BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-276D23
Chromosome8 (Build37)
Map Location 84,475,652 - 84,615,294
singlet/doubletdoublet
Overlap geneInpp4b
Upstream geneUsp38, EG70793, LOC236010, LOC384852
Downstream geneLOC671182, Il15, EG666564, LOC675800, EG666289, Zfp330, Rnf150
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-276D23.bB6Ng01-276D23.g
ACCGA077076GA077077
length1,1381,065
definitionB6Ng01-276D23.b B6Ng01-276D23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,614,157 - 84,615,294)(84,475,652 - 84,476,719)
sequence
gaattcatttagcatactcacctattctagatgaaagagtgaggagaaaa
gggggttgatgattttgaaaagcctgttatatagttttattttatgtaaa
tataaattttaacatcatttaacaagtctagtttaatattatcgctattg
ggaggattgttgaaacaaaccaacacatgagtatttgctttctcagacac
agttgtccctgtttgataataaagggtcactagctggagtggagtactca
cagtctttacaagtattgatgttcagccaactgagactgaagctaatgtg
ggatggcatgtttttgtttgttgcctagctttctagtcagctataagggg
agagaatatgaccaggttagaattcagctgcccatctttatgggcagatt
aaagaacatgtatgcttacaaatatcacttctcaaatcctcttaaaacca
ttacttcctctaagctcataatttgataaagtaatccactttaatgttaa
ctgtcaatatgtgtcaattttagaattcaagacaaaccccgctgattgtc
tagattacagctgtgggggagggctctgtgtgtgtgtgtttgcattttat
gtatgtttctgtgaagagtcaaacatgtgcattatgtatgcatatatgta
tggcagaagactgactatggcagaagtccatcttctctgccatccacatt
tatttactttcttatttttagggtatattttctctctgggctagaagtta
ccaagtaggtttgtttatctggcaagacagccctagtgagctgtgtattt
tggtcttctcaacgttgtgattgcaaaagcaggtcacgatgcctggcctt
ttacatgtgatcaacctcagatcttcatctttggaatgtgaatactttac
caagagagccacctccctagccccagaaagaacatattattagcaggcat
ctttgtgttctctttatgggtaggaagtgcttatcctatctggcatggat
accagcttaggggtgcccactctcatggctctgaacatgtcctacacttt
cttcccttatctgcttgtcttaattgctcatcacattgcagaagcaggtt
gttacgcaaggaacatagaggaatgaactgtcattatt
gaattcagctaagcagtatatccagcgttcatcagcattcctttcaaaag
gcaaaccgactctttaaattaacttggctaaaggctagaatttggataaa
agttaataatttaaatctaaatggcagggttaggcattcctttggataaa
gctgagataacatatatgaatgtggagtattgaaattgtccttgagagaa
atgaatgtcaagaaaactacctgagcctactatctgtagtatttcattaa
aatttaactttttgaagtttgtatagtctaaacttcttatactttatcta
attttattttaagctggtaaactcaagattgcctttgaaggacttcgata
gtgctaattaatagttctattatgtgtactttaaagacaacaataaacat
tgtctatcattttgtattcttaacagaaaccaggagttaaaagaacttgg
tgacctttccccacactgggacaacctacggaaaaatgtcctttctcact
gtgatcaaatggtgactatgtaccaagacattctgacagaactttccaaa
gaaacaggtatgaagcagcaacttcactttcccagattatattacaatag
tggatgtcccaaggaagcaatgactagaactgtggaggtgagatagaaga
gccaatggttaaacttctaactctcttatcttggcatctatagcaaggaa
gaatggactatgatactctgatttatggtattgttaaggtaatatgataa
tgactgaaagagtttttaaaattaattttatgtgaagaatgtaaaggggt
taatgttttcctttccgaagttcttgtaagatctcttatcttttccacat
gtattcttgcaggcacacatactacatattggtttatatgtctgcttatt
catttgttaatcatttctgatctttattcttctagggtcctctttcaatc
cagcagcagcaaaggagagaaacattagaatttgttccagtaaatctaca
cttgcacgggatgcagtgcacagccctcactgaaaggtattgatattcct
ttcaggagtttcaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_84614157_84615294
seq2: B6Ng01-276D23.b_43_1180 (reverse)

seq1  AATAATGACAG-TCATTCTTCTATGTTCC-TGTGT-ACAAACTGCTTCTG  47
      ||||||||||| |||||| |||||||||| || || |||| |||||||||
seq2  AATAATGACAGTTCATTCCTCTATGTTCCTTGCGTAACAACCTGCTTCTG  50

seq1  CAAAGGTTGGAGAGCAATTAAGACAGGCAGA-AAGGGAAGGAAGTGTAGG  96
      ||| |  ||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||
seq2  CAATG--TGATGAGCAATTAAGACAAGCAGATAAGGGAAGAAAGTGTAGG  98

seq1  ACATGTTCAGAGCCATGAGGAGTGGGCACCCCCTAAGCTGGTATCCATGC  146
      |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTTCAGAGCCATGA-GAGTGGGCA-CCCCTAAGCTGGTATCCATGC  146

seq1  CAGATAGGATAAGCACTTCCTACCCATAAAGAGAACACAAAGATGCCTGC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAGGATAAGCACTTCCTACCCATAAAGAGAACACAAAGATGCCTGC  196

seq1  TAATAATATGTTCTTTCTGGGGCTAGGGAGGTGGCTCTCTTGGTAAAGTA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATATGTTCTTTCTGGGGCTAGGGAGGTGGCTCTCTTGGTAAAGTA  246

seq1  TTCACATTCCAAAGATGAAGATCTGAGGTTGATCACATGTAAAAGGCCAG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATTCCAAAGATGAAGATCTGAGGTTGATCACATGTAAAAGGCCAG  296

seq1  GCATCGTGACCTGCTTTTGCAATCACAACGTTGAGAAGACCAAAATACAC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCGTGACCTGCTTTTGCAATCACAACGTTGAGAAGACCAAAATACAC  346

seq1  AGCTCACTAGGGCTGTCTTGCCAGATAAACAAACCTACTTGGTAACTTCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCACTAGGGCTGTCTTGCCAGATAAACAAACCTACTTGGTAACTTCT  396

seq1  AGCCCAGAGAGAAAATATACCCTAAAAATAAGAAAGTAAATAAATGTGGA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGAGAGAAAATATACCCTAAAAATAAGAAAGTAAATAAATGTGGA  446

seq1  TGGCAGAGAAGATGGACTTCTGCCATAGTCAGTCTTCTGCCATACATATA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAGAAGATGGACTTCTGCCATAGTCAGTCTTCTGCCATACATATA  496

seq1  TGCATACATAATGCACATGTTTGACTCTTCACAGAAACATACATAAAATG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACATAATGCACATGTTTGACTCTTCACAGAAACATACATAAAATG  546

seq1  CAAACACACACACACAGAGCCCTCCCCCACAGCTGTAATCTAGACAATCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACACACACACAGAGCCCTCCCCCACAGCTGTAATCTAGACAATCA  596

seq1  GCGGGGTTTGTCTTGAATTCTAAAATTGACACATATTGACAGTTAACATT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGGGTTTGTCTTGAATTCTAAAATTGACACATATTGACAGTTAACATT  646

seq1  AAAGTGGATTACTTTATCAAATTATGAGCTTAGAGGAAGTAATGGTTTTA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGATTACTTTATCAAATTATGAGCTTAGAGGAAGTAATGGTTTTA  696

seq1  AGAGGATTTGAGAAGTGATATTTGTAAGCATACATGTTCTTTAATCTGCC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATTTGAGAAGTGATATTTGTAAGCATACATGTTCTTTAATCTGCC  746

seq1  CATAAAGATGGGCAGCTGAATTCTAACCTGGTCATATTCTCTCCCCTTAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGATGGGCAGCTGAATTCTAACCTGGTCATATTCTCTCCCCTTAT  796

seq1  AGCTGACTAGAAAGCTAGGCAACAAACAAAAACATGCCATCCCACATTAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGACTAGAAAGCTAGGCAACAAACAAAAACATGCCATCCCACATTAG  846

seq1  CTTCAGTCTCAGTTGGCTGAACATCAATACTTGTAAAGACTGTGAGTACT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTCTCAGTTGGCTGAACATCAATACTTGTAAAGACTGTGAGTACT  896

seq1  CCACTCCAGCTAGTGACCCTTTATTATCAAACAGGGACAACTGTGTCTGA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCAGCTAGTGACCCTTTATTATCAAACAGGGACAACTGTGTCTGA  946

seq1  GAAAGCAAATACTCATGTGTTGGTTTGTTTCAACAATCCTCCCAATAGCG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAAATACTCATGTGTTGGTTTGTTTCAACAATCCTCCCAATAGCG  996

seq1  ATAATATTAAACTAGACTTGTTAAATGATGTTAAAATTTATATTTACATA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATTAAACTAGACTTGTTAAATGATGTTAAAATTTATATTTACATA  1046

seq1  AAATAAAACTATATAACAGGCTTTTCAAAATCATCAACCCCCTTTTCTCC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAACTATATAACAGGCTTTTCAAAATCATCAACCCCCTTTTCTCC  1096

seq1  TCACTCTTTCATCTAGAATAGGTGAGTATGCTAAATGAATTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCTTTCATCTAGAATAGGTGAGTATGCTAAATGAATTC  1138

seq1: chr8_84475652_84476719
seq2: B6Ng01-276D23.g_65_1129

seq1  GAATTCAGCTAAGCAGTATATCCAGCGTTCATCAGCATTCCTTTCAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTAAGCAGTATATCCAGCGTTCATCAGCATTCCTTTCAAAAG  50

seq1  GCAAACCGACTCTTTAAATTAACTTGGCTAAAGGCTAGAATTTGGATAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACCGACTCTTTAAATTAACTTGGCTAAAGGCTAGAATTTGGATAAA  100

seq1  AGTTAATAATTTAAATCTAAATGGCAGGGTTAGGCATTCCTTTGGATAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAATAATTTAAATCTAAATGGCAGGGTTAGGCATTCCTTTGGATAAA  150

seq1  GCTGAGATAACATATATGAATGTGGAGTATTGAAATTGTCCTTGAGAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGATAACATATATGAATGTGGAGTATTGAAATTGTCCTTGAGAGAA  200

seq1  ATGAATGTCAAGAAAACTACCTGAGCCTACTATCTGTAGTATTTCATTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGTCAAGAAAACTACCTGAGCCTACTATCTGTAGTATTTCATTAA  250

seq1  AATTTAACTTTTTGAAGTTTGTATAGTCTAAACTTCTTATACTTTATCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAACTTTTTGAAGTTTGTATAGTCTAAACTTCTTATACTTTATCTA  300

seq1  ATTTTATTTTAAGCTGGTAAACTCAAGATTGCCTTTGAAGGACTTCGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATTTTAAGCTGGTAAACTCAAGATTGCCTTTGAAGGACTTCGATA  350

seq1  GTGCTAATTAATAGTTCTATTATGTGTACTTTAAAGACAACAATAAACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTAATTAATAGTTCTATTATGTGTACTTTAAAGACAACAATAAACAT  400

seq1  TGTCTATCATTTTGTATTCTTAACAGAAACCAGGAGTTAAAAGAACTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTATCATTTTGTATTCTTAACAGAAACCAGGAGTTAAAAGAACTTGG  450

seq1  TGACCTTTCCCCACACTGGGACAACCTACGGAAAAATGTCCTTTCTCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTTTCCCCACACTGGGACAACCTACGGAAAAATGTCCTTTCTCACT  500

seq1  GTGATCAAATGGTGACTATGTACCAAGACATTCTGACAGAACTTTCCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCAAATGGTGACTATGTACCAAGACATTCTGACAGAACTTTCCAAA  550

seq1  GAAACAGGTATGAAGCAGCAACTTCACTTTCCCAGATTATATTACAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGGTATGAAGCAGCAACTTCACTTTCCCAGATTATATTACAATAG  600

seq1  TGGATGTCCCAAGGAAGCAATGACTAGAACTGTGGAGGTGAGATAGAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTCCCAAGGAAGCAATGACTAGAACTGTGGAGGTGAGATAGAAGA  650

seq1  GCCAATGGTTAAACTTCTAACTCTCTTATCTTGGCATCTATAGCAAGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGGTTAAACTTCTAACTCTCTTATCTTGGCATCTATAGCAAGGAA  700

seq1  GAATGGACTATGATACTCTGATTTATGGTATTGTTAAGGTAATATGATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGACTATGATACTCTGATTTATGGTATTGTTAAGGTAATATGATAA  750

seq1  TGACTGAAAGAGTTTTTAAAATTAATTTTATGTGAAGAATGTAAAGGGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGAAAGAGTTTTTAAAATTAATTTTATGTGAAGAATGTAAAGGGGT  800

seq1  TAATGTTTTCCTTTCCGAAGTTCTTGTAAGATCTCTTATCTTTTCCACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTTTTCCTTTCCGAAGTTCTTGTAAGATCTCTTATCTTTTCCACAT  850

seq1  GTATTCTTGCAGGCACACATACTACATATTGGTTTATATGTCTGCTTATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCTTGCAGGCACACATACTACATATTGGTTTATATGTCTGCTTATT  900

seq1  CATTTGTTAATCATTTCTGATCTTTATTCTTCTAGGGTCCTCTTTCAAAT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CATTTGTTAATCATTTCTGATCTTTATTCTTCTAGGGTCCTCTTTC-AAT  949

seq1  CCAGCAGCAGCAAAGGAGAGAAAACATTAGAATTTGTTCCAGTAAATCTA  1000
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAGCAGCAAAGGAGAG-AAACATTAGAATTTGTTCCAGTAAATCTA  998

seq1  CACTTGCAACGGATGCAGGTGCACAGCCCTCACCTGAAAGGTATTGATAT  1050
      ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CACTTGCACGGGATGCA-GTGCACAGCCCTCA-CTGAAAGGTATTGATAT  1046

seq1  TCC-TTCAGGAGTTTCAGA  1068
      ||| |||||||||||||||
seq2  TCCTTTCAGGAGTTTCAGA  1065