BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-348E15
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,937,707 - 120,077,196
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933407C03Rik, Plcg2
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan
Downstream gene4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6, Cdh13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-348E15.bB6Ng01-348E15.g
ACCGA129627GA129628
length797708
definitionB6Ng01-348E15.b B6Ng01-348E15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,076,400 - 120,077,196)(119,937,707 - 119,938,414)
sequence
gaattcctcgttttcccttcccgttcatcacccacagatgaacacttggt
tctggtgacaaggctgctgtgaagcatctcgggcaagtgctatgttggat
tctcttggggagattgagggctaggaactagttctccatccatcagaccc
ttggggatgctgggatagcagaagacttcaagcccaggccccacaggttg
aaggtcacacttcccaggcctggaggctgcatcaccaagcccttcacatc
cgtgactgacacttccggagtctatggatgagcagcaggtgaagtccatg
ggtagctgaggtgttctcctctctgctcatcgccattcagtgaccaagag
ctcccaggaagagaaaaggccctctccatctatgagagtgtgccgttaag
acatgatcatctgcaaagctgagatgttggtgtggcatctctagtgacat
gcccagcaggaaccctgtaataagcaggctcatcccacagggtgataatc
ctaccacctcaggcacagagcaacataggtaccatatgacctaaggctag
gaaaagaacctagagttgggtagacagactccacagtcctgggttcatcc
aactcacaagacatgatatggctggtgttcaggctgagggactctgagcc
agccagcctgggtttgtcttgcaacctccccatcagcggggtagcttcag
gtagcaatttcactctgcttgcctctgtttccccagatatgaaagtgata
acatcactcagaacttgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgagtgtgtg
gaattcccagccagtctggggtacatgaggccatgtctgggggggcaaaa
aatcaaacaaaagagagatggttcaggatgcctctgtggttaagagtact
tgctactcttacagaggacccaagttcagttcccagcccctaagcagcag
ctctcagctgcatgcatgcagacaaaacactgttacacatagaataaata
catccttttaaaaccccaaaccaacaaagtcctatgcaggggagacgtct
ccctgtccagcaaacaggatgttcacaacaggggcttctcagagagatgc
atgggtgcccacacagcccagcatagggaactgccccagggttggatgat
ataactccgtaaagaaataaaagctttggactcaggtcaggcggaggttc
aggtccccacttcaacaccgtttccttgtgcatcgggtcagtggctgctc
tgtgatcagctccgagtaactcaatcagttagcaggttgtcaagaaaata
aacctgtcgccataaagcaggagctggtgacacagcgcagaggaataaag
gcttttgtggcccagcctgatgacccaacttaagtccccagaatccatag
ggcagaaagagaaaaacaaatcctgtggattgtcctctgaccgccacctg
attggctttgacatgggtgcatcccatgtactatacagatgggtgggtgg
gtgggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_120076400_120077196
seq2: B6Ng01-348E15.b_48_844 (reverse)

seq1  CACACACTCACACACACACAAACACACACACAAGTTCTGAGTGATGTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACTCACACACACACAAACACACACACAAGTTCTGAGTGATGTTAT  50

seq1  CACTTTCATATCTGGGGAAACAGAGGCAAGCAGAGTGAAATTGCTACCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCATATCTGGGGAAACAGAGGCAAGCAGAGTGAAATTGCTACCTG  100

seq1  AAGCTACCCCGCTGATGGGGAGGTTGCAAGACAAACCCAGGCTGGCTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTACCCCGCTGATGGGGAGGTTGCAAGACAAACCCAGGCTGGCTGGC  150

seq1  TCAGAGTCCCTCAGCCTGAACACCAGCCATATCATGTCTTGTGAGTTGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTCCCTCAGCCTGAACACCAGCCATATCATGTCTTGTGAGTTGGA  200

seq1  TGAACCCAGGACTGTGGAGTCTGTCTACCCAACTCTAGGTTCTTTTCCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCCAGGACTGTGGAGTCTGTCTACCCAACTCTAGGTTCTTTTCCTA  250

seq1  GCCTTAGGTCATATGGTACCTATGTTGCTCTGTGCCTGAGGTGGTAGGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTAGGTCATATGGTACCTATGTTGCTCTGTGCCTGAGGTGGTAGGAT  300

seq1  TATCACCCTGTGGGATGAGCCTGCTTATTACAGGGTTCCTGCTGGGCATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACCCTGTGGGATGAGCCTGCTTATTACAGGGTTCCTGCTGGGCATG  350

seq1  TCACTAGAGATGCCACACCAACATCTCAGCTTTGCAGATGATCATGTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAGAGATGCCACACCAACATCTCAGCTTTGCAGATGATCATGTCTT  400

seq1  AACGGCACACTCTCATAGATGGAGAGGGCCTTTTCTCTTCCTGGGAGCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGCACACTCTCATAGATGGAGAGGGCCTTTTCTCTTCCTGGGAGCTC  450

seq1  TTGGTCACTGAATGGCGATGAGCAGAGAGGAGAACACCTCAGCTACCCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCACTGAATGGCGATGAGCAGAGAGGAGAACACCTCAGCTACCCAT  500

seq1  GGACTTCACCTGCTGCTCATCCATAGACTCCGGAAGTGTCAGTCACGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTCACCTGCTGCTCATCCATAGACTCCGGAAGTGTCAGTCACGGAT  550

seq1  GTGAAGGGCTTGGTGATGCAGCCTCCAGGCCTGGGAAGTGTGACCTTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGGGCTTGGTGATGCAGCCTCCAGGCCTGGGAAGTGTGACCTTCAA  600

seq1  CCTGTGGGGCCTGGGCTTGAAGTCTTCTGCTATCCCAGCATCCCCAAGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGGGCCTGGGCTTGAAGTCTTCTGCTATCCCAGCATCCCCAAGGG  650

seq1  TCTGATGGATGGAGAACTAGTTCCTAGCCCTCAATCTCCCCAAGAGAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATGGATGGAGAACTAGTTCCTAGCCCTCAATCTCCCCAAGAGAATC  700

seq1  CAACATAGCACTTGCCCGAGATGCTTCACAGCAGCCTTGTCACCAGAACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATAGCACTTGCCCGAGATGCTTCACAGCAGCCTTGTCACCAGAACC  750

seq1  AAGTGTTCATCTGTGGGTGATGAACGGGAAGGGAAAACGAGGAATTC  797
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTCATCTGTGGGTGATGAACGGGAAGGGAAAACGAGGAATTC  797

seq1: chr8_119937707_119938414
seq2: B6Ng01-348E15.g_69_776

seq1  GAATTCCCAGCCAGTCTGGGGTACATGAGGCCATGTCTGGGGGGGCAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGCCAGTCTGGGGTACATGAGGCCATGTCTGGGGGGGCAAAA  50

seq1  AATCAAACAAAAGAGAGATGGTTCAGGATGCCTCTGTGGTTAAGAGTACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAACAAAAGAGAGATGGTTCAGGATGCCTCTGTGGTTAAGAGTACT  100

seq1  TGCTACTCTTACAGAGGACCCAAGTTCAGTTCCCAGCCCCTAAGCAGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACTCTTACAGAGGACCCAAGTTCAGTTCCCAGCCCCTAAGCAGCAG  150

seq1  CTCTCAGCTGCATGCATGCAGACAAAACACTGTTACACATAGAATAAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAGCTGCATGCATGCAGACAAAACACTGTTACACATAGAATAAATA  200

seq1  CATCCTTTTAAAACCCCAAACCAACAAAGTCCTATGCAGGGGAGACGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTTTTAAAACCCCAAACCAACAAAGTCCTATGCAGGGGAGACGTCT  250

seq1  CCCTGTCCAGCAAACAGGATGTTCACAACAGGGGCTTCTCAGAGAGATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTCCAGCAAACAGGATGTTCACAACAGGGGCTTCTCAGAGAGATGC  300

seq1  ATGGGTGCCCACACAGCCCAGCATAGGGAACTGCCCCAGGGTTGGATGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTGCCCACACAGCCCAGCATAGGGAACTGCCCCAGGGTTGGATGAT  350

seq1  ATAACTCCGTAAAGAAATAAAAGCTTTGGACTCAGGTCAGGCGGAGGTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTCCGTAAAGAAATAAAAGCTTTGGACTCAGGTCAGGCGGAGGTTC  400

seq1  AGGTCCCCACTTCAACACCGTTTCCTTGTGCATCGGGTCAGTGGCTGCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCCCACTTCAACACCGTTTCCTTGTGCATCGGGTCAGTGGCTGCTC  450

seq1  TGTGATCAGCTCCGAGTAACTCAATCAGTTAGCAGGTTGTCAAGAAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATCAGCTCCGAGTAACTCAATCAGTTAGCAGGTTGTCAAGAAAATA  500

seq1  AACCTGTCGCCATAAAGCAGGAGCTGGTGACACAGCGCAGAGGAATAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGTCGCCATAAAGCAGGAGCTGGTGACACAGCGCAGAGGAATAAAG  550

seq1  GCTTTTGTGGCCCAGCCTGATGACCCAACTTAAGTCCCCAGAATCCATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTGTGGCCCAGCCTGATGACCCAACTTAAGTCCCCAGAATCCATAG  600

seq1  GGCAGAAAGAGAAAAACAAATCCTGTGGATTGTCCTCTGACCGCCACCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAAAGAGAAAAACAAATCCTGTGGATTGTCCTCTGACCGCCACCTG  650

seq1  ATTGGCTTTGACATGGGTGCATCCCATGTACTATACAGATGGGTGGGTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTTTGACATGGGTGCATCCCATGTACTATACAGATGGGTGGGTGG  700

seq1  GTGGGAGG  708
      ||||||||
seq2  GTGGGAGG  708