BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-048L08.T7 (MSMg01no048_l08.b1) | MSMg01-048L08.TJ (MSMg01no048_l08.g1) |
ACC | AG278408 | AG278409 |
length | 1,241 | 1,266 |
length of high quality (start - end) | 635 (77 - 711) | 646 (124 - 769) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_l08.b1 PHD_FILE: MSMg01no048_l08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_l08.g1 PHD_FILE: MSMg01no048_l08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:57 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (32,975,325 - 32,975,959) | (33,141,556 - 33,142,201) |
---|
sequence | NCCTATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCCTC
CAAGGCAGTTCACGCTTAAAATCACCATGTATCCATTAATGGATTCTGGC
TCACGATAGTTATTTCATAACCACATCCATGACCTTGTAGTAAAAACAAG
CAAATGACAGAAAAAGCGGAGCTCTTTTTCCTCCCCCACGTCTATGTAGA
TCATGTTCTTCCATCTCAGCCAGGGATTTATAGTTAACATCTCCTTGGTT
TCTAAACCATATTTTCGGAGAACGAGACTTAAAGTCTATTACTTCTAGGT
TTCACACTCTGAATAGAAAGCAGGAGGCTAAATGTCTGTCAAATCCATAC
TAGTTCAGTCTTGACTCCGAGAAACTGCTTGGATCCCATTATGGATCACT
CTGCTCTTGCAGAATAGAACACTCAAGCTTTCTGTTCAGCTTTCTTTAAC
TGATCCTGAGTAGCCGAGTTTAAATTAGGAAAGGGACTGACCAGCTGGAA
TGTTATAATGGATTCTATTCGCCCTCCAATCAAATTATCCTCATCTTCCT
TTTAAAAACGCTTTTAAGAAAATTCAATTTTCATTTAGTGACCATTTCAA
GGGTAGAAAAATATTACCCCTATTATTCCTTTACGAATCCTCAGTTACAG
AAATGCGCGTACCTGTAAGTATATGGACAAATATAAATATGCTGAGCTAT
AGGCACTGCGGTCACTCAGGACGTCAGGAACTGTACGAAATGAAGTGCTA
AATTTAGTTACGATGTCTGTGCAGTATTTAATATTCGCATAAGATGTGAC
TGACCTCCACGTAAAATTAATATTACTAGTTCCCTCCAGAAGTTGCCGGT
ACACATCAGAATCTGAAGGAAATAAGGTCTAAGATAAATTCTGCATTCCT
TGCATAGTGAATTTATAGATTATATCATATGACATTTTATTCTATGAATT
TTTGGATATATAAAGTTTCCTTTTTTTGGCTAAATATTATTCTTTTCTCC
AAAAATACTTTTTATTTACCCTAATATTTTTGTTATTTTTTCCCTTTTTA
AAAAGGTTATCTCTGATGTTCCTTCTTTCTCTGTCTCTTTTGTTCTTATT
TCCACTCTTTTTTCTCGTCTTTTTTTTTCCCATTCCTTCTTATTTATATT
CTTTTCTTTCTTCTCTTTTTCTACTTTTTTACTTTATTTATTTTCTATCT
TCTTTTCTCTTCCTTCTATTCCCTTTCTCACTATCTTCTCA
| TTTTCAGGATGGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAATGCTCTGATGTCCTAAGATCTTCAGTA
CTGTGGTGATTGTTGGCCAGACGCCCCCCTCATGCCCTGGCTACATGACC
GTCTCACTTAGCATCTTGTTTAATCGAAGAAGCAATGGAGAAAAATCTGC
TAACAAAATGAAAGGCACTCTATGACATAAGCCCTGCAATGACATCTCAT
CCCTTTGCCTCGTCCTATGTATTACAAAGCAATTGGCTAGGCAAGACGAC
ACACAAGATAAGGATCTTCCACGAGGGACAAATACTAGGAGGCAGGCTGT
GGGCTGAAGTGCAATGTAGTGGCTCAGAGTCATAGGTAATGAACACATGT
GCACAGCTTTCTATAGTTAGCTGGCGTCTCCACTGTCTCACATCAAATCT
TTACCCCCTTTGCTCCAGTAATGATGGAGGTCAGTCAAGATGCCCTTCAT
CCACAAGCTAATGACGTCTCCCAAGGTTTTGCCATATTCAAATAACACAA
GCAATTGGCATCTGTTTCCCCCCTAGATGGGCCTGTGTCCCCTCCACATT
TTGTGCCTGTTCGGCTCACAACACCCTTTGGTGCTTCTTTCTTTCCCTCA
TGTTAGAAGGCTACCTGGTCAAGGGTTGCCCCTACCCCACATTTGATCCT
TTCCTGTTCTGTATCTACTCCACTTTAGAAATCAAAGCTTAATCTGTACT
TGCTCCGCACTGGACAGTTTATGATTTTTAAAAATTTCTTCTTTTGAAAA
CTCTCGGTTTGTGTCTACTCCTTTTTGTTTTTGATTTGTTTAAGTTGTTT
GCTTGTGTTCTTTGCTGACCTGCTTTCCAAGTGTTCTGAGCATCTCTCTA
TTCCACCCCTCTGTTTAATGGATAGTTTGTATAGATTTCTTTCCCATTTT
CATAAGCTGCCTCTTCACTCTAATTAATGGATTCTTTTCTCCTACTAAAC
TTTTTTTTCTTTACAAAACATCCTTTTTCCTATTGCCTGGTCTTTTTTCC
TAAAATCCCCGAATCTTTTTTTTAAAATATCTATATTATGTATATACATT
TTTTCCATTTAACTTGCAATCTATCTTCCTCCTAGATTCTTAAACTCTCT
TATTATACTCATATTCTCAACTTTTCTATACTCCTCTCATTACCTCTTTT
TTTTACCTTTCTATTCTCTCCTCTTCATATCCTTACTTATTTACATTTTT
CTCTCTTTTTATCACT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 11 11 10 13 14 18 16 15 10 8 8 8 8 8 9 9 9 19 19 28 24 24 29 36 36 36 36 36 47 50 43 43 43 39 39 37 33 37 37 25 24 11 15 10 22
14 28 20 26 34 46 46 41 25 12 18 9 10 11 12 12 11 11 8 8 8 10 13 8 9 9 19 21 30 33 33 33 44 44 36 36 38 38 53 50 43 43 41 43 43 48 43 57 42 43
43 25 25 23 23 20 27 27 33 33 33 33 37 37 34 28 19 12 11 9 9 9 9 13 21 33 37 37 39 37 41 47 48 48 50 36 36 36 36 36 47 48 43 47 47 47 48 48 48 57
48 48 48 43 43 46 43 43 43 43 43 47 48 54 57 54 54 54 57 57 57 57 48 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 46 42 43
47 47 48 57 50 54 57 57 68 68 59 59 54 54 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 68 57 50 50 37 37 50 50 57 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 52 52 52 59 44 50 35 35 35 50 44 57 43 43 37 43 43 57 59 52 57 57 57 54 52 52 57 57 68 68 68 68
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 59 59 50 59 41 41 41 47 47 57 57 46 43 43 46 47 48 54 57 59 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 43 44 43 59 59 68 68 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 57 43 47 43 48 47 57 57 57 57 57 59 59 57 50 50 50 53 53 50 59 59 47 47 43 59 13 11 8 8 8 10 16 23
34 34 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 48 48 57 57 59 59 43 35 35 35 42 42 43 48 42 34 24 18 18 18 27 32 44 47 43 47 48 54 54 47 47 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 47 48 57 32 34 13 12 13 32 23 41 31 33 33 43 43 43 44 43 29 29 43 44 57 57 57 44 43 35 35 42 44 50 57 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 54 54 50 59 50 54 54 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 54 54 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 43 44 35 42 43 57 57 57 59 59 59 52 52 43 43 43 57 52 57 57 59 57 57 57 57
57 39 39 41 35 35 31 42 42 42 38 43 43 57 57 57 59 57 52 52 52 52 50 50 50 50 50 50 57 57 59 59 50 43 43 44 44 43 52 52 50 43 27 34 11 12 12 24 24 44
43 57 43 43 32 24 27 29 36 32 35 35 35 39 37 32 44 40 47 41 47 47 42 42 18 17 10 10 10 10 16 19 38 32 47 47 47 42 32 26 30 41 32 27 31 23 23 28 32 32
24 24 17 22 22 36 31 21 21 13 13 10 10 14 23 25 30 14 14 14 18 14 10 10 10 10 13 20 25 30 36 21 24 16 19 13 14 14 14 15 17 10 10 9 17 17 37 37 31 30
16 14 15 14 14 14 14 20 26 25 19 12 11 12 13 11 10 16 15 15 10 13 10 15 15 28 32 39 34 24 22 18 18 10 9 9 10 10 10 9 13 9 9 7 10 10 10 15 19 22
19 21 18 11 11 10 9 9 10 10 11 16 11 11 10 8 8 8 11 11 12 16 14 15 24 23 23 13 9 9 9 9 11 11 11 11 11 12 12 11 11 11 9 10 8 8 8 8 15 10
12 10 10 8 8 6 6 8 8 8 11 11 13 13 17 11 10 10 11 10 9 9 11 11 11 11 13 13 13 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 15 10 8 7 6 8 8 10 10
10 15 11 11 11 11 11 11 8 8 6 7 12 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 14 8 8 7 7 12 19 16 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 11 10 8 6 8 6 6 8 8 12 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 13 11 10 9 9 13 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 13 13 13 10 9 9 9
9 9 11 13 10 10 9 9 9 18 21 17 15 10 8 8 8 11 11 8 8 6 6 8 7 6 8 8 6 6 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 9 8 10 10 8 8
9 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 11 7 7 8 6 9 9 9 9 10 11 16 15 11 11 11 11 8 8 8 8 8 10
9 10 9 9 10 8 10 9 9 10 12 10 6 6 8 6 8 8 8 10 12 11 11 10 12 9 11 11 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 9 11 12 12 11 11 11 11
11 11 17 13 8 6 6 8 8 10 8 8 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 9 12 12 11 8 8 7 9 12 11 16 12 10 15 11 9 9 10 7 8 6 6 8 8 10 10
9 9 10 8 11 12 10 10 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 10 15 15 22 18 18 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 7 7 12 15 15 15 12 10 9 9 9 10 15 16 19 10 10 12 21 19 21 11 11 13 27 29 36 36 37 36 47 39 39
39 39 39 44 44 50 50 50 50 47 41 27 27 9 7 7 7 8 8 11 12 12 11 18 18 11 11 11 21 21 25 26 37 37 39 44 50 53 43 43 43 43 43 48 43 36 33 33 33 33
33 33 33 27 21 11 11 10 12 11 13 16 16 16 16 21 31 34 19 10 8 8 8 8 19 30 41 33 33 33 33 33 37 39 47 39 39 39 39 39 42 47 47 47 47 42 47 47 48 48
48 48 42 43 43 47 47 47 47 43 48 54 57 35 44 42 42 35 48 37 50 50 47 47 54 46 46 44 44 44 42 42 43 44 44 57 57 57 46 43 43 57 46 54 57 57 57 57 47 44
44 44 44 54 48 59 48 50 50 59 59 59 59 59 57 48 44 50 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 50 50 52 52 57 57 57 57 57 57 43 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 57 57 57 57 52 43 43 43 43 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 44 43 31 31 43 44 57 59 59 59 59 59 44 44 35 35 35 43
43 62 62 62 62 45 45 45 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 52 43 43 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 39 20
14 14 39 39 62 62 62 52 43 43 43 43 52 62 62 47 62 43 62 39 43 43 52 43 44 35 35 35 43 43 62 62 62 54 62 62 62 62 43 43 52 44 44 29 29 23 43 29 43 39
29 23 29 29 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 44 39 35 35 43 43 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 62 62 44 44 31 31 43 44 62
62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 59 59 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52
62 52 62 62 62 33 33 11 13 15 38 38 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 52 52 43 43 39 39 39
43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 38 38 14 14 14 38 38 43 43 39 43 57 52 52 57 57 57 57 57 38 38 13 13 13 38 38 57 57
57 57 57 57 52 52 52 57 52 27 29 12 11 11 27 27 57 57 32 28 10 10 10 25 38 52 57 57 38 38 19 21 21 38 38 57 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 47 42
42 44 32 57 43 43 43 47 47 54 59 59 57 57 44 41 28 20 20 28 32 36 46 57 57 57 46 39 39 43 43 43 57 48 54 46 48 43 43 40 48 48 54 48 48 48 48 48 57 48
48 48 48 47 47 47 47 47 47 47 48 47 47 47 43 48 48 59 48 41 40 40 39 39 22 18 8 8 8 8 8 12 12 14 13 14 19 21 32 31 22 22 23 25 25 14 14 14 21 21
32 34 37 30 23 18 18 27 30 32 39 29 29 32 37 24 22 11 11 11 13 25 19 19 11 11 19 22 19 13 19 28 18 20 23 34 32 39 37 32 30 26 31 31 22 19 14 13 17 16
27 33 37 28 21 16 12 17 8 8 8 13 15 28 22 25 28 27 24 22 13 17 22 10 10 10 15 12 13 10 10 10 9 9 9 15 19 14 8 8 13 9 9 9 10 13 15 20 18 23
17 12 9 9 12 12 12 13 13 8 8 8 15 17 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 9 9 9 10 10 12 11 11 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 11
11 12 12 11 11 12 12 12 10 8 8 8 8 13 11 13 10 9 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 8 8 6 8 8 19 9 8 8 8 8 8 8 15 13 14 13 20 10 13
11 9 8 8 8 8 8 9 10 8 13 15 11 11 8 8 8 10 10 7 7 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 13 19 16 12 10 13 8 8 8 9 8 8 7 7 10 10 12 9
9 11 13 10 9 8 8 8 8 8 10 7 7 7 7 10 8 8 8 8 8 8 10 10 16 22 29 10 8 8 8 8 10 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12
13 18 10 10 10 11 9 10 12 9 7 8 8 8 8 8 11 14 16 24 16 14 10 10 13 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 6 6 8 8 11 11 12 12 21
18 19 18 16 11 11 11 11 11 11 9 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 9 9 9 9 14 10 12
10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 8 9 10 8 8 8 7 9 8 8 9 7 11 11 10 13 11 15 8 8 8 12 15 17 18 18 16
10 10 10 9 6 8 6 6 8 8 8 7 6 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 8 7 6 8 8 8 10 8 8 8 13 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8
6 6 10 8 6 6 8 8 15 10 8 8 6 6 8 6 |