BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273B02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 7,188,616 - 7,365,795
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG665127, EG546032
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273B02.bB6Ng01-273B02.g
ACCGA074733GA074734
length1,198856
definitionB6Ng01-273B02.b B6Ng01-273B02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,364,602 - 7,365,795)(7,188,616 - 7,189,442)
sequence
gaattccaaagttcacaaatttccagacacaggactgcaagacgactttt
attttggaggatttgacagcatattctgcatcctggacaagggaaagtaa
tgatatcattacttagcacataagtctataatctctacttattaatccaa
ataggtacctactcacactataatgatgatgactgttttcctataggaga
aaatctcttttattcaaaaacaggaatttgtgtatatttaattttgtttg
aggtcatgacccctcacctcccaacatatgccctgtgttaaggaaacctc
tcttcttattattggttatgtagtttagaaatggaaaatgcataaagtaa
aagttaatttctcaatttgttataccaacacccacaagtcactaaagaga
agggatttaagtgggactttccggacattcaggtttatctgagcacagga
cagtttgcattcaatacctgagagtgtttcataaacatcaattaactggc
ataacaacctgggaactttgcttctgtcatatctactttgtagataaaat
gacagcaacatgtaatcaagctacgtggggtgagatataggttgctttcc
cataaacagggagaaagagtcgcaggtttggatgaaatgaaataaaaagg
agtgtgattggcagtcactctcatttatgatcttttgatccagtaaatat
taatttagattttggtatttgcaaaccactaagtccagcttggttctcac
actagttactctctgctaacccttttaacccttatgcaggcacttgccac
ccatctggatcaatagctctgcctcattgtggattcagaaacagctgctg
ctgcttcatagttgcctcacttactctttgcatggcatctgtctccatcc
agatgtgcacacttgtgaggtcagagcacacgcttgttttcttgtgtttg
caggactcctcaagtaaggcggtccatatactgacacattgtctgaaacg
tcacatgtaaacacttttatatctatttcctttctaccatttcacttaaa
atcacccctccccggtctccacttgctgtcctattattcccaagctgtca
gtacaattcttctatccaaatgtgtttttaattcaatgggtcagacgttc
aattaggacctttgtttgaaccttaactttgcaaaggtccctgggaac

gaattctttgtttagttctgtaccacatttttaatagggttacttggctc
tctggagtctaacttcttgagctcttcgtatatattggatattaaccctc
tatgggatgtagtgttggtaagattttttcccaatctgtttgccattttg
tcctattgacagtatcttttgccctacagaagctttgtgattttatgagg
tcccatttgtcagttcttggtcttagagcataagttattggtgttgtgtt
taggaaaatttcccccttgcccatgtgctcgaagctcttccccatctttt
tttctattagtttcagtgtgtctggttttatgtggaggttcttgattcac
ttggacttggataggacttggctaggtgcttaaatttctgccttaacttc
cccacagtgatggactgtaacctggaactgtgagacaaatatatcaattc
ttcactaaattgatttattggatgtgcgggtagtcaggatgttttagcac
agcaacaaaatgaaacttaaactccttaaaaggaaatgctgcattgattc
cccaaagtatctcccatccctaatagattaaaggtcagatacagccttgt
attcaaaacttttcttaaattctattctttacattaaaaactcacactgt
agaagctttgattgctttaggcatttccttgtctgtctgggttccttttc
taagtcataaaatatatacaaaaaaaatgagaacaagattctgaaccatt
ctgcttgcaagatataacaataataagagcacatacatttttcagggcct
gtagatcttcatgtaacagataaaaattagaaaatttatttttcaaatta
ttcttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_7364602_7365795
seq2: B6Ng01-273B02.b_46_1243 (reverse)

seq1  GTTCCAAGGGA-CTTTGCAAAGTTTAGGGTTAAAAAGAAAGTCATAAATG  49
      ||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||  || ||| ||| ||
seq2  GTTCCCAGGGACCTTTGCAAAG-TTAAGGTTCAAACAAAGGTCCTAATTG  49

seq1  AATGTCTGA-CCATGGATTTAAAAACA----TTGATAGAAGGATTTGGTA  94
      || |||||| |||| || |||||||||    | |||||||| |||  |||
seq2  AACGTCTGACCCATTGAATTAAAAACACATTTGGATAGAAGAATT--GTA  97

seq1  CTGACAGCCTGGG-ATAATAGGACAGCAAGTGGAAGACGGGGA-GGGTGA  142
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||
seq2  CTGACAGCTTGGGAATAATAGGACAGCAAGTGGAGACCGGGGAGGGGTGA  147

seq1  TTTTTAAGTGGAAATGTTAGAAAGGAAATAGATATAAAAGTGTTTACATG  192
       |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTTTAAGT-GAAATGGTAGAAAGGAAATAGATATAAAAGTGTTTACATG  195

seq1  TGACGTTTCAGACAATGTGTCAGTATATGGACCGCC-TACTTGAGGAGTC  241
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGACGTTTCAGACAATGTGTCAGTATATGGACCGCCTTACTTGAGGAGTC  245

seq1  CTGCAAACACAAGAAAACAAGCGTGTGCTCTGACCTCACAAGTGTGCACA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAAACACAAGAAAACAAGCGTGTGCTCTGACCTCACAAGTGTGCACA  295

seq1  TCTGGATGGAGACAGATGCCATGCAAAGAGTAAGTGAGGCAACTATGAAG  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGATGGAGACAGATGCCATGCAAAGAGTAAGTGAGGCAACTATGAAG  345

seq1  CAGCAGCAGCTGTTTCTGAATCCACAATGAGGCAGAGCTATTGATCCAGA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCAGCTGTTTCTGAATCCACAATGAGGCAGAGCTATTGATCCAGA  395

seq1  TGGGTGGCAAGTGCCTGCATAAGGGTTAAAAGGGTTAGCAGAGAGTAACT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGGCAAGTGCCTGCATAAGGGTTAAAAGGGTTAGCAGAGAGTAACT  445

seq1  AGTGTGAGAACCAAGCTGGACTTAGTGGTTTGCAAATACCAAAATCTAAA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGAGAACCAAGCTGGACTTAGTGGTTTGCAAATACCAAAATCTAAA  495

seq1  TTAATATTTACTGGATCAAAAGATCATAAATGAGAGTGACTGCCAATCAC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATTTACTGGATCAAAAGATCATAAATGAGAGTGACTGCCAATCAC  545

seq1  ACTCCTTTTTATTTCATTTCATCCAAACCTGCGACTCTTTCTCCCTGTTT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTTTTATTTCATTTCATCCAAACCTGCGACTCTTTCTCCCTGTTT  595

seq1  ATGGGAAAGCAACCTATATCTCACCCCACGTAGCTTGATTACATGTTGCT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAAAGCAACCTATATCTCACCCCACGTAGCTTGATTACATGTTGCT  645

seq1  GTCATTTTATCTACAAAGTAGATATGACAGAAGCAAAGTTCCCAGGTTGT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTTATCTACAAAGTAGATATGACAGAAGCAAAGTTCCCAGGTTGT  695

seq1  TATGCCAGTTAATTGATGTTTATGAAACACTCTCAGGTATTGAATGCAAA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCAGTTAATTGATGTTTATGAAACACTCTCAGGTATTGAATGCAAA  745

seq1  CTGTCCTGTGCTCAGATAAACCTGAATGTCCGGAAAGTCCCACTTAAATC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTGTGCTCAGATAAACCTGAATGTCCGGAAAGTCCCACTTAAATC  795

seq1  CCTTCTCTTTAGTGACTTGTGGGTGTTGGTATAACAAATTGAGAAATTAA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTCTTTAGTGACTTGTGGGTGTTGGTATAACAAATTGAGAAATTAA  845

seq1  CTTTTACTTTATGCATTTTCCATTTCTAAACTACATAACCAATAATAAGA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTACTTTATGCATTTTCCATTTCTAAACTACATAACCAATAATAAGA  895

seq1  AGAGAGGTTTCCTTAACACAGGGCATATGTTGGGAGGTGAGGGGTCATGA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGTTTCCTTAACACAGGGCATATGTTGGGAGGTGAGGGGTCATGA  945

seq1  CCTCAAACAAAATTAAATATACACAAATTCCTGTTTTTGAATAAAAGAGA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAACAAAATTAAATATACACAAATTCCTGTTTTTGAATAAAAGAGA  995

seq1  TTTTCTCCTATAGGAAAACAGTCATCATCATTATAGTGTGAGTAGGTACC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCCTATAGGAAAACAGTCATCATCATTATAGTGTGAGTAGGTACC  1045

seq1  TATTTGGATTAATAAGTAGAGATTATAGACTTATGTGCTAAGTAATGATA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGATTAATAAGTAGAGATTATAGACTTATGTGCTAAGTAATGATA  1095

seq1  TCATTACTTTCCCTTGTCCAGGATGCAGAATATGCTGTCAAATCCTCCAA  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTACTTTCCCTTGTCCAGGATGCAGAATATGCTGTCAAATCCTCCAA  1145

seq1  AATAAAAGTCGTCTTGCAGTCCTGTGTCTGGAAATTTGTGAACTTTGGAA  1191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAGTCGTCTTGCAGTCCTGTGTCTGGAAATTTGTGAACTTTGGAA  1195

seq1  TTC  1194
      |||
seq2  TTC  1198


seq1: chr8_7188616_7189442
seq2: B6Ng01-273B02.g_94_926

seq1  CACATTTTTAATAGGGTTACTTGGCTCTCTGGAGTCTAACTTCTTGAGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTTTAATAGGGTTACTTGGCTCTCTGGAGTCTAACTTCTTGAGCT  50

seq1  CTTCGTATATATTGGATATTAACCCTCTATGGGATGTAGTGTTGGTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCGTATATATTGGATATTAACCCTCTATGGGATGTAGTGTTGGTAAGA  100

seq1  TTTTTTCCCAATCTGTTTGCCATTTTGTCCTATTGACAGTATCTTTTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCCCAATCTGTTTGCCATTTTGTCCTATTGACAGTATCTTTTGCC  150

seq1  CTACAGAAGCTTTGTGATTTTATGAGGTCCCATTTGTCAGTTCTTGGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGAAGCTTTGTGATTTTATGAGGTCCCATTTGTCAGTTCTTGGTCT  200

seq1  TAGAGCATAAGTTATTGGTGTTGTGTTTAGGAAAATTTCCCCCTTGCCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCATAAGTTATTGGTGTTGTGTTTAGGAAAATTTCCCCCTTGCCCA  250

seq1  TGTGCTCGAAGCTCTTCCCCATCTTTTTTTCTATTAGTTTCAGTGTGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCGAAGCTCTTCCCCATCTTTTTTTCTATTAGTTTCAGTGTGTCT  300

seq1  GGTTTTATGTGGAGGTTCTTGATTCACTTGGACTTGGATAGGACTTGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTATGTGGAGGTTCTTGATTCACTTGGACTTGGATAGGACTTGGCT  350

seq1  AGGTGCTTAAATTTCTGCCTTAACTTCCCCACAGTGATGGACTGTAACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCTTAAATTTCTGCCTTAACTTCCCCACAGTGATGGACTGTAACCT  400

seq1  GGAACTGTGAGACAAATATATCAATTCTTCACTAAATTGATTTATTGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTGTGAGACAAATATATCAATTCTTCACTAAATTGATTTATTGGAT  450

seq1  GTGCGGGTAGTCAGGATGTTTTAGCACAGCAACAAAATGAAACTTAAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGGGTAGTCAGGATGTTTTAGCACAGCAACAAAATGAAACTTAAACT  500

seq1  CCTTAAAAGGAAATGCTGCATTGATTCCCCAAAGTATCTCCCATCCCTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAAAGGAAATGCTGCATTGATTCCCCAAAGTATCTCCCATCCCTAA  550

seq1  TAGATTAAAGGTCAGATACAGCCTTGTATTCAAAACTTTTCTTAAATTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTAAAGGTCAGATACAGCCTTGTATTCAAAACTTTTCTTAAATTCT  600

seq1  ATTCTTTACATTAAAAACTCACACTGTAGAAGCTTTGATTGCTTTAGGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTACATTAAAAACTCACACTGTAGAAGCTTTGATTGCTTTAGGCA  650

seq1  TTTCCTTGTCTGTCTGGGT--CCTTTCTAAGTCATAAAATATATAC-AAA  697
      |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTCCTTGTCTGTCTGGGTTCCTTTTCTAAGTCATAAAATATATACAAAA  700

seq1  AAAATGAGAACAAGATTCTGAACCATTCTGCTTGCAAGATATAACAATAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAGAACAAGATTCTGAACCATTCTGCTTGCAAGATATAACAATAA  750

seq1  TAAGAGCACATACA-TTTTCAGGG-CTGTAGATCTTCATGTAACAGATAA  795
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGCACATACATTTTTCAGGGCCTGTAGATCTTCATGTAACAGATAA  800

seq1  AAATTAGAAAATTTA-TTTTCAAATTATTCTTG  827
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAATTAGAAAATTTATTTTTCAAATTATTCTTG  833


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |