BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291D04
Chromosome8 (Build37)
Map Location 15,035,295 - 15,161,589
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBB014433, Myom2, EG665599
Upstream geneErich1, Dlgap2, LOC100041140, C030037F17Rik, Cln8, Arhgef10, 2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11
Downstream geneEG234097, EG665619, LOC634008, Csmd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291D04.bB6Ng01-291D04.g
ACCGA088148GA088149
length1,1231,087
definitionB6Ng01-291D04.b B6Ng01-291D04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,160,471 - 15,161,589)(15,035,295 - 15,036,342)
sequence
gaattcagacaggaatctctgttcctgttatattattttttaccagtttg
gtaataccttcctaattccgactcagaacagggacccgctcgctgtcaga
agtgagttcagagtgttgagttgtcttgctttagtggcttcaagcaaagt
gtagatcagaagctagaattcacctctccctgcacaaaagagattggctc
cacaaagcctcatataaaccatgaacttcatattgaaatgttcttaattg
gtagaaggtagttcatgacgacatactttataactaaaggaacgccgacc
tttagaatcttgcttggctaaccaggctgttaaggtctgttcaagtatat
ctaccatgttaaaccaaggagagctatggaagcagggtatacaggaaaag
tttcgacagtggtgctgggatatggggcaagaagaccattcaagaagagc
aagccatgtggtagggaagctttgttcacagtggctccaccacacaaaag
caatgacatatgaactcactctagcctgatgatcaagatcagcacctttg
aagcagatgccccttctggaaacttaacttctctgtgtctacatatttat
tgtttccctgtagtgagcgctctgggtaatgaggtaacactgatgagact
cgtgtagtactgtctggggtggtctgttgactccccagggcatgccctcc
aggggaggaggagccatgtataactgctgtagaaggaagaccgtctcgtg
tgctggcggactactattcagtctctattcctgctcagtagtagactctc
aataaagaatgtctagtagacgactcacggtgtgccacgtagaaaagttg
ttacattttggttgaacagcctaatcaacttgggaatgtgttctgggcca
tctctttggatgtgcccctctgattatctgtttatacaagtttattaaac
acacatacacatggtttttgtctaaatgtctaaaatgtctaaaaagaagt
ctacaatgtcctaacagccacattttctggcttgcaatgctattttatga
ggctgagagctcttgggagtaagcctaagctggttcaggtaggacacagc
ctattacctggccctagaccaaa
gaattcacagaattcagaaaatgaggttccaggtatgtgaggcacatgag
ccttgacttcagttcgttgttccagctccagtccttaccgtttacatcag
gatggttgaaacacaatgggtcgctcttaactccctgtatctgtttcaag
cttcttacatttaaaatgacatctgggtgcttaggtaatggctggatgct
caccttgctaacacaggccaagatgatggttccatcagcagattgcactt
aagagaacacacacacacacacacacagagggagggggcatctagctgaa
ggctattcctgcctactctccccacatcccactcagctcctggccctgcg
tatttgagttgaggtggtgccaaattcagtgagaggatttatgtttctag
agaggctgaggaaatcccatgccaagggtgtctccgaactgaggccagtc
cctggaagccacgtgaaggagagaatcaacccaatggtgctgccctctgg
ctactaacgtgaccatcactacacaagggggatacaaatagtagtcaata
acagatattaacaagacaggctcttaaaagagtggaaggtgatcatcctt
ttagtaagtttactctttttgtgtgttgagctgcatttcatagctattct
ggggcaccttgactgcaagttgggcatccccgagtataaactgtttgccc
atgaattccatgttaaccttggttgtgcggcctgacagggttgtttctat
tttttctttttgtggcataatgattatctaaaatatgggagcagcaagtc
tgtaaacttgaaacaaccagaaaaaaaaccccactgcttctttcaaagga
ctttcttgggatctatggagagtcaagaaacttgaatagcccaaccccct
ctgcccacgcggaaacatttatattgaaaaatgctcccttgggcctttgg
agccctcttgtccagcacaccccctacccccaccccgcttttgagacaag
ggtttctctgttattatcccagagctgcccttggaaacttgttcgtgtaa
accaggcctagccttgaacacttgagaaatccgctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_15160471_15161589
seq2: B6Ng01-291D04.b_50_1172 (reverse)

seq1  TTTGGTCTAGGG-CAGGT-ATAGCTTGGTGTCCTACTTGAACCAGCTAGG  48
      |||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||  |
seq2  TTTGGTCTAGGGCCAGGTAATAGGCT-GTGTCCTACCTGAACCAGCTTAG  49

seq1  GCCTACCTCCCAAGAGCTTCTCAGCCTCATAAAAATAGCATTGCAAGGCA  98
      || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  GCTTA-CTCCCAAGAGC-TCTCAGCCTCAT-AAAATAGCATTGCAAGCCA  96

seq1  GAAAATGTGGCTGTTAGGGACATTGTAGACT--CTTTTAGACATTTTAGA  146
      |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  GAAAATGTGGCTGTTA-GGACATTGTAGACTTCTTTTTAGACATTTTAGA  145

seq1  CATTTAGACAAAA--CATGTGTATGTGTGTTTAATAAACTTGTATAAACA  194
      |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAGACAAAAACCATGTGTATGTGTGTTTAATAAACTTGTATAAACA  195

seq1  GATAATCAGAGGGGCACATCCAAAGAGATGG-CCAGAACACATT-CCAAG  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  GATAATCAGAGGGGCACATCCAAAGAGATGGCCCAGAACACATTCCCAAG  245

seq1  TTGATTAGGCTGTTCAACCAAAATGTAACAAC-TTTCTACGTGGCACACC  291
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTGATTAGGCTGTTCAACCAAAATGTAACAACTTTTCTACGTGGCACACC  295

seq1  GTGAGTCGTCTACTAGACATTCTTTATTGAGAGTCTACTACTGAGCAGGA  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTCGTCTACTAGACATTCTTTATTGAGAGTCTACTACTGAGCAGGA  345

seq1  ATAGAGACTGAATAGTAGTCCGCCAGCACACGAGACGGTCTTCCTTCTAC  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGACTGAATAGTAGTCCGCCAGCACACGAGACGGTCTTCCTTCTAC  395

seq1  AGCAGTTATACATGGCTCCTCCTCCCCTGGAGGGCATGCCCTGGGGAGTC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTATACATGGCTCCTCCTCCCCTGGAGGGCATGCCCTGGGGAGTC  445

seq1  AACAGACCACCCCAGACAGTACTACACGAGTCTCATCAGTGTTACCTCAT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACCACCCCAGACAGTACTACACGAGTCTCATCAGTGTTACCTCAT  495

seq1  TACCCAGAGCGCTCACTACAGGGAAACAATAAATATGTAGACACAGAGAA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCAGAGCGCTCACTACAGGGAAACAATAAATATGTAGACACAGAGAA  545

seq1  GTTAAGTTTCCAGAAGGGGCATCTGCTTCAAAGGTGCTGATCTTGATCAT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGTTTCCAGAAGGGGCATCTGCTTCAAAGGTGCTGATCTTGATCAT  595

seq1  CAGGCTAGAGTGAGTTCATATGTCATTGCTTTTGTGTGGTGGAGCCACTG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTAGAGTGAGTTCATATGTCATTGCTTTTGTGTGGTGGAGCCACTG  645

seq1  TGAACAAAGCTTCCCTACCACATGGCTTGCTCTTCTTGAATGGTCTTCTT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAAAGCTTCCCTACCACATGGCTTGCTCTTCTTGAATGGTCTTCTT  695

seq1  GCCCCATATCCCAGCACCACTGTCGAAACTTTTCCTGTATACCCTGCTTC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCATATCCCAGCACCACTGTCGAAACTTTTCCTGTATACCCTGCTTC  745

seq1  CATAGCTCTCCTTGGTTTAACATGGTAGATATACTTGAACAGACCTTAAC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCTCTCCTTGGTTTAACATGGTAGATATACTTGAACAGACCTTAAC  795

seq1  AGCCTGGTTAGCCAAGCAAGATTCTAAAGGTCGGCGTTCCTTTAGTTATA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGTTAGCCAAGCAAGATTCTAAAGGTCGGCGTTCCTTTAGTTATA  845

seq1  AAGTATGTCGTCATGAACTACCTTCTACCAATTAAGAACATTTCAATATG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATGTCGTCATGAACTACCTTCTACCAATTAAGAACATTTCAATATG  895

seq1  AAGTTCATGGTTTATATGAGGCTTTGTGGAGCCAATCTCTTTTGTGCAGG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCATGGTTTATATGAGGCTTTGTGGAGCCAATCTCTTTTGTGCAGG  945

seq1  GAGAGGTGAATTCTAGCTTCTGATCTACACTTTGCTTGAAGCCACTAAAG  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTGAATTCTAGCTTCTGATCTACACTTTGCTTGAAGCCACTAAAG  995

seq1  CAAGACAACTCAACACTCTGAACTCACTTCTGACAGCGAGCGGGTCCCTG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACAACTCAACACTCTGAACTCACTTCTGACAGCGAGCGGGTCCCTG  1045

seq1  TTCTGAGTCGGAATTAGGAAGGTATTACCAAACTGGTAAAAAATAATATA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGTCGGAATTAGGAAGGTATTACCAAACTGGTAAAAAATAATATA  1095

seq1  ACAGGAACAGAGATTCCTGTCTGAATTC  1119
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAACAGAGATTCCTGTCTGAATTC  1123

seq1: chr8_15035295_15036342
seq2: B6Ng01-291D04.g_72_1158

seq1  GAATTCACAGAATTCAGAAAATGAGGTTCCAGGTATGTGAGGCACATGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAATTCAGAAAATGAGGTTCCAGGTATGTGAGGCACATGAG  50

seq1  CCTTGACTTCAGTTCGTTGTTCCAGCTCCAGTCCTTACCGTTTACATCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGACTTCAGTTCGTTGTTCCAGCTCCAGTCCTTACCGTTTACATCAG  100

seq1  GATGGTTGAAACACAATGGGTCGCTCTTAACTCCCTGTATCTGTTTCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTGAAACACAATGGGTCGCTCTTAACTCCCTGTATCTGTTTCAAG  150

seq1  CTTCTTACATTTAAAATGACATCTGGGTGCTTAGGTAATGGCTGGATGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTACATTTAAAATGACATCTGGGTGCTTAGGTAATGGCTGGATGCT  200

seq1  CACCTTGCTAACACAGGCCAAGATGATGGTTCCATCAGCAGATTGCACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTGCTAACACAGGCCAAGATGATGGTTCCATCAGCAGATTGCACTT  250

seq1  AAGAGAACACACACACACACACACACAGAGGGAGGGGGCATCTAGCTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAACACACACACACACACACACAGAGGGAGGGGGCATCTAGCTGAA  300

seq1  GGCTATTCCTGCCTACTCTCCCCACATCCCACTCAGCTCCTGGCCCTGCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATTCCTGCCTACTCTCCCCACATCCCACTCAGCTCCTGGCCCTGCG  350

seq1  TATTTGAGTTGAGGTGGTGCCAAATTCAGTGAGAGGATTTATGTTTCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGAGTTGAGGTGGTGCCAAATTCAGTGAGAGGATTTATGTTTCTAG  400

seq1  AGAGGCTGAGGAAATCCCATGCCAAGGGTGTCTCCGAACTGAGGCCAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTGAGGAAATCCCATGCCAAGGGTGTCTCCGAACTGAGGCCAGTC  450

seq1  CCTGGAAGCCACGTGAAGGAGAGAATCAACCCAATGGTGCTGCCCTCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAAGCCACGTGAAGGAGAGAATCAACCCAATGGTGCTGCCCTCTGG  500

seq1  CTACTAACGTGACCATCACTACACAAGGGGGATACAAATAGTAGTCAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTAACGTGACCATCACTACACAAGGGGGATACAAATAGTAGTCAATA  550

seq1  ACAGATATTAACAAGACAGGCTCTTAAAAGAGTGGAAGGTGATCATCCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATATTAACAAGACAGGCTCTTAAAAGAGTGGAAGGTGATCATCCTT  600

seq1  TTAGTAAGTTTACTCTTTTTGTGTGTTGAGCTGCA-TTCATAGCTATTCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTAGTAAGTTTACTCTTTTTGTGTGTTGAGCTGCATTTCATAGCTATTCT  650

seq1  GGGGCACCTTGACTGCAAGTTGGGCATCCCCGAGTAT-AACTGTTTGCCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGGGCACCTTGACTGCAAGTTGGGCATCCCCGAGTATAAACTGTTTGCCC  700

seq1  ATGAATTCCATGTTAACCTTGGTTGTGCGGCCTGACAGGGTTG-TTCTAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATGAATTCCATGTTAACCTTGGTTGTGCGGCCTGACAGGGTTGTTTCTAT  750

seq1  TTTT--CTTTTGTGGCATAATGATTATCTAAAATAT-GGAGCAGCAAGTC  794
      ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTTTTCTTTTTGTGGCATAATGATTATCTAAAATATGGGAGCAGCAAGTC  800

seq1  TGTAAACTTG-AACAACCAG-AAAAAAACCCCACTGCTTCTTTCAAAGGA  842
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAACTTGAAACAACCAGAAAAAAAACCCCACTGCTTCTTTCAAAGGA  850

seq1  C-TTCCTGGGATCTAT-GAG-GTCAAGAA--CTGAATAGCC---ACCCCT  884
      | ||| |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||    |||||
seq2  CTTTCTTGGGATCTATGGAGAGTCAAGAAACTTGAATAGCCCAACCCCCT  900

seq1  CTG-CCACGCGG-AACATTTATATTG-AAAATGCTCC--TTGGCCTTT-G  928
      ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |
seq2  CTGCCCACGCGGAAACATTTATATTGAAAAATGCTCCCTTGGGCCTTTGG  950

seq1  AGCCTTC-TGT-CAGCACACCCC--AACCCCA-CCCGC--TTGAGACAA-  970
      |||| || ||| |||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||| 
seq2  AGCCCTCTTGTCCAGCACACCCCCTACCCCCACCCCGCTTTTGAGACAAG  1000

seq1  GGTTTCTCTG-TAGTATCCCAG-GCTGCCCT--GGAACTTGTTC-TGTAA  1015
      |||||||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||
seq2  GGTTTCTCTGTTATTATCCCAGAGCTGCCCTTGGAAACTTGTTCGTGTAA  1050

seq1  ACCAGG-CTAGCCTTGA--ACTTG-GAGATCCGCTGG  1048
      |||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||
seq2  ACCAGGCCTAGCCTTGAACACTTGAGAAATCCGCTGG  1087