BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328I21
Chromosome8 (Build37)
Map Location 32,750,528 - 32,879,770
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG330731
Upstream geneLOC547008, Dusp26, Rnf122, BC019943, Rbm13, Fut10, LOC666330, LOC666568, 7420700N18Rik, LOC100041329
Downstream geneLOC100041340, Nrg1, 2010007E15Rik, EG666589, EG546052
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328I21.bB6Ng01-328I21.g
ACCGA115787GA115788
length1,198362
definitionB6Ng01-328I21.b B6Ng01-328I21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,878,575 - 32,879,770)(32,750,528 - 32,750,895)
sequence
gaattctgtatattttaaagtggttgcaaattgggggataaatggtgcta
gtcaatttgggggttcaagtgtagagtataagaaccctagtaattccctc
cttgaaatttgttcatacatacttgtgctgattgtatcagcatgcacatt
tgcaaaacttcctaccattggatacacttctttaagattctcctttgtct
tccacgaaattctattaaatctgagtgtctctaatcaactgtaattatct
taaagattctatcataccgaagccatgcatcgataccttcattagctttg
gtcaatgggccaaaacattaattttgcactcatatattaaattgttaaca
tatagcttttctaatacttttcaaggctgaacttactttctgtttcttct
gtcttattctctttggctagcttgttgtcttagttagggttttactgctg
tgaacagacaccatgaccaaggcaagtcttataaaaacaacatttaattg
gggctggcttacaggttcagaggttcagttcattatcatcaaggcgggaa
catggcagtatccaggcaggcatggtgcaggaggagctgagagttctaca
tcttcatccaaaggctactagtggaagactgacttccaaacaactagggt
gaggatcttatgcccacacccacagtgacacacctactccaaccaggtca
cacctccaaatgctgccactccctggtccaagaatatacaaactgtcaca
cctgtgaataccaaataagtattttttttcttgccatttcaaggtaatac
attagtagtcttccttcttttagggtggcactattctcttgtgataactg
atatttttttacaagtgctcatatattctacatgtattagagtaccctag
atgtaaatgtgagtgtttacactcaatgtatgggcccctgagagggaact
tcacatgtgacagtcttctgttctctctgccatgcattccacatataaac
acttgcagaagatatgcttctacttaagatggaatttcacttctcaggaa
tgatttggcagatttttgtcattggacgtctggaattgtaatttcatgaa
aaaagttggctatcatactactatctgatttaaaatttggggttattatc
agaaataatccatcctttttttttttcatgtgggagagagggttttat
ttaagtgaagtctaatggttcatagaaaatgcacaggaaaagaggacaga
gatggatgcctgtttttatttcacttgtagataataattgttcatgacgg
acatgaaattccactggaatcacaatgcagtctaacactgccaagtgtca
aaagttcccagtactcaatggaaaccttctaatgtctacaactaagtgga
ggtgcagaaagatccaatgttctggttttggataaatagctccccaagat
cttatattcaaagtcttggtatgtggactggtaagtagttctattgggag
gttctgttggacctttaagaaggaagctccagtgtgtgtgtgggtgtgtg
tatgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_32878575_32879770
seq2: B6Ng01-328I21.b_44_1241 (reverse)

seq1  ATAAAAC---CTCTTCCACATG-AAAAAAAAAAGGATTGATGTATTACTG  46
      |||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||
seq2  ATAAAACCCTCTCTCCCACATGAAAAAAAAAAAGGATGGAT-TATTTCTG  49

seq1  ATAATAACCCCAAATATTATATCAGATAGTAGGTATGATAGCCAACTTTT  96
      ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATAATAACCCCAAATTTTAAATCAGATAGTA-GTATGATAGCCAACTTTT  98

seq1  TTCATGAAATTAC-ATTCCAGGACGGTCCAATGACAAAAATCTGCCAAAT  145
      ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGAAATTACAATTCCA-GAC-GTCCAATGACAAAAATCTGCCAAAT  146

seq1  CATTTCTGAG-AGTGAAATTCCATCTTTAAGTAG-AGCATATC-TCTGCA  192
      |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
seq2  CATTCCTGAGAAGTGAAATTCCATC-TTAAGTAGAAGCATATCTTCTGCA  195

seq1  AGTGTTTATATGTGGAATGCATGGCAGAGAGAACAGAAGACTGTCACATG  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTATATGTGGAATGCATGGCAGAGAGAACAGAAGACTGTCACATG  245

seq1  TGAAGTTCCCTCTCAGGGGCCCATACATTGAGTGTAAACACTCACATTTT  292
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGAAGTTCCCTCTCAGGGGCCCATACATTGAGTGTAAACACTCACA-TTT  294

seq1  ACATCTAGGGTACTCTAATACATGTAGAATATATGAGCACTTGTAAAAAA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTAGGGTACTCTAATACATGTAGAATATATGAGCACTTGTAAAAAA  344

seq1  ATATCAGTTATCACAAGAGAATAGTGCCACCCTAAAAGAAGGAAGACTAC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAGTTATCACAAGAGAATAGTGCCACCCTAAAAGAAGGAAGACTAC  394

seq1  TAATGTATTACCTTGAAATGGCAAGAAAAAAAATACTTATTTGGTATTCA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTATTACCTTGAAATGGCAAGAAAAAAAATACTTATTTGGTATTCA  444

seq1  CAGGTGTGACAGTTTGTATATTCTTGGACCAGGGAGTGGCAGCATTTGGA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTGACAGTTTGTATATTCTTGGACCAGGGAGTGGCAGCATTTGGA  494

seq1  GGTGTGACCTGGTTGGAGTAGGTGTGTCACTGTGGGTGTGGGCATAAGAT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGACCTGGTTGGAGTAGGTGTGTCACTGTGGGTGTGGGCATAAGAT  544

seq1  CCTCACCCTAGTTGTTTGGAAGTCAGTCTTCCACTAGTAGCCTTTGGATG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACCCTAGTTGTTTGGAAGTCAGTCTTCCACTAGTAGCCTTTGGATG  594

seq1  AAGATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCTGCACCATGCCTGCCTGGATACTGC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCTGCACCATGCCTGCCTGGATACTGC  644

seq1  CATGTTCCCGCCTTGATGATAATGAACTGAACCTCTGAACCTGTAAGCCA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTCCCGCCTTGATGATAATGAACTGAACCTCTGAACCTGTAAGCCA  694

seq1  GCCCCAATTAAATGTTGTTTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATGGTGTCTG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAATTAAATGTTGTTTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATGGTGTCTG  744

seq1  TTCACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACAACAAGCTAGCCAAAGAGAATA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACAACAAGCTAGCCAAAGAGAATA  794

seq1  AGACAGAAGAAACAGAAAGTAAGTTCAGCCTTGAAAAGTATTAGAAAAGC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAAGAAACAGAAAGTAAGTTCAGCCTTGAAAAGTATTAGAAAAGC  844

seq1  TATATGTTAACAATTTAATATATGAGTGCAAAATTAATGTTTTGGCCCAT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTTAACAATTTAATATATGAGTGCAAAATTAATGTTTTGGCCCAT  894

seq1  TGACCAAAGCTAATGAAGGTATCGATGCATGGCTTCGGTATGATAGAATC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAAGCTAATGAAGGTATCGATGCATGGCTTCGGTATGATAGAATC  944

seq1  TTTAAGATAATTACAGTTGATTAGAGACACTCAGATTTAATAGAATTTCG  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGATAATTACAGTTGATTAGAGACACTCAGATTTAATAGAATTTCG  994

seq1  TGGAAGACAAAGGAGAATCTTAAAGAAGTGTATCCAATGGTAGGAAGTTT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGACAAAGGAGAATCTTAAAGAAGTGTATCCAATGGTAGGAAGTTT  1044

seq1  TGCAAATGTGCATGCTGATACAATCAGCACAAGTATGTATGAACAAATTT  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATGTGCATGCTGATACAATCAGCACAAGTATGTATGAACAAATTT  1094

seq1  CAAGGAGGGAATTACTAGGGTTCTTATACTCTACACTTGAACCCCCAAAT  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAGGGAATTACTAGGGTTCTTATACTCTACACTTGAACCCCCAAAT  1144

seq1  TGACTAGCACCATTTATCCCCCAATTTGCAACCACTTTAAAATATACAGA  1192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAGCACCATTTATCCCCCAATTTGCAACCACTTTAAAATATACAGA  1194

seq1  ATTC  1196
      ||||
seq2  ATTC  1198

seq1: chr8_32750528_32750895
seq2: B6Ng01-328I21.g_68_435

seq1  GAATTCTTAAGTGAAGTCTAATGGTTCATAGAAAATGCACAGGAAAAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAAGTGAAGTCTAATGGTTCATAGAAAATGCACAGGAAAAGAG  50

seq1  GACAGAGATGGATGCCTGTTTTTATTTCACTTGTAGATAATAATTGTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGATGGATGCCTGTTTTTATTTCACTTGTAGATAATAATTGTTCA  100

seq1  TGACGGACATGAAATTCCACTGGAATCACAATGCAGTCTAACACTGCCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGGACATGAAATTCCACTGGAATCACAATGCAGTCTAACACTGCCAA  150

seq1  GTGTCAAAAGTTCCCAGTACTCAATGGAAACCTTCTAATGTCTACAACTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAAAAGTTCCCAGTACTCAATGGAAACCTTCTAATGTCTACAACTA  200

seq1  AGTGGAGGTGCAGAAAGATCCAATGTTCTGGTTTTGGATAAATAGCTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAGGTGCAGAAAGATCCAATGTTCTGGTTTTGGATAAATAGCTCCC  250

seq1  CAAGATCTTATATTCAAAGTCTTGGTATGTGGACTGGTAAGTAGTTCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATCTTATATTCAAAGTCTTGGTATGTGGACTGGTAAGTAGTTCTAT  300

seq1  TGGGAGGTTCTGTTGGACCTTTAAGAAGGAAGCTCCAGTGTGTGTGTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGTTCTGTTGGACCTTTAAGAAGGAAGCTCCAGTGTGTGTGTGGG  350

seq1  TGTGTGTATGTGTGTGTG  368
      ||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATGTGTGTGTG  368