BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-348G23
Chromosome8 (Build37)
Map Location 112,913,858 - 112,988,604
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHydin, LOC672398
Upstream geneLOC100042829, Pmfbp1, Dhx38, Txnl4b, Hp, Dhodh, Pkd1l3, 2400003C14Rik, 4930566A11Rik, D8Ertd587e, LOC668089, LOC672735, Ap1g1, Phlppl, Marveld3, LOC100041884, Tat, Chst4, Zfp612, Gm1467, Calb2, BC025546
Downstream geneVac14, BC060632, 2010004A03Rik, Sf3b3, Cog4, Fuk, St3gal2, Ddx19a, Ddx19b, Aars, Exosc6, Mrcl, 4930402E16Rik, 9430091E24Rik, Glg1, Rfwd3, LOC547023, Mlkl, Fa2h, Wdr59
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-348G23.bB6Ng01-348G23.g
ACCGA129731GA129732
length9311,082
definitionB6Ng01-348G23.b B6Ng01-348G23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(112,987,861 - 112,988,604)(112,913,858 - 112,914,935)
sequence
gaattcttttgaatacaaaatataatcatattcaaatcaaatcaaaatat
aatcatataagctcatattttcccacatttatcattgccgatacattttt
gagattataatacaatctccctttccttcaaaaataatatttcccccttt
ccttgtaagctaattaaaaaaattacaaactaattttaaaaaccatggtg
ggtggtgctggaaaaatagcacttaaggctgtcctctggcttctacacac
atgtgcacacagacacaggcacacacagacacacacagacacacacagac
acacacagacacacacacacacacacacacacagacacatacacacagac
agacagacagacagacagacagacacacacacgcagctatagacacatga
gcatgcacatacacggaaaactgtagccaatgaaaccaaagcaaagacag
actgactgaaaaggctcttcacagcacaggaaaaggtgagcaggctgaaa
agcccacttccggagagggctggagctcaccagctacacaactgactagg
ggctaagttcctcagcagatgggcaacccctgcaactcaacagccaatcc
aaatccctcaggcacaaaactaagggacccatttaaagacgggttaatga
gctgagtagacatctctatgaaaatgtacacatagctaacatttgcatcc
aaaccctttgacgtcatcacagaaatgtaaatcacaaccgcagtgagaga
gccggcccctcacataaccccttagcatggttgctattccatagaccaag
tgttagtgtgccgagcacagcgttcctcctgccagggcgcaccatggggg
cagctgctatgaaactgagggcagaagcctttgtaaattaaaaaacaccc
cccccccccaaaccaaaacagatctaggaaa
gaattcaaattggtgcttcaactctggaaatcagtatggagaattctcaa
aagaaaaaaaaaagtaaaaataaacccaccacatggcccatctgtatcgt
tccttgtcatttggccaaaggactcgacatcctacttcacagatgttcat
tgccagctctgttcacaagagctagccacggagacaacctacatgccctt
caacagatgaatggacaatgaaaatgtcatatatacccaatggaataata
ctcagctataaagaaaagttaaatcctgaagtttaaaggtgattggatgg
acctagaatagatcatcttgaatgaggcatccaagacctagaaagacaag
tgccgaatgtgctctctcatctgtggttcccagctccagatgctcaggtg
tgagtgtacaacatggagtaaccatggaaaccaagatagtatactgtaga
caggtagcggcaaggtgatataaagtgaggaatggaaagtgggaggggcg
tcaactggggagaaaagtagtcactcaatacagagaaggtaggacaaggg
acaaataccaccacagttgtttgatagagcctcaaggcatcattattttt
atatctacctaaaactgtaattattcacagtgtgaatgtgtgtgtgactg
tgtgtgtgtgttgtgtacactccccaacaagaaccatagactgaaaaact
tccagtatcagtcacaagaaacatcctcttgtgactcccaaaccaatata
gactatcagtgtagcaccttggttgcccctcaggagttgggagtgggcat
ctgttgccaaagacgcagcatgctcaggacacaggatacgggatgactag
agctgattttgacttgaaagcttccttcctgccacccagaaatgggtact
aggaaataccacgcaaactgctgagggaggtagaattatgcagcccttat
tcagctatattttaaatgaaaaaaaaaatcaggtacaaggtatatgttaa
tttatgctcaccacttaatttatatcacagttgcctttgattatatactt
aggcacggacatagaccaccttaatgttgaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_112987861_112988604
seq2: B6Ng01-348G23.b_50_793 (reverse)

seq1  ACTGCGGTTGTGATTTACATTTCTGTGATGACGTCAAAGGGTTTGGATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCGGTTGTGATTTACATTTCTGTGATGACGTCAAAGGGTTTGGATGC  50

seq1  AAATGTTAGCTATGTGTACATTTTCATAGAGATGTCTACTCAGCTCATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTAGCTATGTGTACATTTTCATAGAGATGTCTACTCAGCTCATTA  100

seq1  ACCCGTCTTTAAATGGGTCCCTTAGTTTTGTGCCTGAGGGATTTGGATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGTCTTTAAATGGGTCCCTTAGTTTTGTGCCTGAGGGATTTGGATTG  150

seq1  GCTGTTGAGTTGCAGGGGTTGCCCATCTGCTGAGGAACTTAGCCCCTAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTGAGTTGCAGGGGTTGCCCATCTGCTGAGGAACTTAGCCCCTAGT  200

seq1  CAGTTGTGTAGCTGGTGAGCTCCAGCCCTCTCCGGAAGTGGGCTTTTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGTGTAGCTGGTGAGCTCCAGCCCTCTCCGGAAGTGGGCTTTTCAG  250

seq1  CCTGCTCACCTTTTCCTGTGCTGTGAAGAGCCTTTTCAGTCAGTCTGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTCACCTTTTCCTGTGCTGTGAAGAGCCTTTTCAGTCAGTCTGTCT  300

seq1  TTGCTTTGGTTTCATTGGCTACAGTTTTCCGTGTATGTGCATGCTCATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTGGTTTCATTGGCTACAGTTTTCCGTGTATGTGCATGCTCATGT  350

seq1  GTCTATAGCTGCGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATAGCTGCGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT  400

seq1  GTGTATGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTCTGT  450

seq1  GTGTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGCCTGTGTCTGTGTGCACATGTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGCCTGTGTCTGTGTGCACATGTGTGT  500

seq1  AGAAGCCAGAGGACAGCCTTAAGTGCTATTTTTCCAGCACCACCCACCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCAGAGGACAGCCTTAAGTGCTATTTTTCCAGCACCACCCACCAT  550

seq1  GGTTTTTAAAATTAGTTTGTAATTTTTTTAATTAGCTTACAAGGAAAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTAAAATTAGTTTGTAATTTTTTTAATTAGCTTACAAGGAAAGGG  600

seq1  GGAAATATTATTTTTGAAGGAAAGGGAGATTGTATTATAATCTCAAAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATATTATTTTTGAAGGAAAGGGAGATTGTATTATAATCTCAAAAAT  650

seq1  GTATCGGCAATGATAAATGTGGGAAAATATGAGCTTATATGATTATATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCGGCAATGATAAATGTGGGAAAATATGAGCTTATATGATTATATTT  700

seq1  TGATTTGATTTGAATATGATTATATTTTGTATTCAAAAGAATTC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGATTTGAATATGATTATATTTTGTATTCAAAAGAATTC  744

seq1: chr8_112913858_112914935
seq2: B6Ng01-348G23.g_70_1151

seq1  GAATTCAAATTGGTGCTTCAACTCTGGAAATCAGTATGGAGAATTCTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTGGTGCTTCAACTCTGGAAATCAGTATGGAGAATTCTCAA  50

seq1  AAGAAAAAAAAAAGTAAAAATAAACCCACCACATGGCCCATCTGTATCGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAAAAAAAGTAAAAATAAACCCACCACATGGCCCATCTGTATCGT  100

seq1  TCCTTGTCATTTGGCCAAAGGACTCGACATCCTACTTCACAGATGTTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTCATTTGGCCAAAGGACTCGACATCCTACTTCACAGATGTTCAT  150

seq1  TGCCAGCTCTGTTCACAAGAGCTAGCCACGGAGACAACCTACATGCCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGCTCTGTTCACAAGAGCTAGCCACGGAGACAACCTACATGCCCTT  200

seq1  CAACAGATGAATGGACAATGAAAATGTCATATATACCCAATGGAATAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGATGAATGGACAATGAAAATGTCATATATACCCAATGGAATAATA  250

seq1  CTCAGCTATAAAGAAAAGTTAAATCCTGAAGTTTAAAGGTGATTGGATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTATAAAGAAAAGTTAAATCCTGAAGTTTAAAGGTGATTGGATGG  300

seq1  ACCTAGAATAGATCATCTTGAATGAGGCATCCAAGACCTAGAAAGACAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGAATAGATCATCTTGAATGAGGCATCCAAGACCTAGAAAGACAAG  350

seq1  TGCCGAATGTGCTCTCTCATCTGTGGTTCCCAGCTCCAGATGCTCAGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGAATGTGCTCTCTCATCTGTGGTTCCCAGCTCCAGATGCTCAGGTG  400

seq1  TGAGTGTACAACATGGAGTAACCATGGAAACCAAGATAGTATACTGTAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTACAACATGGAGTAACCATGGAAACCAAGATAGTATACTGTAGA  450

seq1  CAGGTAGCGGCAAGGTGATATAAAGTGAGGAATGGAAAGTGGGAGGGGCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTAGCGGCAAGGTGATATAAAGTGAGGAATGGAAAGTGGGAGGGGCG  500

seq1  TCAACTGGGGAGAAAAGTAGTCACTCAATACAGAGAAGGTAGGACAAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTGGGGAGAAAAGTAGTCACTCAATACAGAGAAGGTAGGACAAGGG  550

seq1  ACAAATACCACCACAGTTGTTTGATAGAGCCTCAAGGCATCATTATTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATACCACCACAGTTGTTTGATAGAGCCTCAAGGCATCATTATTTTT  600

seq1  ATATCTACCTAAAACTGTAATTATTCACAGTGTGAATGTGTGTGTGACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTACCTAAAACTGTAATTATTCACAGTGTGAATGTGTGTGTGACTG  650

seq1  TGTGTGTGTGTTGTGTACACTCCCCAACAAGAACCATAGACTGAAAAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTTGTGTACACTCCCCAACAAGAACCATAGACTGAAAAACT  700

seq1  TCCAGTATCAGTCACAAGAAACATCCTCTTGTGACTCCCAAACCAATATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTATCAGTCACAAGAAACATCCTCTTGTGACTCCCAAACCAATATA  750

seq1  GACTATCAGTGTAGCACCTTGGTTGCCCCTCAGGAGTTGGGAGTGGGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATCAGTGTAGCACCTTGGTTGCCCCTCAGGAGTTGGGAGTGGGCAT  800

seq1  CTGTTGCCAAAGACGCAGCATGCTCAGGACACAGGATAC-GGATGACTAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CTGTTGCCAAAGACGCAGCATGCTCAGGACACAGGATACGGGATGACTAG  850

seq1  AGCTGATTTTGACTTGAAAAGCTTCCTTCCTGCCACCCAGAAAT-GGTAC  898
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGCTGATTTTGACTTG-AAAGCTTCCTTCCTGCCACCCAGAAATGGGTAC  899

seq1  TAGGAAATACCACGCAAACTGCTGAGGGAGGGAAGAATTATGCAGCCC-T  947
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
seq2  TAGGAAATACCACGCAAACTGCTGAGGGA-GGTAGAATTATGCAGCCCTT  948

seq1  ATTCAGCTATATTTTAAATGAAAAAAAAAATCAGGTACAAAGTAATATG-  996
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| 
seq2  ATTCAGCTATATTTTAAATGAAAAAAAAAATCAGGTACAAGGT-ATATGT  997

seq1  TAATTTATGCTCA-CACTT-ATTTATATCAACAGTTG-CTTTGA-TATAT  1042
      ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||
seq2  TAATTTATGCTCACCACTTAATTTATATC-ACAGTTGCCTTTGATTATAT  1046

seq1  ACTTAAGCACAGACAATAGA-CACCCTAATGTTGACA  1078
      ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||
seq2  ACTTAGGCACGGAC-ATAGACCACCTTAATGTTGACA  1082