BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-344H10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,352,212 - 118,495,076
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneWwox, Maf
Downstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-344H10.bB6Ng01-344H10.g
ACCGA126943GA126944
length5101,123
definitionB6Ng01-344H10.b B6Ng01-344H10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,494,561 - 118,495,076)(118,352,212 - 118,353,330)
sequence
accaagtagtctagactatctttctagggaccctaagactctacttgtct
ttgctctgacatccagcatggcctcctttaaaaactggcttctggagatt
gaaatcaaggcctcacacatgccaggccaacactttaccaactgagttat
ccttttagcgtattattttctcttatacccttatctttttagggtgagca
aaagttcctgcttacttgggattggagacctaccagttttcaacctcgga
tagtgttgggaagacattaacaagttagtcactctgtctgtcccggtcca
gtgcattccagtttccagtcaagatttgtccaagtcttgtagcagtagac
acttaaacatgattaggcctttgcgccaagatgatgcttgacaggtttgg
gtcagttcaatccttctgggctgattcttcattgttgtgtatgggcactt
ggactaatggcttcccagaagtgggtgtggttaaagtgggaggagactga
aggggaaggt

gaattcttattaatggaagacaccaaagatgaagttaatcaaaaacaaat
attagaatagaatagttgcacctttcagaatacgcagttgggtataagtg
atgggaaacatcaaaagttaacaagaaaggggtcatccaatccaacacac
atagcggaaagggctgtggaaggcaattcacagaggtggagagccaggag
tatgatgtaatggggcaaggcatttcaacttagcaaagcttcagatagag
gccaagtgtagtcagtgagaaacaactttagagccatcagatggcccaat
atgaaaaagccaaatgcctccaagtatagacccgaggtaacagagtatat
gcactatggtctgctgcgagattcgtactggatgtgtctgccattgggac
accagtaagagatgggttctctgagaggtgatttggtcatgggggctcta
ccatcctgaagcgattgatgctattatcacgagaatggggattgttactg
aagatatctctctctctcttctctctctctctctctctctctctctctct
ctctctctctctctctctctccatatcattccccacagctctttcacatt
tcttcccccacacagccaaagttctgacacagcaagaagacccttatagc
tgtggccctacatagactccagaactgtgaactacatacacatctgctgt
gtataatttacatagtctgtagatgctgttgaagcaggaaaggagaaaaa
cacatgactcaccacataagcttaactctaaagagtaacctgaccaaaag
tgagcattcctgtccctactccacttcctgaacatcctaggactccttgc
ttatgtttaaggaagagaatgtgggcaggtcttacgggttctgttgccag
cgagatgaccaggctaggaacatcctttccggaaagaggaggttaatgaa
gtagccagccttaacttggtggcaaggagctaacagtaagcacaggctgt
cccagtgacgtggaaactttcgacaagcaggtgctctatcaggactttag
agtgccttcaactgaacccatgaaatggagaagggatcaatctagaagaa
tccaagattgtaccaagggaggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_118494561_118495076
seq2: B6Ng01-344H10.b_49_564 (reverse)

seq1  ACCTTCCCCTTCAGTCTCCTCCCACTTTAACCACACCCACTTCTGGGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCCCTTCAGTCTCCTCCCACTTTAACCACACCCACTTCTGGGAAG  50

seq1  CCATTAGTCCAAGTGCCCATACACAACAATGAAGAATCAGCCCAGAAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTAGTCCAAGTGCCCATACACAACAATGAAGAATCAGCCCAGAAGGA  100

seq1  TTGAACTGACCCAAACCTGTCAAGCATCATCTTGGCGCAAAGGCCTAATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTGACCCAAACCTGTCAAGCATCATCTTGGCGCAAAGGCCTAATC  150

seq1  ATGTTTAAGTGTCTACTGCTACAAGACTTGGACAAATCTTGACTGGAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTAAGTGTCTACTGCTACAAGACTTGGACAAATCTTGACTGGAAAC  200

seq1  TGGAATGCACTGGACCGGGACAGACAGAGTGACTAACTTGTTAATGTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATGCACTGGACCGGGACAGACAGAGTGACTAACTTGTTAATGTCTT  250

seq1  CCCAACACTATCCGAGGTTGAAAACTGGTAGGTCTCCAATCCCAAGTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACACTATCCGAGGTTGAAAACTGGTAGGTCTCCAATCCCAAGTAAG  300

seq1  CAGGAACTTTTGCTCACCCTAAAAAGATAAGGGTATAAGAGAAAATAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACTTTTGCTCACCCTAAAAAGATAAGGGTATAAGAGAAAATAATA  350

seq1  CGCTAAAAGGATAACTCAGTTGGTAAAGTGTTGGCCTGGCATGTGTGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTAAAAGGATAACTCAGTTGGTAAAGTGTTGGCCTGGCATGTGTGAGG  400

seq1  CCTTGATTTCAATCTCCAGAAGCCAGTTTTTAAAGGAGGCCATGCTGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGATTTCAATCTCCAGAAGCCAGTTTTTAAAGGAGGCCATGCTGGAT  450

seq1  GTCAGAGCAAAGACAAGTAGAGTCTTAGGGTCCCTAGAAAGATAGTCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGAGCAAAGACAAGTAGAGTCTTAGGGTCCCTAGAAAGATAGTCTAG  500

seq1  ACTACTTGGTGAATTC  516
      ||||||||||||||||
seq2  ACTACTTGGTGAATTC  516


seq1: chr8_118352212_118353330
seq2: B6Ng01-344H10.g_63_1185

seq1  GAATTCTTATTAATGGAAGACACCAAAGATGAAGTTAATCAAAAACAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATTAATGGAAGACACCAAAGATGAAGTTAATCAAAAACAAAT  50

seq1  ATTAGAATAGAATAGTTGCACCTTTCAGAATACGCAGTTGGGTATAAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAATAGAATAGTTGCACCTTTCAGAATACGCAGTTGGGTATAAGTG  100

seq1  ATGGGAAACATCAAAAGTTAACAAGAAAGGGGTCATCCAATCCAACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAAACATCAAAAGTTAACAAGAAAGGGGTCATCCAATCCAACACAC  150

seq1  ATAGCGGAAAGGGCTGTGGAAGGCAATTCACAGAGGTGGAGAGCCAGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCGGAAAGGGCTGTGGAAGGCAATTCACAGAGGTGGAGAGCCAGGAG  200

seq1  TATGATGTAATGGGGCAAGGCATTTCAACTTAGCAAAGCTTCAGATAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATGTAATGGGGCAAGGCATTTCAACTTAGCAAAGCTTCAGATAGAG  250

seq1  GCCAAGTGTAGTCAGTGAGAAACAACTTTAGAGCCATCAGATGGCCCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTGTAGTCAGTGAGAAACAACTTTAGAGCCATCAGATGGCCCAAT  300

seq1  ATGAAAAAGCCAAATGCCTCCAAGTATAGACCCGAGGTAACAGAGTATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAAAGCCAAATGCCTCCAAGTATAGACCCGAGGTAACAGAGTATAT  350

seq1  GCACTATGGTCTGCTGCGAGATTCGTACTGGATGTGTCTGCCATTGGGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATGGTCTGCTGCGAGATTCGTACTGGATGTGTCTGCCATTGGGAC  400

seq1  ACCAGTAAGAGATGGGTTCTCTGAGAGGTGATTTGGTCATGGGGGCTCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTAAGAGATGGGTTCTCTGAGAGGTGATTTGGTCATGGGGGCTCTA  450

seq1  CCATCCTGAAGCGATTGATGCTATTATCACGAGAATGGGGATTGTTACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTGAAGCGATTGATGCTATTATCACGAGAATGGGGATTGTTACTG  500

seq1  AAGATATCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATATCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  550

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATATCATTCCCCACAGCTCTTTCACATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATATCATTCCCCACAGCTCTTTCACATT  600

seq1  TCTTCCCCCACACAGCCAAAGTTCTGACACAGCAAGAAGACCCTTATAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCCCCACACAGCCAAAGTTCTGACACAGCAAGAAGACCCTTATAGC  650

seq1  TGTGGCCCTACATAGACTCCAGAACTGTGAACTACATACACATCTGCTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCCCTACATAGACTCCAGAACTGTGAACTACATACACATCTGCTGT  700

seq1  GTATAATTTACATAGTCTGTAGATGCTGTTGAAGCAGGAAAGGAGAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATTTACATAGTCTGTAGATGCTGTTGAAGCAGGAAAGGAGAAAAA  750

seq1  CACATGACTCACCACATAAGCTTAACTCTAAAGAGTAACCTGACCAAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGACTCACCACATAAGCTTAACTCTAAAGAGTAACCTGACCAAAAG  800

seq1  TGAGCATTCCTGTCCCTAACTCCACTTCCTGAACATCCTAGGACTCCTTG  850
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTCCTGTCCCT-ACTCCACTTCCTGAACATCCTAGGACTCCTTG  849

seq1  CTTATGTTTAGGAAAGAGAATGTGGCAGGGTCTTACGGG-TCTG-TGCCA  898
      |||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||
seq2  CTTATGTTTAAGGAAGAGAATGTGGGCAGGTCTTACGGGTTCTGTTGCCA  899

seq1  GCGAGATGA-CAGGCTAGGAACATCC-TTCCGGAAAAGAGAGGTTAATGA  946
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||
seq2  GCGAGATGACCAGGCTAGGAACATCCTTTCCGGAAAGAGGAGGTTAATGA  949

seq1  AGTAGCCAAGCCATAAACTTGGT-GCAAGGAGCTAACAGTAAGCACCAGG  995
      ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGTAGCC-AGCC-TTAACTTGGTGGCAAGGAGCTAACAGTAAGCA-CAGG  996

seq1  CTGTCCCAGTGACGT-GAAACTTTCGACAAAGCA-GTGCTCTAATCAAGA  1043
      ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||
seq2  CTGTCCCAGTGACGTGGAAACTTTCGAC-AAGCAGGTGCTCT-ATCAGGA  1044

seq1  CTTTAGA-TGCCTTCAACTGAGACCCATGAAAT-GAGAAGGGATCAATCT  1091
      ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTTTAGAGTGCCTTCAACTGA-ACCCATGAAATGGAGAAGGGATCAATCT  1093

seq1  AGAAG-ATCCAAGATTGTAACAA-GGAGGT  1119
      ||||| ||||||||||||| ||| ||||||
seq2  AGAAGAATCCAAGATTGTACCAAGGGAGGT  1123


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |