BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-292B15
Chromosome8 (Build37)
Map Location 33,915,330 - 34,049,266
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042715
Upstream geneNrg1, 2010007E15Rik, EG666589, EG546052
Downstream geneLOC628408, EG628412, Wrn, Purg, LOC666630, Hmgb1-rs17, Tex15, Ppp2cb, Ubxd6, Gsr, Gtf2e2, Rbpms, LOC100042769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-292B15.bB6Ng01-292B15.g
ACCGA088824GA088825
length1,1251,150
definitionB6Ng01-292B15.b B6Ng01-292B15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,915,330 - 33,916,461)(34,048,114 - 34,049,266)
sequence
gaattcagattacagacagggacagatgcatgtgaaggggtgagcaaagc
agtccattagcagcaagcctctgcagaactaaggagaaaacaggtaaaga
gaaaggcttgaataatatacccagttcataaacactgatgccaatttaag
tctcaaagcagaaatccccaattagttccatactggtttcagatcctgct
cagtttacagttgaattatatcttgctaaaaccatcacatatctctaata
tcaaataatgaaagtacattctgtacatctaacctatcaccatcattgct
cagcatgcacactcagcacactgtagaatgtcagttattcactctcctta
tctcagagctgacttggagctccatttgctgctgcccagcatcagagtat
actgtactcactatggctagcctaatgaaaagatccccattcaaattcaa
accatctcttctactgagtgcatggtgctttcatagcagtgaaacaggtt
gagccatctcaagccagagacaacattactaaatggggttgtgggtgaca
gaggtgatgtcatcctctttcactcttagacttcttgtccatggtggtcc
atactatataagaaatggaggaagaatgaggagataaatcacagaaaaga
tgaaacatctgctcaaaatgttgtcattctttcataaaacaagtgaaaca
tctaactttctgaaaagaaaaccaggatgtaataaaaatgaacagaaagt
ctttaagcatgagcgactataagttgtaggggggaaaatcacccacatga
tgataaaaataaaaatacaagatcaaaatattgatggaaaacagagcaag
attcctgaaatctaacaaataaaactgaaggtgaatgagtgggaaaagaa
atacagactagataacagacatagccaacagtaaatgaagacagaacaca
gagatagcacactcgtgacctgtgttacagcctggtagctgtgcctcttc
agattcacatgtcaactctaccctccagtcatgatgatcatcttagaaca
tgatagtgagctataaagatacccagagagaagtttcatcgctccttcta
ctgtgcaagaaccgacaaaagatag
gaattctactaaagaacaatatgtccagaatttctcattggggtgtctca
ggagaggaaacagggcaagggagatggtgtagagcagtgattctccacgt
tggcagtcacatatcagatatcctgtatatcagctatttacattacaatt
cataacagtaacaaaatgacagctatgaagtagcaatgaaataattctat
ggttggagtcaccagaatatgaggacctgtcttaaggtgtcacaggttga
ggaccatgggcttagagcttatttggagttatattttcatagcgaggcaa
tatttttacttatagtttcagagatgagggggcaactcaaatgtctacaa
aataccatttgctttctctactaattcattaggaattattttttgcatgt
gtatgtatgcatagtatttacacctacatatttgcaggtgcaaatgtgta
ttgctgtctgtatatatggctcatctctcagcctcttaacagaagcttaa
aggtgactttgagtttctttcccagtcacgcccactgtacttatcgaggt
ttagccagcctgattgctgttcaggtctgtggttacttggtactgaaaca
atgaggcattttacatttttatcccccataactaggacttatcctcaaac
tccagtaagagcccacaatgccagctcccaccagcagaggaacggtaggg
tgagtttgctgcacacagagaagcccataatctagattctgggggcgggg
ggggctgtcctcttttccattttagatgaacatccatggtataacatgca
caagatgcaaaggagtggtttctcctccgtgtaaaccgttttaggactat
gaaaggcatcagtgtgcaacaccactgagcataatagtatctcacatagt
attaaatagatcatagcctcatctcttcaccagtggacctatagccccag
gggtgtgctcctcccccaggagtagtacaccatttcccaacagcctctgg
gatataaaattttacaggaatctctgtggaagtgtgctggatctcacaag
atagaattgctattgagcttctcatttggtgttctgctaatggggggttt
ggaacttcccacatggagatgaaaagccaaatatagaacactatattata

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_33915330_33916461
seq2: B6Ng01-292B15.b_52_1176

seq1  GAATTCAGATTACAGACAGGGACAGATGCATGTGAAGGGGTGAGCAAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATTACAGACAGGGACAGATGCATGTGAAGGGGTGAGCAAAGC  50

seq1  AGTCCATTAGCAGCAAGCCTCTGCAGAACTAAGGAGAAAACAGGTAAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCATTAGCAGCAAGCCTCTGCAGAACTAAGGAGAAAACAGGTAAAGA  100

seq1  GAAAGGCTTGAATAATATACCCAGTTCATAAACACTGATGCCAATTTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGCTTGAATAATATACCCAGTTCATAAACACTGATGCCAATTTAAG  150

seq1  TCTCAAAGCAGAAATCCCCAATTAGTTCCATACTGGTTTCAGATCCTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAAGCAGAAATCCCCAATTAGTTCCATACTGGTTTCAGATCCTGCT  200

seq1  CAGTTTACAGTTGAATTATATCTTGCTAAAACCATCACATATCTCTAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTACAGTTGAATTATATCTTGCTAAAACCATCACATATCTCTAATA  250

seq1  TCAAATAATGAAAGTACATTCTGTACATCTAACCTATCACCATCATTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAATGAAAGTACATTCTGTACATCTAACCTATCACCATCATTGCT  300

seq1  CAGCATGCACACTCAGCACACTGTAGAATGTCAGTTATTCACTCTCCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATGCACACTCAGCACACTGTAGAATGTCAGTTATTCACTCTCCTTA  350

seq1  TCTCAGAGCTGACTTGGAGCTCCATTTGCTGCTGCCCAGCATCAGAGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGAGCTGACTTGGAGCTCCATTTGCTGCTGCCCAGCATCAGAGTAT  400

seq1  ACTGTACTCACTATGGCTAGCCTAATGAAAAGATCCCCATTCAAATTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTACTCACTATGGCTAGCCTAATGAAAAGATCCCCATTCAAATTCAA  450

seq1  ACCATCTCTTCTACTGAGTGCATGGTGCTTTCATAGCAGTGAAACAGGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCTCTTCTACTGAGTGCATGGTGCTTTCATAGCAGTGAAACAGGTT  500

seq1  GAGCCATCTCAAGCCAGAGACAACATTACTAAATGGGGTTGTGGGTGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATCTCAAGCCAGAGACAACATTACTAAATGGGGTTGTGGGTGACA  550

seq1  GAGGTGATGTCATCCTCTTTCACTCTTAGACTTCTTGTCCATGGTGGTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGATGTCATCCTCTTTCACTCTTAGACTTCTTGTCCATGGTGGTCC  600

seq1  ATACTATATAAGAAATGGAGGAAGAATGAGGAGATAAATCACAGAAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTATATAAGAAATGGAGGAAGAATGAGGAGATAAATCACAGAAAAGA  650

seq1  TGAAACATCTGCTCAAAATGTTGTCATTCTTTCATAAAACAAGTGAAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACATCTGCTCAAAATGTTGTCATTCTTTCATAAAACAAGTGAAACA  700

seq1  TCTAACTTTCTGAAAAGAAAACCAGGATGTAATAAAAATGAACAGAAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTTTCTGAAAAGAAAACCAGGATGTAATAAAAATGAACAGAAAGT  750

seq1  CTTTAAGCATGAGCGACTATAAGTTGTAGGGGGGAAAATCACCCACATGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAGCATGAGCGACTATAAGTTGTAGGGGGGAAAATCACCCACATGA  800

seq1  TGATAAAAATAAAAATACAAGATCAAAATATTGATGGAAAACAGAGCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAAAATAAAAATACAAGATCAAAATATTGATGGAAAACAGAGCAAG  850

seq1  ATTCCTGAAATCTAACAAATAAAACTGAAGGTGAATGAGTGGGAAAAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGAAATCTAACAAATAAAACTGAAGGTGAATGAGTGGGAAAAGAA  900

seq1  ATACAGACTAGATAACAGACATAGCCAACAGTAAATGAAGACAGAACAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATACAGACTAGATAACAGACATAGCCAACAGTAAATGAAGACAGAAC-AC  949

seq1  AGAGATAGCACACTCGTGACCTGTGTTACAGCCTGGTAGCTGTGCCTCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATAGCACACTCGTGACCTGTGTTACAGCCTGGTAGCTGTGCCTCTT  999

seq1  CAGATTCACATGTTCAACTCTACCCTCCAGTCATGATGATCATCTTAAGA  1050
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
seq2  CAGATTCACATG-TCAACTCTACCCTCCAGTCATGATGATCATCTTAGAA  1048

seq1  CATGATTAGTGAGGCTATAAAAGATAACCCAGAGAG-AGTTTCATCGCCC  1099
      ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
seq2  CATGA-TAGTGA-GCTAT-AAAGAT-ACCCAGAGAGAAGTTTCATCGCTC  1094

seq1  CTTCTACTGTGCAAAGACACAGACAAAAGATAG  1132
      |||||||||||| |||| || ||||||||||||
seq2  CTTCTACTGTGC-AAGA-ACCGACAAAAGATAG  1125

seq1: chr8_34048114_34049266
seq2: B6Ng01-292B15.g_66_1215 (reverse)

seq1  TATAATTATAGTTGTCTATATTGCCTTTTTCATCTCCCTGTGGGAAATTT  50
      ||||| ||||||  ||||||||    ||||||||||| |||||| || ||
seq2  TATAA-TATAGTGTTCTATATTTGGCTTTTCATCTCCATGTGGG-AAGTT  48

seq1  CCCAAACCCCCATAAGCCAAGAACACCAAAATTGAGAAGCTC-ATAGCCA  99
      || || ||||||| |||  |||||||||||  |||||||||| ||||| |
seq2  CCAAACCCCCCATTAGC--AGAACACCAAA--TGAGAAGCTCAATAGCAA  94

seq1  ATCTATCTTGTGAGATCCAGCACACCTTCCACAGAGATTCCTGTAAAATT  149
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATCTTGTGAGATCCAGCACA-CTTCCACAGAGATTCCTGTAAAATT  143

seq1  TTATAT-CCAGAGGCTGTTGGGAAATGGTGTACTTACTCCT-GGGGAGGA  197
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
seq2  TTATATCCCAGAGGCTGTTGGGAAATGGTGTAC-TACTCCTGGGGGAGGA  192

seq1  GCACACCCCTGGGGCTATAGGTCCACTGGTGAAGAGATGAGGCTATGATC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACCCCTGGGGCTATAGGTCCACTGGTGAAGAGATGAGGCTATGATC  242

seq1  TATTTAATACTATGTGAGATACTATTATGCTCAGTGGTGTTGCACACTGA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAATACTATGTGAGATACTATTATGCTCAGTGGTGTTGCACACTGA  292

seq1  TGCC-TTCATAGTCCTAAAACGGTTTACACGGAGGAGAAACCACTCCTTT  346
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTCATAGTCCTAAAACGGTTTACACGGAGGAGAAACCACTCCTTT  342

seq1  GCATCTTGTGCATGTTATACCATGGATGTTCATCTAAAATGGAAAAGAGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTTGTGCATGTTATACCATGGATGTTCATCTAAAATGGAAAAGAGG  392

seq1  ACAG-CCCCCCCGCCCCCAGAATCTAGATTATGGGCTTCTCTGTGTGCAG  445
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCCCCCCCGCCCCCAGAATCTAGATTATGGGCTTCTCTGTGTGCAG  442

seq1  CAAACTCACCCTACCGTTCCTCTGCTGGTGGGAGCTGGCATTGTGGGCTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCACCCTACCGTTCCTCTGCTGGTGGGAGCTGGCATTGTGGGCTC  492

seq1  TTACTGGAGTTTGAGGATAAGTCCTAGTTATGGGGGATAAAAATGTAAAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGGAGTTTGAGGATAAGTCCTAGTTATGGGGGATAAAAATGTAAAA  542

seq1  TGCCTCATTGTTTCAGTACCAAGTAACCACAGACCTGAACAGCAATCAGG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCATTGTTTCAGTACCAAGTAACCACAGACCTGAACAGCAATCAGG  592

seq1  CTGGCTAAACCTCGATAAGTACAGTGGGCGTGACTGGGAAAGAAACTCAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTAAACCTCGATAAGTACAGTGGGCGTGACTGGGAAAGAAACTCAA  642

seq1  AGTCACCTTTAAGCTTCTGTTAAGAGGCTGAGAGATGAGCCATATATACA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACCTTTAAGCTTCTGTTAAGAGGCTGAGAGATGAGCCATATATACA  692

seq1  GACAGCAATACACATTTGCACCTGCAAATATGTAGGTGTAAATACTATGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCAATACACATTTGCACCTGCAAATATGTAGGTGTAAATACTATGC  742

seq1  ATACATACACATGCAAAAAATAATTCCTAATGAATTAGTAGAGAAAGCAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACACATGCAAAAAATAATTCCTAATGAATTAGTAGAGAAAGCAA  792

seq1  ATGGTATTTTGTAGACATTTGAGTTGCCCCCTCATCTCTGAAACTATAAG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTATTTTGTAGACATTTGAGTTGCCCCCTCATCTCTGAAACTATAAG  842

seq1  TAAAAATATTGCCTCGCTATGAAAATATAACTCCAAATAAGCTCTAAGCC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATATTGCCTCGCTATGAAAATATAACTCCAAATAAGCTCTAAGCC  892

seq1  CATGGTCCTCAACCTGTGACACCTTAAGACAGGTCCTCATATTCTGGTGA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTCCTCAACCTGTGACACCTTAAGACAGGTCCTCATATTCTGGTGA  942

seq1  CTCCAACCATAGAATTATTTCATTGCTACTTCATAGCTGTCATTTTGTTA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAACCATAGAATTATTTCATTGCTACTTCATAGCTGTCATTTTGTTA  992

seq1  CTGTTATGAATTGTAATGTAAATAGCTGATATACAGGATATCTGATATGT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTATGAATTGTAATGTAAATAGCTGATATACAGGATATCTGATATGT  1042

seq1  GACTGCCAACGTGGAGAATCACTGCTCTACACCATCTCCCTTGCCCTGTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCCAACGTGGAGAATCACTGCTCTACACCATCTCCCTTGCCCTGTT  1092

seq1  TCCTCTCCTGAGACACCCCAATGAGAAATTCTGGACATATTGTTCTTTAG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTCCTGAGACACCCCAATGAGAAATTCTGGACATATTGTTCTTTAG  1142

seq1  TAGAATTC  1153
      ||||||||
seq2  TAGAATTC  1150