BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-298P13
Chromosome8 (Build37)
Map Location 53,039,273 - 53,157,573
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC667517, LOC623872
Downstream geneLOC100040220, LOC623935, 1190028D05Rik, LOC676688
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298P13.bB6Ng01-298P13.g
ACCGA093940GA093941
length1,1361,125
definitionB6Ng01-298P13.b B6Ng01-298P13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(53,039,273 - 53,040,406)(53,156,448 - 53,157,573)
sequence
gaattccatccaactttccagcaagccatttggttcactatatttcaaac
caaatggtttgtaaaactgtttttgttgttgttgttgctgttgttgtttt
taaccgtttaacaacaaatacaataacacctttataaagatgtcagtaca
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acatctattcaccagagagacttatatgactgagaatatatcaaatttgt
gattattaatacatccaaatatcactttgcctatttttcacaatatttta
tgaactttatttaataaatatgctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_53039273_53040406
seq2: B6Ng01-298P13.b_49_1184

seq1  GAATTCCATCCAACTTTCCAGCAAGCCATTTGGTTCACTATATTTCAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GATTAATAATATAAAATCAGGTGCATTTTTTTTTGTCTATAGGAAATCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAATAATATAAAATCAGGTGCATTTTTTTTTGTCTATAGGAAATCAT  600

seq1  GTATTACCTTTTTCTAATCAGTACATTGAATGACTTGCTCCAAAATTTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAATTTAACAGTTCAGAAGATACACCATTTATTTCTATCATCTAC  700

seq1  AATAATTTCACTTTGTACAAATTAAATTTTGATTGAATTATATTGTAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTTCACTTTGTACAAATTAAATTTTGATTGAATTATATTGTAATT  750

seq1  ATAATTTTAATGTAAATTATTATGAATCTCCTTACTTGATATGCTTGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGTACAGTGGAATAAAGAAAACTAACAAGAGATTTCTCTATTTTGA  850

seq1  ATAAAATATGTATATTTTAATATCTGCAAAAATATTTCTCATGGAGAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATATGTATATTTTAATATCTGC-AAAATATTTCTCATGGAGAAAG  899

seq1  AATAAAGGGTATATTAGAATATTCAATTCTGAATCTCCACATAATTTACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAGGGTATATTAGAATATTCAATTCTGAATCTCCACATAATTTACA  949

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      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGAACACAGTTTAACTTAAATTTTTGCTGATAGAATGAAGTTCAAA  999

seq1  CATTGAGCTGACCATAGTGTTAGTAAGCTACTAGTGTGCTACTAATTAAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAGCTGACCATAGTGTTAGTAAGCTACTAGTGTGCTACTAATTAAC  1049

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      ||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||
seq2  ATGCAGAAAAG-TGGTTTGCAGTTTCTGGGAACCTATCCT-ATTCATAAA  1097

seq1  ATGTAG-AAAATTATCTAGATG-CAATGTAGAAAATTAA  1134
      |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||
seq2  ATGTAGAAAAATTATCTAGATGCCAATGTTAGAAATTAA  1136

seq1: chr8_53156448_53157573
seq2: B6Ng01-298P13.g_69_1193 (reverse)

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      |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||  ||
seq2  GAGCATATTTATTAAATAAAGT-TCATAAAATATTGTGAAAAATAGGCAA  49

seq1  AGTTGATATTTGAATGTA-TAATAATTCACAAATTTGATTATATCCTCAG  97
      || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||
seq2  AG-TGATATTTGGATGTATTAATAA-TCACAAATTTGA-TATATTCTCAG  96

seq1  TTCATAT-AGTCTCTCTGGGTGAATAGATGTGCATGAATATACATATATA  146
       |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TCATATAAGTCTCTCT-GGTGAATAGATGTGCATGAATATACATATATA  144

seq1  TATATATATATACATGTATATATATGTATATTTT-CTTTAACTACTATAC  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TATATATATATACATGTATATATATGTATATTTTCCTTTAACTACTATAC  194

seq1  ATATAGTAGGTAAGTAAGCATGCTTTTAAAGCAGAATGCAATGTCATTTT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGTAGGTAAGTAAGCATGCTTTTAAAGCAGAATGCAATGTCATTTT  244

seq1  ATGTTGTTAAAAATAATAAAGATGCTTTCTTATTAAGATATGTAATATAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGTTAAAAATAATAAAGATGCTTTCTTATTAAGATATGTAATATAT  294

seq1  ACAATATTCCATCATTACATGATGAATAATGAATATGAAAGTCACAATAA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATTCCATCATTACATGATGAATAATGAATATGAAAGTCACAATAA  344

seq1  GCTCTCCAAGAAAATACAAGTAAAAACGTTGAAATCAAAGTTTCAAGGGA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCAAGAAAATACAAGTAAAAACGTTGAAATCAAAGTTTCAAGGGA  394

seq1  ATTGAATTCCACTCATCATAAGGTTCTTGCAATTGACTTCCTGAGTATGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATTCCACTCATCATAAGGTTCTTGCAATTGACTTCCTGAGTATGG  444

seq1  GCTGTGACTTTATTGCTGACAGGTCTGTGGTTACATGTTAAGATGACAAA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGACTTTATTGCTGACAGGTCTGTGGTTACATGTTAAGATGACAAA  494

seq1  GGCAAGCATTAAATCATTAGCTCTGATGGCCAGCAGATGAACATCCTTTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGCATTAAATCATTAGCTCTGATGGCCAGCAGATGAACATCCTTTA  544

seq1  CTTAGATCCTCAGCACTTCATGTAATCCCATTTGACAAACGCTGCTTCCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGATCCTCAGCACTTCATGTAATCCCATTTGACAAACGCTGCTTCCA  594

seq1  TTTAGATACTATCTTGATAAAATAACTTTGATTTTTAAAGCACATGGATT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATACTATCTTGATAAAATAACTTTGATTTTTAAAGCACATGGATT  644

seq1  ATATGAATGTTACAGTCTAAAGCTTTCTCTTTGTACTTGTAAAACAGTAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAATGTTACAGTCTAAAGCTTTCTCTTTGTACTTGTAAAACAGTAA  694

seq1  TACATGAAGGAAAAATGTGTTTACTTCAGACTTAAGTATTATCAAATTGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGAAGGAAAAATGTGTTTACTTCAGACTTAAGTATTATCAAATTGA  744

seq1  AGCATTTTAGAACTTATCATTTAAATTGTGATAATATTGCTGTTTTTATA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTTAGAACTTATCATTTAAATTGTGATAATATTGCTGTTTTTATA  794

seq1  ATTTTTACTTAAAGTAGTTTCCTAGATATAAAATATTTTTATTTGCCTCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTACTTAAAGTAGTTTCCTAGATATAAAATATTTTTATTTGCCTCA  844

seq1  ATCCTGCAAATACTGGTTATTGGCTCCTTATTTCAATGGTTAAGTGTAAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGCAAATACTGGTTATTGGCTCCTTATTTCAATGGTTAAGTGTAAG  894

seq1  TTGGGAATATGTATTAATGTACTTTCAGAAATTTTCAATGAAAAATAATA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAATATGTATTAATGTACTTTCAGAAATTTTCAATGAAAAATAATA  944

seq1  TTAATCAATATAAGAAAAGTATTGGTACTGATAATTATTGGATTTGTGTC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAATATAAGAAAAGTATTGGTACTGATAATTATTGGATTTGTGTC  994

seq1  TCATAAATTTATTATTTAGCAGTTCAATAAACCCCATCTTCCAAAAAGTG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAATTTATTATTTAGCAGTTCAATAAACCCCATCTTCCAAAAAGTG  1044

seq1  TTTTTTTTTTTTCTAAATGGTAGTGTGATGAATTCTTTAACCTTCTTTCA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTCTAAATGGTAGTGTGATGAATTCTTTAACCTTCTTTCA  1094

seq1  GTGTCCCAGGAAAATGATATTTATTGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCAGGAAAATGATATTTATTGAATTC  1125