BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322K03
Chromosome8 (Build37)
Map Location 127,134,971 - 127,350,469
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCapn9, 2310022B05Rik, Ttc13, Arv1, 2310031A18Rik, LOC668444, Trim67
Upstream geneRhou, LOC100042484, LOC100042490, Rab4a, 1700054N08Rik, LOC100043296, Acta1, Nup133, Abcb10, Taf5l, AK122209, LOC100042530, LOC100042535, Galnt2, Pgbd5, Cog2, Agt
Downstream gene2810004N23Rik, Gnpat, Exoc8, Gm505, Egln1, Tsnax, Disc1, Sipa1l2, 4933403G14Rik, 2310079N02Rik, E330039K12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322K03.bB6Ng01-322K03.g
ACCGA111425GA111426
length1,126820
definitionB6Ng01-322K03.b B6Ng01-322K03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,349,349 - 127,350,469)(127,134,971 - 127,135,790)
sequence
gaattcagttcccagcaaccatatgatggctcacccatctgtacagctac
agtgtactcatatgcattaaagaaagtaagaaagagagaaagaaagaaag
aaagaaagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagag
agagagagagagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagacagaa
agagagaaagaaagagaggaagaaagaaaactttttaaaagacagctcct
cccccaacacctgggacaatcagagaaccttgtccccgcccctgaatctg
cgggctaagtgggggttcagggagcacgcacctgttggtatgggagttac
agtgcatgaaccagctgcggttgttgtccacgtacatggcccaggccttg
tcatccttgcctagcatcatatctttgaccacgctggccctggccactcc
gaaggctgggtccgggtggttgtcatagcggtccacgtgcagctcccagt
agtgcacgcctttggagaaggcagctgtgcctagcaccacccggtcatca
tagctgctgcaagtagccgtctggttgtcattggataagatgatgtcccg
atggccagagttggggtcaaaggtgaaccaggccactggaaaggaagaag
gcaggtagagcaggcacaagaatctctgtttcctgcccctcttatccccc
catctttcccccaacacaacacacattttttctgtacagccaaggtgact
gatagacttagttgcttctaacagagtcgattcattgccgccagtggtct
atgtgggatacacacacacactcacatatacacagtcacactctgtgctg
attggcttttgtcaacttgacagaaatctagattatctgggaagagggaa
cctagattcagaaaatgcctctataagatttgcccaggggctggagagat
ggctccgtggttaagagcactgactgctctaccaaggtcctgagttccag
tcccagcaccacgtggtggctcacaacccatccatatgagatctggatgc
cctcttcctggggtgtcttggagaacagctaccgatgtacttaccatatg
tataaataataagtctcatgggagta
gaattcacctctagagattttaaattaatcatgtcatggttaggtcatgg
ttaaccgtgtcttaggtcttctgtcttgaatagcaggtgacaccccacta
tgtgaagtaatttcagttctctgggtgctcctgtagagacgtacaaggac
ctatttgctctccaaaggtcttctgactctttaatgtctctcacagcttt
ttgaagcattctcggggactattgcatccttacaggatggctggcttgcc
ttcccctttcctgagtctctcctggggtggtcggcccttccctgagaaac
caatgggtgcagctaccaaggaggtggactccgctcccagcacagcagcc
ccagggccactctccccccaggagccaagtgaagtttagaattgtcgggg
gaccaaaaagagcacttgtctccactccacaggacatggaggtgtcagct
gaggagcttgaatatgttctaaatgctgttctgcagaagagtaagtgccg
ttcccacaggggacagggctccctggagagaaagagtgaccaccctgtca
gggctctcccgggctctgttccttggagcatcagacctgctgaccattgc
tgacatccatgtgtatacagactgtagaatatggtctgttgcttatttcc
taactgggacactgatgcagcttcccatagagtgtttcccactttttgtc
tcaaacttaacaaatactgaacattttgtatcaaagactcatgcatcata
tggctgttactatattgttacacttagcctactgtttagtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_127349349_127350469
seq2: B6Ng01-322K03.b_49_1174 (reverse)

seq1  TACTCCCAT-AGACTTATTTATTTAT-CATAT-GTAAGTACA-CTGTAGC  46
      ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||
seq2  TACTCCCATGAGACTTA-TTATTTATACATATGGTAAGTACATCGGTAGC  49

seq1  TGTCTTC--AGACACCCCA-GAAGAGGGCAT-CAGATCTCATTATGGAT-  91
      |||  ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| 
seq2  TGTTCTCCAAGACACCCCAGGAAGAGGGCATCCAGATCTCA-TATGGATG  98

seq1  GGTTGTGAGCCACCACGTGGTTGCTGGGACTTGAACTCAGGACCTTTGGT  141
      |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  GGTTGTGAGCCACCACGTGG-TGCTGGGACTGGAACTCAGGACC-TTGGT  146

seq1  AGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACGGAGCCATCTCTCCAGCCCCTGGGCA  191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACGGAGCCATCTCTCCAGCCCCTGGGCA  196

seq1  AATCTTATAGAGGCATTTTCTGAATCTAGGTTCCCTCTTCCCAGATAATC  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTATAGAGGCATTTTCTGAATCTAGGTTCCCTCTTCCCAGATAATC  246

seq1  TAGATTTCTGTCAAGTTGACAAAAGCCAATCAGCACAGAGTGTGACTGTG  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTTCTGTCAAGTTGACAAAAGCCAATCAGCACAGAGTGTGACTGTG  296

seq1  TATATGTGAGTGTGTGTGTGTATCCCACATAGACCACTGGCGGCAATGAA  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGAGTGTGTGTGTGTATCCCACATAGACCACTGGCGGCAATGAA  346

seq1  TCGACTCTGTTAGAAGCAACTAAGTCTATCAGTCACCTTGGCTGTACAGA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGACTCTGTTAGAAGCAACTAAGTCTATCAGTCACCTTGGCTGTACAGA  396

seq1  AAAAATGTGTGTTGTGTTGGGGGAAAGATGGGGGGATAAGAGGGGCAGGA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGTGTGTTGTGTTGGGGGAAAGATGGGGGGATAAGAGGGGCAGGA  446

seq1  AACAGAGATTCTTGTGCCTGCTCTACCTGCCTTCTTCCTTTCCAGTGGCC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGATTCTTGTGCCTGCTCTACCTGCCTTCTTCCTTTCCAGTGGCC  496

seq1  TGGTTCACCTTTGACCCCAACTCTGGCCATCGGGACATCATCTTATCCAA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCACCTTTGACCCCAACTCTGGCCATCGGGACATCATCTTATCCAA  546

seq1  TGACAACCAGACGGCTACTTGCAGCAGCTATGATGACCGGGTGGTGCTAG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAACCAGACGGCTACTTGCAGCAGCTATGATGACCGGGTGGTGCTAG  596

seq1  GCACAGCTGCCTTCTCCAAAGGCGTGCACTACTGGGAGCTGCACGTGGAC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGCTGCCTTCTCCAAAGGCGTGCACTACTGGGAGCTGCACGTGGAC  646

seq1  CGCTATGACAACCACCCGGACCCAGCCTTCGGAGTGGCCAGGGCCAGCGT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTATGACAACCACCCGGACCCAGCCTTCGGAGTGGCCAGGGCCAGCGT  696

seq1  GGTCAAAGATATGATGCTAGGCAAGGATGACAAGGCCTGGGCCATGTACG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAAAGATATGATGCTAGGCAAGGATGACAAGGCCTGGGCCATGTACG  746

seq1  TGGACAACAACCGCAGCTGGTTCATGCACTGTAACTCCCATACCAACAGG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAACAACCGCAGCTGGTTCATGCACTGTAACTCCCATACCAACAGG  796

seq1  TGCGTGCTCCCTGAACCCCCACTTAGCCCGCAGATTCAGGGGCGGGGACA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTGCTCCCTGAACCCCCACTTAGCCCGCAGATTCAGGGGCGGGGACA  846

seq1  AGGTTCTCTGATTGTCCCAGGTGTTGGGGGAGGAGCTGTCTTTTAAAAAG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTCTGATTGTCCCAGGTGTTGGGGGAGGAGCTGTCTTTTAAAAAG  896

seq1  TTTTCTTTCTTCCTCTCTTTCTTTCTCTCTTTCTGTCTTTCTTTCTTTCT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTCTTCCTCTCTTTCTTTCTCTCTTTCTGTCTTTCTTTCTTTCT  946

seq1  TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCT  996

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTTT  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTTT  1046

seq1  CTTACTTTCTTTAATGCATATGAGTACACTGTAGCTGTACAGATGGGTGA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTTTCTTTAATGCATATGAGTACACTGTAGCTGTACAGATGGGTGA  1096

seq1  GCCATCATATGGTTGCTGGGAACTGAATTC  1121
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCATATGGTTGCTGGGAACTGAATTC  1126

seq1: chr8_127134971_127135790
seq2: B6Ng01-322K03.g_65_884

seq1  GAATTCACCTCTAGAGATTTTAAATTAATCATGTCATGGTTAGGTCATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTCTAGAGATTTTAAATTAATCATGTCATGGTTAGGTCATGG  50

seq1  TTAACCGTGTCTTAGGTCTTCTGTCTTGAATAGCAGGTGACACCCCACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCGTGTCTTAGGTCTTCTGTCTTGAATAGCAGGTGACACCCCACTA  100

seq1  TGTGAAGTAATTTCAGTTCTCTGGGTGCTCCTGTAGAGACGTACAAGGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGTAATTTCAGTTCTCTGGGTGCTCCTGTAGAGACGTACAAGGAC  150

seq1  CTATTTGCTCTCCAAAGGTCTTCTGACTCTTTAATGTCTCTCACAGCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTGCTCTCCAAAGGTCTTCTGACTCTTTAATGTCTCTCACAGCTTT  200

seq1  TTGAAGCATTCTCGGGGACTATTGCATCCTTACAGGATGGCTGGCTTGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCATTCTCGGGGACTATTGCATCCTTACAGGATGGCTGGCTTGCC  250

seq1  TTCCCCTTTCCTGAGTCTCTCCTGGGGTGGTCGGCCCTTCCCTGAGAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTTTCCTGAGTCTCTCCTGGGGTGGTCGGCCCTTCCCTGAGAAAC  300

seq1  CAATGGGTGCAGCTACCAAGGAGGTGGACTCCGCTCCCAGCACAGCAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGGTGCAGCTACCAAGGAGGTGGACTCCGCTCCCAGCACAGCAGCC  350

seq1  CCAGGGCCACTCTCCCCCCAGGAGCCAAGTGAAGTTTAGAATTGTCGGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGCCACTCTCCCCCCAGGAGCCAAGTGAAGTTTAGAATTGTCGGGG  400

seq1  GACCAAAAAGAGCACTTGTCTCCACTCCACAGGACATGGAGGTGTCAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAAAAGAGCACTTGTCTCCACTCCACAGGACATGGAGGTGTCAGCT  450

seq1  GAGGAGCTTGAATATGTTCTAAATGCTGTTCTGCAGAAGAGTAAGTGCCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCTTGAATATGTTCTAAATGCTGTTCTGCAGAAGAGTAAGTGCCG  500

seq1  TTCCCACAGGGGACAGGGCTCCCTGGAGAGAAAGAGTGACCACCCTGTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCACAGGGGACAGGGCTCCCTGGAGAGAAAGAGTGACCACCCTGTCA  550

seq1  GGGCTCTCCCGGGCTCTGTTCCTTGGAGCATCAGACCTGCTGACCATTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTCCCGGGCTCTGTTCCTTGGAGCATCAGACCTGCTGACCATTGC  600

seq1  TGACATCCATGTGTATACAGACTGTAGAATATGGTCTGTTGCTTATTTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATCCATGTGTATACAGACTGTAGAATATGGTCTGTTGCTTATTTCC  650

seq1  TAACTGGGACACTGATGCAGCTTCCCATAGAGTGTTTCCCACTTTTTGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGGGACACTGATGCAGCTTCCCATAGAGTGTTTCCCACTTTTTGTC  700

seq1  TCAAACTTAACAAATACTGAACATTTTGTATCAAAGACTCATGCATCATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACTTAACAAATACTGAACATTTTGTATCAAAGACTCATGCATCATA  750

seq1  TGGCTGTTACTATATTGTTACACTTAGCCTACTGTTTAGTGTGTGTGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTTACTATATTGTTACACTTAGCCTACTGTTTAGTGTGTGTGTGT  800

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGA  820
      ||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGA  820