BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-327G17
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,860,661 - 120,043,043
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933407C03Rik, Plcg2
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan
Downstream gene4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6, Cdh13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-327G17.bB6Ng01-327G17.g
ACCGA114973GA114974
length931,005
definitionB6Ng01-327G17.b B6Ng01-327G17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,042,951 - 120,043,043)(119,860,661 - 119,861,658)
sequence
cgtggcatgggaaccaaatctcagtgaggcaatgaaaatgaggaaaagga
gagaacaggaagttggggggggaggtctggagggagtaagagg
gaattctttcatatgaaacatgaaggaatagaggggtcaagtcacttgcc
tgaggtcacacagctagatggagtggctctccctgttacctgttgtgcct
ctccctgttggctgtgtgtcctggccaacctagccagtccctgggttact
tcttggtgtttcttattccttatggaatgctatttctattttaaaaagaa
atacttggctgggcagtggtggcgcatgcctgtaatcccagcacttggga
ggcagaggctctgagtttgaggccagcctggtctacagagtgagttccag
gatacaagcactggggtctgagagttgaatgttcctttagactttatgtt
tattgcttttataaaatggtggtaaaaatacacatactatagaattgatc
gctctctcagtctttctctgagacagcttcactgttcaggctggccttga
actcatgattcccctgcctcagtgctgagattataggtatgccccaccac
ccctggctaggatttcttccctcaagtctctctaagtgtgtataggtcag
ttgctaattctgttagtgtcaacgtagtcttgacctctggaacttcgagt
tgtcattagcgcaacctagagctgctgccagcatgggctctgagctcatg
gcctttgggtgaagtgggtggaacctaccagaggcagaaggccatgagat
gtagcaggagtcttttaacaggccaccaacctcccattttacaaatgaga
aaacctagcagaccaacattatatagaaaacaaacatgtagactttaatg
tatccagcagcacacaaatgggaggtctgaggttaaatgtatccagcagg
atttgatgggaggtctgacgtaatgtatacagcagcagcatttgttggga
ggtactgattgtaatgtagtcagcagcatgcataggtctgacgtttaatg
tatccagaagcattcataggaggtctcctccagcaaatttttccaagcct
taacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_120042951_120043043
seq2: B6Ng01-327G17.b_51_143 (reverse)

seq1  CCTCTTACTCCCTCCAGACCTCCCCCCCCAACTTCCTGTTCTCTCCTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTACTCCCTCCAGACCTCCCCCCCCAACTTCCTGTTCTCTCCTTTT  50

seq1  CCTCATTTTCATTGCCTCACTGAGATTTGGTTCCCATGCCACG  93
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATTTTCATTGCCTCACTGAGATTTGGTTCCCATGCCACG  93

seq1: chr8_119860661_119861658
seq2: B6Ng01-327G17.g_71_1075

seq1  GAATTCTTTCATATGAAACATGAAGGAATAGAGGGGTCAAGTCACTTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCATATGAAACATGAAGGAATAGAGGGGTCAAGTCACTTGCC  50

seq1  TGAGGTCACACAGCTAGATGGAGTGGCTCTCCCTGTTACCTGTTGTGCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTCACACAGCTAGATGGAGTGGCTCTCCCTGTTACCTGTTGTGCCT  100

seq1  CTCCCTGTTGGCTGTGTGTCCTGGCCAACCTAGCCAGTCCCTGGGTTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTGTTGGCTGTGTGTCCTGGCCAACCTAGCCAGTCCCTGGGTTACT  150

seq1  TCTTGGTGTTTCTTATTCCTTATGGAATGCTATTTCTATTTTAAAAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTGTTTCTTATTCCTTATGGAATGCTATTTCTATTTTAAAAAGAA  200

seq1  ATACTTGGCTGGGCAGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGGCTGGGCAGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGA  250

seq1  GGCAGAGGCTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGGCTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAG  300

seq1  GATACAAGCACTGGGGTCTGAGAGTTGAATGTTCCTTTAGACTTTATGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAAGCACTGGGGTCTGAGAGTTGAATGTTCCTTTAGACTTTATGTT  350

seq1  TATTGCTTTTATAAAATGGTGGTAAAAATACACATACTATAGAATTGATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGCTTTTATAAAATGGTGGTAAAAATACACATACTATAGAATTGATC  400

seq1  GCTCTCTCAGTCTTTCTCTGAGACAGCTTCACTGTTCAGGCTGGCCTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTCAGTCTTTCTCTGAGACAGCTTCACTGTTCAGGCTGGCCTTGA  450

seq1  ACTCATGATTCCCCTGCCTCAGTGCTGAGATTATAGGTATGCCCCACCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATGATTCCCCTGCCTCAGTGCTGAGATTATAGGTATGCCCCACCAC  500

seq1  CCCTGGCTAGGATTTCTTCCCTCAAGTCTCTCTAAGTGTGTATAGGTCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCTAGGATTTCTTCCCTCAAGTCTCTCTAAGTGTGTATAGGTCAG  550

seq1  TTGCTAATTCTGTTAGTGTCAACGTAGTCTTGACCTCTGGAACTTCGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTAATTCTGTTAGTGTCAACGTAGTCTTGACCTCTGGAACTTCGAGT  600

seq1  TGTCATTAGCGCAACCTAGAGCTGCTGCCAGCATGGGCTCTGAGCTCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTAGCGCAACCTAGAGCTGCTGCCAGCATGGGCTCTGAGCTCATG  650

seq1  GCCTTTGGGTGAAGTGGGTGGAACCTACCAGAGGCAGAAGGCCATGAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGGGTGAAGTGGGTGGAACCTACCAGAGGCAGAAGGCCATGAGAT  700

seq1  GTAGCAGGAGTCTTTTAACAGGCCACCAACCTCCCATTTTACAAATGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGGAGTCTTTTAACAGGCCACCAACCTCCCATTTTACAAATGAGA  750

seq1  AAACCTAGCAGACCAACATTATATAGAAAACAAACATGTAGACTTTAATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTAGCAGACCAACATTATATAGAAAACAAACATGTAGACTTTAATG  800

seq1  TATCCAGCAGCACACAAATGGGAGGTCTGAGGTT-AATGTATCCAGCAGG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TATCCAGCAGCACACAAATGGGAGGTCTGAGGTTAAATGTATCCAGCAGG  850

seq1  A-TTGATGGGAGGTCTGACGTAATGTATACAGCAGCAGCATTTG-TGGGA  897
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATTTGATGGGAGGTCTGACGTAATGTATACAGCAGCAGCATTTGTTGGGA  900

seq1  GG-ACTGA-TGTAATGTAGCCAGCAGCATGCATAGGTCTGACG-TTAATG  944
      || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGTACTGATTGTAATGTAGTCAGCAGCATGCATAGGTCTGACGTTTAATG  950

seq1  TATCCAGAAGCATTCATAGGAGGTCTTCTCCAGCAAATTTTCACAAGCC-  993
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| 
seq2  TATCCAGAAGCATTCATAGGAGGTCTCCTCCAGCAAATTTTTCCAAGCCT  1000

seq1  TAACC  998
      |||||
seq2  TAACC  1005