BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283I24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 97,155,889 - 97,268,608
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRspry1, Arl2bp, Pllp
Upstream geneGnao1, Amfr, Nudt21, Ogfod1, Bbs2, Mt4, Mt3, Mt2, Mt1, Nup93, LOC100041555, Slc12a3, Herpud1, EG434339, AI451557, Cpne2, 2310065K24Rik
Downstream geneCcl22, Cx3cl1, 1700121C10Rik, Ccl17, Ciapin1, LOC664947, Coq9, Polr2c, Dok4, LOC100040942, Ccdc102a, Gpr114, Gpr56, Gpr97, Gm770, Katnb1, Kifc3, BC016201, Map1lc3-ps6, 1700055M20Rik, Zfp319, AA960436, Mmp15, Gtl3, Csnk2a2, 4933406B17Rik, Ccdc113, 4931432M23Rik, EG546088, LOC100041040, Gins3, LOC547022, Ndrg4, Setd6, Cnot1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283I24.bB6Ng01-283I24.g
ACCGA082493GA082494
length1,1341,048
definitionB6Ng01-283I24.b B6Ng01-283I24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,155,889 - 97,157,013)(97,267,571 - 97,268,608)
sequence
gaattcttttgggaaaataacctgcagagtatatattcaccaaatctatt
tccaacttttttaataggatgcactccagaaattgaccgaaattctcaat
ttaaatggagaggtagcatgccaggactcaggccaccctgccaaacatag
gaatacatccgcagtcttgggctgtttggctgagaaactagcaggtaact
ccagcacatgctttctggtttgacattgagacaactgcactacagaccgt
tgaccaaacctgttagagcagaaagaaggaaagaagctgaatatggtggc
acaagcctataaccacagcactttaagacaagagggttaaaagttcaagt
ccccaccccacacagtaagtatgttagaggccagtcaaaactgtggggag
ctctttcctttctgttctccctctctcttgtttggtctctctggctctct
gtctgtgtctctgcctctctttctctctcatgtctttcacttcaagtctg
ccattcactctcctccttccccaataaacctcttggcctaaaaacaaaac
caaaccaaactgtgggggaccctttttcaaaacaaacaaaaaaggaatga
acagaaatggactaaaaggaagacaattactcaaaagactcagtttcagt
taagtgtaatctaatttagctttgttgattctttttcagagaaatttaag
ataaatttgttgtattgatttgcttaagacaggggaaaggctaaatttag
aataataaataattattatatgtatttctaataattaatattgtccactt
taggactatgaacagcaaattgcatgaaaatatctcagccagttacttta
tatatagtaaaagaatgatgaattcaaaatcagaacacatggggtgctgg
tccagactattatggctctctaggagcctgacctagctagtctctttatg
ggtgaactcagtttgctacactgaaaagatgatggtagtaggaacaacct
gagaaaggaagccttgggtaatggtgttgtcagaggatggaaactcaatt
tggttgtcactaggtaccaatttaaaaatagccatgacactttatcatgt
cccagtgtttggctggtgtttgttaggtcctgca
gaattcacactctccaagtaacctggaacatggcccaggaagagactttc
tcctaagctcctctcataagcacaggggagctaatccctcatctttctta
gtattcaacctgttgagttgcctgctggctgactgtgtgctccaggttcc
cagctttgtgagctgtcaccccatgatgcggtgggctttggtgatgcagc
tgtcttagagacttcatttttgttcctgtaaataaccccccccacacaca
cccatattcctgtaagtaaccccaataaaacacatggttcaccaagttgg
accttagtattatccatactttggtctatctatggcctctctatctggag
tgagtagatgtgtgtgttgtgtttcctcaggaaaagtcttaatacacatt
aggcaaaatagaacattcgggcagggatgacagccatggtcgcacaaaca
tttgaacaagcctaatgctgctgagcacactgtacacttaaaatggtttg
aaatattaaatatggcctagagagatggctcagccattaagagcaatgac
tgcttgctcttcctgagttcaattcccagcaaccatatggtagctcacaa
ccatctgtaatgggatctgatgccctcttctggtgtgtgtctgaagacag
ctacagtgtactcgtataaataagtaaataatatttaaaaaaagaaaaga
aatactaaatatgtattgtgtatttcatactaaacatgtggccctctcca
actcaaaccaagcctccagtacgaatttctagttagaaaaaaatacaggt
gttggagttggtagctcacacctgtattcccagctacttcagagggtaaa
aaaaaaagggggggggtttgcttagacttgagagctcaaaaccctttggg
catttatagtgaagatccagttcttttaaccaagcaacagtcaaaaactg
ggaagaaacaagttactccacaaaagcaatttgtccatcaccaaaggcac
attaggacctttccacccttccaatccactgtcctaaggtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_97155889_97157013
seq2: B6Ng01-283I24.b_45_1178

seq1  GAATTCTTTTGGGAAAATAACCTGCAGAGTATATATTCACCAAATCTATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGGGAAAATAACCTGCAGAGTATATATTCACCAAATCTATT  50

seq1  TCCAACTTTTTTAATAGGATGCACTCCAGAAATTGACCGAAATTCTCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACTTTTTTAATAGGATGCACTCCAGAAATTGACCGAAATTCTCAAT  100

seq1  TTAAATGGAGAGGTAGCATGCCAGGACTCAGGCCACCCTGCCAAACATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATGGAGAGGTAGCATGCCAGGACTCAGGCCACCCTGCCAAACATAG  150

seq1  GAATACATCCGCAGTCTTGGGCTGTTTGGCTGAGAAACTAGCAGGTAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACATCCGCAGTCTTGGGCTGTTTGGCTGAGAAACTAGCAGGTAACT  200

seq1  CCAGCACATGCTTTCTGGTTTGACATTGAGACAACTGCACTACAGACCGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACATGCTTTCTGGTTTGACATTGAGACAACTGCACTACAGACCGT  250

seq1  TGACCAAACCTGTTAGAGCAGAAAGAAGGAAAGAAGCTGAATATGGTGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAACCTGTTAGAGCAGAAAGAAGGAAAGAAGCTGAATATGGTGGC  300

seq1  ACAAGCCTATAACCACAGCACTTTAAGACAAGAGGGTTAAAAGTTCAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCCTATAACCACAGCACTTTAAGACAAGAGGGTTAAAAGTTCAAGT  350

seq1  CCCCACCCCACACAGTAAGTATGTTAGAGGCCAGTCAAAACTGTGGGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACCCCACACAGTAAGTATGTTAGAGGCCAGTCAAAACTGTGGGGAG  400

seq1  CTCTTTCCTTTCTGTTCTCCCTCTCTCTTGTTTGGTCTCTCTGGCTCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCCTTTCTGTTCTCCCTCTCTCTTGTTTGGTCTCTCTGGCTCTCT  450

seq1  GTCTGTGTCTCTGCCTCTCTTTCTCTCTCATGTCTTTCACTTCAAGTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTCTCTGCCTCTCTTTCTCTCTCATGTCTTTCACTTCAAGTCTG  500

seq1  CCATTCACTCTCCTCCTTCCCCAATAAACCTCTTGGCCTAAAAACAAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCACTCTCCTCCTTCCCCAATAAACCTCTTGGCCTAAAAACAAAAC  550

seq1  CAAACCAAACTGTGGGGGACCCTTTTTCAAAACAAACAAAAAAGGAATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCAAACTGTGGGGGACCCTTTTTCAAAACAAACAAAAAAGGAATGA  600

seq1  ACAGAAATGGACTAAAAGGAAGACAATTACTCAAAAGACTCAGTTTCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAATGGACTAAAAGGAAGACAATTACTCAAAAGACTCAGTTTCAGT  650

seq1  TAAGTGTAATCTAATTTAGCTTTGTTGATTCTTTTTCAGAGAAATTTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTAATCTAATTTAGCTTTGTTGATTCTTTTTCAGAGAAATTTAAG  700

seq1  ATAAATTTGTTGTATTGATTTGCTTAAGACAGGGGAAAGGCTAAATTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTGTTGTATTGATTTGCTTAAGACAGGGGAAAGGCTAAATTTAG  750

seq1  AATAATAAATAATTATTATATGTATTTCTAATAATTAATATTGTCCACTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATAAATAATTATTATATGTATTTCTAATAATTAATATTGTCCACTT  800

seq1  TAGGACTATGAACAGCAAATTGCATGAAAATATCTCAGCCAGTTACTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACTATGAACAGCAAATTGCATGAAAATATCTCAGCCAGTTACTTTA  850

seq1  TATATAGTAAAAGAATGATGAATTCAAAATCAGAACACAT-GGGTGCTGG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATATAGTAAAAGAATGATGAATTCAAAATCAGAACACATGGGGTGCTGG  900

seq1  TCCAGACTATTATGGCTCTCTAGGAGCCTGACCTAGCTAGTCTCTTTAT-  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCCAGACTATTATGGCTCTCTAGGAGCCTGACCTAGCTAGTCTCTTTATG  950

seq1  GGTGAACTCAG-TTGCTACACTGAAAAGATGATGGTAGTAGGAACAACCT  997
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAACTCAGTTTGCTACACTGAAAAGATGATGGTAGTAGGAACAACCT  1000

seq1  GAGAAAGGAAGCCTT-GGTAAT-GTG-TGTCAGAGAATGG-AACTCAATT  1043
      ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||
seq2  GAGAAAGGAAGCCTTGGGTAATGGTGTTGTCAGAGGATGGAAACTCAATT  1050

seq1  TGGTTGTCACTAGTTACCAATTT-AAAATAG-CATGACACTTTTAATCAT  1091
      ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||
seq2  TGGTTGTCACTAGGTACCAATTTAAAAATAGCCATGACACTTT--ATCAT  1098

seq1  GT-CCAGTGTTT-GCT-GTGTTTGTTTAGGTCCTGCA  1125
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||
seq2  GTCCCAGTGTTTGGCTGGTGTTTG-TTAGGTCCTGCA  1134

seq1: chr8_97267571_97268608
seq2: B6Ng01-283I24.g_66_1113 (reverse)

seq1  ACACACACACC-TAGGACAGTTGATTTGAA-GGTGG-AAGGTCCT-ATGT  46
      ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||
seq2  ACACACACACCTTAGGACAGTGGATTGGAAGGGTGGAAAGGTCCTAATGT  50

seq1  GCCTTTGGTGATTGACAAATTGCTTTTGTGGAGTAACTTGTTTTCTTCCA  96
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||
seq2  GCCTTTGGTGATGGACAAATTGCTTTTGTGGAGTAACTTGTTTCTTCCCA  100

seq1  GTTTTTG-CTGTTGCTTTGTTAAA--GACTGGATC-TCACTAT-AATGCC  141
      ||||||| ||||||||| ||||||   |||||||| ||||||| ||||||
seq2  GTTTTTGACTGTTGCTTGGTTAAAAGAACTGGATCTTCACTATAAATGCC  150

seq1  CAAAGGGTTTTGAGCTCTCAAGTCTAAGCAAACCCCCCCCC-TTTTTTTT  190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAAAGGGTTTTGAGCTCTCAAGTCTAAGCAAACCCCCCCCCTTTTTTTTT  200

seq1  TACCCTCTGAAGTAGCTGGGAATACAGGTGTGAGCTACCAACTCCAACAC  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTCTGAAGTAGCTGGGAATACAGGTGTGAGCTACCAACTCCAACAC  250

seq1  CTGTATTTTTTTCTAACTAGAAATTCGTACTGGAGGCTTGGTTTGAGTTG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATTTTTTTCTAACTAGAAATTCGTACTGGAGGCTTGGTTTGAGTTG  300

seq1  GAGAGGGCCACATGTTTAGTATGAAATACACAATACATATTTAGTATTTC  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGCCACATGTTTAGTATGAAATACACAATACATATTTAGTATTTC  350

seq1  TTTTCTTTTTTTAAATATTATTTACTTATTTATACGAGTACACTGTAGCT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTTTTTAAATATTATTTACTTATTTATACGAGTACACTGTAGCT  400

seq1  GTCTTCAGACACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAGACACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTT  450

seq1  GTGAGCTACCATATGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGAAGAGCAAGCAGT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCTACCATATGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGAAGAGCAAGCAGT  500

seq1  CATTGCTCTTAATGGCTGAGCCATCTCTCTAGGCCATATTTAATATTTCA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTCTTAATGGCTGAGCCATCTCTCTAGGCCATATTTAATATTTCA  550

seq1  AACCATTTTAAGTGTACAGTGTGCTCAGCAGCATTAGGCTTGTTCAAATG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATTTTAAGTGTACAGTGTGCTCAGCAGCATTAGGCTTGTTCAAATG  600

seq1  TTTGTGCGACCATGGCTGTCATCCCTGCCCGAATGTTCTATTTTGCCTAA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCGACCATGGCTGTCATCCCTGCCCGAATGTTCTATTTTGCCTAA  650

seq1  TGTGTATTAAGACTTTTCCTGAGGAAACACAACACACACATCTACTCACT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATTAAGACTTTTCCTGAGGAAACACAACACACACATCTACTCACT  700

seq1  CCAGATAGAGAGGCCATAGATAGACCAAAGTATGGATAATACTAAGGTCC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAGAGAGGCCATAGATAGACCAAAGTATGGATAATACTAAGGTCC  750

seq1  AACTTGGTGAACCATGTGTTTTATTGGGGTTACTTACAGGAATATGGGTG  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGGTGAACCATGTGTTTTATTGGGGTTACTTACAGGAATATGGGTG  800

seq1  TGTGTGGGGGGGGTTATTTACAGGAACAAAAATGAAGTCTCTAAGACAGC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGGGGGGGTTATTTACAGGAACAAAAATGAAGTCTCTAAGACAGC  850

seq1  TGCATCACCAAAGCCCACCGCATCATGGGGTGACAGCTCACAAAGCTGGG  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCACCAAAGCCCACCGCATCATGGGGTGACAGCTCACAAAGCTGGG  900

seq1  AACCTGGAGCACACAGTCAGCCAGCAGGCAACTCAACAGGTTGAATACTA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGAGCACACAGTCAGCCAGCAGGCAACTCAACAGGTTGAATACTA  950

seq1  AGAAAGATGAGGGATTAGCTCCCCTGTGCTTATGAGAGGAGCTTAGGAGA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGATGAGGGATTAGCTCCCCTGTGCTTATGAGAGGAGCTTAGGAGA  1000

seq1  AAGTCTCTTCCTGGGCCATGTTCCAGGTTACTTGGAGAGTGTGAATTC  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTCTTCCTGGGCCATGTTCCAGGTTACTTGGAGAGTGTGAATTC  1048