BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049J18.T7 (MSMg01no049_j18.b1) | MSMg01-049J18.TJ (MSMg01no049_j18.g1) |
ACC | AG279000 | AG279001 |
length | 1,301 | 1,360 |
length of high quality (start - end) | 489 (122 - 610) | 328 (115 - 442) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_j18.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_j18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_j18.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_j18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:48 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NTATATGCGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCCACA
CCTTGGTAATCCACATTTGAGGCACTCTATAAACTTGCTTCCATTATCTT
TAGAACAAGACTACCGGCATTATTTGCCCAAACCCATAGGTACTAAACTA
TGCCTTTCTCTTTGACTCTTGATGCCCCCTGAACCCCTAAGACTCTGGGA
ACTGATCAAAAGCAGTCACATGGTCTTTCATTCATCTCTGTGTCACATCC
CACTGCCTCCTTTGGTTTCAGAATTTGGACCTTTCTAGTTGTTCTCTGAT
TCCTTCGAAGAACTGTTTATGTGCTGATTAGCTCTCACACTTAATTCAGC
AGAGGGTTACTCTGAAACAAAAAGTTTATTATGTCCATGAATACAACTGC
ACTGAAACTTTTCCATCCCTCAGTAACTTGCGCATCAATGAATGCAGACA
ACGTTCGTTGTTTTAGTCATCTAGCACCATGTTCCTCTTATTCTGTCTTT
AGCTTTTCTTTGCTATACTGTGACAATAGTCTTCAATTTACAACCTTACC
ACTAAACTACTAAAAGTTCATTTCATCACATCTAACATAAGATTTTCATA
ATGATTATATCGTTATGGACATGAATACACAGAAAGTTTCCTCCCAAGCA
CAGTTCAGAATTTTATATTTGGTACGACAGTCTTCTACTTATATAAGGCA
TTTTCTCCATTAAAAATAGTCAACTATGAATGAACTTTATCGATACTGCA
AATGTCTGTTGAAAATCTGATTCACAGTAACCCTCAACAAGTTCAAGCAT
TTCAACCTGCTTCTGACTGGCCTTCTTTATATCTGCCTATTCAAAATCTA
CTTGAAGCATCCATAACTTCATCTAACTTCAAGACCTAATCCCCCCAGCG
GGAACTCTTTATTCCCACCCCCCTAAATTATTTCCCTTGACAAAAAATGG
TGTCTTAATTGTCCTTCCAAGTCAAATAACTTTCATAGTTAATCCTTTTT
GACTTTTCACCCTATTGAAAGTTTCCAAGCCCTATTTCTGGGAAAATTAA
AATATTTTGAAAAACGCTCTGCCTGTTAAAAATTTAGCTCCCACTTGAAA
ATACTTTCTCCCCTTTATGTAAATAACAAATCTAATCCTTTTTTAAAATA
AAAAAGTGTTTTGTGGTCAACAATGGTTAAGCAAAGATTTAATTGCTATT
TTACATCATTCTACTCTTTTATATATTCACTAAATTTTGTTTCGCGGTAT
TACTCTTCCCTATTATTCCTTAGAACTNTCTCCATTTAGTTATTAAATTA
G
| TTTTTAACAGTGAGCCTGGGGCGCCGGTCGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTACACCANCTTTCTTCAAAGGACAGATCG
TGGAAACAGCCACTAAACAGGGACCCCGTGAAACTAACAGAAGTTATGAA
ACAAATGGACCTGACAGATATCTACAGAACATTTTATCCTAAAACAAAAG
GATATACCTTCTTCTCAGCACCTCACGGGACCTTCTCCAAAATTGACCAT
ATAATTGGTCACAAAACAGGCCTCAATAGATACAAAAATATTGAAATTGT
CCCATGTATCCTATCAGACCACCATGGCCTAAGACTGATCTTCAATAACA
ACATAAATAATGGAAAGCCAACATTCACGTGGAAACTGAATAACACTCTT
CTCAATGATACCCTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT
TTCAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTATTGGACA
CAACGAAAGCATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTCTGAGTGCCTCCAAG
AAGAAACGGGAGACAGCCCATACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGC
CCTACAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAAGAGGAGTAGACGGCAGGAAA
TAATCAAACTCAGGGGTGAAATCACCCAAGCGGATACAAGAAGAAATATT
CAAAGAATTTAACCAACGAGGAATTTGGTTCTTTGGGAACATCCCCAAGA
TAAGATAAACCCTTTAGCTAGACCTCCCTATAGGGTCCCGAAGACAAATT
CCTACTTAACAAAATCAAAACTGAAAAAGGGATACTTAACTACCACATCC
TGAAAAAAATCCAAAACAACCATCAAAATCTCTTCTACAAAAGGTCTATC
CTCAACAAAACTTGCAAAAACTGGAATGAAAAGGGACAAAACTCTCTGGA
ACGAAAACCCAGTTAACCAAAGTTTGAATTCGGGATTTCAAGTTTGAACC
TTCTTAAACATCCCCCATAATCCCCCTAAAGCAAAAAAAAAACCAGTTTT
TTAATATAATCCTCCCCTACCAACAATAAACCCCATGTACCCAAAATGGT
GTTTTAAGGCGCAAAAGTTCTTATATTAAACCTTCTCAAAAAAAATACTA
ATCTCCAAATTTTTGGCGCAAAATATATTTCTCCAAAAAAATAAAACCCC
CCCACCGAAACCTATACCCCAATTCTCTTTTTTTATAGAATCCCCCTTTA
TTCTTCCGATTATCCTCTAACCACTCCGAAATAGATATCCTCCACATATA
TATATAACATATCTCCTACGACTCAATTTTTTCCTTCTATTAGATATCTC
TAGTGTCTTN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 7 6 6 8 8 10 12 12 15 8 8 8 8 8 15 8 8 8 12 8 8 8 13 21 33 36 34 34 39 39 39 39 35 26 31 24 24 26 26 26 29 33 28 28 20 28
33 33 30 25 16 13 15 25 21 15 9 9 9 9 10 11 11 13 10 10 10 8 8 8 8 8 22 22 37 37 37 33 33 33 33 30 30 34 34 34 34 39 40 40 43 44 48 43 43 30
28 12 12 9 12 12 12 15 13 13 22 22 22 12 16 20 29 23 24 19 15 17 19 29 32 39 39 37 35 35 35 35 42 42 48 40 38 28 28 28 30 30 42 42 47 47 47 57 57 57
57 48 48 48 57 50 57 37 37 37 57 57 50 50 43 43 43 46 57 52 52 52 52 37 43 52 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 32 27 24 18 26 28 44 44 52 38 32 13 13 13
38 38 57 57 52 52 57 59 59 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 43 43 39 35 35 20 38 38 57 43 57 57 57 52 52 52 52 52 43 43 39 35 35 39 43 57 57 62 62 62 62
52 52 52 52 45 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 31 31 31 31 31 35 43 35 35 35 43 47 62 62 43 43 24 18 12 29 29 43 38 39 43 43 43 43 43 39 39
62 62 62 43 43 27 23 23 20 43 20 43 43 43 35 43 43 47 47 62 62 43 43 35 35 35 31 21 21 21 21 31 44 44 44 43 23 23 23 35 35 43 44 44 59 57 38 34 15 15
13 15 15 34 32 35 35 43 43 57 57 57 43 38 28 20 20 23 32 32 32 32 29 33 28 33 33 33 35 42 32 43 19 19 17 20 19 32 43 35 35 36 27 18 12 12 15 11 19 15
18 19 30 38 43 43 37 35 35 35 50 50 57 54 54 57 57 57 57 44 40 28 27 25 20 32 28 28 15 12 9 9 12 24 42 42 42 35 30 37 32 37 37 32 32 37 37 37 24 23
15 19 15 26 14 19 14 18 15 41 41 46 30 30 14 14 14 28 26 36 37 43 28 17 17 26 42 43 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 27 27 11 11 9 10 10 10 17
13 20 20 31 32 39 47 47 47 47 39 33 30 30 20 19 19 14 10 10 12 30 31 37 37 31 31 25 25 25 30 30 42 42 42 42 47 46 46 39 37 36 46 46 47 42 42 35 22 22
13 12 15 25 24 28 13 18 18 32 32 37 29 28 28 30 32 23 26 11 11 11 25 19 21 21 28 18 23 28 28 35 35 33 34 25 22 17 21 16 22 16 27 21 35 31 37 34 28 21
14 14 25 30 37 28 28 12 12 13 12 12 18 18 23 28 15 19 12 19 19 22 34 24 20 15 15 18 11 11 12 21 22 31 28 32 35 32 32 24 33 24 18 11 11 11 18 17 25 36
27 19 10 10 10 21 10 14 13 24 19 23 11 12 12 12 10 12 10 10 8 8 10 12 15 15 24 24 29 24 18 12 13 13 18 24 28 28 28 19 17 23 23 16 12 10 8 8 13 13
16 13 9 13 10 10 7 7 10 8 8 9 9 9 14 11 12 9 10 10 12 14 10 12 15 12 12 12 12 18 18 15 10 8 8 8 21 22 10 10 10 15 19 24 17 14 14 24 21 14
14 12 17 9 9 9 12 10 14 14 21 19 37 33 33 22 21 12 12 9 9 10 8 13 13 10 14 14 19 19 22 10 13 13 14 10 12 12 10 10 13 8 6 6 8 6 8 8 8 10
8 8 9 10 9 10 9 10 23 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 13 10 12 12 15 18 12 8 8 8 8 10 10 12 10 10 8 13 8 10 10 8 11 11 10 10 8 8 8 13
17 10 10 10 13 11 10 10 10 16 19 10 10 9 15 13 9 10 10 8 8 8 8 12 11 9 9 9 15 11 12 12 12 10 10 10 8 11 11 10 10 10 9 9 8 8 8 8 6 6
8 8 9 9 10 9 9 8 8 8 9 10 10 16 9 8 8 8 9 11 9 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 12 12 9 9 8 8 8 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 15 15 13 8 8 6 8 7 7 7 8 9 8 8 8 8 10 10 18 14 8 8
8 8 8 10 8 8 6 6 7 7 8 8 9 7 10 8 10 10 12 10 9 6 8 6 6 6 8 9 9 9 9 10 12 15 12 10 8 8 6 6 6 6 9 11 8 9 10 8 8 9
10 9 10 12 16 16 16 11 18 18 9 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 11 9 10 10 10 10 10 9 7 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 13 12 7
10 6 6 6 8 18 21 10 10 10 8 10 10 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 10 12 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 19 8 6 6 6 8 8 8 8 9
9 12 15 11 9 9 8 8 8 8 10 9 9 8 7 7 7 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 7 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 11
8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 9 9 9 8 13 6 6 8 8 8 8 6 10 7 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 11 8 13 8
8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 9 8 8 8 3 0 3 10 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 10 13 11 10 13 9 8 8 6
6 | Open.Hide. 7 7 7 8 8 9 7 6 6 6 6 8 10 12 9 9 9 7 7 7 9 9 19 19 8 8 8 10 10 13 9 7 10 8 10 16 19 22 19 10 10 10 17 17 24 28 32 32 34 29
29 21 21 23 26 22 35 35 39 39 46 40 39 22 11 8 8 8 8 10 12 12 11 13 22 22 8 3 0 3 14 15 30 37 37 37 37 43 43 39 37 39 36 36 39 39 57 36 35 22
21 17 21 25 22 22 12 12 9 9 9 9 9 10 23 19 30 31 28 21 15 11 11 13 13 11 12 11 15 22 29 39 33 33 33 33 33 28 30 37 37 43 34 33 34 34 39 39 43 40
46 43 43 43 43 43 43 43 43 39 39 42 42 42 43 48 48 54 54 54 48 48 42 37 30 30 41 44 44 57 44 39 39 43 43 47 57 57 57 57 43 43 42 42 30 32 32 35 44 42
57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 54 50 50 50 43 43 43 50 50 52 52 52 43 43 35 38 43 43 43 52 57 57 57 52 52 52 52 57 59 59 57 59 57 57 57 52 52
43 59 43 52 52 43 43 35 43 44 43 43 52 52 57 57 45 45 45 52 52 52 43 38 26 26 26 43 43 52 57 57 45 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62
62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 43 43 39 34 34 18 16 16 13 21 12 30 21 31 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52
52 52 52 62 52 52 62 52 43 62 52 45 43 43 39 39 32 33 12 12 12 33 33 62 62 45 45 45 43 43 20 20 20 43 43 52 57 57 52 52 52 57 57 52 59 59 59 59 59 59
44 43 35 19 19 16 27 14 18 34 28 12 12 12 28 20 35 39 44 43 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 43 43 33 33 37 37 25 21 11 11 11 27 27 32 16 20 16
19 8 8 8 14 10 32 32 43 47 50 48 48 43 44 23 23 23 36 30 42 42 42 35 41 41 33 33 33 42 42 43 43 47 46 43 43 43 42 42 32 42 42 32 32 28 28 20 28 28
18 14 14 20 26 36 37 43 43 44 44 32 32 35 41 26 28 18 23 23 37 32 28 24 32 32 39 40 40 40 34 23 20 20 28 32 34 37 32 37 29 29 26 26 34 36 34 39 32 27
16 11 11 11 12 15 15 17 13 9 9 9 9 10 18 18 28 37 37 39 36 43 30 28 18 13 13 19 24 30 37 37 32 32 32 28 28 32 37 39 43 43 47 43 30 28 28 22 19 24
24 24 30 29 24 22 22 27 25 28 32 36 36 37 37 32 30 30 30 37 39 37 37 30 30 28 32 15 10 8 8 8 19 23 37 28 23 18 11 11 12 22 16 23 22 31 31 34 34 34
39 30 24 24 17 15 13 15 18 18 28 15 20 10 10 10 10 10 9 14 21 19 11 10 10 12 12 13 8 8 8 8 6 6 6 6 8 15 16 18 18 12 9 8 8 8 8 9 10 10
9 15 12 10 10 10 10 10 14 11 10 8 7 12 10 10 10 14 14 15 14 11 11 11 14 14 12 11 17 13 15 16 10 10 9 10 13 13 25 20 21 21 15 13 9 10 15 10 10 8
10 8 8 8 8 10 11 11 11 13 10 14 14 14 15 8 8 9 9 12 17 10 10 13 10 8 9 12 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 16 18 18
14 10 10 10 8 8 8 9 10 12 11 12 12 11 11 10 10 10 10 12 13 15 11 12 11 9 10 9 10 8 8 8 8 8 10 12 12 12 10 10 13 14 8 8 9 8 10 10 8 8
8 9 11 10 17 17 14 11 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 9 11 10 7 7 9 6 6 8 13 10 10 10 12 15 13 13 6 6 8 8 9 10 8
8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 10 8 8 10 9 9 13 8 8 8 8 10 10 15 11 13 14 16 19 13 11 11 11 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 9 11
9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 12 12 18 16 14 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 12 10 8 12 7 9 9 10 7 13
12 12 12 16 21 15 12 10 8 8 6 6 8 10 23 16 11 11 11 9 9 11 14 13 14 11 11 11 18 10 10 10 10 17 11 13 15 15 19 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 11 16 12 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 15 8 10 6 6 8 8 6 6 8 10 10 10 10 8 10 10 10 10 10
10 9 12 11 9 10 9 6 6 7 7 9 9 8 8 9 10 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 7 8 8 11 8 10 8 8 7 7 8 12 16 23 25 13 15 9 9 7 10 8 10
8 8 8 8 10 8 8 9 10 18 10 11 9 10 8 8 8 8 8 8 21 15 15 10 10 10 15 13 9 8 8 6 6 8 8 9 9 12 14 12 12 12 18 7 7 7 7 7 9 9
9 11 9 8 8 8 10 8 10 6 7 6 6 8 8 7 9 13 10 13 12 9 8 8 8 10 9 9 9 8 15 13 12 9 6 12 6 7 10 7 9 8 11 8 8 8 8 8 8 11
8 10 6 7 6 6 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 6 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10
8 8 10 13 8 8 8 6 6 7 8 9 9 9 8 8 10 8 6 6 6 7 6 6 8 10 8 10 9 10 7 7 6 8 8 6 7 9 9 10 7 6 6 7 15 14 13 13 9 14
6 6 6 6 6 6 10 10 3 0 |