BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-300A06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 38,974,394 - 38,974,946
singlet/doubletsinglet
Overlap geneSgcz
Upstream geneA730069N07Rik, AI429214, LOC666877, LOC100041616, 1700016D18Rik, LOC641121, LOC621149
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-300A06.bB6Ng01-300A06.g
ACCGA094698GA094699
length547491
definitionB6Ng01-300A06.b B6Ng01-300A06.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
caggtaatcactgtacctggagccacagttattggattttctagcctcct
aatattctcaggcaattactctgtatttcacagcagcaaggtactcataa
aacaaactatatatatatatatatatatatatatacatatatgtgtgtgt
gtgtatgagtgtgtatgtatgtatgtaatctacatattatatatacatac
acatacatatacatgatatatgtttaatatatattatacatattatacta
aactacacacatacacaaacacacatacacacacacatatatgtatatat
atggaattagaacccagtgctctgtatagatgaggcaaatgcactgtcaa
ggatctacaatgtcagcccaagtaactgtactataggcttaaatttccct
gtgattctacttgcaacttaaaagcaaaaataaagaatgaaaattatatg
attattgaaatagttttgaaacatgaatataattgctttggctgtgactc
ttacttttgcttagagcatatgatgtgttcaattgcatataatcttt

tttgttcagttctgagccccattttttaatggggttatttgattttctga
agtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagtcccctatct
gatttaggataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggtctttttgt
cctattagattatgctgaaaggaccctgatatagctgtctcttgtcagag
tatgcctgggcctagcaaacatagaagtggatgctcacagtcggctattg
gatggatcacatggcccccaatgaaggagctagagaaagtaccaaagaag
ctaaagggatctgcaaccctataggtggaacaacattatgaactaaccag
taccccggagctcttgactctagctgcatatgcatcaaaagatggcctag
tcggccatcactggaaagagaggcccattggacacgcaaactttatatgc
cccagtacaggggaacgccagggccataaaaggggagtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_38974394_38974946
seq2: B6Ng01-300A06.b_49_601

seq1  GAATTCCAGGTAATCACTGTACCTGGAGCCACAGTTATTGGATTTTCTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTAATCACTGTACCTGGAGCCACAGTTATTGGATTTTCTAG  50

seq1  CCTCCTAATATTCTCAGGCAATTACTCTGTATTTCACAGCAGCAAGGTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTAATATTCTCAGGCAATTACTCTGTATTTCACAGCAGCAAGGTAC  100

seq1  TCATAAAACAAACTATATATATATATATATATATATATATACATATATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAAACAAACTATATATATATATATATATATATATATACATATATGT  150

seq1  GTGTGTGTGTATGAGTGTGTATGTATGTATGTAATCTACATATTATATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTATGAGTGTGTATGTATGTATGTAATCTACATATTATATAT  200

seq1  ACATACACATACATATACATGATATATGTTTAATATATATTATACATATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACACATACATATACATGATATATGTTTAATATATATTATACATATT  250

seq1  ATACTAAACTACACACATACACAAACACACATACACACACACATATATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAAACTACACACATACACAAACACACATACACACACACATATATGT  300

seq1  ATATATATGGAATTAGAACCCAGTGCTCTGTATAGATGAGGCAAATGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATGGAATTAGAACCCAGTGCTCTGTATAGATGAGGCAAATGCAC  350

seq1  TGTCAAGGATCTACAATGTCAGCCCAAGTAACAGTACTATAGGCTTAAAT  400
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGTCAAGGATCTACAATGTCAGCCCAAGTAACTGTACTATAGGCTTAAAT  400

seq1  TTCCCTGTGATTCTACTTGCAACTTAAAAGCAAAAATAAAGAATGAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGTGATTCTACTTGCAACTTAAAAGCAAAAATAAAGAATGAAAAT  450

seq1  TATAGGATTATTGAAATAGTTTTGAAACATGAGTATAATTGCTTTGGCTG  500
      |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TATATGATTATTGAAATAGTTTTGAAACATGAATATAATTGCTTTGGCTG  500

seq1  TGACTCTTACTTTTGCTTAGAGCATATGATGTGTCCAAATGCATATAATC  550
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  TGACTCTTACTTTTGCTTAGAGCATATGATGTGTTCAATTGCATATAATC  550

seq1  TTT  553
      |||
seq2  TTT  553


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |