BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-332K10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 36,179,387 - 36,283,235
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666797, LOC666804
Upstream geneMboat4, Leprotl1, LOC666694, Tmem66, LOC619780, LOC666718, EG234159, LOC666746, Dusp4, LOC675578, Tnks, LOC666792
Downstream genePpp1r3b, Thex1, Mfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23, LOC671641, D8Ertd82e, Lonrf1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-332K10.bB6Ng01-332K10.g
ACCGA118693GA118694
length1,0671,138
definitionB6Ng01-332K10.b B6Ng01-332K10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,282,175 - 36,283,235)(36,179,387 - 36,180,535)
sequence
gaattctgccttaaaaaataagagctggggctgaagagatagctctgtgc
ttaagagcactggctgttcttttagaggacctggtttgggtctctgcatg
tacaaagaggctcaaaccatctttaattccacttccaggaaatctagtgc
cttttgcaggcttccctgggtaccaggcatgcgcacaagtggtttgcagg
catacatgcatcaaaacacccattcgcatgaaataaaaactttaaagtga
agactattataaatcagtggttgaatgcttgcatagtatacttaaggccc
tgggtttaatgtccaacaccacagaaaggggagaaagttatgttaggcat
cagcgtgtcttacagcatctgctatcatttgagtctgaattatcccatga
aatcctacctgctaaaggtttggtccctagcccacagcactgttgagaag
tggtagaacctttaggaaatggggttcactggatagaagttaaatcactg
ggggtgtggtcatgaaggggatgctgagatccaagctgcttcctatctct
ctgtgcttctgtttgagacgaggtatctgggcctcttctgccatgtcata
gcatcacagcccaaagcagcggggccaagtaatcatgggatacaacctct
aaagccatgaaccttcttcttaggttgattacctcaacctgcggtgtttt
gtcactgcagtggtaggaggttaagatggggcctaaggtgccttcacaga
gtaaagaacgaacttttgttttgggaggttcctatctccatattttaata
tctctgtttaaacatctgatggactgaaataacagcattggaaagctgta
gctgcagacatttggccaggagaacaaacttagggtagggccatttctta
tttagaaatttgggggggggggggctggaagacttggctcacagataaca
gcactgactcgctctttcaaaggtcctgagttcagaattcctacaactac
ttggtggctcaccaaccatccgttaccaaatcttgatgccctcctctgga
atggtctgagacagcta
gaattcacctttgataaggagaagccatatcaacccccttcccctcagcc
aataaacaatgaaaaatacccagtactgcctgcatcagagcacggaaaga
gatggagctgtcttcttcaaggatgaatgttgactgatgagtgggttttg
tccgttccatttctgacatgttggctcttgggagccatgtgcggttgctg
atggcgcgccatactttcggttagagcaagagagccgagcggagagcgag
cgacagattctgccttcgcagacagtgtgacctagcacagatttgtggga
tgtgacagtttccaacgccgtgggcctcattgatttgtccttttcctgtc
tgcaagatctcatgtgtggaggttttagaagattgctaatggcaagccgg
ggaatctcgtcaagggctctttcttttgagaataaatagctgtagtctct
tcttgcctggctgctgctcatcttttctgtaggcactgtgaggatagagg
agcatcctgtcgatccagtttcctttatgcagacagctatccttctccct
cgcagcttacaatcttccattttctgtttcttatttgtttttaaggagcc
tctcaactaagaatagactttaattcttaaaccttaaatttttatttctt
aaaaattaacctgtctgttaattctcatcccatcctgatataccctctgg
ggaagactctccccaacccacgtgaagtcagttgtcttcttcatagaaga
gaggagatgtcacagtggtttgaagaagactgtgaaggtctagaagtcaa
tcagcagacagaagccacacagcttctcaaaaaaaaaggcgactcatgcc
tacctctgatgtttaccaacactgtagccttgcacaaactgcctacattt
tctaagatcacgcatgcatctataaaataaggaaatattacagcccagct
tatggggctgaagcccccagatcctggtgtctcagggcttttgtgcagtg
ctggcacatagacctctcactgtcatgaacccttgtggtcatcttcatca
tatagactagcaaagagacttctgatgagcctgaaagctagaacccaatt
tcgatgaagcttccactccctgacttccaatcaatttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_36282175_36283235
seq2: B6Ng01-332K10.b_49_1115 (reverse)

seq1  TAGCTGTCTTCAGA-CACTCCAGAAGAGGGCATC-AGATTTTGTTACGGA  48
      |||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||| || |||||
seq2  TAGCTGTC-TCAGACCATTCCAGAGGAGGGCATCAAGATTTGGTAACGGA  49

seq1  TGGTT-GTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATT-TGAACTCAGGACCTTT  96
      ||||| ||||||||||| || ||||  || ||| ||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGTGAGCCACCAAGTAGTTGTAGGAATTCTGAACTCAGGACCTTT  99

seq1  GGAAGAGC-AGTCAGTGCTCTTATCTGCTGAGCCATGTC-TCCAG--CCC  142
      | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  |||
seq2  GAAAGAGCGAGTCAGTGCTGTTATCTG-TGAGCCAAGTCTTCCAGCCCCC  148

seq1  CCCCCCCCAAATTTCTAAATAAGAAATGGCCCTACCCTAAGTTTGTTCTC  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCAAATTTCTAAATAAGAAATGGCCCTACCCTAAGTTTGTTCTC  198

seq1  CTGGCCAAATGTCTGCAGCTACAGCTTTCCAATGCTGTTATTTCAGTCCA  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCAAATGTCTGCAGCTACAGCTTTCCAATGCTGTTATTTCAGTCCA  248

seq1  TCAGATGTTTAAACAGAGATATTAAAATATGGAGATAGGAACCTCCCAAA  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATGTTTAAACAGAGATATTAAAATATGGAGATAGGAACCTCCCAAA  298

seq1  ACAAAAGTTCGTTCTTTACTCTGTGAAGGCACCTTAGGCCCCATCTTAAC  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAGTTCGTTCTTTACTCTGTGAAGGCACCTTAGGCCCCATCTTAAC  348

seq1  CTCCTACCACTGCAGTGACAAAACACCGCAGGTTGAGGTAATCAACCTAA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACCACTGCAGTGACAAAACACCGCAGGTTGAGGTAATCAACCTAA  398

seq1  GAAGAAGGTTCATGGCTTTAGAGGTTGTATCCCATGATTACTTGGCCCCG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGGTTCATGGCTTTAGAGGTTGTATCCCATGATTACTTGGCCCCG  448

seq1  CTGCTTTGGGCTGTGATGCTATGACATGGCAGAAGAGGCCCAGATACCTC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTGGGCTGTGATGCTATGACATGGCAGAAGAGGCCCAGATACCTC  498

seq1  GTCTCAAACAGAAGCACAGAGAGATAGGAAGCAGCTTGGATCTCAGCATC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAAACAGAAGCACAGAGAGATAGGAAGCAGCTTGGATCTCAGCATC  548

seq1  CCCTTCATGACCACACCCCCAGTGATTTAACTTCTATCCAGTGAACCCCA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCATGACCACACCCCCAGTGATTTAACTTCTATCCAGTGAACCCCA  598

seq1  TTTCCTAAAGGTTCTACCACTTCTCAACAGTGCTGTGGGCTAGGGACCAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTAAAGGTTCTACCACTTCTCAACAGTGCTGTGGGCTAGGGACCAA  648

seq1  ACCTTTAGCAGGTAGGATTTCATGGGATAATTCAGACTCAAATGATAGCA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTAGCAGGTAGGATTTCATGGGATAATTCAGACTCAAATGATAGCA  698

seq1  GATGCTGTAAGACACGCTGATGCCTAACATAACTTTCTCCCCTTTCTGTG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGTAAGACACGCTGATGCCTAACATAACTTTCTCCCCTTTCTGTG  748

seq1  GTGTTGGACATTAAACCCAGGGCCTTAAGTATACTATGCAAGCATTCAAC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGGACATTAAACCCAGGGCCTTAAGTATACTATGCAAGCATTCAAC  798

seq1  CACTGATTTATAATAGTCTTCACTTTAAAGTTTTTATTTCATGCGAATGG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATTTATAATAGTCTTCACTTTAAAGTTTTTATTTCATGCGAATGG  848

seq1  GTGTTTTGATGCATGTATGCCTGCAAACCACTTGTGCGCATGCCTGGTAC  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTGATGCATGTATGCCTGCAAACCACTTGTGCGCATGCCTGGTAC  898

seq1  CCAGGGAAGCCTGCAAAAGGCACTAGATTTCCTGGAAGTGGAATTAAAGA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAAGCCTGCAAAAGGCACTAGATTTCCTGGAAGTGGAATTAAAGA  948

seq1  TGGTTTGAGCCTCTTTGTACATGCAGAGACCCAAACCAGGTCCTCTAAAA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGAGCCTCTTTGTACATGCAGAGACCCAAACCAGGTCCTCTAAAA  998

seq1  GAACAGCCAGTGCTCTTAAGCACAGAGCTATCTCTTCAGCCCCAGCTCTT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGCCAGTGCTCTTAAGCACAGAGCTATCTCTTCAGCCCCAGCTCTT  1048

seq1  ATTTTTTAAGGCAGAATTC  1061
      |||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTAAGGCAGAATTC  1067

seq1: chr8_36179387_36180535
seq2: B6Ng01-332K10.g_67_1204

seq1  GAATTCACCTTTGATAAGGAGAAGCCATATCAACCCCCTTCCCCTCAGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTTTGATAAGGAGAAGCCATATCAACCCCCTTCCCCTCAGCC  50

seq1  AATAAACAATGAAAAATACCCAGTACTGCCTGCATCAGAGCACGGAAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACAATGAAAAATACCCAGTACTGCCTGCATCAGAGCACGGAAAGA  100

seq1  GATGGAGCTGTCTTCTTCAAGGATGAATGTTGACTGATGAGTGGGTTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAGCTGTCTTCTTCAAGGATGAATGTTGACTGATGAGTGGGTTTTG  150

seq1  TCCGTTCCATTTCTGACATGTTGGCTCTTGGGAGCCATGTGCGGTTGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGTTCCATTTCTGACATGTTGGCTCTTGGGAGCCATGTGCGGTTGCTG  200

seq1  ATGGCGCGCCATACTTTCGGTTAGAGCAAGAGAGCCGAGCGGAGAGCGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCGCGCCATACTTTCGGTTAGAGCAAGAGAGCCGAGCGGAGAGCGAG  250

seq1  CGACAGATTCTGCCTTCGCAGACAGTGTGACCTAGCACAGATTTGTGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACAGATTCTGCCTTCGCAGACAGTGTGACCTAGCACAGATTTGTGGGA  300

seq1  TGTGACAGTTTCCAACGCCGTGGGCCTCATTGATTTGTCCTTTTCCTGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAGTTTCCAACGCCGTGGGCCTCATTGATTTGTCCTTTTCCTGTC  350

seq1  TGCAAGATCTCATGTGTGGAGGTTTTAGAAGATTGCTAATGGCAAGCCGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGATCTCATGTGTGGAGGTTTTAGAAGATTGCTAATGGCAAGCCGG  400

seq1  GGAATCTCGTCAAGGGCTCTTTCTTTTGAGAATAAATAGCTGTAGTCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCTCGTCAAGGGCTCTTTCTTTTGAGAATAAATAGCTGTAGTCTCT  450

seq1  TCTTGCCTGGCTGCTGCTCATCTTTTCTGTAGGCACTGTGAGGATAGAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCCTGGCTGCTGCTCATCTTTTCTGTAGGCACTGTGAGGATAGAGG  500

seq1  AGCATCCTGTCGATCCAGTTTCCTTTATGCAGACAGCTATCCTTCTCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCTGTCGATCCAGTTTCCTTTATGCAGACAGCTATCCTTCTCCCT  550

seq1  CGCAGCTTACAATCTTCCATTTTCTGTTTCTTATTTGTTTTTAAGGAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGCTTACAATCTTCCATTTTCTGTTTCTTATTTGTTTTTAAGGAGCC  600

seq1  TCTCAACTAAGAATAGACTTTAATTCTTAAACCTTAAATTTTTATTTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAACTAAGAATAGACTTTAATTCTTAAACCTTAAATTTTTATTTCTT  650

seq1  AAAAATTAACCTGTCTGTTAATTCTCATCCCATCCTGATATACCCTCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTAACCTGTCTGTTAATTCTCATCCCATCCTGATATACCCTCTGG  700

seq1  GGAAGACTCTCCCCAACCCACGTGAAGTCAGTTGTCTTCTTCATAGAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGACTCTCCCCAACCCACGTGAAGTCAGTTGTCTTCTTCATAGAAGA  750

seq1  GAGGAGATGTCACAGTGGTTTGAAGAAGACTGTGAAGGTCTAGAAGTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGATGTCACAGTGGTTTGAAGAAGACTGTGAAGGTCTAGAAGTCAA  800

seq1  TCAGCAGACAGAAGCCACACAGCTTCTCAAAAAAAAAGGCGACTCATGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGACAGAAGCCACACAGCTTCTCAAAAAAAAAGGCGACTCATGCC  850

seq1  TACCTCTGATGTTTACCAACACTGTAGCCTTGCACAAACTGCCTACATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCTGATGTTTACCAACACTGTAGCCTTGCACAAACTGCCTACATTT  900

seq1  TCTAAGATCACGCATGCATCTATAAAATAAGGGAAATATTACAGCCCAGC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGATCACGCATGCATCTATAAAATAA-GGAAATATTACAGCCCAGC  949

seq1  TTATGGGGCTGAAGCCCCCAGGATCCTGGTGTCTCAGGGCTTTTGTGCAG  1000
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGGGCTGAAGCCCCCA-GATCCTGGTGTCTCAGGGCTTTTGTGCAG  998

seq1  TGCTTGGCACATAGACCTCTCACTGTCATGAACCCTTGTGGTTCATC-TC  1049
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  TGC-TGGCACATAGACCTCTCACTGTCATGAACCCTTGTGG-TCATCTTC  1046

seq1  ATCATTATTAGACTAGCAAAGAGGACTTCTGATGGAGCTGGAAAGCTAGG  1099
      |||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |
seq2  ATCAT--ATAGACTAGCAAAGA-GACTTCTGAT-GAGCCTGAAAGCTA-G  1091

seq1  AACCCATTTTTTCGATGGTAGCTCCCAC-CCCTGACTTCCCATTCAATTT  1148
      ||||||   ||||||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||
seq2  AACCCA--ATTTCGAT-GAAGCTTCCACTCCCTGACTT-CCAATCAATTT  1137

seq1  C  1149
      |
seq2  C  1138