BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326P21
Chromosome8 (Build37)
Map Location 8,370,748 - 8,532,844
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039836
Upstream genenone
Downstream geneEfnb2, 9430010O03Rik, Tmem28
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326P21.bB6Ng01-326P21.g
ACCGA114656GA114657
length898998
definitionB6Ng01-326P21.b B6Ng01-326P21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(8,370,748 - 8,371,541)(8,531,845 - 8,532,844)
sequence
gaattcttcgagctctatttataacttatgataagggtattgatttataa
ttttaatatttataatctgtacttttaataaatgttttcatgagaattta
tcataccctgataactagccttgggaagtagaagatttgaaaaagtacca
acatatggtaaaagttttgaatttgagatttttttataatccatgatacc
aagaataacccatgtaaaaaatatagtctctttaacacaataaaacagga
tttttactgatgttatgtagataaaaatgaacaaagacctgtgtttttca
aaaagatttgtaagagaaaatggaagtagacatctacagaaaaaagttgt
ttgagcatgaccttgagagtgcatgtatgaagtcacagcagatgtgatag
tatacactagacctgtgcgagcacaagccaacaaaaaccccatcacttat
acaagacggactcatcaagacccacccttagccaagaaactattagaatt
gaagactgctgggtgagggataatcattttccttcagagaaatctctgag
aggctacacgtgttcccgtagatagacctatactcacacatactagcatc
actaagtgaatagtgggtagtaaggtggggcacataaagctaggacagat
agggggtgatgcgaaagaactgaatgggaagaaatgggggaggatggttt
tgataaaaacgcaatatatacatgtatgaaagtcttaaacaattaaaaaa
gtgtataacatggagctagagaaagtactcaaggagctaaaggggtctgc
aaccctataggtggaacaacaatattgaactaaccagtaccctccagagc
tcgtgtctctagcttgcattatgtaacagaggatggcttatttcggcc

gaattctttttgaaaaagacataggttcaaaatctccttgccatcttgag
ctgctcctcctgtccccacctgtaacatgaaagtggtcatgtgggctgag
gccagataaaatgattccatataattagaacattctgagggtgtctggca
taaacagttggcagtaaacactgggtgtgacaattaagatctttccccag
ttgcacaattgatattgaatgtatagatatgaagatcaaagattccatac
agtttgagtaagaatagtttgttagacataaagaaagcatcccgcccatg
gtctgcctgattaggaagccatttgaaatcacctccttgactgtggtgag
ttccaagtctgtgttttgagtggtatgcggtgggttccctgcgtcatcag
tgatcctagcgactcttgccaagggacatgttcagcagttgtgtctcatg
tggcttgagatttgcacagaccatctcctggtagatcagaagaatctcca
ctcgggaatctttctctgtacaatgggctcataactttgtgaacagcatg
gttaggaaacaggggtggggagagatttatcagctgcagcaggtaaggag
aacgtgggagttatttccaaagccatgccctcctaaaacgaaaggaagct
tggggttgcatttgggaagttacatatgttcatactggaaagtccactag
gagactgtacacaagaaagcatgtttcctaatagagtccatttctgagca
tgctcagtttaaatgtcatggtccaagaaggatgataccagacacgtttt
gtgggcatgcttaactcgaggtcccatgtttgaacggtcaaagctgttct
tgggcatgcccagtctgtatcacatatggcactcatgaacaaagggcctt
tgcacttgcagttgaataattaacatttttgtgaaaaataatgtttgtaa
catattggagaccagtatagggtgcatacctctatgtaatcccaggca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_8370748_8371541
seq2: B6Ng01-326P21.b_50_843

seq1  GAATTCTTCGAGCTCTATTTATAACTTATGATAAGGGTATTGATTTATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCGAGCTCTATTTATAACTTATGATAAGGGTATTGATTTATAA  50

seq1  TTTTAATATTTATAATCTGTACTTTTAATAAATGTTTTCATGAGAATTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATATTTATAATCTGTACTTTTAATAAATGTTTTCATGAGAATTTA  100

seq1  TCATACCCTGATAACTAGCCTTGGGAAGTAGAAGATTTGAAAAAGTACCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACCCTGATAACTAGCCTTGGGAAGTAGAAGATTTGAAAAAGTACCA  150

seq1  ACATATGGTAAAAGTTTTGAATTTGAGATTTTTTTATAATCCATGATACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATGGTAAAAGTTTTGAATTTGAGATTTTTTTATAATCCATGATACC  200

seq1  AAGAATAACCCATGTAAAAAATATAGTCTCTTTAACACAATAAAACAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAACCCATGTAAAAAATATAGTCTCTTTAACACAATAAAACAGGA  250

seq1  TTTTTACTGATGTTATGTAGATAAAAATGAACAAAGACCTGTGTTTTTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACTGATGTTATGTAGATAAAAATGAACAAAGACCTGTGTTTTTCA  300

seq1  AAAAGATTTGTAAGAGAAAATGGAAGTAGACATCTACAGAAAAAAGTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGATTTGTAAGAGAAAATGGAAGTAGACATCTACAGAAAAAAGTTGT  350

seq1  TTGAGCATGACCTTGAGAGTGCATGTATGAAGTCACAGCAGATGTGATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCATGACCTTGAGAGTGCATGTATGAAGTCACAGCAGATGTGATAG  400

seq1  TATACACTAGACCTGTGCGAGCACAAGCCAACAAAAACCCCATCACTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACACTAGACCTGTGCGAGCACAAGCCAACAAAAACCCCATCACTTAT  450

seq1  ACAAGACGGACTCATCAAGACCCACCCTTAGCCAAGAAACTATTAGAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGACGGACTCATCAAGACCCACCCTTAGCCAAGAAACTATTAGAATT  500

seq1  GAAGACTGCTGGGTGAGGGATAATCATTTTCCTTCAGAGAAATCTCTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACTGCTGGGTGAGGGATAATCATTTTCCTTCAGAGAAATCTCTGAG  550

seq1  AGGCTACACGTGTTCCCGTAGATAGACCTATACTCACACATACTAGCATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTACACGTGTTCCCGTAGATAGACCTATACTCACACATACTAGCATC  600

seq1  ACTAAGTGAATAGTGGGTAGTAAGGTGGGGCACATAAAGCTAGGACAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGTGAATAGTGGGTAGTAAGGTGGGGCACATAAAGCTAGGACAGAT  650

seq1  AGGGGGTGATGCGAAAGAACTGAATGGGAAGAAATGGGGGAGGATGGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTGATGCGAAAGAACTGAATGGGAAGAAATGGGGGAGGATGGTTT  700

seq1  TGATAAAAACGCAATATATACATGTATGAAAGTCTTAAACAATTAAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAAAACGCAATATATACATGTATGAAAGTCTTAAACAATTAAAAAA  750

seq1  GTGTATAACATGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGG  794
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTGTATAACATGGAGCTAGAGAAAGTACTCAAGGAGCTAAAGGG  794


seq1: chr8_8531845_8532844
seq2: B6Ng01-326P21.g_69_1066 (reverse)

seq1  TGCCTGGGATTACATAGAGGTATGCACCCTATACCTGGTCTCCAAATATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  TGCCTGGGATTACATAGAGGTATGCACCCTATA-CTGGTCTCC-AATATG  48

seq1  TTACAAAACATTATTTTTCACAAAAATGTTAA-TATTCAACTGCAAGTGC  99
      |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTAC-AAACATTATTTTTCACAAAAATGTTAATTATTCAACTGCAAGTGC  97

seq1  AAAGGGCCCTTGTTTCATGAGTGCCATATGTGATACAGACTGGGCATGCC  149
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAA-GGCCCTTTGTTCATGAGTGCCATATGTGATACAGACTGGGCATGCC  146

seq1  CAAGAACAGCTTTGACCGTTCAAACATGGGACCTCGAGTTAAGCATGCCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAACAGCTTTGACCGTTCAAACATGGGACCTCGAGTTAAGCATGCCC  196

seq1  ACAAAACGTGTCTGGTATCATCCTTCTTGGACCATGACATTT-AACTGAG  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACAAAACGTGTCTGGTATCATCCTTCTTGGACCATGACATTTAAACTGAG  246

seq1  CATGCTCAGAAATGGACTCTATTAGGAAACATGCTTTCTTGTGTACAGTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCAGAAATGGACTCTATTAGGAAACATGCTTTCTTGTGTACAGTC  296

seq1  TCCTAGTGGACTTTCCAGTATGAACATATGTAACTTCCCAAATGCAACCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGTGGACTTTCCAGTATGAACATATGTAACTTCCCAAATGCAACCC  346

seq1  CAAGCTTCCTTTCGTTTTAGGAGGGCATGGCTTTGGAAATAACTCCCACG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTTCCTTTCGTTTTAGGAGGGCATGGCTTTGGAAATAACTCCCACG  396

seq1  TTCTCCTTACCTGCTGCAGCTGATAAATCTCTCCCCACCCCTGTTTCCTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTTACCTGCTGCAGCTGATAAATCTCTCCCCACCCCTGTTTCCTA  446

seq1  ACCATGCTGTTCACAAAGTTATGAGCCCATTGTACAGAGAAAGATTCCCG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCTGTTCACAAAGTTATGAGCCCATTGTACAGAGAAAGATTCCCG  496

seq1  AGTGGAGATTCTTCTGATCTACCAGGAGATGGTCTGTGCAAATCTCAAGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAGATTCTTCTGATCTACCAGGAGATGGTCTGTGCAAATCTCAAGC  546

seq1  CACATGAGACACAACTGCTGAACATGTCCCTTGGCAAGAGTCGCTAGGAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGAGACACAACTGCTGAACATGTCCCTTGGCAAGAGTCGCTAGGAT  596

seq1  CACTGATGACGCAGGGAACCCACCGCATACCACTCAAAACACAGACTTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATGACGCAGGGAACCCACCGCATACCACTCAAAACACAGACTTGG  646

seq1  AACTCACCACAGTCAAGGAGGTGATTTCAAATGGCTTCCTAATCAGGCAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCACCACAGTCAAGGAGGTGATTTCAAATGGCTTCCTAATCAGGCAG  696

seq1  ACCATGGGCGGGATGCTTTCTTTATGTCTAACAAACTATTCTTACTCAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGGGCGGGATGCTTTCTTTATGTCTAACAAACTATTCTTACTCAAA  746

seq1  CTGTATGGAATCTTTGATCTTCATATCTATACATTCAATATCAATTGTGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATGGAATCTTTGATCTTCATATCTATACATTCAATATCAATTGTGC  796

seq1  AACTGGGGAAAGATCTTAATTGTCACACCCAGTGTTTACTGCCAACTGTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGGAAAGATCTTAATTGTCACACCCAGTGTTTACTGCCAACTGTT  846

seq1  TATGCCAGACACCCTCAGAATGTTCTAATTATATGGAATCATTTTATCTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCAGACACCCTCAGAATGTTCTAATTATATGGAATCATTTTATCTG  896

seq1  GCCTCAGCCCACATGACCACTTTCATGTTACAGGTGGGGACAGGAGGAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAGCCCACATGACCACTTTCATGTTACAGGTGGGGACAGGAGGAGC  946

seq1  AGCTCAAGATGGCAAGGAGATTTTGAACCTATGTCTTTTTCAAAAAGAAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAAGATGGCAAGGAGATTTTGAACCTATGTCTTTTTCAAAAAGAAT  996

seq1  TC  1000
      ||
seq2  TC  998


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |