BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274M04
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,875,621 - 120,021,214
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933407C03Rik
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan
Downstream genePlcg2, 4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6, Cdh13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274M04.bB6Ng01-274M04.g
ACCGA075980GA075981
length1,0201,001
definitionB6Ng01-274M04.b B6Ng01-274M04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,875,621 - 119,876,637)(120,020,220 - 120,021,214)
sequence
gaattccagccatgagataccctgcaggctcaggccaccggaatggttaa
ataagggcctgctctgtaggcagtagatggctcaggcaccaggttggagg
aaaagtggtccggtctaccttggctcatggaaggctgggctgtctcttgg
cagatgggtttatagcatctgttcatgggttctgtgcacgcctagtctcc
agttgagtgcgctcacggtcatgactttaaaagcaaccaacaacgattga
cttaagtaagtgatttaagttcatctcacttgtggagaatcgatctccca
ggtgtatcatcatctgcccagggtcccacagcttccgggtgatgtaacca
ctctgattccatctgggagactgcgctacagtctcttttggacacatatt
ggatgtttgctagaaccttctatggatgagttaaatgcatctagtgatgg
ggaggagccatgaagccaggctggaaatgtaaaatctaggaggaggcggt
ttgtgttgtgggttcccctggcgagagggccttccagccttgtggctcta
tggcagggttgtggtttggagatgaaaagtccctacaggcacatagtttg
aatacttgttttctggctggtggcgctattttgagaggctgtgggaccct
tatggtatgaggcctcaccagtgagagttggtcatagggacaggcctttg
aagtggatggctcaccactggtcgtggcctctttctctccttcctggtct
acaagattctcaaatcttccacccccatccccactcccacgcacagtctc
tgccatgtctcggctaccacgatggggccacgtctgttgaagcttcaggc
tcaaagtctttccgtccgatatttctagcaggatactccatgtccatgga
gcaccttctggcctgcccacctccatgccgaagtgagctctctttgtccc
gccgagctccccctgcacctcagccacctcaggtctccaagtcagtttca
acacctccctgtgggacaag
gaattccagggcagccaaagccacacagagaaaccctgtccaaagaaaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga
gacttggtttcttctgggtgcctttaatcctagcactcaagaggcagagg
caggtgaatctcttgagtttgaggccaacctggtctacagaaggacttcc
aagacagccagagccacacagagaaattctgttttgaaggataaataaat
aaataaacaagcaagcaaacaaacaaacaaacaaaaagacttggttttat
gtagcccaggctacctcaatcttctagcagggaccaaccttctgatcctc
ctgcctctaactccccggggctcagtttacaggttttgccactgttccct
tttacattgtgtccccccacctcatcccacccccgcagatgtcctgcact
aggtcagcactttaccaacctcatgctgagagccaccttacagctgtccc
agcacagtggccactggctttgttcttgtcaccaatcaccatccaacagg
tatgtatccctttcagacacagggtctccttaagggtctcctttgcagct
caatatgtagaccaggctggcctcaaactcacagagatctgcctccctgg
tgctgaggctaaaggcatgtgccaccactaaatcactcatgaaagagatc
atgatgacatcaaacacatgaaacacgggcctcttctcagaaataatgac
tagggctggagagatggctcaatggttaaaagcaccgactgttcttccta
aggtcctgagttcaaatcccagccaccacatggtggctcacaaccattca
taatgaagatttgacgctctcttctgatgcttttgaagacaactacgatg
tccttagatataataatgaattaattcttaaaaaaataagtaatgatcta
tatgaccctttggcattttctttaaggacctctacatataattatccttt
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119875621_119876637
seq2: B6Ng01-274M04.b_43_1062

seq1  GAATTCCAGCCATGAGATACCCTGCAGGCTCAGGCCACCGGAATGGTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCCATGAGATACCCTGCAGGCTCAGGCCACCGGAATGGTTAA  50

seq1  ATAAGGGCCTGCTCTGTAGGCAGTAGATGGCTCAGGCACCAGGTTGGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGGCCTGCTCTGTAGGCAGTAGATGGCTCAGGCACCAGGTTGGAGG  100

seq1  AAAAGTGGTCCGGTCTACCTTGGCTCATGGAAGGCTGGGCTGTCTCTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGGTCCGGTCTACCTTGGCTCATGGAAGGCTGGGCTGTCTCTTGG  150

seq1  CAGATGGGTTTATAGCATCTGTTCATGGGTTCTGTGCACGCCTAGTCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGGGTTTATAGCATCTGTTCATGGGTTCTGTGCACGCCTAGTCTCC  200

seq1  AGTTGAGTGCGCTCACGGTCATGACTTTAAAAGCAACCAACAACGATTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGAGTGCGCTCACGGTCATGACTTTAAAAGCAACCAACAACGATTGA  250

seq1  CTTAAGTAAGTGATTTAAGTTCATCTCACTTGTGGAGAATCGATCTCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTAAGTGATTTAAGTTCATCTCACTTGTGGAGAATCGATCTCCCA  300

seq1  GGTGTATCATCATCTGCCCAGGGTCCCACAGCTTCCGGGTGATGTAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTATCATCATCTGCCCAGGGTCCCACAGCTTCCGGGTGATGTAACCA  350

seq1  CTCTGATTCCATCTGGGAGACTGCGCTACAGTCTCTTTTGGACACATATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGATTCCATCTGGGAGACTGCGCTACAGTCTCTTTTGGACACATATT  400

seq1  GGATGTTTGCTAGAACCTTCTATGGATGAGTTAAATGCATCTAGTGATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTTTGCTAGAACCTTCTATGGATGAGTTAAATGCATCTAGTGATGG  450

seq1  GGAGGAGCCATGAAGCCAGGCTGGAAATGTAAAATCTAGGAGGAGGCGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGCCATGAAGCCAGGCTGGAAATGTAAAATCTAGGAGGAGGCGGT  500

seq1  TTGTGTTGTGGGTTCCCCTGGCGAGAGGGCCTTCCAGCCTTGTGGCTCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTGTGGGTTCCCCTGGCGAGAGGGCCTTCCAGCCTTGTGGCTCTA  550

seq1  TGGCAGGGTTGTGGTTTGGAGATGAAAAGTCCCTACAGGCACATAGTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGGGTTGTGGTTTGGAGATGAAAAGTCCCTACAGGCACATAGTTTG  600

seq1  AATACTTGTTTTCTGGCTGGTGGCGCTATTTTGAGAGGCTGTGGGACCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTTGTTTTCTGGCTGGTGGCGCTATTTTGAGAGGCTGTGGGACCCT  650

seq1  TATGGTATGAGGCCTCACCAGTGAGAGTTGGTCATAGGGACAGGCCTTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTATGAGGCCTCACCAGTGAGAGTTGGTCATAGGGACAGGCCTTTG  700

seq1  AAGTGGATGGCTCACCACTGGTCGTGGCCTCTTTCTCTCCTTCCTGGTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGATGGCTCACCACTGGTCGTGGCCTCTTTCTCTCCTTCCTGGTCT  750

seq1  ACAAGATTCTCAAATCTTCCACCCCCATCCCCACTCCCACGCACAGTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATTCTCAAATCTTCCACCCCCATCCCCACTCCCACGCACAGTCTC  800

seq1  TGCCATGTCTCGGCTACCACGAT-GGGCCACGTCTGTTGAAGCTTCAGGC  849
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGTCTCGGCTACCACGATGGGGCCACGTCTGTTGAAGCTTCAGGC  850

seq1  TCAAAGTCTTTCCGTCCGATATTTCTAGCAGGATACTCCATGTCCATGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGTCTTTCCGTCCGATATTTCTAGCAGGATACTCCATGTCCATGGA  900

seq1  GCACC-TCTGGCCTGCCCACCTCCATGCCGAAGTGAGCTCTC-TTGTCCC  947
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCACCTTCTGGCCTGCCCACCTCCATGCCGAAGTGAGCTCTCTTTGTCCC  950

seq1  GCCGAGCTCCCCCTGCACCTCAGCCACCTCAGGTCTCCAAGTCAGTTTCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGAGCTCCCCCTGCACCTCAGCCACCTCAGGTCTCCAAGTCAGTTTCA  1000

seq1  ACACCTCCCTGTGGGACAAG  1017
      ||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCCCTGTGGGACAAG  1020

seq1: chr8_120020220_120021214
seq2: B6Ng01-274M04.g_67_1067 (reverse)

seq1  CAAA-GATAA-TATATGTTGAAGTTCCTTAAA-AAAATACCAAAGTGTCA  47
      |||| ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||| ||||
seq2  CAAAGGATAATTATATGTAG-AGGTCCTTAAAGAAAATGCCAAAGGGTCA  49

seq1  TATAG-TCATTATTTCTTTTTTTTAAGATTTATTTATTATTATATCTAAG  96
      ||||| |||||| || ||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||
seq2  TATAGATCATTACTTATTTTTTTAAGAATTAATTCATTATTATATCTAAG  99

seq1  TACATTGTAGTTGTCTTCAGATGCATCAGAAGAGGGCGTCAAATC-TCAT  145
       |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  GACATCGTAGTTGTCTTCAAAAGCATCAGAAGAGAGCGTCAAATCTTCAT  149

seq1  TATGAATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGAC  195
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTGGCTGGGATTTGAACTCAGGAC  199

seq1  CTTAGGAAGAACAGTCGGTGCTTTTAACCATTGAGCCATCTCTCCAGCCC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGAAGAACAGTCGGTGCTTTTAACCATTGAGCCATCTCTCCAGCCC  249

seq1  TAGTCATTATTTCTGAGAAGAGGCCCGTGTTTCATGTGTTTGATGTCATC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCATTATTTCTGAGAAGAGGCCCGTGTTTCATGTGTTTGATGTCATC  299

seq1  ATGATCTCTTTCATGAGTGATTTAGTGGTGGCACATGCCTTTAGCCTCAG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCTCTTTCATGAGTGATTTAGTGGTGGCACATGCCTTTAGCCTCAG  349

seq1  CACCAGGGAGGCAGATCTCTGTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACATAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGGAGGCAGATCTCTGTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACATAT  399

seq1  TGAGCTGC-AAGGAGACCCTTAAGGAGACCCTGTGTCTG-AAGGGATACA  443
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGAGCTGCAAAGGAGACCCTTAAGGAGACCCTGTGTCTGAAAGGGATACA  449

seq1  TACCTGTTGGATGGTGATTGGTGACAAGAACAAAGCCAGTGGCCACTGTG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGTTGGATGGTGATTGGTGACAAGAACAAAGCCAGTGGCCACTGTG  499

seq1  CTGGGACAGCTGTAAGGTGGCTCTCAGCATGAGGTTGGTAAAGTGCTGAC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGACAGCTGTAAGGTGGCTCTCAGCATGAGGTTGGTAAAGTGCTGAC  549

seq1  CTAGTGCAGGACATCTGCGGGGGTGGGATGAGGTGGGGGGACACAATGTA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGCAGGACATCTGCGGGGGTGGGATGAGGTGGGGGGACACAATGTA  599

seq1  AAAGGGAACAGTGGCAAAACCTGTAAACTGAGCCCCGGGGAGTTAGAGGC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGAACAGTGGCAAAACCTGTAAACTGAGCCCCGGGGAGTTAGAGGC  649

seq1  AGGAGGATCAGAAGGTTGGTCCCTGCTAGAAGATTGAGGTAGCCTGGGCT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGATCAGAAGGTTGGTCCCTGCTAGAAGATTGAGGTAGCCTGGGCT  699

seq1  ACATAAAACCAAGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGCTTGTTTAT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAACCAAGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGCTTGTTTAT  749

seq1  TTATTTATTTATCCTTCAAAACAGAATTTCTCTGTGTGGCTCTGGCTGTC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATTTATCCTTCAAAACAGAATTTCTCTGTGTGGCTCTGGCTGTC  799

seq1  TTGGAAGTCCTTCTGTAGACCAGGTTGGCCTCAAACTCAAGAGATTCACC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAGTCCTTCTGTAGACCAGGTTGGCCTCAAACTCAAGAGATTCACC  849

seq1  TGCCTCTGCCTCTTGAGTGCTAGGATTAAAGGCACCCAGAAGAAACCAAG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTGCCTCTTGAGTGCTAGGATTAAAGGCACCCAGAAGAAACCAAG  899

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  949

seq1  TCTCTTTCTTTGGACAGGGTTTCTCTGTGTGGCTTTGGCTGCCCTGGAAT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCTTTGGACAGGGTTTCTCTGTGTGGCTTTGGCTGCCCTGGAAT  999

seq1  TC  995
      ||
seq2  TC  1001