BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-287N24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 86,242,530 - 86,430,006
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdx39, Cd97, EG384857, Lphn1
Upstream geneLOC675800, EG666289, Zfp330, Rnf150, LOC100039688, Tbc1d9, Ucp1, Elmod2, 4933434I20Rik, Clgn, Scoc, LOC546077, LOC675854, Olfr370, Ndufb7, Gpsn2, Dnajb1, Gipc1, Ptger1, Pkn1
Downstream geneAsf1b, Prkaca, Samd1, 1700067K01Rik, 2210011C24Rik, 4432412L15Rik, Il27ra, Rln3, C330011M18Rik, Rfx1, BC057552, LOC100039920, Podnl1, Cc2d1a, 4930432K21Rik, Nanos3, Zswim4, D8Ertd738e, 2410018C20Rik, Ccdc130, Cacna1a, Ier2, LOC100039975, Btbd14b, Trmt1, LOC100039997, Lyl1, Nfix, Dand5, Gadd45gip1, Rad23a, Calr, LOC546080, Farsa, Syce2, Gcdh, Klf1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-287N24.bB6Ng01-287N24.g
ACCGA085683GA085684
length588581
definitionB6Ng01-287N24.b B6Ng01-287N24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,429,460 - 86,430,006)(86,242,530 - 86,243,110)
sequence
ttggggacttttcagatagtatataaatgccaggtccctgagagccaggg
tgggttgttggttggctgtggtttgtcaagcagtcatatgcaaggaaatg
agaattaggaccctgatggtgaagatcaaacttaccccaaggaactcaat
gccctaatctgcaggaagtagtctaacaagaatgtcactcccttccccct
ccatcatttttttctctctcctatctagagttaggggtttgaaagggtgg
aagaaagaataacccacaaagccccaaatggagccgcccctagttgaggt
gctctgtggcagggtctggcgaccatggtttggtcaccgcctattctgtc
tgtcatgagctcagaagggcatcttacgtttctagggtgaagagaagaat
gaacttgaacatagccagtccagagcccgtgggaacccccatgttgcttt
attttgagtgggtgtgccaaacttgcactcacggccttagagtatgcttg
tcagctggacagttctgccttggaattgattggcctggagagactactgg
gtgctgccgtggtacctgtggaggacactgttgacact
gaattccatttagcatcttaactggctggcttgctggcctggcccaatgg
gaatcctcttcataaaagctcttaatgattcccctgtgtagaccacaaaa
ggtaggggaggctaggctaggctgggctgggctgggctgggctggtaggg
gaaatgctgcttgcttcttgaccacaacaactcctttctcaacaccaagg
caggtacaacttcaggtccaagctgtgggttccaggagctccttgggagg
gtggtctgagaaaccttattagtgccaaaacttgaatgtcagtgaggaca
cattagccaggtgaaatgatgtcaacctgtaactgtccgttctggaacag
ccaggactattagggctgtctaaaaaaaatcttgtatatacagacttgaa
aacggccatgagggctatagtgacgaatctgtgtgataactatcacttat
ttgatttgtggtgttggggatagaacctggtagatcactgggccaggtcc
ccatttgtagtatggtagaccttagaatgcttgggctgggtggcattgga
tgggagagtggtgtgtagcagatgggaggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_86429460_86430006
seq2: B6Ng01-287N24.b_98_644 (reverse)

seq1  AGTGTCAACAGTGTCCTCCACAGGTACCACGGCAGCACCCAGTAGTCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCAACAGTGTCCTCCACAGGTACCACGGCAGCACCCAGTAGTCTCT  50

seq1  CCAGGCCAATCAATTCCAAGGCAGAACTGTCCAGCTGACAAGCATACTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCCAATCAATTCCAAGGCAGAACTGTCCAGCTGACAAGCATACTCT  100

seq1  AAGGCCGTGAGTGCAAGTTTGGCACACCCACTCAAAATAAAGCAACATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCGTGAGTGCAAGTTTGGCACACCCACTCAAAATAAAGCAACATGG  150

seq1  GGGTTCCCACGGGCTCTGGACTGGCTATGTTCAAGTTCATTCTTCTCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTCCCACGGGCTCTGGACTGGCTATGTTCAAGTTCATTCTTCTCTTC  200

seq1  ACCCTAGAAACGTAAGATGCCCTTCTGAGCTCATGACAGACAGAATAGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTAGAAACGTAAGATGCCCTTCTGAGCTCATGACAGACAGAATAGGC  250

seq1  GGTGACCAAACCATGGTCGCCAGACCCTGCCACAGAGCACCTCAACTAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACCAAACCATGGTCGCCAGACCCTGCCACAGAGCACCTCAACTAGG  300

seq1  GGCGGCTCCATTTGGGGCTTTGTGGGTTATTCTTTCTTCCACCCTTTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGCTCCATTTGGGGCTTTGTGGGTTATTCTTTCTTCCACCCTTTCAA  350

seq1  ACCCCTAACTCTAGATAGGAGAGAGAAAAAAATGATGGAGGGGGAAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTAACTCTAGATAGGAGAGAGAAAAAAATGATGGAGGGGGAAGGGA  400

seq1  GTGACATTCTTGTTAGACTACTTCCTGCAGATTAGGGCATTGAGTTCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACATTCTTGTTAGACTACTTCCTGCAGATTAGGGCATTGAGTTCCTT  450

seq1  GGGGTAAGTTTGATCTTCACCATCAGGGTCCTAATTCTCATTTCCTTGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAAGTTTGATCTTCACCATCAGGGTCCTAATTCTCATTTCCTTGCA  500

seq1  TATGACTGCTTGACAAACCACAGCCAACCAACAACCCACCCTGGCTC  547
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACTGCTTGACAAACCACAGCCAACCAACAACCCACCCTGGCTC  547

seq1: chr8_86242530_86243110
seq2: B6Ng01-287N24.g_68_648

seq1  GAATTCCATTTAGCATCTTAACTGGCTGGCTTGCTGGCCTGGCCCAATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTTAGCATCTTAACTGGCTGGCTTGCTGGCCTGGCCCAATGG  50

seq1  GAATCCTCTTCATAAAAGCTCTTAATGATTCCCCTGTGTAGACCACAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCTCTTCATAAAAGCTCTTAATGATTCCCCTGTGTAGACCACAAAA  100

seq1  GGTAGGGGAGGCTAGGCTAGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGTAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGGGAGGCTAGGCTAGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGTAGGG  150

seq1  GAAATGCTGCTTGCTTCTTGACCACAACAACTCCTTTCTCAACACCAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCTGCTTGCTTCTTGACCACAACAACTCCTTTCTCAACACCAAGG  200

seq1  CAGGTACAACTTCAGGTCCAAGCTGTGGGTTCCAGGAGCTCCTTGGGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTACAACTTCAGGTCCAAGCTGTGGGTTCCAGGAGCTCCTTGGGAGG  250

seq1  GTGGTCTGAGAAACCTTATTAGTGCCAAAACTTGAATGTCAGTGAGGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCTGAGAAACCTTATTAGTGCCAAAACTTGAATGTCAGTGAGGACA  300

seq1  CATTAGCCAGGTGAAATGATGTCAACCTGTAACTGTCCGTTCTGGAACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGCCAGGTGAAATGATGTCAACCTGTAACTGTCCGTTCTGGAACAG  350

seq1  CCAGGACTATTAGGGCTGTCTAAAAAAAATCTTGTATATACAGACTTGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACTATTAGGGCTGTCTAAAAAAAATCTTGTATATACAGACTTGAA  400

seq1  AACGGCCATGAGGGCTATAGTGACGAATCTGTGTGATAACTATCACTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGCCATGAGGGCTATAGTGACGAATCTGTGTGATAACTATCACTTAT  450

seq1  TTGATTTGTGGTGTTGGGGATAGAACCTGGTAGATCACTGGGCCAGGTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTGTGGTGTTGGGGATAGAACCTGGTAGATCACTGGGCCAGGTCC  500

seq1  CCATTTGTAGTATGGTAGACCTTAGAATGCTTGGGCTGGGTGGCATTGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGTAGTATGGTAGACCTTAGAATGCTTGGGCTGGGTGGCATTGGA  550

seq1  TGGGAGAGTGGTGTGTAGCAGATGGGAGGTT  581
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGAGTGGTGTGTAGCAGATGGGAGGTT  581