BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-315B24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 68,643,902 - 68,724,235
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMarch1
Upstream geneLOC665396, LOC100040949, LOC665405, Vaultrc-ps1, LOC100040967, LOC100040986
Downstream gene1810029B16Rik, Tktl2, Npy5r, Npy1r, BC053440, LOC665453
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-315B24.bB6Ng01-315B24.g
ACCGA105856GA105857
length1,133151
definitionB6Ng01-315B24.b B6Ng01-315B24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,723,093 - 68,724,235)(68,643,902 - 68,644,052)
sequence
gaattctccatctgggcatattggtgcatcttcatcttattttctgaata
tgacaagacactctgtcactctatttttagaggaggaaatgagactgaaa
tcatgtgggctttggtagagttcaatataaatattaaatttctaatcata
gtcaggtacaatactttccctatagaagttataatataccacttctctgt
cccaaacactccgatgaatccatccttttattcagtatcaaacaagatgc
tcattacttcctacaaggttagcctccatttcatgtctctaatactagtg
gctgagaatgcacaagccaactcctatttggctgtgactgcatttctgct
ccctcttcccgaattctgttcccatcaatatcagcatggcttgctgtctt
agctggaaccaaatgtgaaagaaatgattcacaatttacatgtttactat
catatcacatgggcctttaatcatcacctccctgctcagttttagcattc
attacaacactcatttatggattaattttttgttgtgtcagctgttcttt
attcttaagaacaggaccttgtttagctcagtatgatgtccctattctta
gatcagagcctgttatacaacaatcatctcaagactattgagcaagtata
tgaattattaacattttatacaacaaaggaacttactgtgtgcaatttgt
tatgggctcatatacagtactgacaaatttaggaggggtttgttgccaat
cttcttcaaggtggactactgaggagagattattttctggtatagaatgg
cttaattttccagctaataaaggagcaaggcatttaaagctcttcgtttc
agaggaagtaatagttttaaggctaaaatacaaagagaatctatgtgtgt
taatagagaaagaggggacagaggagtcagaatgtgtggtcactgcagta
ccagtgatcctaggggtgggaagaggagctcacactccaaagtttgcaga
catatttttaaagagaatttacttctatgtgtgacctcactatgatgtaa
gacttatagcttatgataacattcaaggcctagcttccttgcttttctca
tgcagcaatcaattaatatggaaggcttgaacc

tgcttctataagatgtttagctgaaattgagcaaattttatttgttatta
gcatataccaaatagttcacaacgatgttttggtaaataatggactatgt
gtgtctatgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_68723093_68724235
seq2: B6Ng01-315B24.b_49_1181 (reverse)

seq1  GGTTCAAGCCTTCCAATATTTATGTGATTTTCTCCATGAGAAAAGGAAAG  50
      |||||||||||||| ||||| || ||| || || ||||||||||| || |
seq2  GGTTCAAGCCTTCC-ATATTAAT-TGA-TTGCTGCATGAGAAAAGCAAGG  47

seq1  AAGCTAAGCC-TGATTGTTATCATAAGCTGGTTAGTCTTTACATTCATAG  99
      |||||| ||| ||| ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||
seq2  AAGCTAGGCCTTGAATGTTATCATAAGCT-ATAAGTC-TTACA-TCATAG  94

seq1  TGA-GTCACACATAAGAAGTAAATTCTTCCTTAAAAATATGTCCTGCAAA  148
      ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||
seq2  TGAGGTCACACAT-AGAAGTAAATTC-TCTTTAAAAATATGT-CTGC-AA  140

seq1  ACTTTGGAGTGTGAGCTCCTCTTCCCACCCCTAGGATCACTGGTACTGCA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGAGTGTGAGCTCCTCTTCCCACCCCTAGGATCACTGGTACTGCA  190

seq1  GTGACCACACATTTCTGACCTCCTCTGTCCCCTCTTTTCTCTATTAACAC  248
      ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTGACCACACA-TTCTGA-CTCCTCTGTCCCCTC-TTTCTCTATTAACAC  237

seq1  ACATAGATTCTCTTTGTATTTTAGCCTTAAAACTATTACTTCCTCTGAAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGATTCTCTTTGTATTTTAGCCTTAAAACTATTACTTCCTCTGAAA  287

seq1  CGAAGAGCTTTAAATGCCTTGCTCC-TTATTAGCTGGAAAATTAAGCCAT  347
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGAGCTTTAAATGCCTTGCTCCTTTATTAGCTGGAAAATTAAGCCAT  337

seq1  TCTATACCAGAAAATAATCTCTCCTCAGTAGTCCACCTTGAAGAAGATTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATACCAGAAAATAATCTCTCCTCAGTAGTCCACCTTGAAGAAGATTG  387

seq1  GCAACAAACCCCTCCTAAATTTGTCAGTACTGTATATGAGCCCATAACAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACAAACCCCTCCTAAATTTGTCAGTACTGTATATGAGCCCATAACAA  437

seq1  ATTGCACACAGTAAGTTCCTTTGTTGTATAAAATGTTAATAATTCATATA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACACAGTAAGTTCCTTTGTTGTATAAAATGTTAATAATTCATATA  487

seq1  CTTGCTCAATAGTCTTGAGATGATTGTTGTATAACAGGCTCTGATCTAAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTCAATAGTCTTGAGATGATTGTTGTATAACAGGCTCTGATCTAAG  537

seq1  AATAGGGACATCATACTGAGCTAAACAAGGTCCTGTTCTTAAGAATAAAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGGACATCATACTGAGCTAAACAAGGTCCTGTTCTTAAGAATAAAG  587

seq1  AACAGCTGACACAACAAAAAATTAATCCATAAATGAGTGTTGTAATGAAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTGACACAACAAAAAATTAATCCATAAATGAGTGTTGTAATGAAT  637

seq1  GCTAAAACTGAGCAGGGAGGTGATGATTAAAGGCCCATGTGATATGATAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAACTGAGCAGGGAGGTGATGATTAAAGGCCCATGTGATATGATAG  687

seq1  TAAACATGTAAATTGTGAATCATTTCTTTCACATTTGGTTCCAGCTAAGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATGTAAATTGTGAATCATTTCTTTCACATTTGGTTCCAGCTAAGA  737

seq1  CAGCAAGCCATGCTGATATTGATGGGAACAGAATTCGGGAAGAGGGAGCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGCCATGCTGATATTGATGGGAACAGAATTCGGGAAGAGGGAGCA  787

seq1  GAAATGCAGTCACAGCCAAATAGGAGTTGGCTTGTGCATTCTCAGCCACT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCAGTCACAGCCAAATAGGAGTTGGCTTGTGCATTCTCAGCCACT  837

seq1  AGTATTAGAGACATGAAATGGAGGCTAACCTTGTAGGAAGTAATGAGCAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTAGAGACATGAAATGGAGGCTAACCTTGTAGGAAGTAATGAGCAT  887

seq1  CTTGTTTGATACTGAATAAAAGGATGGATTCATCGGAGTGTTTGGGACAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTGATACTGAATAAAAGGATGGATTCATCGGAGTGTTTGGGACAG  937

seq1  AGAAGTGGTATATTATAACTTCTATAGGGAAAGTATTGTACCTGACTATG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGGTATATTATAACTTCTATAGGGAAAGTATTGTACCTGACTATG  987

seq1  ATTAGAAATTTAATATTTATATTGAACTCTACCAAAGCCCACATGATTTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAAATTTAATATTTATATTGAACTCTACCAAAGCCCACATGATTTC  1037

seq1  AGTCTCATTTCCTCCTCTAAAAATAGAGTGACAGAGTGTCTTGTCATATT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCATTTCCTCCTCTAAAAATAGAGTGACAGAGTGTCTTGTCATATT  1087

seq1  CAGAAAATAAGATGAAGATGCACCAATATGCCCAGATGGAGAATTC  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAATAAGATGAAGATGCACCAATATGCCCAGATGGAGAATTC  1133


seq1: chr8_68643902_68644052
seq2: B6Ng01-315B24.g_72_222

seq1  TGCTTCTATAAGATGTTTAGCTGAAATTGAGCAAATTTTATTTGTTATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTATAAGATGTTTAGCTGAAATTGAGCAAATTTTATTTGTTATTA  50

seq1  GCATATACCAAATAGTTCACAACGATGTTTTGGTAAATAATGGACTATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATACCAAATAGTTCACAACGATGTTTTGGTAAATAATGGACTATGT  100

seq1  GTGTCTATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  150

seq1  G  151
      |
seq2  G  151


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |