BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283C24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 42,569,125 - 42,681,322
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZdhhc2, Cnot7, Vps37a, Mtmr7, LOC100039179, Adam24, LOC667019, LOC100039170, LOC436137, Adam25, EG667041, LOC667052, LOC384806, Adam39, LOC384808, EG667077, Slc7a2, Pdgfrl, Mtus1, Fgl1, Pcm1, Asah1, Frg1
Downstream geneLOC100039376, Gm1815, LOC671994, Zfp353, EG620772, LOC628212
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283C24.bB6Ng01-283C24.g
ACCGA082211GA082212
length1,1161,112
definitionB6Ng01-283C24.b B6Ng01-283C24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(42,569,125 - 42,570,237)(42,680,213 - 42,681,322)
sequence
gaattcagtgacctttcatctgcattaaagtcagaatttggaattttgag
tattttcttttacgaattagcattaactgcaccaaaagagcttaatgaga
gtcacatggcatgtggcgctcactttttaacaattaaccgaaaaagaaaa
gctcattgatttgtttcattttcaagagtggaaaacagcagccgcaaagg
aatattgaccagggtcaaagcatgttaaggcatggtccagctcctttgta
acagattggtatggagtgattttgtgtccaagttttactggtgtcagcag
actgaataagaccacacacagaaatgctgaatggccaaacaagggctggc
ctcatccagcaacaacggaatatttaggacagtagtcctgaactgtcaca
gtggcgcaagtgccctgccctagtcgtcccagatgggacaatgtaagaaa
gaatgcttttgatgcagacaggtcaatgtcttctttctctactccagctt
tgcaacatctgagccacctttggtaggagggcttaagacagcggctctca
atctgggggtgacaacccccggggggggtcatatatcagatatcctctat
atcagatatttacatacaattcataacagtagcaaagctacagatatgaa
gtagcagcaaaataattttatggtttggcgtcacagcattaggaaggctg
agaaccactgctctaagataaaggcttgctcctttccctaagttttcaat
tcttaaaatttctcctgtaagggttggagagatagctggactagttaaga
acactggctgctcttcctgaggacttgggacttgattcccagcaccccca
cggtggcttacaaccatatgtaactccagttctgggggatctgacatttt
cttctggcctaggataccaaggcacaagtgtccaggcaaacacacgtgta
tataaaaaaacaaaaaataaataaattaatttaaaatgccactggttcca
gaatcttccttgccttgggtgctactgacaacacttccttcccttctttt
tgatcactcacacacactgcacagtgatatcacagccctgattacatcac
tggtgggtccttcact
gaattctctctgtgggagaggccactcaataaagcttcaatgtaaataaa
agaagattacctgaaagaaaaatgttttctgtcttagacctgggagctca
aggatctatccaaggtcctgacttccatactaacaccacaacctcaaatg
tagcctaccatcacagtttctcccttatatcttctaaaatccccatccaa
atgattatgactcccaaccaccccaataacctgccttgaatatgcatgga
ttaatcacaccccaattcacatcaaaaagggaaatgacgtttttgttcaa
atcatgaaacaaatgtatttggtagtttgagaaagaactaaaaactgaaa
actcccattgaaagtgcacccaactcatattgtcaggtagtattaataat
gggtctcatttcatttcctagaggtcaattcacctctcatttgttttcaa
acaaatatatataaagtagctcctagtaatgccagtactttgccaggaca
accacagctcaaaccaaatttgtcttatgctaatttaaatttttatcaat
ttctttggcatgtcaaatatctattattgttatttttattgatttccata
gtttacctatcaagagaaactaggcacacatatctttagcacacatattt
atgttacatagtctaggaacacaagtctgtgacaactttccacaggactc
aatctaaatgaaacattttacattccaaaattgcttgacattctataaca
acaattctcaactggtgggtcatgacgtcttttgtacctgaatgatcctt
ttacagaggtcacctaaaatcgtaggaaaacacagatatttatattacaa
ctcataatagttgcaaaatgaaagttatgaagtaacaatgaaaataattt
tagagttggggggtcaccccaacatgaaggaactgcattaaagggtcaca
gcattgggaaggttaagaaacactgttttaataagaaaactaaccttcat
gtctccttgtattctttcatagaattaaatttcttactgaaatctgcttg
gtgtcttttcttcgtgctcagttttggaaaactacttgaactcacaaggc
tcagagacatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_42569125_42570237
seq2: B6Ng01-283C24.b_45_1160

seq1  GAATTCAGTGACCTTTCATCTGCATTAAAGTCAGAATTTGGAATTTTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGACCTTTCATCTGCATTAAAGTCAGAATTTGGAATTTTGAG  50

seq1  TATTTTCTTTTACGAATTAGCATTAACTGCACCAAAAGAGCTTAATGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTTTTACGAATTAGCATTAACTGCACCAAAAGAGCTTAATGAGA  100

seq1  GTCACATGGCATGTGGCGCTCACTTTTTAACAATTAACCGAAAAAGAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACATGGCATGTGGCGCTCACTTTTTAACAATTAACCGAAAAAGAAAA  150

seq1  GCTCATTGATTTGTTTCATTTTCAAGAGTGGAAAACAGCAGCCGCAAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATTGATTTGTTTCATTTTCAAGAGTGGAAAACAGCAGCCGCAAAGG  200

seq1  AATATTGACCAGGGTCAAAGCATGTTAAGGCATGGTCCAGCTCCTTTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGACCAGGGTCAAAGCATGTTAAGGCATGGTCCAGCTCCTTTGTA  250

seq1  ACAGATTGGTATGGAGTGATTTTGTGTCCAAGTTTTACTGGTGTCAGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTGGTATGGAGTGATTTTGTGTCCAAGTTTTACTGGTGTCAGCAG  300

seq1  ACTGAATAAGACCACACACAGAAATGCTGAATGGCCAAACAAGGGCTGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATAAGACCACACACAGAAATGCTGAATGGCCAAACAAGGGCTGGC  350

seq1  CTCATCCAGCAACAACGGAATATTTAGGACAGTAGTCCTGAACTGTCACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCCAGCAACAACGGAATATTTAGGACAGTAGTCCTGAACTGTCACA  400

seq1  GTGGCGCAAGTGCCCTGCCCTAGTCGTCCCAGATGGGACAATGTAAGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCGCAAGTGCCCTGCCCTAGTCGTCCCAGATGGGACAATGTAAGAAA  450

seq1  GAATGCTTTTGATGCAGACAGGTCAATGTCTTCTTTCTCTACTCCAGCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCTTTTGATGCAGACAGGTCAATGTCTTCTTTCTCTACTCCAGCTT  500

seq1  TGCAACATCTGAGCCACCTTTGGTAGGAGGGCTTAAGACAGCGGCTCTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACATCTGAGCCACCTTTGGTAGGAGGGCTTAAGACAGCGGCTCTCA  550

seq1  ATCTGGGGGTGACAACCCCCGGGGGGGGTCATATATCAGATATCCTCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGGGTGACAACCCCCGGGGGGGGTCATATATCAGATATCCTCTAT  600

seq1  ATCAGATATTTACATACAATTCATAACAGTAGCAAAGCTACAGATATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGATATTTACATACAATTCATAACAGTAGCAAAGCTACAGATATGAA  650

seq1  GTAGCAGCAAAATAATTTTATGGTTTGGCGTCACAGCATTAGGAAGGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGCAAAATAATTTTATGGTTTGGCGTCACAGCATTAGGAAGGCTG  700

seq1  AGAACCACTGCTCTAAGATAAAGGCTTGCTCCTTTCCCTAAGTTTTCAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCACTGCTCTAAGATAAAGGCTTGCTCCTTTCCCTAAGTTTTCAAT  750

seq1  TCTTAAAATTTCTCCTGTAAGGGTTGGAGAGATAGCTGGACTAGTTAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAAATTTCTCCTGTAAGGGTTGGAGAGATAGCTGGACTAGTTAAGA  800

seq1  ACACTGGCTGCTCTTCCTGAGGACTTGGGACTTGATTCCCAGCACCCCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGGCTGCTCTTCCTGAGGACTTGGGACTTGATTCCCAGCACCCCCA  850

seq1  CGGTGGCTTACAACCATATGTAACTCCAGTTCTGGGGGATCTGACATTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTGGCTTACAACCATATGTAACTCCAGTTCTGGGGGATCTGACATTTT  900

seq1  CTTCTGGCCTAGGATACCAAGGCACAAGTGTCCAGGCAAAACACACGTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTTCTGGCCTAGGATACCAAGGCACAAGTGTCCAGGC-AAACACACGTGT  949

seq1  ATATAAAAAAAC-AAAAATAAATAAATTAATTAAAAATGCCACT-GTTCC  998
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  ATATAAAAAAACAAAAAATAAATAAATTAATTTAAAATGCCACTGGTTCC  999

seq1  AGAATCTTCCTTG-CTTGGGTGCTACTGACAACACTTCCCTTCCCTC-TT  1046
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || ||
seq2  AGAATCTTCCTTGCCTTGGGTGCTACTGACAACACTTCCTTCCCTTCTTT  1049

seq1  TTGATCACTCACACACACTGCACAGTGATTATCCACAGCCCTG-GTACAT  1095
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||
seq2  TTGATCACTCACACACACTGCACAGTGA-TAT-CACAGCCCTGATTACAT  1097

seq1  CAACTGTGGGTCC-TCACT  1113
      ||   |||||||| |||||
seq2  CACTGGTGGGTCCTTCACT  1116

seq1: chr8_42680213_42681322
seq2: B6Ng01-283C24.g_67_1178 (reverse)

seq1  GTATGTCTCTGAGGCTTGTGAATTTCAGTAAGTTTTCCAAAACTGAACCA  50
      ||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||| | ||
seq2  GTATGTCTCTGAGCCTTGTGAGTTCAAGT-AGTTTTCCAAAACTG-AGCA  48

seq1  CGAAG-AAAGACA-CAAGCAGATTTCAGTAGGAAATTTAAATCTATGAAA  98
      ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  CGAAGAAAAGACACCAAGCAGATTTCAGTAAGAAATTTAATTCTATGAAA  98

seq1  GAATACAAGGAGACAATGAAGGTTAG-TATCTTA-TAAAACAGTGGTTCT  146
      |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||
seq2  GAATACAAGGAGAC-ATGAAGGTTAGTTTTCTTATTAAAACAGTGTTTCT  147

seq1  TAACCTTCCCAATGCTGTGACCCTTTAATGCAGTTCC-TCATGTTGGGGT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TAACCTTCCCAATGCTGTGACCCTTTAATGCAGTTCCTTCATGTTGGGGT  197

seq1  GACCCCCCAACTCTAAAATTATTTTCATTGTTACTTCATAACTTTCATTT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCCCAACTCTAAAATTATTTTCATTGTTACTTCATAACTTTCATTT  247

seq1  TGCAACTATTATGAGTTGTAATATAAATATCTGTGTTTTCCTACGATTTT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACTATTATGAGTTGTAATATAAATATCTGTGTTTTCCTACGATTTT  297

seq1  AGGTGACCTCTGTAAAAGGATCATTCAGGTACAAAAGACGTCATGACCCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGACCTCTGTAAAAGGATCATTCAGGTACAAAAGACGTCATGACCCA  347

seq1  CCAGTTGAGAATTGTTGTTATAGAATGTCAAGCAATTTTGGAATGTAAAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTGAGAATTGTTGTTATAGAATGTCAAGCAATTTTGGAATGTAAAA  397

seq1  TGTTTCATTTAGATTGAGTCCTGTGGAAAGTTGTCACAGACTTGTGTTCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCATTTAGATTGAGTCCTGTGGAAAGTTGTCACAGACTTGTGTTCC  447

seq1  TAGACTATGTAACATAAATATGTGTGCTAAAGATATGTGTGCCTAGTTTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTATGTAACATAAATATGTGTGCTAAAGATATGTGTGCCTAGTTTC  497

seq1  TCTTGATAGGTAAACTATGGAAATCAATAAAAATAACAATAATAGATATT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATAGGTAAACTATGGAAATCAATAAAAATAACAATAATAGATATT  547

seq1  TGACATGCCAAAGAAATTGATAAAAATTTAAATTAGCATAAGACAAATTT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATGCCAAAGAAATTGATAAAAATTTAAATTAGCATAAGACAAATTT  597

seq1  GGTTTGAGCTGTGGTTGTCCTGGCAAAGTACTGGCATTACTAGGAGCTAC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGAGCTGTGGTTGTCCTGGCAAAGTACTGGCATTACTAGGAGCTAC  647

seq1  TTTATATATATTTGTTTGAAAACAAATGAGAGGTGAATTGACCTCTAGGA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATATATTTGTTTGAAAACAAATGAGAGGTGAATTGACCTCTAGGA  697

seq1  AATGAAATGAGACCCATTATTAATACTACCTGACAATATGAGTTGGGTGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAATGAGACCCATTATTAATACTACCTGACAATATGAGTTGGGTGC  747

seq1  ACTTTCAATGGGAGTTTTCAGTTTTTAGTTCTTTCTCAAACTACCAAATA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCAATGGGAGTTTTCAGTTTTTAGTTCTTTCTCAAACTACCAAATA  797

seq1  CATTTGTTTCATGATTTGAACAAAAACGTCATTTCCCTTTTTGATGTGAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTTCATGATTTGAACAAAAACGTCATTTCCCTTTTTGATGTGAA  847

seq1  TTGGGGTGTGATTAATCCATGCATATTCAAGGCAGGTTATTGGGGTGGTT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGTGTGATTAATCCATGCATATTCAAGGCAGGTTATTGGGGTGGTT  897

seq1  GGGAGTCATAATCATTTGGATGGGGATTTTAGAAGATATAAGGGAGAAAC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTCATAATCATTTGGATGGGGATTTTAGAAGATATAAGGGAGAAAC  947

seq1  TGTGATGGTAGGCTACATTTGAGGTTGTGGTGTTAGTATGGAAGTCAGGA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGGTAGGCTACATTTGAGGTTGTGGTGTTAGTATGGAAGTCAGGA  997

seq1  CCTTGGATAGATCCTTGAGCTCCCAGGTCTAAGACAGAAAACATTTTTCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGATAGATCCTTGAGCTCCCAGGTCTAAGACAGAAAACATTTTTCT  1047

seq1  TTCAGGTAATCTTCTTTTATTTACATTGAAGCTTTATTGAGTGGCCTCTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGTAATCTTCTTTTATTTACATTGAAGCTTTATTGAGTGGCCTCTC  1097

seq1  CCACAGAGAGAATTC  1110
      |||||||||||||||
seq2  CCACAGAGAGAATTC  1112