BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-344O15
Chromosome8 (Build37)
Map Location 67,602,547 - 67,679,001
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665388, LOC665396
Upstream geneTll1, LOC100040989, Cpe, Sc4mol, Klhl2, LOC100040903, LOC619647, 3110005G23Rik, Trim75, Trim60
Downstream geneLOC100040949, LOC665405, Vaultrc-ps1, LOC100040967, March1, LOC100040986
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-344O15.bB6Ng01-344O15.g
ACCGA127275GA127276
length9161,125
definitionB6Ng01-344O15.b B6Ng01-344O15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,602,547 - 67,603,462)(67,677,951 - 67,679,001)
sequence
gaattcaaggccaagcctggtctacagagtgagttccaggacagccagag
ctacacagagaaaccctgtctcgaaaaaaccaaaaatcagaacaaaacaa
aacaaaaaacccaatacaaaaacaaaaaacaaaaaacaaaaaacaaaaaa
caaaaaacaaaaaacaattaaacaatccagagcaaccatatccctctagt
gttataaactctcttctgggctgtcttcttagccatcctccagagtggtt
acagggcaggcctggtacagtgtaagggatttgaatgccaatgtggccaa
gcctgtgaagatgagcccagcctgagatgtgtgtggccatctcagagata
tcagatttattttcaggatcttgttggtggctttcagggattaacttgac
cgtcaaggcaggagggtacctggtaggataaggtgtgcaggaggggtaga
gagggtgactgggggttagctgactattgagcagatgagaaagaaaaaga
tttatttttgttgtatatgattgacggtttgtctgattgtatgtctgtgt
ctcttgtgttcgcctgatgcctgcagaggacagaaaaggaccaggaatcc
cttgggacatggaattagatatggttgtgaaccaccacgtgaatggtaag
gactgaatcctttgaaagaaacaacaagtgctcttaacctctgagccaat
tctctagacccaagaacagatgtttggcaaaggtcactggcagccagcaa
atggaagagagccttgttggaagaagtatgttatgttagggttggtctta
gagaccctcctcctagccatatgggagtcagtcatctcctagctgcctca
gatgaagatgtagaactctcagctctgcctgcaccattgcctgcctggat
gttgccatggttccac
gaattcttttgttaagtgagctctcaagtgtgggactatctgatggtgat
tctattatttaaccaacatagcaattagaaattgccctaccacactttat
gttcatggacatatcaaaaccttgttaggagacagaattttttttaaatt
ttattatttactcactttacatcctgctcactgccccaccttttcaatca
ccctcctaaatccttccccctttccccccaccccctcccccctccccttc
tcctctgagtgggtggaagtcctgactatcccccaactctgccactccaa
gggagacaagttgtatcttgattcgatatttatttgtttaataagtcatc
agaaatcattgagtgaagatgagattgagccatctgactgcaagaaaatg
aacattatgagacgtttttaatgtaatttaatcatatactaatcagactg
gggagggggtttaaagagacctggttttactgtgttagcccagactcgcc
caaaaacttccaggctctagagatcttcacagctcagatttcagagcgct
ttggcaacaagcaaatgttaccacacacagcttggtatgactgactggac
attaactacatttttatgtgtgaggaaaattggggctcagagaaattaat
actgtggtgtcagggaaatattggtgatccccaaaaacacagacaggagc
caatctgatcaactcacaacagggtctttattctattcaatctaggtcgc
ctccccccattcactgctgtcatgaaggatagttttggtgctaggggagc
cccaaatatctatcagggcaaggtttttgtagtaagcagcaagcaagggc
taactgtgcaagcatctaattggaaagctactgtggcctttaacataatt
ggctggtgctgggagtcatatcataaacttaattttgctccctcttcatt
ggtgatcattaggcttgtaacatggggggtgcagtttggtgggggaataa
ctgagactctggtcttgtgaagggtgcacctggagatgctggtcttattg
ggaattagcccaagactgagtagcctgggatttttcgggaggagggggca
acttggaaacctttctaggtcatcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_67602547_67603462
seq2: B6Ng01-344O15.b_47_962

seq1  GAATTCAAGGCCAAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGAG  50

seq1  CTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAACCAAAAATCAGAACAAAACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAACCAAAAATCAGAACAAAACAA  100

seq1  AACAAAAAACCCAATACAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAACCCAATACAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAA  150

seq1  CAAAAAACAAAAAACAATTAAACAATCCAGAGCAACCATATCCCTCTAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAACAAAAAACAATTAAACAATCCAGAGCAACCATATCCCTCTAGT  200

seq1  GTTATAAACTCTCTTCTGGGCTGTCTTCTTAGCCATCCTCCAGAGTGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATAAACTCTCTTCTGGGCTGTCTTCTTAGCCATCCTCCAGAGTGGTT  250

seq1  ACAGGGCAGGCCTGGTACAGTGTAAGGGATTTGAATGCCAATGTGGCCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGCAGGCCTGGTACAGTGTAAGGGATTTGAATGCCAATGTGGCCAA  300

seq1  GCCTGTGAAGATGAGCCCAGCCTGAGATGTGTGTGGCCATCTCAGAGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGAAGATGAGCCCAGCCTGAGATGTGTGTGGCCATCTCAGAGATA  350

seq1  TCAGATTTATTTTCAGGATCTTGTTGGTGGCTTTCAGGGATTAACTTGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATTTATTTTCAGGATCTTGTTGGTGGCTTTCAGGGATTAACTTGAC  400

seq1  CGTCAAGGCAGGAGGGTACCTGGTAGGATAAGGTGTGCAGGAGGGGTAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCAAGGCAGGAGGGTACCTGGTAGGATAAGGTGTGCAGGAGGGGTAGA  450

seq1  GAGGGTGACTGGGGGTTAGCTGACTATTGAGCAGATGAGAAAGAAAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTGACTGGGGGTTAGCTGACTATTGAGCAGATGAGAAAGAAAAAGA  500

seq1  TTTATTTTTGTTGTATATGATTGACGGTTTGTCTGATTGTATGTCTGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTTGTTGTATATGATTGACGGTTTGTCTGATTGTATGTCTGTGT  550

seq1  CTCTTGTGTTCGCCTGATGCCTGCAGAGGACAGAAAAGGACCAGGAATCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTGTTCGCCTGATGCCTGCAGAGGACAGAAAAGGACCAGGAATCC  600

seq1  CTTGGGACATGGAATTAGATATGGTTGTGAACCACCACGTGAATGGTAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGACATGGAATTAGATATGGTTGTGAACCACCACGTGAATGGTAAG  650

seq1  GACTGAATCCTTTGAAAGAAACAACAAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGAATCCTTTGAAAGAAACAACAAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCAAT  700

seq1  TCTCTAGACCCAAGAACAGATGTTTGGCAAAGGTCACTGGCAGCCAGCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGACCCAAGAACAGATGTTTGGCAAAGGTCACTGGCAGCCAGCAA  750

seq1  ATGGAAGAGAGCCTTGTTGGAAGAAGTATGTTATGTTAGGGTTGGTCTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGAGAGCCTTGTTGGAAGAAGTATGTTATGTTAGGGTTGGTCTTA  800

seq1  GAGACCCTCCTCCTAGCCATATGGGAGTCAGTCATCTCCTAGCTGCCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAGACCCTCCTCCTAGCCATATGGGAGTCAGTCATCTCCTAGCTGCC-TC  849

seq1  AGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTGCACCA-TGCCTGCCTGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTGCACCATTGCCTGCCTGGA  899

seq1  TGTTGCCATGGTCCCAC  916
      |||||||||||| ||||
seq2  TGTTGCCATGGTTCCAC  916

seq1: chr8_67677951_67679001
seq2: B6Ng01-344O15.g_153_1193 (reverse)

seq1  GGATGGTACCTAGAAAAAGTTTCCAAGTTGCCCCCTCCTCCCCAAAAAAT  50
      |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||
seq2  GGATG--ACCTAG-AAAGGTTTCCAAGTTGCCCCCTCCT-CCCGAAAAAT  46

seq1  CCAAGCCTAACTCCAGTCTCTGGGCTAATCCCCAATAAGACCAGCATCTC  100
      || || || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCT-ACT-CAGTCT-TGGGCTAATTCCCAATAAGACCAGCATCTC  93

seq1  CAGGTTGCACCCTCAACAAGACCAGAGTCTCCAGGTTATTCCCCCACCAA  150
      |||| ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  CAGG-TGCACCCTTCACAAGACCAGAGTCTC--AGTTATTCCCCCACCAA  140

seq1  ACCTGCA-CCCCCATGTTACAAGCCTAATGATCACCAATGAAGAGGGGAG  199
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  A-CTGCACCCCCCATGTTACAAGCCTAATGATCACCAATGAAGA-GGGAG  188

seq1  CAAAATTAAGTTTATGATATGACTCCCAGCACCAGCCAATTATGTTAAAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTAAGTTTATGATATGACTCCCAGCACCAGCCAATTATGTTAAAG  238

seq1  GCCACAGTAGCTTTCCAATTAGATGCTTGCACAGTTAGCCCTTGCTTGCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACAGTAGCTTTCCAATTAGATGCTTGCACAGTTAGCCCTTGCTTGCT  288

seq1  GCTTACTAC-AAAACCTTGCCCTGATAGATATTTGGGGCTCCCCTAGCAC  348
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTACTACAAAAACCTTGCCCTGATAGATATTTGGGGCTCCCCTAGCAC  338

seq1  CAAAACTATCCTTCATGACAGCAGTGAATGGGGGGAGGCGACCTAGATTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACTATCCTTCATGACAGCAGTGAATGGGGGGAGGCGACCTAGATTG  388

seq1  AATAGAATAAAGACCCTGTTGTGAGTTGATCAGATTGGCTCCTGTCTGTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAATAAAGACCCTGTTGTGAGTTGATCAGATTGGCTCCTGTCTGTG  438

seq1  TTTTTGGGGATCACCAATATTTCCCTGACACCACAGTATTAATTTCTCTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGGGGATCACCAATATTTCCCTGACACCACAGTATTAATTTCTCTG  488

seq1  AGCCCCAATTTTCCTCACACATAAAAATGTAGTTAATGTCCAGTCAGTCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAATTTTCCTCACACATAAAAATGTAGTTAATGTCCAGTCAGTCA  538

seq1  TACCAAGCTGTGTGTGGTAACATTTGCTTGTTGCCAAAGCGCTCTGAAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAGCTGTGTGTGGTAACATTTGCTTGTTGCCAAAGCGCTCTGAAAT  588

seq1  CTGAGCTGTGAAGATCTCTAGAGCCTGGAAGTTTTTGGGCGAGTCTGGGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTGTGAAGATCTCTAGAGCCTGGAAGTTTTTGGGCGAGTCTGGGC  638

seq1  TAACACAGTAAAACCAGGTCTCTTTAAACCCCCTCCCCAGTCTGATTAGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACAGTAAAACCAGGTCTCTTTAAACCCCCTCCCCAGTCTGATTAGT  688

seq1  ATATGATTAAATTACATTAAAAACGTCTCATAATGTTCATTTTCTTGCAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATTAAATTACATTAAAAACGTCTCATAATGTTCATTTTCTTGCAG  738

seq1  TCAGATGGCTCAATCTCATCTTCACTCAATGATTTCTGATGACTTATTAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATGGCTCAATCTCATCTTCACTCAATGATTTCTGATGACTTATTAA  788

seq1  ACAAATAAATATCGAATCAAGATACAACTTGTCTCCCTTGGAGTGGCAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATAAATATCGAATCAAGATACAACTTGTCTCCCTTGGAGTGGCAGA  838

seq1  GTTGGGGGATAGTCAGGACTTCCACCCACTCAGAGGAGAAGGGGAGGGGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGGGATAGTCAGGACTTCCACCCACTCAGAGGAGAAGGGGAGGGGG  888

seq1  GAGGGGGTGGGGGGAAAGGGGGAAGGATTTAGGAGGGTGATTGAAAAGGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGGTGGGGGGAAAGGGGGAAGGATTTAGGAGGGTGATTGAAAAGGT  938

seq1  GGGGCAGTGAGCAGGATGTAAAGTGAGTAAATAATAAAATTTAAAAAAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGTGAGCAGGATGTAAAGTGAGTAAATAATAAAATTTAAAAAAAA  988

seq1  TTCTGTCTCCTAACAAGGTTTTGATATGTCCATGAACATAAAGTGTGGTA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTCCTAACAAGGTTTTGATATGTCCATGAACATAAAGTGTGGTA  1038

seq1  GGG  1051
      |||
seq2  GGG  1041