BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-294D10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 70,233,134 - 70,368,670
singlet/doubletdoublet
Overlap genePsd3
Upstream geneBC053440, LOC665453, Nat1, Nat2, LOC100041265, Nat3
Downstream geneSh2d4a, LOC665510, 4732435N03Rik, Ints10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-294D10.bB6Ng01-294D10.g
ACCGA090399GA090400
length1,100921
definitionB6Ng01-294D10.b B6Ng01-294D10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,367,568 - 70,368,670)(70,233,134 - 70,234,054)
sequence
gaattctcccagctcctcttttggaacactttttaaagttgacattttca
attaaatgactttgttaactatggatagaatgtgaacaacattagtgctt
tctatctgaaaataagaataaaaataatgtaatgtactatggtggtttta
ttattctttcatgttacagttttggacttttaactgtattttgcagaaga
aactcaaccacctggtccattatactctctgttctgtgatcttgctttat
gttctttataacacttggctcaacatgaaacccttacttcatttgatgag
gctgccttcctcattaaaacctgtattctaggaatatatgctttgcattt
caccgctacacctgtccctacccagagccatggctgacaagtcgtaagca
tttagtaaatgcttgctgaatgaacataaataccaatgcaagttttctgg
taacctggaggactaagataggaagaaatggaagactgccctgggtgtga
ccagaggggcacagtgactggcaagccctgtcctgttctccaggatctct
agagcagcttgggctctgtgagtgtcctgtcgtctggagattgttccagc
caaggcaagcattagccactctgctggggacacttttgaatgaccttcct
gtttcaaaaaaaggaaactggatagtttgtactttataaatcacccacca
atatttctgcactttatttgggggaatacagcctacctttatagctcagg
ctagtgcagaactcatcgtcatcatgtgatggtctcctctgcacttccta
gtctcagattaggtgcttacctttcatgaacaattgaaattaggataatt
tcaagactagtataatattgtcttcccttagagtgttctaatttttaagt
aaacaataaataaataataaataaataaacaatgaatatattactgaagc
ataatgaaccagtgatttccagatcataaattgtggtttcattagtaagt
agatcattgagtaattcagtgccttcagtagaaagaataagtagctattt
tatataggaagtagcagtgctctctgaagagtgtcctccttgtatgtgct

gaattcacttattaggacctatcacccaacagaattggttaaatttatga
cacactaatttcatgtggcactcaaactatattgggatggtgaattctga
agccagtattcaacaactcaactagagtttcagtcctaaatgactggctg
cagtctcagtaactgggtttgaggcttggacacctttaagcattaagaca
gacgtggagccatcggatgcaacgtgatggagcccgcaggaaggaaagag
cttcttttgcttaagtgaattgacactgcaatcaaagcacgtgtactgtc
acgcaccgtccacgcaccctgtgtggcactcagttttacaggtggctcta
cagtcacctttgtgaggctgagagcaagcccaccttcctcagtgtgactg
tttcccagtgcagcaatgatttggggggttatactgatatcccttctcct
ccctctctctcctcaggtctagctcaatgtaaggatcagttacctattgt
aactatcttaagtactgcatgagacacatcttgaaataagcaacgtcttc
atcttctaattgctgttgtttttaaggaagcaaagccaaacactgaggct
gaggacaaggccatcaaacgactttgaagatgctgctgcttcaagcacat
agctgtctcccagcatagctcagccctctgtgctccactgatgggagctt
tgtgtttattctgtctgcaaaccatctgtcttccttctaaatcttcatat
attttctaaagtaccttggaagcttggaaatcagtgaaaacactttagaa
ttgaataaaacagaaataaactaatgtgtaaagacatgtggctacggatg
atacttacttccccaaactgggagagaacttaagtttcctttatatgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_70367568_70368670
seq2: B6Ng01-294D10.b_47_1146 (reverse)

seq1  AGCACATAC-AGGAGGACACTC-TCAGAGAGCACTGCCTACCTTCCTATA  48
      ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  AGCACATACAAGGAGGACACTCTTCAGAGAGCACTG-CTA-CTTCCTATA  48

seq1  T-AAATAGCTACTTA-TCTTTCTACTTGAAAGGCACTGAATTAACTCAAT  96
      | ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||
seq2  TAAAATAGCTACTTATTCTTTCTACT--GAAGGCACTGAATT-ACTCAAT  95

seq1  GATCTACTTACTAATGAAACCACAATTTATGATCTGGAAATCACTGGTTC  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTACTTACTAATGAAACCACAATTTATGATCTGGAAATCACTGGTTC  145

seq1  ATTATGCTTCAGTAATATATTCATTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTT  196
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ATTATGCTTCAGTAATATATTCA-TTGTTTATTTATTTA-TTATTTATTT  193

seq1  ATTGTTTACTTAAAAATTAGAACACTCTAAGGGAAGACAATATTATACTA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTTACTTAAAAATTAGAACACTCTAAGGGAAGACAATATTATACTA  243

seq1  GTCTTGAAATTATCCTAATTTCAATTGTTCATGAAAGGTAAGCACCTAAT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGAAATTATCCTAATTTCAATTGTTCATGAAAGGTAAGCACCTAAT  293

seq1  CTGAGACTAGGAAGTGCAGAGGAGACCATCACATGATGACGATGAGTTCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACTAGGAAGTGCAGAGGAGACCATCACATGATGACGATGAGTTCT  343

seq1  GCACTAGCCTGAGCTATAAAGGTAGGCTGTATTCCCCCAAATAAAGTGCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTAGCCTGAGCTATAAAGGTAGGCTGTATTCCCCCAAATAAAGTGCA  393

seq1  GAAATATTGGTGGGTGATTTATAAAGTACAAACTATCCAGTTTCCTTTTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATATTGGTGGGTGATTTATAAAGTACAAACTATCCAGTTTCCTTTTT  443

seq1  TTGAAACAGGAAGGTCATTCAAAAGTGTCCCCAGCAGAGTGGCTAATGCT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACAGGAAGGTCATTCAAAAGTGTCCCCAGCAGAGTGGCTAATGCT  493

seq1  TGCCTTGGCTGGAACAATCTCCAGACGACAGGACACTCACAGAGCCCAAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTGGCTGGAACAATCTCCAGACGACAGGACACTCACAGAGCCCAAG  543

seq1  CTGCTCTAGAGATCCTGGAGAACAGGACAGGGCTTGCCAGTCACTGTGCC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTAGAGATCCTGGAGAACAGGACAGGGCTTGCCAGTCACTGTGCC  593

seq1  CCTCTGGTCACACCCAGGGCAGTCTTCCATTTCTTCCTATCTTAGTCCTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGTCACACCCAGGGCAGTCTTCCATTTCTTCCTATCTTAGTCCTC  643

seq1  CAGGTTACCAGAAAACTTGCATTGGTATTTATGTTCATTCAGCAAGCATT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTACCAGAAAACTTGCATTGGTATTTATGTTCATTCAGCAAGCATT  693

seq1  TACTAAATGCTTACGACTTGTCAGCCATGGCTCTGGGTAGGGACAGGTGT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAAATGCTTACGACTTGTCAGCCATGGCTCTGGGTAGGGACAGGTGT  743

seq1  AGCGGTGAAATGCAAAGCATATATTCCTAGAATACAGGTTTTAATGAGGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGTGAAATGCAAAGCATATATTCCTAGAATACAGGTTTTAATGAGGA  793

seq1  AGGCAGCCTCATCAAATGAAGTAAGGGTTTCATGTTGAGCCAAGTGTTAT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCCTCATCAAATGAAGTAAGGGTTTCATGTTGAGCCAAGTGTTAT  843

seq1  AAAGAACATAAAGCAAGATCACAGAACAGAGAGTATAATGGACCAGGTGG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACATAAAGCAAGATCACAGAACAGAGAGTATAATGGACCAGGTGG  893

seq1  TTGAGTTTCTTCTGCAAAATACAGTTAAAAGTCCAAAACTGTAACATGAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTTCTTCTGCAAAATACAGTTAAAAGTCCAAAACTGTAACATGAA  943

seq1  AGAATAATAAAACCACCATAGTACATTACATTATTTTTATTCTTATTTTC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAATAAAACCACCATAGTACATTACATTATTTTTATTCTTATTTTC  993

seq1  AGATAGAAAGCACTAATGTTGTTCACATTCTATCCATAGTTAACAAAGTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGAAAGCACTAATGTTGTTCACATTCTATCCATAGTTAACAAAGTC  1043

seq1  ATTTAATTGAAAATGTCAACTTTAAAAAGTGTTCCAAAAGAGGAGCTGGG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATTGAAAATGTCAACTTTAAAAAGTGTTCCAAAAGAGGAGCTGGG  1093

seq1  AGAATTC  1103
      |||||||
seq2  AGAATTC  1100

seq1: chr8_70233134_70234054
seq2: B6Ng01-294D10.g_67_987

seq1  GAATTCACTTATTAGGACCTATCACCCAACAGAATTGGTTAAATTTATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTATTAGGACCTATCACCCAACAGAATTGGTTAAATTTATGA  50

seq1  CACACTAATTTCATGTGGCACTCAAACTATATTGGGATGGTGAATTCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTAATTTCATGTGGCACTCAAACTATATTGGGATGGTGAATTCTGA  100

seq1  AGCCAGTATTCAACAACTCAACTAGAGTTTCAGTCCTAAATGACTGGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGTATTCAACAACTCAACTAGAGTTTCAGTCCTAAATGACTGGCTG  150

seq1  CAGTCTCAGTAACTGGGTTTGAGGCTTGGACACCTTTAAGCATTAAGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTCAGTAACTGGGTTTGAGGCTTGGACACCTTTAAGCATTAAGACA  200

seq1  GACGTGGAGCCATCGGATGCAACGTGATGGAGCCCGCAGGAAGGAAAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTGGAGCCATCGGATGCAACGTGATGGAGCCCGCAGGAAGGAAAGAG  250

seq1  CTTCTTTTGCTTAAGTGAATTGACACTGCAATCAAAGCACGTGTACTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTTGCTTAAGTGAATTGACACTGCAATCAAAGCACGTGTACTGTC  300

seq1  ACGCACCGTCCACGCACCCTGTGTGGCACTCAGTTTTACAGGTGGCTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCACCGTCCACGCACCCTGTGTGGCACTCAGTTTTACAGGTGGCTCTA  350

seq1  CAGTCACCTTTGTGAGGCTGAGAGCAAGCCCACCTTCCTCAGTGTGACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACCTTTGTGAGGCTGAGAGCAAGCCCACCTTCCTCAGTGTGACTG  400

seq1  TTTCCCAGTGCAGCAATGATTTGGGGGGTTATACTGATATCCCTTCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCAGTGCAGCAATGATTTGGGGGGTTATACTGATATCCCTTCTCCT  450

seq1  CCCTCTCTCTCCTCAGGTCTAGCTCAATGTAAGGATCAGTTACCTATTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCTCTCCTCAGGTCTAGCTCAATGTAAGGATCAGTTACCTATTGT  500

seq1  AACTATCTTAAGTACTGCATGAGACACATCTTGAAATAAGCAACGTCTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATCTTAAGTACTGCATGAGACACATCTTGAAATAAGCAACGTCTTC  550

seq1  ATCTTCTAATTGCTGTTGTTTTTAAGGAAGCAAAGCCAAACACTGAGGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTAATTGCTGTTGTTTTTAAGGAAGCAAAGCCAAACACTGAGGCT  600

seq1  GAGGACAAGGCCATCAAACGACTTTGAAGATGCTGCTGCTTCAAGCACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACAAGGCCATCAAACGACTTTGAAGATGCTGCTGCTTCAAGCACAT  650

seq1  AGCTGTCTCCCAGCATAGCTCAGCCCTCTGTGCTCCACTGATGGGAGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTCTCCCAGCATAGCTCAGCCCTCTGTGCTCCACTGATGGGAGCTT  700

seq1  TGTGTTTATTCTGTCTGCAAACCATCTGTCTTCCTTCTAAATCTTCATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTATTCTGTCTGCAAACCATCTGTCTTCCTTCTAAATCTTCATAT  750

seq1  ATTTTCTAAAGTACCTTGGAAGCTTGGAAATCAGTGAAAACACTTTAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTAAAGTACCTTGGAAGCTTGGAAATCAGTGAAAACACTTTAGAA  800

seq1  TTGAATAAAACAGAAATAAACTAATGTGTAAAGACATGTGGCTACGGATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATAAAACAGAAATAAACTAATGTGTAAAGACATGTGGCTACGGATG  850

seq1  ATACTTACTTCCCCAAACTGGGAGAGAACTTAAGTTTCCTTTATATGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTACTTCCCCAAACTGGGAGAGAACTTAAGTTTCCTTTATATGTGT  900

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  921
      |||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  921