BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285I11
Chromosome8 (Build37)
Map Location 44,159,240 - 44,253,779
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTriml1, LOC622082
Upstream geneZfp353, EG620772, LOC628212
Downstream geneEG622117, LOC100039417, Zfp42, Adam26b, Adam26a, EG384813, Adam34, EG384814, LOC100039472, LOC547011, LOC622263
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285I11.bB6Ng01-285I11.g
ACCGA083957GA083958
length1,1241,076
definitionB6Ng01-285I11.b B6Ng01-285I11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,159,240 - 44,160,363)(44,252,696 - 44,253,779)
sequence
gaattctctccaagtatttgttttgatttctttgctttatctgtcgtcca
gctgagaacaaagtaaactgcataacttctgttcagttctattttctttt
gttttgctttcctttgtttgaggtaaggttttgctatacagcttaggctg
accttgaactcatggcaatcctcctccttcgaccttccaaatgctgagtt
taccgccattctaggctgaatcaagaaaaatgtaataccactatttacct
caagtagaatcgaatagccaagttctaatgaagctggaatgaatgtgaag
gtaaaagatgcaatgcttcatattagactagtgattaccatgagtacatg
catgtaaacggccagcccctctcggagtcaaaattcagccctggttatga
tctcacccatatcttgattatcttctcctcctctctctttcttttacttt
tctccctttcctccttcccctttcttcaattcctatgattgaagtatatt
atatatacatatcaatacatcacaataagctccattactttgtataaata
atgggtgccatctaaacaattcgttttgggctagagatactgctcagtca
ttaagaacaattaccactcctacaaaggacctgagttcagttctccatca
aaacagctatcagtaggaaaagaaacaataaagtgctaatatagatgtat
taaaaatgaagccttacactactgatgacactgtaaattaatgacatcac
tatagaaatcagaatagagattcctcaaacaacttaaaatagaactactg
tatgatccagctacatcactcccaagtacatacctaaagaatcagagata
actgcacacccacatttattgtgtggcactatttacaataaccaaatgat
ggattcaacctacgtattgatgaatgaatgaagaaaactatgtatatgtg
cctattagagttgttctaacataaaagaacaaagcttctctttggtagga
gaatagattgaaataaacaacatgaaaagaaaggaaaacaaggctgcaga
agattggcctcagcagttaaagcaccaaaccggctcttcgaggtcctgga
gttccatctcagcaccgcatggtg
gaattcttaacagaaaatagttcctcttctccattcctccttttggatac
cattagcacatatgtcctttcgttgtcttgtgcgcttcagcctcttgagt
gcagggatgagcggtgtgaaccaccatgccaggatggtatataatttctg
aggagggatgagtcagtacaaacaaccaccatctgctatcaagagaatgg
catctttcagaggctagagagaaggcttgggggctaagagcacagactgt
tcttgcagaggcatcaaactgagtttgcagaacctatattaggcagctat
aaacgcttgtagttgcagtgcttggagcatccagtgactagcctctgtgg
gcatttgcaaacatgaacccatacccccccccccacacacacacacacat
acacaattaaaaataacctttaaaaaagtataaaatgagatggcagcagc
tggtcagttgtataaccgaggggattgagcacagatttcagatgagaata
tgtcctggccactatcttattttgacctcttgagacatgaacagaggatc
aagtcaccccaggctggacagcagatccatagagctgtgagctcatgaat
aggtgccgtgtgctaggatgctaaacttcttgtaatctgttaccattcaa
cagaaaatgagtacaggcacttatttcagtgaactgcttcttgctgcctg
agggaagaaaagaaatggggttagagacggattctctaagcagcactctc
attttatagtggatgaaacagaaaacagatctggagaacagatcaagaat
tgtgttctcagtcacaaaactattttattagtctcgagaggtagtctcaa
gcaagcctaggatagctgtggatgagaactcaacccaaaataaaagtatc
ctcaggtggtatttgattttcttttccataatggaggaataaaaatttac
cttcttcttgagggggcacctttcctgagttaaaggctgtagagactcaa
ggtatttattttgcaaatattcatttgttattgctatcctggtcaataca
agacagtgatgtgaactctcacatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_44159240_44160363
seq2: B6Ng01-285I11.b_42_1165

seq1  GAATTCTCTCCAAGTATTTGTTTTGATTTCTTTGCTTTATCTGTCGTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCCAAGTATTTGTTTTGATTTCTTTGCTTTATCTGTCGTCCA  50

seq1  GCTGAGAACAAAGTAAACTGCATAACTTCTGTTCAGTTCTATTTTCTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGAACAAAGTAAACTGCATAACTTCTGTTCAGTTCTATTTTCTTTT  100

seq1  GTTTTGCTTTCCTTTGTTTGAGGTAAGGTTTTGCTATACAGCTTAGGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGCTTTCCTTTGTTTGAGGTAAGGTTTTGCTATACAGCTTAGGCTG  150

seq1  ACCTTGAACTCATGGCAATCCTCCTCCTTCGACCTTCCAAATGCTGAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGAACTCATGGCAATCCTCCTCCTTCGACCTTCCAAATGCTGAGTT  200

seq1  TACCGCCATTCTAGGCTGAATCAAGAAAAATGTAATACCACTATTTACCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGCCATTCTAGGCTGAATCAAGAAAAATGTAATACCACTATTTACCT  250

seq1  CAAGTAGAATCGAATAGCCAAGTTCTAATGAAGCTGGAATGAATGTGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAGAATCGAATAGCCAAGTTCTAATGAAGCTGGAATGAATGTGAAG  300

seq1  GTAAAAGATGCAATGCTTCATATTAGACTAGTGATTACCATGAGTACATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGATGCAATGCTTCATATTAGACTAGTGATTACCATGAGTACATG  350

seq1  CATGTAAACGGCCAGCCCCTCTCGGAGTCAAAATTCAGCCCTGGTTATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAAACGGCCAGCCCCTCTCGGAGTCAAAATTCAGCCCTGGTTATGA  400

seq1  TCTCACCCATATCTTGATTATCTTCTCCTCCTCTCTCTTTCTTTTACTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCCATATCTTGATTATCTTCTCCTCCTCTCTCTTTCTTTTACTTT  450

seq1  TCTCCCTTTCCTCCTTCCCCTTTCTTCAATTCCTATGATTGAAGTATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTTTCCTCCTTCCCCTTTCTTCAATTCCTATGATTGAAGTATATT  500

seq1  ATATATACATATCAATACATCACAATAAGCTCCATTACTTTGTATAAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATACATATCAATACATCACAATAAGCTCCATTACTTTGTATAAATA  550

seq1  ATGGGTGCCATCTAAACAATTCGTTTTGGGCTAGAGATACTGCTCAGTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTGCCATCTAAACAATTCGTTTTGGGCTAGAGATACTGCTCAGTCA  600

seq1  TTAAGAACAATTACCACTCCTACAAAGGACCTGAGTTCAGTTCTCCATCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAACAATTACCACTCCTACAAAGGACCTGAGTTCAGTTCTCCATCA  650

seq1  AAACAGCTATCAGTAGGAAAAGAAACAATAAAGTGCTAATATAGATGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGCTATCAGTAGGAAAAGAAACAATAAAGTGCTAATATAGATGTAT  700

seq1  TAAAAATGAAGCCTTACACTACTGATGACACTGTAAATTAATGACATCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATGAAGCCTTACACTACTGATGACACTGTAAATTAATGACATCAC  750

seq1  TATAGAAATCAGAATAGAGATTCCTCAAACAACTTAAAATAGAACTACTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAAATCAGAATAGAGATTCCTCAAACAACTTAAAATAGAACTACTG  800

seq1  TATGATCCAGCTACATCACTCCCAAGTACATACCTAAAGAATCAGAGATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATCCAGCTACATCACTCCCAAGTACATACCTAAAGAATCAGAGATA  850

seq1  ACTGCACACCCACATTTATTGTGTGGCACTATTTACAATAACCAAATGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCACACCCACATTTATTGTGTGGCACTATTTACAATAACCAAATGAT  900

seq1  GGATTCAACCTACGTATTGATGAATGAATGAAGAAAACTATGTATATGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCAACCTACGTATTGATGAATGAATGAAGAAAACTATGTATATGTG  950

seq1  CCTATTAGAGTTGTTCTAACAT-AAAGAACAAAAGCTTCTCTTTGGTAGG  999
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCTATTAGAGTTGTTCTAACATAAAAGAAC-AAAGCTTCTCTTTGGTAGG  999

seq1  AGAATAGATTGAAATAAACAACATGAAAAGAAAGGAAAACAAGGGCTGCA  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGAATAGATTGAAATAAACAACATGAAAAGAAAGGAAAACAA-GGCTGCA  1048

seq1  G-AGAT--GGCTCAGCAGTTAAGAGCACCAA--CCGCTCTTCCAGAGGTC  1094
      | ||||  | |||||||||||| ||||||||  | |||||||  ||||||
seq2  GAAGATTGGCCTCAGCAGTTAA-AGCACCAAACCGGCTCTTC--GAGGTC  1095

seq1  CT-GAGTTCAATTCCCAGCAACCGCATGGTG  1124
      || |||||| | || |||| |||||||||||
seq2  CTGGAGTTCCA-TCTCAGC-ACCGCATGGTG  1124

seq1: chr8_44252696_44253779
seq2: B6Ng01-285I11.g_68_1143 (reverse)

seq1  ACATGTGAAGAAGTTCACATCACTGTCTTGTATGAACAGGGATAGCAATA  50
      ||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||
seq2  ACATGTGA--GAGTTCACATCACTGTCTTGTATTGACCAGGATAGCAATA  48

seq1  AACAAAATGAATATTTGCAAAATAAATACCTTGAGTCTCTAACAGCCTTT  100
      |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  A--CAAATGAATATTTGCAAAATAAATACCTTGAGTCTCT-ACAGCC-TT  94

seq1  TAACTCAGGAAAGGTTGCCCCCTTCAAGAAAGAAGGTAAA-TTTTATTCC  149
      |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  TAACTCAGGAAAGG-TGCCCCC-TCAAG-AAGAAGGTAAATTTTTATTCC  141

seq1  TCCATTATGGAAAAGAAAATCAAATACCACCTGAGGATACTTTTATTTTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTATGGAAAAGAAAATCAAATACCACCTGAGGATACTTTTATTTTG  191

seq1  GGTTGAGTTCTCATCCACAGCTATCCTAGGCTTGCTTGAGACTACCTCTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAGTTCTCATCCACAGCTATCCTAGGCTTGCTTGAGACTACCTCTC  241

seq1  GAGACTAATAAAATAGTTTTGTGACTGAGAACACAATTCTTGATCTGTTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTAATAAAATAGTTTTGTGACTGAGAACACAATTCTTGATCTGTTC  291

seq1  TCCAGATCTGTTTTCTGTTTCATCCACTATAAAATGAGAGTGCTGCTTAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGATCTGTTTTCTGTTTCATCCACTATAAAATGAGAGTGCTGCTTAG  341

seq1  AGAATCCGTCTCTAACCCCATTTCTTTTCTTCCCTCAGGCAGCAAGAAGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCCGTCTCTAACCCCATTTCTTTTCTTCCCTCAGGCAGCAAGAAGC  391

seq1  AGTTCACTGAAATAAGTGCCTGTACTCATTTTCTGTTGAATGGTAACAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCACTGAAATAAGTGCCTGTACTCATTTTCTGTTGAATGGTAACAGA  441

seq1  TTACAAGAAGTTTAGCATCCTAGCACACGGCACCTATTCATGAGCTCACA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGAAGTTTAGCATCCTAGCACACGGCACCTATTCATGAGCTCACA  491

seq1  GCTCTATGGATCTGCTGTCCAGCCTGGGGTGACTTGATCCTCTGTTCATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTATGGATCTGCTGTCCAGCCTGGGGTGACTTGATCCTCTGTTCATG  541

seq1  TCTCAAGAGGTCAAAATAAGATAGTGGCCAGGACATATTCTCATCTGAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGAGGTCAAAATAAGATAGTGGCCAGGACATATTCTCATCTGAAA  591

seq1  TCTGTGCTCAATCCCCTCGGTTATACAACTGACCAGCTGCTGCCATCTCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGCTCAATCCCCTCGGTTATACAACTGACCAGCTGCTGCCATCTCA  641

seq1  TTTTATACTTTTTTAAAGGTTATTTTTAATTGTGTATGTGTGTGTGTGTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATACTTTTTTAAAGGTTATTTTTAATTGTGTATGTGTGTGTGTGTG  691

seq1  TGGGGGGGGGGGTATGGGTTCATGTTTGCAAATGCCCACAGAGGCTAGTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGGGGGGGTATGGGTTCATGTTTGCAAATGCCCACAGAGGCTAGTC  741

seq1  ACTGGATGCTCCAAGCACTGCAACTACAAGCGTTTATAGCTGCCTAATAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGATGCTCCAAGCACTGCAACTACAAGCGTTTATAGCTGCCTAATAT  791

seq1  AGGTTCTGCAAACTCAGTTTGATGCCTCTGCAAGAACAGTCTGTGCTCTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTGCAAACTCAGTTTGATGCCTCTGCAAGAACAGTCTGTGCTCTT  841

seq1  AGCCCCCAAGCCTTCTCTCTAGCCTCTGAAAGATGCCATTCTCTTGATAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCCAAGCCTTCTCTCTAGCCTCTGAAAGATGCCATTCTCTTGATAG  891

seq1  CAGATGGTGGTTGTTTGTACTGACTCATCCCTCCTCAGAAATTATATACC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGGTGGTTGTTTGTACTGACTCATCCCTCCTCAGAAATTATATACC  941

seq1  ATCCTGGCATGGTGGTTCACACCGCTCATCCCTGCACTCAAGAGGCTGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGCATGGTGGTTCACACCGCTCATCCCTGCACTCAAGAGGCTGAA  991

seq1  GCGCACAAGACAACGAAAGGACATATGTGCTAATGGTATCCAAAAGGAGG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCACAAGACAACGAAAGGACATATGTGCTAATGGTATCCAAAAGGAGG  1041

seq1  AATGGAGAAGAGGAACTATTTTCTGTTAAGAATTC  1084
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAGAAGAGGAACTATTTTCTGTTAAGAATTC  1076