BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326F07
Chromosome8 (Build37)
Map Location 107,519,866 - 107,681,335
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC436058, EG436059, Es31, EG13909, LOC667774, BC026374
Upstream geneLOC100041397, LOC667656, Cdh5, Bean, Tk2, Cklf, Cmtm2a, Cmtm2b, Cmtm3, Cmtm4, Dync1li2, Ccdc79, Appbp1, Car7, LOC628007, 4833426J09Rik, Cdh16, Rrad, 1110019N10Rik, EG637550, LOC382052, LOC100041473, Ces6, LOC628050, 4932416K20Rik, BC015286, Matr3-ps2, Ces2, LOC667754, LOC667760, Ces5, 2310038E17Rik, 2210023G05Rik
Downstream geneLOC100042408, Cbfb, D230025D16Rik, C76566, Tradd, Fbxl8, Hsf4, Nol3, 4931428F04Rik, Exoc3l, E2f4, Elmo3, Lrrc29, Hspc171, Fhod1, Slc9a5, Plekhg4, Kctd19, Lrrc36, 2700055K07Rik, Zdhhc1, LOC667837, Hsd11b2, Atp6v0d1, Agrp, EG667846, 2310066E14Rik, LOC546100, Ctcf, EG546101, D130029J02Rik, Acd, Pard6a, E130303B06Rik, 4933405L10Rik, Gfod2, Ranbp10, Tsnaxip1, Cenpt, LOC100041617, Thap11, Nutf2, Edc4, Nrn1l, Pskh1, Ctrl, Psmb10, Lcat, Slc12a4, Dpep3, Dpep2, Ddx28, Dus2l, Nfatc3, Rbm35b, Lypla3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326F07.bB6Ng01-326F07.g
ACCGA114165GA114166
length1,1151,155
definitionB6Ng01-326F07.b B6Ng01-326F07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,519,866 - 107,520,984)(107,680,168 - 107,681,335)
sequence
gaattcaattagaggtgtgggtggctcttggatcctgggtggtaaaggag
gaagggaaagagacctggagttcagggtcgggctgcagtaagaatggaga
ctgtggagcatatgtaggcagctgcatcaggagtctgggacctgaacctt
tgtcttcccattcactacagttgacctcactgcggaggagaagctgctga
gcagaagcatcatgaagtactgggccaactttgcacggcataggtgagac
cgccctttccccaacctcctcagtggtgagtccctatctagggctccatt
tgtgattgatgatctcattaacatgaatggataattcatcacatggtaga
gtcacctcaccccagggcacacttagatatattgtacatattgcttattc
atcatactccagtgacctggcaggtgccatggtactgttccttaaatttt
ccctctgagacagagacatgaaactggtcaggtagtcttgccccacatgg
aacagaaactagtgggtgacacctgtatccctgtacaaggacacttgccc
catcagccccctcaacccttggcctaattggttcactgccctgacacaaa
ttaggatatcaggccttggatgagagtgactttcaccttctctgctgggt
ggcatatccacaggaaccccaacagcttgggtctaccccactggcctgtt
tttgaccacggtgagcagtatctgaagctggacacccagcctgctgtggg
ccgagccctgaaggccagaaggcatcatttctggaccaagactctgcccc
agaagtccaggagctaaaggggtcttagtaaaatcacaaagatctgtagt
gtcctgtgagaaaaatgatgtgtaggattgagtacacgtggggtcagcct
aacattcttaaagcccactcagaattcttgtagagccaaaaattacaaaa
gcattcctaacctctaaagtgtccatttgtccaacatgtatgacaacctg
tagttgtgtcactcatactcaacatgtgggacaccttttatgaagaccca
ctcagtaaatgtcccatgattgtatagaatgtatgataggtgtccagttt
tcaattccactggga
gaattcacatcacgcaactcatgatcacctgtgactctaggatcccaaca
tcctcctcttctatcctactcagattctcatgcgtctgcttgtacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacacacaatttttaagaatca
gagtagaggcaacagctatgttaaaacccaggatccccaccctgcccctt
tctgagcaccgtggtttgctatgactcgggaggggcaaattcgtggtttt
gaaagatccagcaactgagttttggagtcctgggcctgattgatgtcttt
gggaggctatggaggcagcactagccttttcccccaggctggcagagctg
ctccttgggcaggcgccatgaatcaaccataggcacctctgccatgttga
tagattttcctgccactagtgttaatttcctgaaagcccttctttcccac
cttcagcctccccatcaaaaagaacaagatctgtaatggtcttaggatcc
aaagagctgcaagtgataaggctttgtagctggaaggagcttaggccaga
gtctttttttttttcttcaagatttatttacttattttatgtatatgagt
acactgtagttgtacagatgcttgggagccttcaagtggttgttgggaat
tgaaattttaggacctctgcttgttccagtaaaccctgcagacagcttca
gatctcattatgggtagttgtgagacaccatatggttgctgggatttgaa
ctcaggaccttcagaagtgatcttacccactgagccgtctcgccagcccc
tttagggcatagtcttgtttcaccactgggggctgtttctagtgtacaga
tgaggagaggcaggctatggggatgcaagagacctacctgaagatgggaa
ccaaaggtcacgtccagacaagaacacagtgtttccagattatgcttagg
agccatggggattcctgctctacatagtcatctagacttagcccttaggg
gtttctttttcaggctcaaatagacccccccatatctcctccatggctct
caacaattccagttcagccccttgacacaaagctgggtgtaagagaagtc
agtcagtctgtaagctcctggatgaccgtgctctgcctgaacttccctcc
tgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_107519866_107520984
seq2: B6Ng01-326F07.b_51_1165

seq1  GAATTCAATTAGAGGTGTGGGTGGCTCTTGGATCCTGGGTGGTAAAGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTAGAGGTGTGGGTGGCTCTTGGATCCTGGGTGGTAAAGGAG  50

seq1  GAAGGGAAAGAGACCTGGAGTTCAGGGTCGGGCTGCAGTAAGAATGGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGAAAGAGACCTGGAGTTCAGGGTCGGGCTGCAGTAAGAATGGAGA  100

seq1  CTGTGGAGCATATGTAGGCAGCTGCATCAGGAGTCTGGGACCTGAACCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGAGCATATGTAGGCAGCTGCATCAGGAGTCTGGGACCTGAACCTT  150

seq1  TGTCTTCCCATTCACTACAGTTGACCTCACTGCGGAGGAGAAGCTGCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCCCATTCACTACAGTTGACCTCACTGCGGAGGAGAAGCTGCTGA  200

seq1  GCAGAAGCATCATGAAGTACTGGGCCAACTTTGCACGGCATAGGTGAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAGCATCATGAAGTACTGGGCCAACTTTGCACGGCATAGGTGAGAC  250

seq1  CGCCCTTTCCCCAACCTCCTCAGTGGTGAGTCCCTATCTAGGGCTCCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCTTTCCCCAACCTCCTCAGTGGTGAGTCCCTATCTAGGGCTCCATT  300

seq1  TGTGATTGATGATCTCATTAACATGAATGGATAATTCATCACATGGTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTGATGATCTCATTAACATGAATGGATAATTCATCACATGGTAGA  350

seq1  GTCACCTCACCCCAGGGCACACTTAGATATATTGTACATATTGCTTATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTCACCCCAGGGCACACTTAGATATATTGTACATATTGCTTATTC  400

seq1  ATCATACTCCAGTGACCTGGCAGGTGCCATGGTACTGTTCCTTAAATTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATACTCCAGTGACCTGGCAGGTGCCATGGTACTGTTCCTTAAATTTT  450

seq1  CCCTCTGAGACAGAGACATGAAACTGGTCAGGTAGTCTTGCCCCACATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGAGACAGAGACATGAAACTGGTCAGGTAGTCTTGCCCCACATGG  500

seq1  AACAGAAACTAGTGGGTGACACCTGTATCCCTGTACAAGGACACTTGCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAACTAGTGGGTGACACCTGTATCCCTGTACAAGGACACTTGCCC  550

seq1  CATCAGCCCCCTCAACCCTTGGCCTAATTGGTTCACTGCCCTGACACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCCCCCTCAACCCTTGGCCTAATTGGTTCACTGCCCTGACACAAA  600

seq1  TTAGGATATCAGGCCTTGGATGAGAGTGACTTTCACCTTCTCTGCTGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGATATCAGGCCTTGGATGAGAGTGACTTTCACCTTCTCTGCTGGGT  650

seq1  GGCATATCCACAGGAACCCCAACAGCTTGGGTCTACCCCACTGGCCTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATATCCACAGGAACCCCAACAGCTTGGGTCTACCCCACTGGCCTGTT  700

seq1  TTTGACCACGGTGAGCAGTATCTGAAGCTGGACACCCAGCCTGCTGTGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACCACGGTGAGCAGTATCTGAAGCTGGACACCCAGCCTGCTGTGGG  750

seq1  CCGAGCCCTGAAGGCCAGAAGGCATCATTTCTGGACCAAGACTCTGCCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAGCCCTGAAGGCCAGAAGGCATCATTTCTGGACCAAGACTCTGCCCC  800

seq1  AGAAGTCCAGGAGCTAAAGGGGTCTTAGTAAAATCACAAAGATCTGTAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTCCAGGAGCTAAAGGGGTCTTAGTAAAATCACAAAGATCTGTAGT  850

seq1  GTCCTGTGAGAAAAATGATGTGTAGGATTGAGTACACGTGGGGTCAGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGTGAGAAAAATGATGTGTAGGATTGAGTACACGTGGGGTCAGCCT  900

seq1  AACATTCTTAAAGCCCACTCAGAATTCTTGTAGAGCCAAAAAATTACAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AACATTCTTAAAGCCCACTCAGAATTCTTGTAGAGCC-AAAAATTACAAA  949

seq1  AGCATTCCTAACCTCTAAAGTTGTCCATTTGTCCAACATGTATGACAACC  1000
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCCTAACCTCTAAAG-TGTCCATTTGTCCAACATGTATGACAACC  998

seq1  TGTAGGTGTGTCACTCATTACTCAACATGTTGGGACACCTTTTATG-AGA  1049
      ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  TGTAGTTGTGTCACTCA-TACTCAACATG-TGGGACACCTTTTATGAAGA  1046

seq1  CCCACTCAGTAAATGTCCCATGATTGTATAG-ATGTATGATAAGTGTCCC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||
seq2  CCCACTCAGTAAATGTCCCATGATTGTATAGAATGTATGATAGGTGT-CC  1095

seq1  AGTTTTCACATTCCACTGGGA  1119
      |||||||| ||||||||||||
seq2  AGTTTTCA-ATTCCACTGGGA  1115

seq1: chr8_107680168_107681335
seq2: B6Ng01-326F07.g_67_1221 (reverse)

seq1  CCCCAAGAGGG-AGTTCAGGCAGAGCCACGTGCTATCCCAGGGAAAGCTA  49
      ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |  || |||||   |||| 
seq2  CCCCAGGAGGGAAGTTCAGGCAGAG-CACG-GTCAT-CCAGG---AGCTT  44

seq1  ACCAAGACTGGACTGGACTCTCTTACCACCAGCTTTGTGGTCAAGGGGGC  99
      ||  ||||| |||||   ||||||||  |||||||||| |||||||||  
seq2  AC--AGACT-GACTGACTTCTCTTACACCCAGCTTTGT-GTCAAGGGG--  88

seq1  TTGAACTTGGGATTTGTTTGGAGAGCCATTGGGAGGGAGATATGGGGGGG  149
       ||||||  ||| |||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||
seq2  CTGAACT--GGAATTGTT--GAGAGCCAT--GGA-GGAGATATGGGGGGG  131

seq1  TCTATTTGAGCCCTGAAAAAGAAACCCCTAA-GGCTAAGTCTAGATGACT  198
      |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTGAG-CCTGAAAAAGAAACCCCTAAGGGCTAAGTCTAGATGACT  180

seq1  ATGTAGAGCAGGATTCCCCATGGCTCCTAAGCATAATCTGGGAACACTGT  248
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATGTAGAGCAGGAATCCCCATGGCTCCTAAGCATAATCTGGAAACACTGT  230

seq1  GTTCTTGTCTGGACGTGACC-TTGGTT-CCATCTTCAGGTAGGTCTCTTG  296
      |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGTCTGGACGTGACCTTTGGTTCCCATCTTCAGGTAGGTCTCTTG  280

seq1  CAT-CCCATAGCCTGCCTCTCCTCATCTGTACACTAGAAACAG-CCCCAG  344
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CATCCCCATAGCCTGCCTCTCCTCATCTGTACACTAGAAACAGCCCCCAG  330

seq1  TGGTGAAACAAGACTATGCCCT-AAGGGGCTGGCGAGACGGCTCAGTGGG  393
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGAAACAAGACTATGCCCTAAAGGGGCTGGCGAGACGGCTCAGTGGG  380

seq1  TAAGATCACTTCTGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCATATGGTG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATCACTTCTGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCATATGGTG  430

seq1  TCTCACAACTACCCATAATGAGATCTGAAGCTGTCTGCAGGGTTTACTGG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACAACTACCCATAATGAGATCTGAAGCTGTCTGCAGGGTTTACTGG  480

seq1  AACAAGCAGAGGTCCTAAAATTTCAATTCCCAACAACCACTTGAAGGCTC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGCAGAGGTCCTAAAATTTCAATTCCCAACAACCACTTGAAGGCTC  530

seq1  CCAAGCATCTGTACAACTACAGTGTACTCATATACATAAAATAAGTAAAT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCATCTGTACAACTACAGTGTACTCATATACATAAAATAAGTAAAT  580

seq1  AAATCTTGAAGAAAAAAAAAAAGACTCTGGCCTAAGCTCCTTCCAGCTAC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTGAAGAAAAAAAAAAAGACTCTGGCCTAAGCTCCTTCCAGCTAC  630

seq1  AAAGCCTTATCACTTGCAGCTCTTTGGATCCTAAGACCATTACAGATCTT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCTTATCACTTGCAGCTCTTTGGATCCTAAGACCATTACAGATCTT  680

seq1  GTTCTTTTTGATGGGGAGGCTGAAGGTGGGAAAGAAGGGCTTTCAGGAAA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTTTTGATGGGGAGGCTGAAGGTGGGAAAGAAGGGCTTTCAGGAAA  730

seq1  TTAACACTAGTGGCAGGAAAATCTATCAACATGGCAGAGGTGCCTATGGT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACTAGTGGCAGGAAAATCTATCAACATGGCAGAGGTGCCTATGGT  780

seq1  TGATTCATGGCGCCTGCCCAAGGAGCAGCTCTGCCAGCCTGGGGGAAAAG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCATGGCGCCTGCCCAAGGAGCAGCTCTGCCAGCCTGGGGGAAAAG  830

seq1  GCTAGTGCTGCCTCCATAGCCTCCCAAAGACATCAATCAGGCCCAGGACT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTGCTGCCTCCATAGCCTCCCAAAGACATCAATCAGGCCCAGGACT  880

seq1  CCAAAACTCAGTTGCTGGATCTTTCAAAACCACGAATTTGCCCCTCCCGA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAACTCAGTTGCTGGATCTTTCAAAACCACGAATTTGCCCCTCCCGA  930

seq1  GTCATAGCAAACCACGGTGCTCAGAAAGGGGCAGGGTGGGGATCCTGGGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAGCAAACCACGGTGCTCAGAAAGGGGCAGGGTGGGGATCCTGGGT  980

seq1  TTTAACATAGCTGTTGCCTCTACTCTGATTCTTAAAAATTGTGTGTGTGT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACATAGCTGTTGCCTCTACTCTGATTCTTAAAAATTGTGTGTGTGT  1030

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACAAGCAGACGCATGAGA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACAAGCAGACGCATGAGA  1080

seq1  ATCTGAGTAGGATAGAAGAGGAGGATGTTGGGATCCTAGAGTCACAGGTG  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGAGTAGGATAGAAGAGGAGGATGTTGGGATCCTAGAGTCACAGGTG  1130

seq1  ATCATGAGTTGCGTGATGTGAATTC  1168
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGAGTTGCGTGATGTGAATTC  1155