BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-289E01
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,507,624 - 14,653,578
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2
Upstream geneLOC434282, 1700029H14Rik, Rasa3, 4932443I19Rik, LOC665516, Cdc16, Upf3a, AF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140
Downstream geneC030037F17Rik, Cln8, Arhgef10, 2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599, EG234097, EG665619
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-289E01.bB6Ng01-289E01.g
ACCGA086706GA086707
length1,1021,116
definitionB6Ng01-289E01.b B6Ng01-289E01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,507,624 - 14,508,724)(14,652,467 - 14,653,578)
sequence
gaattccaaatgttgtgttgggagatgctttcttttctttatttacctta
ttgtgacaaaacaaaaataaaacaaagcaaaaaagacagaaagaagattc
atcaaatcttcaaaaagcgccgggtgtggtggcgcacgcctttaatccca
gcacttgggaggcagaggcaggcagatttcagagtttgaggccagcctgg
tctgcaaagtaagttctaggacagccagggctatacagagaaaccctgtc
tcgaaaaacaaacaaagaaacaaaaaaacaaaaacaaaaaaccaaatctt
caaaaagctgtacatcgtattataacattaagaaaatggaaaggcagccc
aaatgattatagaaaatatttacacattatatatctaataaaagtttgga
tattaaagttctcttaccattcagtaataaaaatacaaaagaaagaaacc
agtcaaaagtagacaaaagaccaaggtagacatttccacaaaaatacaga
aagagctaagaattccatgaacagctgcttaacatagggacctgaggaaa
gcacaaatcagaataactgtgaggtgcagtcattagcatggcggtcactc
agcagttctcaacctggaggtcacggccattggaaaacacatatttctga
tggtcttaggaactgagataccactcagtagcaaaattacagttatgaag
tagcaatgaaagtaattttatggttggggggttcctaaggccactagaaa
tatatgcttcctggtggtcatgacccacaggttgagaatggctgctgtac
ctaaaaatgctgcataatgagtgagtgtctgagaggacagggagagatta
gaccccctgaacctcttaatggaaacattaaacggtacattcatttaatg
caacatctttccagtttctcctatagttaaacacagatgcaccatcaaat
ccagcaattccactcctgcccatgaaccccaaagccgtgcagcatgcatc
tgtacagaaactcaaaatgcgcatcaccgaaggtcttcagcatcactgag
agtgggtcaacagctgtgttttgtcctaccacagaataacgcccaaatgg
gg
gaattctcacccatcactcacagtggctcactttctagaactttgtgtgc
ttcttatgatatttcacattggtccccatgtttcagcatagtcctgacaa
ctgaaggtctaaagcccatggcgcaggtggaaatccatgctcccagtgac
atgtctacttctgctctcatgaatacaatggcttgtgctccactctggtt
tcttattggggtattgttatatctaaggaatttgcagggtagcaaagctg
gtctaaagaccctactatgagaactcaagctagctcaggatctatgttag
gatgttagctgggccatcctagacacagcacgccagtggaaggtgaatgt
gcgaggatggtgtgagccacagtagacatttgaagttttcctagatgggc
acaaagtcattcatgacatgaacaaggttacttacatcctggataaactc
ctttgcctaccaacccccaagttctccagctgtgaagtaacagtaagaac
gtaggattcaaagctcactgtgagattaaattaaacatagggttgcaaaa
ctgtagagagttctctggcgttcattatggatgtagcaataagctctgcc
acactggggcttctctctatatgcaaagagaatagagaaaggagaagata
aagttcctcttgagtctcctgggaaggagcccctgtttgctgctctgctc
ctggggaccacagtgtcgccaccagaggcagatactcaactgataccaac
agaccaactccccttggcttttcctcagcatccccctggctcatgctctc
actggctccttatcacaccttattttcctcaacctttgaaggcctgatga
cagaggaagggcatggtctgacctttgaaaagccacagtccaacaagtaa
cactgccgcaaaaggtatatgtgtggacattggccgtgagattggacaat
ccctggagagtatgtcctagggaggtagggtgtgggcttaagtcttgaga
cataagcagtttattatattctgttcagaaagtggctaactcaggagtaa
aggccataaggaagtgacctttaagaagatggcaatatggtgaatgtagg
agctctgtgggggggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14507624_14508724
seq2: B6Ng01-289E01.b_46_1147

seq1  GAATTCCAAATGTTGTGTTGGGAGATGCTTTCTTTTCTTTATTTACCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAATGTTGTGTTGGGAGATGCTTTCTTTTCTTTATTTACCTTA  50

seq1  TTGTGACAAAACAAAAATAAAACAAAGCAAAAAAGACAGAAAGAAGATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGACAAAACAAAAATAAAACAAAGCAAAAAAGACAGAAAGAAGATTC  100

seq1  ATCAAATCTTCAAAAAGCGCCGGGTGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAATCTTCAAAAAGCGCCGGGTGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCA  150

seq1  GCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCAGAGTTTGAGGCCAGCCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCAGAGTTTGAGGCCAGCCTGG  200

seq1  TCTGCAAAGTAAGTTCTAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAAGTAAGTTCTAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTC  250

seq1  TCGAAAAACAAACAAAGAAACAAAAAAACAAAAACAAAAAACCAAATCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAAAAACAAACAAAGAAACAAAAAAACAAAAACAAAAAACCAAATCTT  300

seq1  CAAAAAGCTGTACATCGTATTATAACATTAAGAAAATGGAAAGGCAGCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGCTGTACATCGTATTATAACATTAAGAAAATGGAAAGGCAGCCC  350

seq1  AAATGATTATAGAAAATATTTACACATTATATATCTAATAAAAGTTTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATTATAGAAAATATTTACACATTATATATCTAATAAAAGTTTGGA  400

seq1  TATTAAAGTTCTCTTACCATTCAGTAATAAAAATACAAAAGAAAGAAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAGTTCTCTTACCATTCAGTAATAAAAATACAAAAGAAAGAAACC  450

seq1  AGTCAAAAGTAGACAAAAGACCAAGGTAGACATTTCCACAAAAATACAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAAAGTAGACAAAAGACCAAGGTAGACATTTCCACAAAAATACAGA  500

seq1  AAGAGCTAAGAATTCCATGAACAGCTGCTTAACATAGGGACCTGAGGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTAAGAATTCCATGAACAGCTGCTTAACATAGGGACCTGAGGAAA  550

seq1  GCACAAATCAGAATAACTGTGAGGTGCAGTCATTAGCATGGCGGTCACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAATCAGAATAACTGTGAGGTGCAGTCATTAGCATGGCGGTCACTC  600

seq1  AGCAGTTCTCAACCTGGAGGTCACGGCCATTGGAAAACACATATTTCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTCTCAACCTGGAGGTCACGGCCATTGGAAAACACATATTTCTGA  650

seq1  TGGTCTTAGGAACTGAGATACCACTCAGTAGCAAAATTACAGTTATGAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTTAGGAACTGAGATACCACTCAGTAGCAAAATTACAGTTATGAAG  700

seq1  TAGCAATGAAAGTAATTTTATGGTTGGGGGGTTCCTAAGGCCACTAGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAATGAAAGTAATTTTATGGTTGGGGGGTTCCTAAGGCCACTAGAAA  750

seq1  TATATGCTTCCTGGTGGTCATGACCCACAGGTTGAGAATGGCTGCTGTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGCTTCCTGGTGGTCATGACCCACAGGTTGAGAATGGCTGCTGTAC  800

seq1  CTAAAAATGCTGCATAATGAGTGAGTGTCTGAGAGGACAGGGAGAGATTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAATGCTGCATAATGAGTGAGTGTCTGAGAGGACAGGGAGAGATTA  850

seq1  GACCCCCTGAACCTCTTAATGGAAACATTAAACGGTACATTCATTTAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCCTGAACCTCTTAATGGAAACATTAAACGGTACATTCATTTAATG  900

seq1  CAACATCTTTCCAGTTTCTCCTATAGTTAAACACAGATGCACCATCAAAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATCTTTCCAGTTTCTCCTATAGTTAAACACAGATGCACCATCAAAT  950

seq1  CCAGCAATTCCACTCCTGCCCATGAACCCAAAAGCCGTGCAAGCATGCAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  CCAGCAATTCCACTCCTGCCCATGAACCCCAAAGCCGTGC-AGCATGCAT  999

seq1  CTGTACAGAAACTCAAAATGCGCATCACCG-AGGTCTTCAGCATCACTGA  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTGTACAGAAACTCAAAATGCGCATCACCGAAGGTCTTCAGCATCACTGA  1049

seq1  GAAGTGGGTCAACCAGCTGTG-TTTGTCCTACCACAG-ATAACGCCC-AA  1096
      | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  G-AGTGGGTCAA-CAGCTGTGTTTTGTCCTACCACAGAATAACGCCCAAA  1097

seq1  TGGGG  1101
      |||||
seq2  TGGGG  1102

seq1: chr8_14652467_14653578
seq2: B6Ng01-289E01.g_65_1179 (reverse)

seq1  CCCCCCCA---AGCTCCCTCACATCCACCATATTGGCCATCCTTCTTTAA  47
      ||||||||   ||||||   |||| ||||||||| ||||| |||| ||||
seq2  CCCCCCCACAGAGCTCC--TACATTCACCATATT-GCCAT-CTTC-TTAA  45

seq1  AGGTCACTTCCTTTATGGCCTTTACTCCTGGAGTTAGCCACTTCCTG-AC  96
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||
seq2  AGGTCACTTCC-TTATGGCCTTTACTCCT-GAGTTAGCCACTTTCTGAAC  93

seq1  AG-ATAT-ATAAACTGCTTATGTCTCAAGACTT-AGCCCACACCCTACCT  143
      || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGAATATAATAAACTGCTTATGTCTCAAGACTTAAGCCCACACCCTACCT  143

seq1  CCCTAGGACATACTCTCCAGG--ATGTCCAATCTCAC-GCCAATGTCCAC  190
      |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCCTAGGACATACTCTCCAGGGATTGTCCAATCTCACGGCCAATGTCCAC  193

seq1  ACATATACCTTTTGCGGCAGTGTTACTTGTTGGACTGTGGCTTTTCAAAG  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATACCTTTTGCGGCAGTGTTACTTGTTGGACTGTGGCTTTTCAAAG  243

seq1  GTCAGACCATGCCCTTCCTCTGTCATCAGGCCTTCAAAGGTTGAGGAAAA  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGACCATGCCCTTCCTCTGTCATCAGGCCTTCAAAGGTTGAGGAAAA  293

seq1  TAAGGTGTGATAAGGAGCCAGTGAGAGCATGAGCCAGGGGGATGCTGAGG  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTGTGATAAGGAGCCAGTGAGAGCATGAGCCAGGGGGATGCTGAGG  343

seq1  AAAAGCCAAGGGGAGTTGGTCTGTTGGTATCAGTTGAGTATCTGCCTCTG  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCAAGGGGAGTTGGTCTGTTGGTATCAGTTGAGTATCTGCCTCTG  393

seq1  GTGGCGACACTGTGGTCCCCAGGAGCAGAGCAGCAAACAGGGGCTCCTTC  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCGACACTGTGGTCCCCAGGAGCAGAGCAGCAAACAGGGGCTCCTTC  443

seq1  CCAGGAGACTCAAGAGGAACTTTATCTTCTCCTTTCTCTATTCTCTTTGC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGACTCAAGAGGAACTTTATCTTCTCCTTTCTCTATTCTCTTTGC  493

seq1  ATATAGAGAGAAGCCCCAGTGTGGCAGAGCTTATTGCTACATCCATAATG  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGAGAGAAGCCCCAGTGTGGCAGAGCTTATTGCTACATCCATAATG  543

seq1  AACGCCAGAGAACTCTCTACAGTTTTGCAACCCTATGTTTAATTTAATCT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCCAGAGAACTCTCTACAGTTTTGCAACCCTATGTTTAATTTAATCT  593

seq1  CACAGTGAGCTTTGAATCCTACGTTCTTACTGTTACTTCACAGCTGGAGA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTGAGCTTTGAATCCTACGTTCTTACTGTTACTTCACAGCTGGAGA  643

seq1  ACTTGGGGGTTGGTAGGCAAAGGAGTTTATCCAGGATGTAAGTAACCTTG  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGGGTTGGTAGGCAAAGGAGTTTATCCAGGATGTAAGTAACCTTG  693

seq1  TTCATGTCATGAATGACTTTGTGCCCATCTAGGAAAACTTCAAATGTCTA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTCATGAATGACTTTGTGCCCATCTAGGAAAACTTCAAATGTCTA  743

seq1  CTGTGGCTCACACCATCCTCGCACATTCACCTTCCACTGGCGTGCTGTGT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCTCACACCATCCTCGCACATTCACCTTCCACTGGCGTGCTGTGT  793

seq1  CTAGGATGGCCCAGCTAACATCCTAACATAGATCCTGAGCTAGCTTGAGT  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGATGGCCCAGCTAACATCCTAACATAGATCCTGAGCTAGCTTGAGT  843

seq1  TCTCATAGTAGGGTCTTTAGACCAGCTTTGCTACCCTGCAAATTCCTTAG  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATAGTAGGGTCTTTAGACCAGCTTTGCTACCCTGCAAATTCCTTAG  893

seq1  ATATAACAATACCCCAATAAGAAACCAGAGTGGAGCACAAGCCATTGTAT  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAACAATACCCCAATAAGAAACCAGAGTGGAGCACAAGCCATTGTAT  943

seq1  TCATGAGAGCAGAAGTAGACATGTCACTGGGAGCATGGATTTCCACCTGC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAGAGCAGAAGTAGACATGTCACTGGGAGCATGGATTTCCACCTGC  993

seq1  GCCATGGGCTTTAGACCTTCAGTTGTCAGGACTATGCTGAAACATGGGGA  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGGCTTTAGACCTTCAGTTGTCAGGACTATGCTGAAACATGGGGA  1043

seq1  CCAATGTGAAATATCATAAGAAGCACACAAAGTTCTAGAAAGTGAGCCAC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGTGAAATATCATAAGAAGCACACAAAGTTCTAGAAAGTGAGCCAC  1093

seq1  TGTGAGTGATGGGTGAGAATTC  1112
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTGATGGGTGAGAATTC  1115