BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-303G06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,263,451 - 119,456,261
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2
Downstream geneBC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik, Plcg2, 4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-303G06.bB6Ng01-303G06.g
ACCGA097202GA097203
length1,175993
definitionB6Ng01-303G06.b B6Ng01-303G06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,455,081 - 119,456,261)(119,263,451 - 119,264,011)
sequence
aacggccactgctaggttgtcagctctgggattcaatggccactgctagg
ttgtcagctagctccagtccacctcagaattctgacccaggaaaggagaa
cctgaagagcagccagccagctcgctcctccttccctctgggatcttact
gcaggaagagcaggtggctatgctgcctgctaggctgcctttcctgatcc
tctggtgcaatggtgaggaactctccctgtctgggctgcgggttcgcagg
atcatgtgttgtcccttggtgagcagcaagagtgtgctcctctttggagc
tctgtggcccctactggttggaacagcaaagcgtctcactctaggcaaga
gtgaccaatagaagagccatcagctgcatgtggaccatctaatgggaatt
cattaagtaagcttaaagattcaattgcttggtcatttcagcgacctatc
aagtcctcacgtggcaggcagctatgaactggacattgttaactgagggt
gctgctgccacagcagagttccactaagtgttgctcctgagatgtactgg
gtgggatgggcaggcgagagatggaagtaatacttcagttggtttaggta
aaatgacctatctccaccccccaccccaccctccgcccccgatatcatta
aactgaatttcatagaaatccaagaaggcttggatccttacgttttttaa
tgctctctgaagaattctcttaaaggaactttggaactgttccatatcaa
aaaggtcgacatcttcacctgtcaaaacacaggaatatataaataaataa
gaaaagtcaagagcggtacaatgtctttgtcccctgcaccccagagcagt
aacgaccataccacacacatgctcctgataagtgccagggaacacacatg
aggaacagtcacggctttccaaaagcctaaggagagcagagggctcggct
gggtggtggttagcacacacctgcagtctcatcccctctgggaggtaagg
caggaaaaccactacagtccagactagcctagtctacaccagtggagttc
aagcagctttgcctacagagtgagtctagaactagctatgacctacaggg
atacaatgcttcgaaaaaccaaacatcagtaattctgacataggacactt
gggtactctcacctttcaaactacc
gaattcacatctgcctggaaccccagaacacaacctcgttggcagataaa
attggttaagatggtatagtggtttgaataagaatggctcccataggctc
atttatttgaatgcttagtcaccagggagtggaactctttgaaaggatta
taaggatgagaaagtaggcaggatcttgttagaggaaatgatctatatca
ctgggggtaggcattaaggtttcaaaagaccatgccaagcctacgtgttc
tccccctccttcctcctccccctcccctttccctccctctctatctgcta
tggatcaggatgtaactcagctactgctccagctcctacctgcatgctgc
catgctccctgtcatgatgataatgtagctgtaagcaagctcccagtaaa
actccttttcataggagttgccatgatcatggtatctcttcatagcaaca
gaacagtgactaagacagaagttggtaccgtgagtggggtactgatgttg
caagtctgactgtactgcttattggtacaatgtagacttcaggactttgg
attaagaaagcagttgaaagctttaaatgggcttaatggcccataccatt
aggaaaacagataacagtgctgatagcaatgtagattatgatgtcctggt
tcatgaagtttcagaaggaaggaatattaagtggcctagagatatatctt
gtgatatttttggcaaagaatgtggctgctttttttttgtccttgtccta
aatatctatttgaggctaaactaaagagttttacattaatggcattagca
gaggaaattttcaagacagccctagtattgactctgttgtgttggttaat
gtatccactcttatgcagatctataaaggaaaagaaacaagtgggagcaa
gggaaaaataaaaaaaaacctacagtgtgacagaaaaggagcaccagttt
aatgtaatggcacttaagtccagttgttcaagggagataaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119455081_119456261
seq2: B6Ng01-303G06.b_53_1227 (reverse)

seq1  GGTAGTTTGAAA---GTGAGTACCAAATGTTGTCTTTTTTGTCAGGATTT  47
      ||||||||||||   | ||||||| ||    || |  | |||||| ||  
seq2  GGTAGTTTGAAAGGTGAGAGTACCCAA----GTGTCCTATGTCAGAAT--  44

seq1  TATTTTGTTTTTTTGTTTTTTTCTGAGACATTGTATCCCTGTATGTCATA  97
        |  || | ||| ||||||    ||  ||||||||||||||| ||||||
seq2  --TACTGATGTTTGGTTTTT---CGAAGCATTGTATCCCTGTAGGTCATA  89

seq1  GGCTAG-TCTAGACTTCACTCTGTAGGCAAGGCTGGCCTTGAACT-CACT  145
       ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||
seq2  -GCTAGTTCTAGAC-TCACTCTGTAGGCAAAGCTG--CTTGAACTCCACT  135

seq1  -GTGTAGACTAGGCTAGTCTGGACTTGTGGTGGTTTTCCTGCCTTTACCT  194
       ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||
seq2  GGTGTAGACTAGGCTAGTCTGGAC-TGTAGTGGTTTTCCTGCC-TTACCT  183

seq1  -CCAGA-GGGATGAGACTGCAGGTGTGTGCT-ACCA-CACCCAGCCGAGC  240
       ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
seq2  CCCAGAGGGGATGAGACTGCAGGTGTGTGCTAACCACCACCCAGCCGAGC  233

seq1  CCTCTGCTCTCC-TAGGCTTTTGGAAAGCCGTGACTGTTCCTCATGTGTG  289
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCTCTCCTTAGGCTTTTGGAAAGCCGTGACTGTTCCTCATGTGTG  283

seq1  TTCCCTGGCACTTATCAGGAGCATGTGTGTGGTATGGTCGTTACTGCTCT  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGGCACTTATCAGGAGCATGTGTGTGGTATGGTCGTTACTGCTCT  333

seq1  GGGGTGCAGGGGACAAAGACATTGTACCGCTCTTGACTTTTCTTATTTAT  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGCAGGGGACAAAGACATTGTACCGCTCTTGACTTTTCTTATTTAT  383

seq1  TTATATATTCCTGTGTTTTGACAGGTGAAGATGTCGACCTTTTTGATATG  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATATTCCTGTGTTTTGACAGGTGAAGATGTCGACCTTTTTGATATG  433

seq1  GAACAGTTCCAAAGTTCCTTTAAGAGAATTCTTCAGAGAGCATTAAAAAA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTTCCAAAGTTCCTTTAAGAGAATTCTTCAGAGAGCATTAAAAAA  483

seq1  CGTAAGGATCCAAGCCTTCTTGGATTTCTATGAAATTCAGTTTAATGATA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAAGGATCCAAGCCTTCTTGGATTTCTATGAAATTCAGTTTAATGATA  533

seq1  TCGGGGGCGGAGGGTGGGGTGGGGGGTGGAGATAGGTCATTTTACCTAAA  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGGGCGGAGGGTGGGGTGGGGGGTGGAGATAGGTCATTTTACCTAAA  583

seq1  CCAACTGAAGTATTACTTCCATCTCTCGCCTGCCCATCCCACCCAGTACA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTGAAGTATTACTTCCATCTCTCGCCTGCCCATCCCACCCAGTACA  633

seq1  TCTCAGGAGCAACACTTAGTGGAACTCTGCTGTGGCAGCAGCACCCTCAG  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGAGCAACACTTAGTGGAACTCTGCTGTGGCAGCAGCACCCTCAG  683

seq1  TTAACAATGTCCAGTTCATAGCTGCCTGCCACGTGAGGACTTGATAGGTC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAATGTCCAGTTCATAGCTGCCTGCCACGTGAGGACTTGATAGGTC  733

seq1  GCTGAAATGACCAAGCAATTGAATCTTTAAGCTTACTTAATGAATTCCCA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAATGACCAAGCAATTGAATCTTTAAGCTTACTTAATGAATTCCCA  783

seq1  TTAGATGGTCCACATGCAGCTGATGGCTCTTCTATTGGTCACTCTTGCCT  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGGTCCACATGCAGCTGATGGCTCTTCTATTGGTCACTCTTGCCT  833

seq1  AGAGTGAGACGCTTTGCTGTTCCAACCAGTAGGGGCCACAGAGCTCCAAA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGAGACGCTTTGCTGTTCCAACCAGTAGGGGCCACAGAGCTCCAAA  883

seq1  GAGGAGCACACTCTTGCTGCTCACCAAGGGACAACACATGATCCTGCGAA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCACACTCTTGCTGCTCACCAAGGGACAACACATGATCCTGCGAA  933

seq1  CCCGCAGCCCAGACAGGGAGAGTTCCTCACCATTGCACCAGAGGATCAGG  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGCAGCCCAGACAGGGAGAGTTCCTCACCATTGCACCAGAGGATCAGG  983

seq1  AAAGGCAGCCTAGCAGGCAGCATAGCCACCTGCTCTTCCTGCAGTAAGAT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAGCCTAGCAGGCAGCATAGCCACCTGCTCTTCCTGCAGTAAGAT  1033

seq1  CCCAGAGGGAAGGAGGAGCGAGCTGGCTGGCTGCTCTTCAGGTTCTCCTT  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGGGAAGGAGGAGCGAGCTGGCTGGCTGCTCTTCAGGTTCTCCTT  1083

seq1  TCCTGGGTCAGAATTCTGAGGTGGACTGGAGCTAGCTGACAACCTAGCAG  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGTCAGAATTCTGAGGTGGACTGGAGCTAGCTGACAACCTAGCAG  1133

seq1  TGGCCATTGAATCCCAGAGCTGACAACCTAGCAGTGGCCGTT  1181
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCATTGAATCCCAGAGCTGACAACCTAGCAGTGGCCGTT  1175

seq1: chr8_119263451_119264011
seq2: B6Ng01-303G06.g_67_627

seq1  GAATTCACATCTGCCTGGAACCCCAGAACACAACCTCGTTGGCAGATAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATCTGCCTGGAACCCCAGAACACAACCTCGTTGGCAGATAAA  50

seq1  ATTGGTTAAGATGGTATAGTGGTTTGAATAAGAATGGCTCCCATAGGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTTAAGATGGTATAGTGGTTTGAATAAGAATGGCTCCCATAGGCTC  100

seq1  ATTTATTTGAATGCTTAGTCACCAGGGAGTGGAACTCTTTGAAAGGATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTTGAATGCTTAGTCACCAGGGAGTGGAACTCTTTGAAAGGATTA  150

seq1  TAAGGATGAGAAAGTAGGCAGGATCTTGTTAGAGGAAATGATCTATATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGATGAGAAAGTAGGCAGGATCTTGTTAGAGGAAATGATCTATATCA  200

seq1  CTGGGGGTAGGCATTAAGGTTTCAAAAGACCATGCCAAGCCTACGTGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGGTAGGCATTAAGGTTTCAAAAGACCATGCCAAGCCTACGTGTTC  250

seq1  TCCCCCTCCTTCCTCCTCCCCCTCCCCTTTCCCTCCCTCTCTATCTGCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCTCCTTCCTCCTCCCCCTCCCCTTTCCCTCCCTCTCTATCTGCTA  300

seq1  TGGATCAGGATGTAACTCAGCTACTGCTCCAGCTCCTACCTGCATGCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCAGGATGTAACTCAGCTACTGCTCCAGCTCCTACCTGCATGCTGC  350

seq1  CATGCTCCCTGTCATGATGATAATGTAGCTGTAAGCAAGCTCCCAGTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCCCTGTCATGATGATAATGTAGCTGTAAGCAAGCTCCCAGTAAA  400

seq1  ACTCCTTTTCATAGGAGTTGCCATGATCATGGTATCTCTTCATAGCAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTTTCATAGGAGTTGCCATGATCATGGTATCTCTTCATAGCAACA  450

seq1  GAACAGTGACTAAGACAGAAGTTGGTACCGTGAGTGGGGTACTGATGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTGACTAAGACAGAAGTTGGTACCGTGAGTGGGGTACTGATGTTG  500

seq1  CAAGTCTGACTGTACTGCTTATTGGTACAATGTAGACTTCAGGACTTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCTGACTGTACTGCTTATTGGTACAATGTAGACTTCAGGACTTTGG  550

seq1  ATTAAGAAAGC  561
      |||||||||||
seq2  ATTAAGAAAGC  561