BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-276H18
Chromosome8 (Build37)
Map Location 53,033,378 - 53,172,345
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC667517, LOC623872
Downstream geneLOC100040220, LOC623935, 1190028D05Rik, LOC676688
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-276H18.bB6Ng01-276H18.g
ACCGA077255GA077256
length1,1491,146
definitionB6Ng01-276H18.b B6Ng01-276H18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(53,033,378 - 53,034,539)(53,171,193 - 53,172,345)
sequence
gaattctttcatcaattctttcaaactttactcatataaagtttaatatt
atttctctcctcttttttctttggctttgatacatacatatcaaataaac
acaatgttgcttacctgtcacagccatcaattaattcatatatatgcata
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atttcaagaataaagtaaacttctaatctgatcattcatgttcacaaagt
agatttggactttttgaccagcatattcgatatgaatttatctttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_53033378_53034539
seq2: B6Ng01-276H18.b_45_1193

seq1  GAATTCTTTCATCAATTCTTTCAAACTTTACTCATATAAAGTTTAATATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACATACTGCTTAGATTATTTTAGAAATTATAATACCCCTTTAAGAT  500

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTTTGGAGTAGCATAAATGGCTATGTGCTGCAGTGAGCAAAAACAA  900

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGCTGGACAACCAGATCTAATCTGTTATCTATGTTAGAATAGAGAG  950

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      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| 
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      |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||   |||||| 
seq2  ATCTAGCATGTAGATGAGT--AGTACACCTTACTTTGTGAATATTTCTC-  1092

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      |||||||||||| |||||||||||  |||||||   | | ||||  ||||
seq2  ATCTGAAATTATAAAAAAATAAAAACATTTATT---TATCTGTG--AATA  1137

seq1  TCATAGCCCAAGA  1162
      |||||| ||||||
seq2  TCATAG-CCAAGA  1149

seq1: chr8_53171193_53172345
seq2: B6Ng01-276H18.g_63_1208 (reverse)

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      ||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||   || |||||
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      ||  ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||  |||
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      || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
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      ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCAAATTTCACTATAAGATATGCATGACTTACTGTATACATTGTAA  239

seq1  ATCTAACACAGGAACACACATGCATACCCACTGAAACACTCAGATTTTCT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CTAAATGTTACTGTTCTAAAATGTTGTGTTTATTTATATTCCTTGTATAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATGGAATATATTAATTCTCAGATTTTACAGAAGGTTTGATAACTGGAAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AACAAATTTTACAAATATACTAGTCTTTCATTTTATCTGCATTATGGAGA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTTAATATTCAACCTAAATTATTAATTTCAGTCAGATTATAATATATATT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTCATAGACGTCCCATTTTTTAATAATTAAATGTAAATTTGGTATTTTAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTACAGTTCCTAAAAGATAAAAATGTATTAATGAATACATTAAAAATATA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGACTAAATGGTTCGTGATAATCTCACTGATTGCAGATGATATCACTAAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ACTAATAAAAATGAGAAATGTTAAGTTTTACACATTTTTTTGAAATTATA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAGGTTGTCATGGTTAGTCTATGATTCAGTCATGCTTGGTTATAAGTTGT  996
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ACTGTTTCATTGTTTTAAAGCAAATCATCTATGAACTCACGTACTTTTGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GAGATGTCTTTGTTTAGATCTTCAATCACACCATCACTCTCCCATCCCTT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGAATTC  1153
      |||||||
seq2  AGAATTC  1146