTGCAGAACAGCCCCTTCGC  1077

seq1  TAGCGCCTCCATTCCATCTAGCTTGCCACCTTCAGAGGGTCTGGAATGTA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCGCCTCCATTCCATCTAGCTTGCCACCTTCAGAGGGTCTGGAATGTA  1127

seq1  GCAGGGAGGGTGACATGCAGGAATTC  1175
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGAGGGTGACATGCAGGAATTC  1153