BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-287D19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 120,001,193 - 120,125,845
singlet/doubletdoublet
Overlap genePlcg2
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik
Downstream gene4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6, Cdh13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-287D19.bB6Ng01-287D19.g
ACCGA085215GA085216
length8661,127
definitionB6Ng01-287D19.b B6Ng01-287D19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,001,193 - 120,002,055)(120,124,721 - 120,125,845)
sequence
gaattcttccgagtcaagatgctttcagtactgctgtggggtggcgtgac
acccgtgttctcagcctcacctagaatgacattctccgatggagagaggc
agtgtggggtgacatggggacttggaatcttgtcagtttccagttcctgg
ttagcaattctttatgcaattcattgccctatatctgacatagactaggg
cccagtggaaagacctgtgtggccaaaggcctggaggctaaaggcccctt
caaataggcagagccctgaggggttgacgggacatatggagtgctagaaa
ggtaggatggaggtgttgcatggccagggttggccagcaggggctagaag
ccatggaagattccagatgacagaatgtaattggctatcagttatgaagc
cttccctggacattgtgcccagttcctagaggatgcaatgggaaaatcaa
ggccaaggtgaccagagtgtcaaggagctcactagccactcaggagcgtt
cctctgatggtgaggagcggatctcatcacagggcccagagtccacctcg
aatgatcttcagatggccgagagtcttcaatgtccccgttgatgttggct
ttgaacagagtatgtctatctcttaggtgggtcctttgaggacacatggg
ctttccctgcacagggggacctgaggcaccatctctaaagatgaccatgg
ggacccattccccccaacagatacccaaacctcgaatgttcatgtccctc
agatgtaagggcgcatgttggcatgagacctttcacacttaccctgtgtg
cagtaagccatctctagcttctatagatctagtgtagtagcagcactgtg
taaaataaggtgtgtg
gaattccctagatcaaggggcaaaatgacagtgagggagcgcctgcagct
gagacgcccagagtgggagaggcctcggtaatgtcaagcgcctgccctgg
gagagaaggtcaaagggcaccaatcagtgagggcaggcggcctctgtgag
gacagaggcgtcgtcagaaagactgaggggggccgttcctcacctgctgt
cgtatggctttgatgccgaggggttaggtgaaaaccagtttggaatcaag
ggggtctcctgatttttttaaatgaacttgagaggctggagagacggctc
agtggtttaaagctctttgcttctgtttcagaggacccaggttcagttcc
cagcatccacatggtggctcacaaccatctgtaactgcgttcccagggtt
ctgatgcccttgtcgggactctttaggtacctgcatatatgtgtgtgcat
attcagacaaataggcacacgtgtatatttttttttagtttgtttgtttt
taatttttaaccacaaacaagcttgtgtcattgctagagcccgcacagta
acgatgcaaccttgggaagacctccgtggtgaatcagcacccatccagtc
tggaatgtgagacaagagggctcagagcgccacccagccccttagagtca
ccacaataggagaccagtcaagttcacccccaagaggcccatccccggtc
aggcttaccatcccccgggctccttggagacattgtggatgagggcaccg
cggcagaaggtcagctcgtcgctgcgcttggctttgtagtcatagagcgc
tttcacggtcctctgaggcttgggggggggggaacaggaagaaaagaggg
gcagttggatgacagagcagcagagggaagcagacccttttaggagccag
agacggcagagccggagttactacgccatctgctggtgagagttggtatt
gcatgggaaccaaacacatgcagtccaccaggaagtgggtttaagactag
cttcaccaagaaaaagactaaactcttcgacacaatcctctagaatattc
atacctcgccacctcaagagcttggcagttcttatggtctcccagaagtt
cagacccaatccgtctatgtcatgcta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_120001193_120002055
seq2: B6Ng01-287D19.b_44_909

seq1  GAATTCTTCCGAGTCAAGATGCTTTCAGTACTGCTGTGGGGTGGCGTGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCGAGTCAAGATGCTTTCAGTACTGCTGTGGGGTGGCGTGAC  50

seq1  ACCCGTGTTCTCAGCCTCACCTAGAATGACATTCTCCGATGGAGAGAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGTGTTCTCAGCCTCACCTAGAATGACATTCTCCGATGGAGAGAGGC  100

seq1  AGTGTGGGGTGACATGGGGACTTGGAATCTTGTCAGTTTCCAGTTCCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGGGGTGACATGGGGACTTGGAATCTTGTCAGTTTCCAGTTCCTGG  150

seq1  TTAGCAATTCTTTATGCAATTCATTGCCCTATATCTGACATAGACTAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCAATTCTTTATGCAATTCATTGCCCTATATCTGACATAGACTAGGG  200

seq1  CCCAGTGGAAAGACCTGTGTGGCCAAAGGCCTGGAGGCTAAAGGCCCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTGGAAAGACCTGTGTGGCCAAAGGCCTGGAGGCTAAAGGCCCCTT  250

seq1  CAAATAGGCAGAGCCCTGAGGGGTTGACGGGACATATGGAGTGCTAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAGGCAGAGCCCTGAGGGGTTGACGGGACATATGGAGTGCTAGAAA  300

seq1  GGTAGGATGGAGGTGTTGCATGGCCAGGGTTGGCCAGCAGGGGCTAGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGATGGAGGTGTTGCATGGCCAGGGTTGGCCAGCAGGGGCTAGAAG  350

seq1  CCATGGAAGATTCCAGATGACAGAATGTAATTGGCTATCAGTTATGAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGAAGATTCCAGATGACAGAATGTAATTGGCTATCAGTTATGAAGC  400

seq1  CTTCCCTGGACATTGTGCCCAGTTCCTAGAGGATGCAATGGGAAAATCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCTGGACATTGTGCCCAGTTCCTAGAGGATGCAATGGGAAAATCAA  450

seq1  GGCCAAGGTGACCAGAGTGTCAAGGAGCTCACTAGCCACTCAGGAGCGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAAGGTGACCAGAGTGTCAAGGAGCTCACTAGCCACTCAGGAGCGTT  500

seq1  CCTCTGATGGTGAGGAGCGGATCTCATCACAGGGCCCAGAGTCCACCTCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGATGGTGAGGAGCGGATCTCATCACAGGGCCCAGAGTCCACCTCG  550

seq1  AATGATCTTCAGATGGCCGAGAGTCTTCAATGTCCCCGTTGATGTTGGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATCTTCAGATGGCCGAGAGTCTTCAATGTCCCCGTTGATGTTGGCT  600

seq1  TTGAACAGAGTATGTCTATCTCTTAGGTGGGTCCTTTGAGGACACATGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACAGAGTATGTCTATCTCTTAGGTGGGTCCTTTGAGGACACATGGG  650

seq1  CTTTCCCTGCACA-GGGGACCTGAGGCACCATCTCTAAAGATGACCATGG  699
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCCTGCACAGGGGGACCTGAGGCACCATCTCTAAAGATGACCATGG  700

seq1  GGACCCATTCCCCCCAACAGATACCCAAACCTCGAATGTTCATGTCCCTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCATTCCCCCCAACAGATACCCAAACCTCGAATGTTCATGTCCCTC  750

seq1  AGATGTAAGGGCGCATGTTGGCATGAGACC-TTCACACTTACCCTGTGTG  798
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGATGTAAGGGCGCATGTTGGCATGAGACCTTTCACACTTACCCTGTGTG  800

seq1  CAGTAAGCCATCTCTAGCTTCTATAGATCTAGTGTAGTAGCAGCACTGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGCCATCTCTAGCTTCTATAGATCTAGTGTAGTAGCAGCACTGTG  850

seq1  T-AAATAAGGTGTGTG  863
      | ||||||||||||||
seq2  TAAAATAAGGTGTGTG  866

seq1: chr8_120124721_120125845
seq2: B6Ng01-287D19.g_68_1194 (reverse)

seq1  TAGCATGAC-TAGAC-GATAGTGTCTGAACTTCTGGGAGAACCATTAAGA  48
      ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||
seq2  TAGCATGACATAGACGGATTGGGTCTGAACTTCTGGGAG-ACCA-TAAGA  48

seq1  ACTGC--AGCTC-TGAGGTGGCGA-GTATGGATTAATCTAAGAGATTGTG  94
      |||||  ||||| ||||||||||| |||| || || ||||   |||||||
seq2  ACTGCCAAGCTCTTGAGGTGGCGAGGTAT-GAATATTCTAGAGGATTGTG  97

seq1  TCG-AGAGTTTAGTCTTTCTCCTGGTTGAGCTAGTCTTTAACCCACTTCC  143
      ||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||
seq2  TCGAAGAGTTTAGTCTTTTTCTTGGTGAAGCTAGTCTTAAACCCACTTCC  147

seq1  TGGTGGACTGCATGTGTTTGGTTCCCATGCAATACCAACTCTCACCAGCA  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGACTGCATGTGTTTGGTTCCCATGCAATACCAACTCTCACCAGCA  197

seq1  GATGGCGTAGTAACTCCGGCCTCTGCCGTCTCTGGCTTCCTAAAGGGTCC  243
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |
seq2  GATGGCGTAGTAACTCCGG-CTCTGCCGTCTCTGGC-TCCTAAAAGGGTC  245

seq1  TGCTTCCCTCTGCTGCCTCTGTCATCCAACTGCCCCTCTTTTCTTCCTGT  293
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCCTCTGCTG-CTCTGTCATCCAACTGCCCCTCTTTTCTTCCTGT  294

seq1  T-CCCCCCCCCCAAGCCTCAGAGGACCGTGAAAGCGCTCTATGACTACAA  342
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCCCCCCCAAGCCTCAGAGGACCGTGAAAGCGCTCTATGACTACAA  344

seq1  AGCCAAGCGCAGCGACGAGCTGACCTTCTGCCGCGGTGCCCTCATCCACA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGCGCAGCGACGAGCTGACCTTCTGCCGCGGTGCCCTCATCCACA  394

seq1  ATGTCTCCAAGGAGCCCGGGGGATGGTAAGCCTGACCGGGGATGGGCCTC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTCCAAGGAGCCCGGGGGATGGTAAGCCTGACCGGGGATGGGCCTC  444

seq1  TTGGGGGTGAACTTGACTGGTCTCCTATTGTGGTGACTCTAAGGGGCTGG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGGTGAACTTGACTGGTCTCCTATTGTGGTGACTCTAAGGGGCTGG  494

seq1  GTGGCGCTCTGAGCCCTCTTGTCTCACATTCCAGACTGGATGGGTGCTGA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCGCTCTGAGCCCTCTTGTCTCACATTCCAGACTGGATGGGTGCTGA  544

seq1  TTCACCACGGAGGTCTTCCCAAGGTTGCATCGTTACTGTGCGGGCTCTAG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCACGGAGGTCTTCCCAAGGTTGCATCGTTACTGTGCGGGCTCTAG  594

seq1  CAATGACACAAGCTTGTTTGTGGTTAAAAATTAAAAACAAACAAACTAAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACACAAGCTTGTTTGTGGTTAAAAATTAAAAACAAACAAACTAAA  644

seq1  AAAAAATATACACGTGTGCCTATTTGTCTGAATATGCACACACATATATG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATATACACGTGTGCCTATTTGTCTGAATATGCACACACATATATG  694

seq1  CAGGTACCTAAAGAGTCCCGACAAGGGCATCAGAACCCTGGGAACGCAGT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTACCTAAAGAGTCCCGACAAGGGCATCAGAACCCTGGGAACGCAGT  744

seq1  TACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGATGCTGGGAACTGAACCTGGGTC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGATGCTGGGAACTGAACCTGGGTC  794

seq1  CTCTGAAACAGAAGCAAAGAGCTTTAAACCACTGAGCCGTCTCTCCAGCC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAAACAGAAGCAAAGAGCTTTAAACCACTGAGCCGTCTCTCCAGCC  844

seq1  TCTCAAGTTCATTTAAAAAAATCAGGAGACCCCCTTGATTCCAAACTGGT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGTTCATTTAAAAAAATCAGGAGACCCCCTTGATTCCAAACTGGT  894

seq1  TTTCACCTAACCCCTCGGCATCAAAGCCATACGACAGCAGGTGAGGAACG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACCTAACCCCTCGGCATCAAAGCCATACGACAGCAGGTGAGGAACG  944

seq1  GCCCCCCTCAGTCTTTCTGACGACGCCTCTGTCCTCACAGAGGCCGCCTG  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCCTCAGTCTTTCTGACGACGCCTCTGTCCTCACAGAGGCCGCCTG  994

seq1  CCCTCACTGATTGGTGCCCTTTGACCTTCTCTCCCAGGGCAGGCGCTTGA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCACTGATTGGTGCCCTTTGACCTTCTCTCCCAGGGCAGGCGCTTGA  1044

seq1  CATTACCGAGGCCTCTCCCACTCTGGGCGTCTCAGCTGCAGGCGCTCCCT  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACCGAGGCCTCTCCCACTCTGGGCGTCTCAGCTGCAGGCGCTCCCT  1094

seq1  CACTGTCATTTTGCCCCTTGATCTAGGGAATTC  1125
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCATTTTGCCCCTTGATCTAGGGAATTC  1127