BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-298B01
Chromosome8 (Build37)
Map Location 115,499,315 - 115,633,092
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042061
Upstream geneAdat1, Kars, Terf2ip, EG627828, LOC672498, LOC100042040, Cntnap4
Downstream geneMon1b, 4930481F22Rik, Adamts18
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298B01.bB6Ng01-298B01.g
ACCGA093271GA093272
length1,099682
definitionB6Ng01-298B01.b B6Ng01-298B01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(115,499,315 - 115,500,421)(115,632,411 - 115,633,092)
sequence
gaattctggcaagggcatcagacaagttagtcaggaagacttccaacttg
tagaattgtggtaggcacctacctttgttctggctatgtgtataacttgc
atgcatcagcccagccctggatttaatataaacaatctaaatgaactggg
ataggatgccgaggttgaggtcatttccagatctgtaatcagtgcacagc
agaacccttttggaccctcatttatctttcagttagtatagtggatcagt
cgatatttgcaaagaattctggtcagggtcaaacgtcttcagggatccct
gaggagggaggaataaattacagggccacagttaccctttcatataatat
ctaaaaggccattatgtgcaaagattctctctgaaatctaattcttgccc
cagccaagtcaatttaggaaaagtggacctgtagcagccagctctgtaat
gctgcccaaacagataaaagcttgtggttttgtgtctggcccagactgtg
tttgctgcctctatagaaacagatgttttcctgtgtgaaacagctacttg
tccactgaccaagcttgcacaagctgataatggacatgtatgtctataat
gttgggagggggtggctgttacaatgaatcttcagcaagcagtgtctaag
atggtctctgatgatcttttctgccacgcacaagccacttgtcaacacag
actggcgtagtcatttgcatcaaaataagaaaatatggcagagaccaaaa
ttggttgtctgctctgtaattacttgacacagaacactaacttccatatt
agtaactgattctttcccagctggctatggccaaacaatttttgtcgttg
gagaggtctccatcacaaggaacggaggaccacatttagcagctctctag
taacttgaggctctcagctcagcatctgaaaggaatgagatgcaaacagt
gacatcatgaatgagctcaaaagtctttgtctaggttagacatcatggga
gattcacagtatcagagaaaagtgattatagcatgtgggaagccctgggt
gggagagggttcatttagctgaacccagattcttactcataaaaccata
gaattccaggtcaccctgggctacatgagaccctgttctatcctcctcat
aaaaggaaagcaacaggcagaggcaggcagatttctaagtttaaggccag
cctggtctacaaagtgagttccaggacagccagggctacacagagaaacc
ctgtctcgaaaaacaaaacaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaa
aaaaggaaagcaaagagttccattctttcacatccttcatcactgggaat
ttgcagctcttccccctttggaaataaggttatttctcctgtgcctgact
ccctccttgtttgaggatatgtgttgaggagtagaagtcagcgatgatgg
tgaggctgttaccatgcaactgtttctcttagaaactcctggccaccttg
gggaagagtctggagagcctgactcacagtcaatttaaagaggtcagaat
ccaggtgagatcatactgcctacctgactcactgagttaacatagataaa
gtagtgttgttaccttggggagggggagggactagtagagcccagactag
cttcaaaatccctaagtagctcagtatgaccttgaagctcaggtcctctt
gcctctatcccctaagtactaggattatgacaatgtggcataatatcact
ctgaatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_115499315_115500421
seq2: B6Ng01-298B01.b_45_1143

seq1  GAATTCTGGCAAGGGCATCAGACAAGTTAGTCAGGAAGACTTCCAACTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGCAAGGGCATCAGACAAGTTAGTCAGGAAGACTTCCAACTTG  50

seq1  TAGAATTGTGGTAGGCACCTACCTTTGTTCTGGCTATGTGTATAACTTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATTGTGGTAGGCACCTACCTTTGTTCTGGCTATGTGTATAACTTGC  100

seq1  ATGCATCAGCCCAGCCCTGGATTTAATATAAACAATCTAAATGAACTGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATCAGCCCAGCCCTGGATTTAATATAAACAATCTAAATGAACTGGG  150

seq1  ATAGGATGCCGAGGTTGAGGTCATTTCCAGATCTGTAATCAGTGCACAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGATGCCGAGGTTGAGGTCATTTCCAGATCTGTAATCAGTGCACAGC  200

seq1  AGAACCCTTTTGGACCCTCATTTATCTTTCAGTTAGTATAGTGGATCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCCTTTTGGACCCTCATTTATCTTTCAGTTAGTATAGTGGATCAGT  250

seq1  CGATATTTGCAAAGAATTCTGGTCAGGGTCAAACGTCTTCAGGGATCCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATATTTGCAAAGAATTCTGGTCAGGGTCAAACGTCTTCAGGGATCCCT  300

seq1  GAGGAGGGAGGAATAAATTACAGGGCCACAGTTACCCTTTCATATAATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGGGAGGAATAAATTACAGGGCCACAGTTACCCTTTCATATAATAT  350

seq1  CTAAAAGGCCATTATGTGCAAAGATTCTCTCTGAAATCTAATTCTTGCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGGCCATTATGTGCAAAGATTCTCTCTGAAATCTAATTCTTGCCC  400

seq1  CAGCCAAGTCAATTTAGGAAAAGTGGACCTGTAGCAGCCAGCTCTGTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAAGTCAATTTAGGAAAAGTGGACCTGTAGCAGCCAGCTCTGTAAT  450

seq1  GCTGCCCAAACAGATAAAAGCTTGTGGTTTTGTGTCTGGCCCAGACTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCCAAACAGATAAAAGCTTGTGGTTTTGTGTCTGGCCCAGACTGTG  500

seq1  TTTGCTGCCTCTATAGAAACAGATGTTTTCCTGTGTGAAACAGCTACTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTGCCTCTATAGAAACAGATGTTTTCCTGTGTGAAACAGCTACTTG  550

seq1  TCCACTGACCAAGCTTGCACAAGCTGATAATGGACATGTATGTCTATAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTGACCAAGCTTGCACAAGCTGATAATGGACATGTATGTCTATAAT  600

seq1  GTTGGGAGGGGGTGGCTGTTACAATGAATCTTCAGCAAGCAGTGTCTAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGAGGGGGTGGCTGTTACAATGAATCTTCAGCAAGCAGTGTCTAAG  650

seq1  ATGGTCTCTGATGATCTTTTCTGCCACGCACAAGCCACTTGTCAACACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCTCTGATGATCTTTTCTGCCACGCACAAGCCACTTGTCAACACAG  700

seq1  ACTGGCGTAGTCATTTGCATCAAAATAAGAAAATATGGCAGAGACCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCGTAGTCATTTGCATCAAAATAAGAAAATATGGCAGAGACCAAAA  750

seq1  TTGGTTGTCTGCTCTGTAATTACTTGACACAGAACACTAACTTCCATATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTGTCTGCTCTGTAATTACTTGACACAGAACACTAACTTCCATATT  800

seq1  AGTAACTGATTCTTTCCCAGCTGGCTATGGCCAAACAATTTTTGTCGTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACTGATTCTTTCCCAGCTGGCTATGGCCAAACAATTTTTGTCGTTG  850

seq1  GAGAGGTCTCCATCACAAGGAACGGAGGACCACATTTAGCAGCTCTCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTCTCCATCACAAGGAACGGAGGACCACATTTAGCAGCTCTCTAG  900

seq1  TAACTTGAGGCTCTCAGCTCAGCATCTGAAAGGGAATGAGATGCAAACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAACTTGAGGCTCTCAGCTCAGCATCTGAAA-GGAATGAGATGCAAACAG  949

seq1  TGACATCATGAATGAGCTCAAAAGTCTTTGTCTAGGTTAGACATCATGGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATCATGAATGAGCTCAAAAGTCTTTGTCTAGGTTAGACATCATGGG  999

seq1  AGAATCACAGTATCAGAGGAAAAGTTGATTATAGCCATGTGGGAAGCCCT  1050
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGATTCACAGTATCAGA-GAAAAG-TGATTATAG-CATGTGGGAAGCCCT  1046

seq1  GGGTGGGGAGAGGGTCCAATTTAGCTGAACCCAGATTCCTAACTCATAAA  1100
      |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||
seq2  GGGT-GGGAGAGGGTTC-ATTTAGCTGAACCCAGATT-CTTACTCAT-AA  1092

seq1  AACCATA  1107
      |||||||
seq2  AACCATA  1099

seq1: chr8_115632411_115633092
seq2: B6Ng01-298B01.g_65_746 (reverse)

seq1  ACACACACACACACATACACACACACATTCAGAGTGATATTATGCCACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACATACACACACACATTCAGAGTGATATTATGCCACAT  50

seq1  TGTCATAATCCTAGTACTTAGGGGATAGAGGCAAGAGGACCTGAGCTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATAATCCTAGTACTTAGGGGATAGAGGCAAGAGGACCTGAGCTTCA  100

seq1  AGGTCATACTGAGCTACTTAGGGATTTTGAAGCTAGTCTGGGCTCTACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCATACTGAGCTACTTAGGGATTTTGAAGCTAGTCTGGGCTCTACTA  150

seq1  GTCCCTCCCCCTCCCCAAGGTAACAACACTACTTTATCTATGTTAACTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTCCCCCTCCCCAAGGTAACAACACTACTTTATCTATGTTAACTCA  200

seq1  GTGAGTCAGGTAGGCAGTATGATCTCACCTGGATTCTGACCTCTTTAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTCAGGTAGGCAGTATGATCTCACCTGGATTCTGACCTCTTTAAAT  250

seq1  TGACTGTGAGTCAGGCTCTCCAGACTCTTCCCCAAGGTGGCCAGGAGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGTGAGTCAGGCTCTCCAGACTCTTCCCCAAGGTGGCCAGGAGTTT  300

seq1  CTAAGAGAAACAGTTGCATGGTAACAGCCTCACCATCATCGCTGACTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAGAAACAGTTGCATGGTAACAGCCTCACCATCATCGCTGACTTCT  350

seq1  ACTCCTCAACACATATCCTCAAACAAGGAGGGAGTCAGGCACAGGAGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTCAACACATATCCTCAAACAAGGAGGGAGTCAGGCACAGGAGAAA  400

seq1  TAACCTTATTTCCAAAGGGGGAAGAGCTGCAAATTCCCAGTGATGAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTTATTTCCAAAGGGGGAAGAGCTGCAAATTCCCAGTGATGAAGGA  450

seq1  TGTGAAAGAATGGAACTCTTTGCTTTCCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAAGAATGGAACTCTTTGCTTTCCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT  500

seq1  TTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCC  550

seq1  TGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTAAACTTAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTAAACTTAGAA  600

seq1  ATCTGCCTGCCTCTGCCTGTTGCTTTCCTTTTATGAGGAGGATAGAACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCCTGCCTCTGCCTGTTGCTTTCCTTTTATGAGGAGGATAGAACAG  650

seq1  GGTCTCATGTAGCCCAGGGTGACCTGGAATTC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCATGTAGCCCAGGGTGACCTGGAATTC  682