| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-053H01.T7 (MSMg01no053_h01.b1) | MSMg01-053H01.TJ (MSMg01no053_h01.g1) |
|---|
| ACC | AG281655 | AG281656 |
|---|
| length | 701 | 1,784 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 250 (64 - 313) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_h01.b1 PHD_FILE: MSMg01no053_h01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:54:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_h01.g1 PHD_FILE: MSMg01no053_h01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:54:21 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | ACTCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTCGAGAGGACCGCGGA
TTCCCTCCACCCGCTGATTCCCATAAACTCTCATCTGGCAACTATACTTG
GATAGCATTGGTTAGCAACACTTTGTCTGGAGTGAGTAGATATGTTTTGT
TTTACAAAGTTATACAACAGTGTGATAAATATTTCCATATAGACTCAGTA
ATGGAGAACAGAAAACTTATCTGTGCCAAACTACTAAGTTGATAAGTTTT
TTTAATTTATTTTTTTTAAATGATAGCTCTGCCTAATTATAAGGGAAATG
AACATCTATGGCGGAAAGGTTTGGAACACATAAAAGCATATTAAAATGTC
AAAACATGTGTGTTAATCTCAAAACTGAGCTGTGGCTTTTCATTAAACTG
ATGTTTCATGCATTCCCCCGTATGTGTGCCTTTCCCGTCCATCTATATAT
ACTATGCGCCTATATAACAACGGAAAAAGCCCTATCGTTTCATTCTTCTT
GTTTTTATTTCTCCTAACGGCGCCACTTCATGTTCAATTAAGAAACATGT
TATTCCTTCTATTAATATCCCTTATTTTTCCATATGACGACGCTACAGCG
ATCTCTGACATGCCCAACTTCATATTACGATGACGTGTTACGTCGTTAGC
CTCCTCCCCCAATTTCTCTTCCCCATTCTTCCCTTCTTACCCTGTTTCCT
C
| TTTTTTATATCTACTTATGGTATATTAANNTGTGTGNNNNAACGCGCCAN
CGGGGNACAGGNGANCGGGCGCNNTGAGAAATGACGGTGNAACGNCNGCT
AGANAGGGGGGGNNGNANNANNNNNNANNGNANNGATATNACGTACNACG
TACAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGANGNTGNNGGGNNGNNNGNNGAGAGAG
AANANATAACANTNCCCANNNANNNAAGNTNNCATATANGGAAGTAACTG
AAANATATATCTNATNTATATTATCTACTCCACACATACAANTATAATCG
CACCTATAGCTCTGTANGNAGATGCACGCAGCTACTGNTGAGTGTGTCTT
CTGTGGCGTCATACAATACTTTGATCGCTGTCGTCGTANTTACACGTATA
TACATGATATCGCGTGCTCTCTATATTTTCGCACACGCTCCTACGATGTC
GCATATACTGACTATCACGATGTTATATTANAACTCCACTAATATTATAA
TAATACNTATCACACAATACGCGCCGTTATCCTCACCGACATATATANCN
ATAGATATCTAACATCTCGCTATTATCAGTCTCTGCAGGGTCGACTCGAT
TGCACGATATGTCAATACTAGTTACACTGTGGACACGTGTATGTAATNGG
ATNGTNTAGNGTGATGATGATGTTGACCATCCCNGAGCACTCATACTATG
TCACTGTACGCCAGACGATACAGCAGTCGTCAGACGACAGAGGCGCGTGT
CGAGTGAAGCGGGTAGTCTGTGCTATTGATTGTACGCTCTGTATGNGTGT
GCTGTCTATGCGAGCACAGCTGNTGTAGCGTGGACAGATGCTCGCGACGN
TAGGCGTGAGGACGCTGCTAATAATGCACAGCCGGNTNATGTGAATCGCT
ATATAATTNCTGGNGCGCGCGTATACTACTGCCGTCTGCGTTTGCGGGAC
AGAATAATACATATGTCTCGCGCGCTATAGTTAGTGTCTTGCTCGTACGA
GTNCGTATATACAGCGTCTCGTCGTTGTACTATGTGNTTATNCGTGGCGG
CGGGGCACGGCNTGACCGCGTGCTCATTNACATACATACGCGCGCGTGAT
CGATATAATACCATACTGGCTCGTCGTGCTAGCTCGTGTGGNCGCGTCGG
NCGCGCGCTCGGCTGTTGTGTATCGCACGAGCNCGCCGGGCGCACTNGCG
NTGTCGTTATAACGTGCTCGCGCACATCTCCNCNATGATTTTTTATGCGT
GGCGGCACGCCNGATCGCGTGGATTAGCGCGTANAGCATGTATGAGTCAG
ACGCATAGAGGTGCGATATAGTCAGCGTGATAGATGAGAGCGATAGAATG
ATAGATATTAGATATAAGTGGGTAGGCGCGAGGAGCGTGTGGTTNTGCGC
GCGATATAGTTGAGTACAGCGTATGCGGNGGATANATCTGCGTGCTGTCG
CGACGCCGTATGACGATTGTGCGATGTATAGCTATGTCGTATNATTNAGT
AGACGACGATAGTAGTGCGCTATCTATACGCAGCGGATGATACGCACGAC
GCGAAGTAGATCGACACATCCGACAGTTATACACCGTGTGACCGCGACAA
TATATAGATACTGNGTATTAGTATAGCGCGCAAGCGCGATATAGTCNTAT
ACGCGCGAGCCGCAGATGCGGGAAACGACGACTGTACACNCTGATATGGA
CGACGTAGACGAGATGACAACGANCGTGTCGTGAGCGCGACGTATATATC
GTNCCTATCGTGTGCGCGGACTGCGGCGGCGNTG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 8 9 9 9 13 14 20 29 23 22 24 22 22 28 30 30 30 33 28 28 22 22 23 19 10 10 10 19 10 10 14 10 9 10 13 13 13 8 10 8 15 15 30 19 21 11
10 10 26 30 22 10 8 8 13 8 10 11 12 12 23 25 37 37 37 28 28 36 36 36 36 57 50 47 47 37 36 33 33 33 33 27 23 10 10 10 22 23 48 44 44 43 43 39 47 43
50 43 42 36 32 32 37 42 42 47 47 48 42 42 37 37 30 36 35 37 37 42 47 57 57 43 43 46 44 38 41 41 41 41 41 36 37 35 35 35 42 42 46 50 50 50 50 50 47 50
50 57 57 57 50 50 57 57 57 57 52 43 44 43 32 32 43 43 43 52 52 52 41 46 46 46 50 50 50 52 52 50 50 37 43 37 43 43 43 43 32 32 16 27 27 24 14 27 27 39
43 57 57 43 43 34 34 33 33 26 35 38 43 43 35 42 42 43 44 45 34 34 34 38 43 43 42 43 43 43 57 57 57 52 43 57 43 52 45 52 57 57 57 47 47 52 52 52 57 57
57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 50 52 52 52 52 52 57 52 52 37 52 52 43 43 28 23 23 28 43 43 50 43 37 37 37 43 43 43 43 24 24 15 19 14 21 21 33 33 32 37
35 35 42 32 32 28 33 28 26 15 8 8 8 10 9 18 18 20 16 18 11 11 11 15 16 20 23 16 21 11 11 11 12 16 15 21 21 23 24 31 24 24 15 16 16 19 15 9 9 9
9 16 21 26 23 23 23 22 23 13 13 10 9 10 10 15 15 28 25 32 32 37 39 39 37 28 24 12 11 11 11 29 24 12 12 11 18 15 16 18 12 11 11 12 12 11 11 11 12 12
23 12 14 14 22 16 12 12 12 15 15 17 12 15 12 12 8 8 8 9 12 17 16 11 11 11 12 12 18 15 12 12 12 10 13 12 15 13 22 15 15 13 13 13 26 25 24 12 12 12
19 12 13 12 8 8 6 6 6 8 8 8 8 15 8 10 12 13 8 8 8 8 8 8 11 12 16 16 15 14 15 13 16 10 10 9 8 10 8 8 10 12 13 13 18 10 10 10 10 10
9 9 10 15 17 12 11 10 10 11 11 11 17 21 13 13 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 17 19 15 15 14 14 12 16 11 11 8 8 6 7 8 8 14 13
10 8 8 8 8 8 10 12 11 11 11 11 13 11 11 11 11 12 9 9 9 9 9 16 21 24 30 13 10 8 10 8 10 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 17 15 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 13 12 11 11 10 10 10 10 10 10 11 17 23 21 13 10 10 11 10 10 11 12 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 10 12
8 8 8 10 10 12 15 13 15 10 9 9 9 10 15 19 8 10 10 8 10 13 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 8 8 8 6 8 7 6 8 8 14 9 10 10 8 8 8 8 8
8 | Open.Hide.12 12 12 11 8 8 8 9 9 11 11 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 3 0 0 3 8 6 6 6 3 0 0 0 0 3 6 6 8 8 10 10 13 3 0
3 6 7 7 3 0 3 6 6 6 3 0 3 3 0 3 8 8 8 8 8 3 0 0 3 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 0 3 9 6
6 8 3 0 3 8 8 11 11 8 8 3 0 0 3 0 3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 3 0 0 3 0 3 0 0 3 6 6 6 3 0 3 7 9 9 9 3 0 3 9 9
9 7 7 8 7 7 7 9 9 13 10 11 9 7 7 6 6 6 6 6 6 6 9 3 0 3 0 3 3 0 0 3 10 3 0 0 3 0 0 0 3 0 0 3 6 6 8 8 8 10
8 3 0 3 0 3 14 10 12 10 3 0 3 0 3 8 8 3 0 0 0 3 0 0 0 3 6 3 0 3 0 0 3 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8
8 8 3 0 3 6 8 8 10 10 10 3 0 3 3 0 3 10 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 8 8 10 9 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8
8 6 8 8 8 8 8 10 14 11 9 9 9 9 9 3 0 3 0 3 9 9 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 3 0 3 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 6 6 6 10 10 11 11 9 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 9 8 8 8 8 13 10 9 9
8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 9 7 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 7 6 8 8 10 10
10 12 18 10 10 8 8 8 8 8 8 9 11 7 8 8 7 6 6 9 9 9 10 11 11 10 9 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 6 6 6 8 8 7 6 6
6 6 6 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 7 8 7 6 8 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 8 6 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0
3 9 8 8 6 6 8 6 7 7 9 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 12 6 6 6 6 6 6 8 6 7 7 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 9 7 6 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 14 8 10 7 6 6 6 3 0 3 6
6 3 0 3 3 0 3 9 3 0 3 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 6 8 6 6 6 6 8 6 6 3 0 3 6 7 6 8 8 8 8 6 10 6 6 6 6 6 6
6 9 12 12 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 13 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 7 7 6 8 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 9 9 9 9 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0
3 6 6 6 6 6 6 10 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 9 11 9 9 9 9 9 9 9 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 6 9 9
9 8 8 8 8 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 8 8 8 10 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 9 9 11 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 7 8 6 6 7 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 14 14 9 9 9 8 6 6 6 6 6
8 3 0 3 13 11 14 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 10 9 8 6 6 6 6 8 10 8 3 0 3 8 8 3 0 3 7 7 7 8 8 7 6
7 6 7 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 7 6 6 6 6 6 6 9 9 6 6 6 6 7 3 0 3 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 10 17 10
10 10 9 8 6 6 6 6 6 8 8 10 14 14 11 11 6 7 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 17 17 14 12 11 11 3
0 3 12 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 3 0 3 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 3 0 3 13 3
0 3 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 15 10 10 7 7 7 7 8 13 15 10 3 0 3 0 3 8 8 12 9 11 18 14 8 6 6 6 6 8 8 6
6 6 7 6 6 6 6 10 8 8 3 0 3 7 6 8 8 8 6 7 8 6 6 7 6 8 9 10 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
9 9 9 10 9 10 12 9 8 8 6 6 7 7 7 7 8 6 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 7 10 11 14 10 9 9 11 9 8 8 7 7 6
6 6 6 6 6 8 8 8 10 11 11 10 10 10 6 6 6 9 9 7 8 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 7 6 6 6 6 8 13 8 8 8 8 7 3 0 3 8 9 10 10
10 13 10 10 12 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 8 8 10 9 9 8 8 6 6 8 3 0 3 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 8 9 11 10 8 8 7 7 7
6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 7 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 12 12 10 12 11 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 3 0 3 6 3 0 3 6 6
6 11 10 8 8 8 8 8 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 6 6 6 6 6 6 10 12 9 9 7 7 7 7 6 6 6 6 8 6 8 8 9 10 10 8 8 6
6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 8 9 9 11 10 9 9 7 7 8 8 8 8 9 9 9 8 9 9 9 9 9 11 11 11 12 12 16 10 6 8 6 6 6 6 8 10 10 9
9 9 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 7 7 6 6 6 10 12 11 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 10 10 11 8 8 9 9 9 9 9 3 0 3 6 8
8 17 12 12 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 14 11 10 8 6 6 6 6 8 6 8 6 10 6 6 6 8 9 9 9 7 8 8 3 0 3 6 6 8 6 8 6 7 7 6
8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 12 7 10 6 6 6 6 6 7 6 6 6 9 9 9
11 3 0 3 9 9 10 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 |
|---|
